核苷酸多樣性（nucleotide diversity）係分子遺傳學（分子生物學）中的一個概念。該概念用於表徵某一種群中多態性的強弱。 Nei和Li在1979年引入了一種計算核苷酸多樣性的方法：在從某一種群中取得的多個樣品DNA上隨機取一段序列，將在這些序列上的同一位點鹼基的不同取平均值，即可得核苷酸多樣性的值。他們將這個值記爲「π」。 這種方法用數學公式表示如下： xi 、xj分別代表第i個和第j個序列的對應頻率比如一共擁有5個樣本，那麼xi 、xj均爲1/5。πij則爲兩個序列之間不同位點所佔百分比舉個例子來說，假設第i個樣本的序列爲ATTAC，第j個樣本的序列爲ATTAT。進行比較可知，兩個序列的長度均爲5個鹼基對，其中有一對鹼基對在兩個樣本間是不同的，πij爲1/5。n則爲總樣本數。 核苷酸多樣性是（genetic variation）的一個量化值。核苷酸多樣性通常與其他衡量種群多樣性的數值有聯繫，同時也和期望雜合度（expected heterozygosity）有聯繫。核苷酸多樣性通常用於衡量種群內或種群間的多樣性，或作物與相關物種間的遺傳變異。另外，核苷酸多樣性還可以用於推算進化關係。 可通過直接比對DNA序列來算出核苷酸多樣性，亦可使用用分子標記得出的數據（比如使用隨機擴增多態性DNA（RAPD）技術或擴增片段長度多態性PCR（AFLP-PCR）得出的數據）推算出。.
2 关系: 分子遺傳學，种群。
分子遺傳學（Molecular genetics）是生物學中的一個領域，專門在分子層次下研究遺傳學，這一學門使用許多分子生物學與遺傳學的研究方法 。對生物體染色體和基因表達的研究可以深入了解遺傳，遺傳變異和突變。 這在發育生物學的研究和理解和治療遺傳疾病中很有用。.
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种群（英语：Population，或族群）在生物学上，是在一定空间范围内同时生活着的同种生物的全部个体；或者说是有个体组成，能够而且确实进行交配的群体。种群的个体之间一般享有同一个基因库。 它是种群遗传学研究的对象。.
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