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苹果酸合酶

指数 苹果酸合酶

苹果酸合酶(malate synthase,)是能催化如下反应的酶: 该酶属于轉移酶中的一类,并在转移过程中把酰基转化为烷基。苹果酸合酶参与了乙醛酸循环。.

13 关系: 反應乙醛酸乙醛酸循环乙酰辅酶A催化烷基轉移酶辅酶A酰基苹果酸蛋白質三級結構蛋白質資料庫

反應

反應(reaction)為因為事件所引發的回應,例如:.

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乙醛酸

乙醛酸由一个醛基(-CHO)与一个羧基(-COOH)构成,其结构简式为HOCCOOH,分子式C2H2O3。.

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乙醛酸循环

乙醛酸循環(Glyoxylate cycle)又稱乙醛酸途徑、乙醛酸旁路,其名稱來自於此路徑經由產生乙醛酸來節省檸檬酸循環所會損失的兩個二氧化碳。此路徑只存在於植物和微生物中。其與檸檬酸循環的差異在於以透過乙醛酸途径使異檸檬酸轉為琥珀酸與乙醛酸,後者再與乙酰-CoA藉酵素轉為蘋果酸,從而回到檸檬酸循環。.

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乙酰辅酶A

乙酰辅酶A(acetyl-CoA)是活化了的乙酸,由乙酰基(CH3CO-)与辅酶A的巯基以高能的硫酯键相连。乙醯輔酶A是脂肪酸的β-氧化及糖酵解后产生的丙酮酸脱羧後的产物。 在三羧酸循环的第一步,乙酰基转移到草酰乙酸中,生成柠檬酸,--。.

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催化

催化是利用催化剂改变化学反应速度的一种工艺。许多化学工业要利用催化作用来获得需要的反应速度。催化也是一种化工单元过程,催化剂本身在反应中不会被消耗,但催化剂会改变反应速度,一催化劑亦可能參與複數的催化反應。正催化劑可加速反應;負催化劑或抑制劑則會與反應物反應進而降低化學反應。可提高催化劑活性的物質稱為促進劑;降低催化劑活性者則稱為催化毒。 相較於未催化的反應,同溫度的催化反應擁有較低的活化能。催化劑可以藉由結合反應物達到極化的效果,如酸催化劑之於羰基化合物的合成;催化劑也可產生非自然的反應中間物,如以四氧化鋨催化烯烴的雙羥基化中產生的鋨酸鹽酯;催化劑亦可造成反應物的裂解,如製氫時產生的單原子氫。 很多物质都可以做催化剂,在无机物反应中,通常利用酸、碱、金属或金属化合物作为催化剂,在有机物反应中多用有性的蛋白质分子——酶作为催化剂,生物体内许多化学反应都依赖酶來进行的。 催化反应可以发生在单相和多相中,也可以发生在复相中:.

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烷基

烷基是一类仅含有碳、氢两种原子的链状有机官能团。它们是一系列同系物,其通式为CnH2n+1。常见的有甲基·(对应于甲烷)、乙基·(对应于乙烷)、丙基·(分为正丙基与异丙基)等。.

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轉移酶

轉移酶是一種催化一個分子(稱為供體)的官能團(如甲基或磷酸鹽團)轉移至另一個分子(稱為受體)的酶。 舉例來說,一種酶催化以下的化學反應就是轉移酶: 在這例子中的A就是供體,而B就是受體。供體一般都會被稱為輔酶。.

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辅酶A

辅酶A(coenzyme A,簡稱CoA、CoASH或HSCoA)是一種輔酶,值得注意的是其在合成和氧化脂肪酸的角色,和在三羧酸循環中氧化丙酮酸。所有基因組測序日期編碼的酶,即利用輔酶A作為底物,並在4%左右的細胞酶中使用(或硫酯,例如乙酰-CoA)作為基材。在人類中,輔酶A生物合成需要半胱氨酸、泛酸和三磷酸腺苷(ATP)。主要參與脂肪酸以及丙酮酸的代謝。.

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酰基

酰基(acyl group)是指從含氧酸,包括無機酸中除去一個或多個羥基基團的衍生的官能團。它包含一個強制性羰基和烷基。在有機化學中,酰基(IUPAC名:鏈烷酰基)通常是衍生自羧酸。因此,它具有結構式RCO-,其中R代表被附著到CO基用單鍵的烷基。雖然稱呼幾乎總是應用於有機化合物,但酰基原則上可以是來自於其它類型的酸如磺酸,膦酸。在最常見的安排,酰基連接到一個更大的分子片段,在這種情況下,碳和氧原子通過雙鍵相連。 酰基指的是有机或无机含氧酸去掉羟基后剩下的一价原子团,通式为R-M(O)-。酰基与卤素原子、烷氧基、氨基或取代氨基及酰氧基结合可以分别获得酰卤、酯、酰胺和酸酐。 通常酰基中的M原子都为碳,但硫、磷、氙等原子也可以形成类似的酰基化合物,如四氟一氧化氙、硫酰氯、氯化亚砜。此类酰卤一般称为卤氧化物。.

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酶(Enzyme( ))是一类大分子生物催化劑。酶能加快化學反應的速度(即具有催化作用)。由酶催化的反應中,反應物稱爲底物,生成的物質稱爲產物。幾乎所有細胞內的代謝過程都離不開酶。酶能大大加快這些過程中各化學反應進行的速率,使代謝產生的物質和能量能滿足生物體的需求。細胞中酶的類型對可在該細胞中發生的代謝途徑的類型起決定作用。對酶進行研究的學科稱爲「酶學」(enzymology)。 目前已知酶可以催化超過5000種生化反應。大部分酶是蛋白質,有少部分酶是具有催化活性的RNA分子,这些酶被称为核酶。酶的特異性是由其獨特的三級結構決定的。 和所有的催化劑一樣,酶通過降低反應活化能加快化學反應的速率。一些酶可以將底物轉化爲產物的速率提高數百萬倍。一個比較極端的例子是。該酶可以使在無催化劑條件下需要進行數百萬年的化學反應在幾毫秒內完成。從化學原理上講,酶和其它所有催化劑一樣,反應不會使其物質量發生變化。酶亦不能改變化學平衡,這一點和其它催化劑也是一樣的。酶和其它催化劑的不同之處在於,它們的專一性要強得多。一些分子可以影響酶的活性。如酶抑制劑能降低酶的活性,酶激活劑能提高酶的活性。許多藥物及毒物是酶的抑制劑。當超出適宜的溫度和pH值後,酶的活性會顯著下降。 酶在工业和人们的日常生活中的应用也非常广泛。例如,药厂用特定的合成酶来合成抗生素;洗衣粉中添加酶能加速附着在衣物上的蛋白质、淀粉或脂肪漬的分解;嫩肉粉中加入木瓜蛋白酶能將蛋白質分解爲稍小的分子,使肉的口感更嫩滑。.

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苹果酸

苹果酸即2-羟基丁二酸,是一个二羧酸,化学式为C4H6O5。分子中含有一个不对称碳原子,因此有两种旋光异构体和一种外消旋体。它是三羧酸循环的中间物之一,由反丁烯二酸水合生成,继续氧化得到草酰乙酸。存在于苹果、葡萄、山楂等果实中,苹果酸首先从苹果汁中分离出来,是苹果汁酸味的来源,并因此得名。它也用作食品添加剂。.

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蛋白質三級結構

蛋白質三級結構(Protein tertiary structure)是在生物化學裡指蛋白質整體几何形狀,亦稱為其摺疊。蛋白質分子是一連串的胺基酸一條線地接結,基本上假定其會有一可作用其生物功能的三維結構。對蛋白質三級結構的研究稱為結構生物學。蛋白质的三级结构是由它的原子坐标定义的。这些坐标可参照或一个蛋白质结构域或整个三级结构。Branden C. and Tooze J. "Introduction to Protein Structure" Garland Publishing, New York.

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蛋白質資料庫

蛋白質資料庫(Protein Data Bank,简称PDB)是一個專門收錄蛋白質及核酸的三維結構資料的数据庫。由Worldwide Protein Data Bank监管。PDB可以经由网络免费访问,是结构生物学研究中的重要资源。为了确保PDB资料的完备与权威,各个主要的科学杂志、基金组织会要求科学家将自己的研究成果提交给PDB。在PDB的基础上,还发展出来若干依据不同原则对PDB结构数据进行分类的数据库,例如GO将PDB中的数据按基因进行了分类。這些資料和數據一般是世界各地的结构生物学家經由X射線晶體學或NMR光譜學實驗所得,並釋放到公有領域供公众免費使用。.

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