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史密斯-沃特曼算法
史密斯-沃特曼算法(Smith-Waterman algorithm)是一种进行局部序列比对(相对于全局比对)的算法,用于找出两个核苷酸序列或蛋白质序列之间的相似区域。该算法的目的不是进行全序列的比对,而是找出两个序列中具有高相似度的片段。 该算法由坦普尔·史密斯(Temple F.
另见
动态规划
- Floyd-Warshall算法
- 动态规划
- 史密斯-沃特曼算法
- 哈密顿-雅可比-贝尔曼方程
- 子集和問題
- 字符串近似匹配
- 尼德曼-翁施算法
- 最大子数列问题
- 最长公共子串
- 最长公共子序列
- 最长递增子序列
- 矩陣鏈乘積
- 粘性解
- 维数灾难
- 维特比算法
- 背包问题
- 自动换行
- 萊文斯坦距離
- 貝爾曼方程
- 贝尔曼-福特算法
- 部分可觀察馬可夫決策過程
- 馬可夫決策過程
序列排比算法
生物信息学算法
- BLAST (生物資訊學)
- Velvet拼接软件
- 史密斯-沃特曼算法
- 尼德曼-翁施算法
- 序列比對
计算系统发生学
亦称为 Needleman–Wunsch algorithm,Needleman–Wunsch算法。