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113 关系: ABC模型，AP-1转录因子，基因组进化，基因表現，基因预测，原生質絲，卷曲螺旋，古菌，受体 (生物化学)，发育生物学，吳成文，同源，同源框蛋白質NANOG，山中伸彌，中心法則，干扰素伽玛，亮氨酸拉链，人類免疫缺陷病毒，信号转导及转录激活蛋白，刺猬信号通路，响应元件，内胚窦瘤，啟動子，八聚体转录因子，C-Myc，CDX1，CTCF，碱性螺旋-环-螺旋，线粒体拟核相关蛋白质，结构域，细胞内受体，细胞凋亡，细胞因子，细胞核，缺氧誘導因子，生物，生物化学概述，甲状腺激素，癌基因，癌变，癌症，Daf-16，DNA结合位点，EGR4，EPAS1，花，花色素苷，芳香烃受体，遗传学，鍾邦柱，... 扩展索引 (63 更多) »
ABC模型
被子植物花发育的ABC模型由E.
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AP-1转录因子
在分子生物学中，AP-1转录因子（激活蛋白1，activator protein 1，AP-1）是一种异二聚体蛋白转录因子，由c-Fos、c-Jun、JDP以及ATF家族的不同蛋白组成，调节基因表达以响应多种外界信号，如细胞因子、生长因子、环境压力以及细菌和病毒感染，与细胞分化、细胞增殖和细胞凋亡等细胞进程的调控密切相关。 AP-1可以上调包含佛波醇-12-十四烷酰-13-乙酸酯（TPA）DNA响应元件（缩写TRE，序列为：5'-TGAG/CTCA-3'）的基因的表达。AP-1通过一种碱性的氨基酸区域——由异二聚体两个亚基组成的亮氨酸拉链来与DNA序列结合。.
基因组进化
基因组进化 是 基因组 的结构（序列）或大小随时间变化过程。 基因组进化的研究涉及多个领域，如基因组的结构分析，基因组寄生虫的研究，基因和古代基因组重复，多倍体和比较基因组学。由于原核生物和真核生物的基因序列是稳定增加的，故基因组进化是一个不断变化和发展的领域，况且这些基因序列可以从科学界和广大公众中获取。.
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基因表現
基因表現（Gene expression）是用基因中的信息来合成基因产物的过程。产物通常是蛋白质，但对于非蛋白质编码基因，如转运RNA（tRNA）和小核RNA（snRNA），产物则是RNA。所有已知生物都通过基因表达来生成生命所需的高分子物质。 基因表現的过程可分为转录、RNA剪接、翻译、蛋白质的翻译后修饰这几步。控制细胞的结构与功能，同时也是细胞分化、及生物体的多功能性和的基础。不同的時間、不同的環境，以及不同部位的細胞，或是基因在細胞中的含量差異，皆可能使基因產生不同的表現。基因调节也可以作为进化变化的底物，因为基因表达的时间，位置和数量的控制可以对基因在细胞或多细胞生物体中的功能（作用）具有深远的影响。 在遗传学中，基因表現是基因型产生表型（即可观察的性状）的最基本的层次。.
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基因预测
基因识别，是生物信息学的一个重要分支，使用生物学实验或计算机等手段识别DNA序列上的具有生物学特征的片段。基因识别的对象主要是蛋白质编码基因，也包括其他具有一定生物学功能的因子，如RNA基因和调控因子。基因识别是基因组研究的基础。 在早期，基因识别的主要手段是基于活的细胞或生物的实验。通过对若干种不同基因的同源重组的速率的统计分析，我们能够获知它们在染色体上的顺序。若进行大量类似的分析，我们可以确定各个基因的大致位置。现在，由于人类已经获得了巨大数量的基因组信息，依靠较慢的实验分析已不能满足基因识别的需要，而基于计算机算法的基因识别得到了长足的发展，成为了基因识别的主要手段。 识别具有生物学功能的片段与判定该片段（或其对应的产品）的功能是两个不同的概念，后者通常需要通过基因敲除等的实验手段来决定。不过，生物信息学的前沿研究正在使得由基因序列预测基因功能变得愈发可能。.
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原生質絲
原生質絲（Plasmodesmata）為植物細胞和部分藻類細胞壁間貫穿細胞壁的特有孔道，可以讓相鄰細胞的細胞質相互流通。Oparka, K. J. （2005） Plasmodesmata. Blackwell Pub Professional.
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卷曲螺旋
卷曲螺旋（coiled coil）是一种蛋白质超二级结构，由2－7个α螺旋（最常见的是2或4个）互相缠绕形成麻花状结构。许多具有重要生物学功能（如基因表达调控中的转录因子）蛋白质含有卷曲螺旋。 许多含有卷曲螺旋结构的蛋白质具有重要的生物学功能，例如基因表达的调控中的转录因子。含有卷曲螺旋结构最知名的蛋白质有原癌蛋白（oncoprotein）c-fos和jun，以及原肌球蛋白（tropomyosin，一种肌肉蛋白）。.
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古菌
古菌（Archaea，来自，意为“古代的东西”）又稱古細菌、古生菌或太古生物、古核生物，是单细胞微生物，构成生物分类的一个域，或一个界。这些微生物属于原核生物，它們與细菌有很多相似之處，即它们没有细胞核与任何其他膜结合细胞器，同時另一些特徵相似於真核生物，比如存在重复序列与核小体。 过去曾经将古菌和细菌一同归为原核生物，并将其命名为“古细菌”，但这种分类方式已过时。事实上古菌有其独特的进化历程，并与其它生命形式有显著的生化差异，所以现在将其列为三域系统中的一个域。在这个系统中，古菌、细菌与真核生物各为一个域，并进一步划分为界与门。到目前为止，古菌已被划分为公认的四个门，随着进一步研究，还可能建立更多的门类。在这些类群中，研究最深入的是泉古菌门与广古菌门。但对古菌进行分类仍然是困难的，因为绝大多数的古菌都无法在实验室中纯化培养，只能通过环境宏基因组检测来分析。 古菌和细菌的大小和形状非常相似，但少数古菌有不寻常的形状，如嗜鹽古菌拥有平面正方形的细胞。尽管看起来与细菌更相似，但古菌与真核生物的亲缘关系更为密切，特别是在一些代谢途径（如转录和转译）有关酶的相似性上。古菌还有一些性状是独一无二的，比如由依赖醚键构成的细胞膜。与真核生物相比，古菌有更多的能量来源，从熟悉的有机物糖类到氨到金属离子直到氢气。（如）可以以太阳光为能源，其它一些种类的古菌能进行；但不像蓝藻与植物，没有一种古菌能同时做到这两者而进行光合作用。古菌通过分裂、出芽、断裂来进行无性生殖，但没有发现能产生孢子的种类。 一开始，古菌被认为都是一些生活在温泉、盐湖之类极端环境的嗜极生物，但近来发现它们的栖息地其实十分广泛，从土壤、海洋、到河流湿地。它们也被发现在人类的大肠、口腔、与皮肤。尤其是在海洋中古菌特别多，一些浮游生物中的古菌可能是这个星球上数量最大的生物群体。现在，古菌被认为是地球生命的一个重要组成部分，在碳循环和氮循环中可能扮演重要的角色。目前没有已知的作为病原体或寄生虫的古菌，他们往往是偏利共生或互利共生。一个例子是，生活在人和反刍动物的肠道中帮助消化，还被用于沼气生产和污水处理。嗜极生物古菌中的酶能承受高温和有机溶剂，在被生物技术所利用。.
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受体 (生物化学)
受體（Receptor），又称受器、接收器，是一個生物化學上的概念，指一類能傳導細胞外信號，並在細胞內產生特定效應的分子。產生的效應可能僅在短時間內持續，比如改變細胞的代謝或者細胞的運動。也可能是長效的效應，比如上調或下調某個或某些基因的表達。 受體通過與特定的配體結合而感知到細胞外的信號。隨後，受體的結構發生變化，並誘導細胞內產生相應的效應。受體通過信号级联效應，逐步以指數級擴大細胞內產生的效應的強度。信號級聯的第一步可能是產生cAMP等第二信使分子，誘導下一級反應。根據受體所在的位置，可以分爲細胞表面受體和細胞內受體兩類。其中細胞表面受體位於細胞表面，處於內環境中的配體可以直接與之結合。大部分的細胞內受體都屬於核受體。在未與配體結合時，這些受體位於細胞質中，配體需要穿過細胞膜進入細胞內，才能與該受體結合結合。在與配體結合後，核受體會轉入細胞核中發揮效應。另一類細胞內受體是細胞內的酶、RNA、核糖體等，配體通過與這些受體結合發揮效應。.
发育生物学
育生物學（英语：Developmental biology）是對於生物體生長和發育過程的研究。發育生物學研究基因對細胞生長，分化和形態發生（Morphogenesis）的調控，這些過程使生物體形成組織和器官。胚胎學（Embryology）有時被比較明確地規範到生物體單一細胞階段，到獨立個體之間的研究。直到20世紀，胚胎學是一個比較偏重述敘的科學。時至今日，胚胎學或發育生物學處理討論一個生物體，如何形成個體正確及完整形態的各個步驟。进入21世纪70年代以后，发育生物学的研究主要着重于分子和细胞生物学水平上的胚胎学。 演化發育生物學的相關領域主要在1990年代形成，這是由分子發育生物學和演化生物學而來，研究不同物種間發育過程的差異性。經常被使用在發育生物學上的動物模式，有線蟲 （Caenorhabditis elegans）、黑腹果蠅（Drosophila melanogaster）、斑馬魚（Danio rerio）、小鼠（Mus musculus）和擬南芥（Arabidopsis thaliana，或稱阿拉伯芥）。發育生物學的研究結果，可幫助瞭解染色體異常引起的發育不全，例如唐氏症。.
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吳成文
吳成文，畢業於臺灣師範大學附中、臺灣大學醫學系，1969年獲美國凱斯西儲大學生物化學博士。當選第15屆中央研究院院士，曾任台北醫學大學董事、中央研究院生物醫學所所長、國家衛生研究院院長。專長為生物物理、分子生物、生物化學、生物醫學等。.
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同源
在生物学种系发生理论中，若两个或多个结构具有相同的祖先，则称它们同源（Homology）。这里相同的祖先既可以指演化意义上的祖先，即两个结构由一个共同的祖先演化而来（在这个意义上，蝙蝠的翅膀与人类的手臂是同源的），也可以指发育意义上的祖先，即两个结构由胚胎时期的同一组织发育而来（在这个意义上，人类女性的卵巢与男性的睾丸同源）。 同源这一概念需与相似区分开来。比如说，昆虫的翅膀、蝙蝠的翅膀和鸟类的翅膀是相似的，但却不同源，这种现象被称为非同源相似（或同形质，英文：Homoplasy）。这些相似的结构由不同的渠道演化而来，这种演化过程叫做趋同演化（Convergency）。.
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同源框蛋白質NANOG
NANOG（讀法：nanOg）是一种对未分化的胚胎干细胞（ESC）自我更新至关重要的转录因子。人体的NANOG蛋白质由NANOG基因编码。.
山中伸彌
山中伸彌（，），日本幹細胞科學家，現任京都大学教授、UCSF附屬高等研究員、奈良先端科學技術大學院大學榮譽教授。美国国家科学院外籍院士 、宗座科學院院士、日本學士院會員。文化勳章表彰。文化功勞者。時代百大人物。 山中教授曾獲日本最初的。他也與魯道夫·耶尼施同獲2011年沃爾夫醫學獎、與林納斯·托瓦茲同獲2012年千禧年科技獎，同年他因「發現成熟細胞可被重寫成多功能細胞」與约翰·格登爵士同獲诺贝尔生理学或医学奖。2013年再獲300萬美元獎金的生命科學突破獎。.
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中心法則
分子生物學的中心法则（The central dogma of molecular biology，又譯分子生物學的中心教條），首先由佛朗西斯·克里克於1958年Crick, F.H.C. (1958): Symp.
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干扰素伽玛
干扰素伽玛（干扰素-γ, Interferon-γ,IFNG、IFNγ）是水溶性二聚体的细胞因子 。是II型干扰素的唯一成员。最初叫巨噬细胞活化因子。.
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亮氨酸拉链
亮氨酸拉链（leucine zipper，亦称为亮氨酸剪刀）是蛋白质中一种常见的三维结构模体，常见于许多转录因子的DNA结合结构域，因此涉及基因的表达调控。亮氨酸拉链在真核生物和原核生物的蛋白中都有发现，但以真核生物居多。 亮氨酸拉链是一种作为二聚体化结构域的超二级结构，且使相互平行的α-螺旋之间产生粘附力。一个亮氨酸拉链包含了多个亮氨酸残基，通常每七个氨基酸残基就出现一次，这形成了一条两性的α-螺旋，疏水区只在其中一侧。这个疏水区提供了二聚化的区域，使得基序可以像“拉链”一样拉起来。此外，疏水亮氨酸区域对于其结合到DNA是不可或缺的。.
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人類免疫缺陷病毒
人類免疫缺乏病毒（human immunodeficiency virus，缩写为HIV）是一種感染人類免疫系統細胞的慢病毒，屬反轉錄病毒的一種。普遍認為，人類免疫缺陷病毒的感染導致艾滋病，艾滋病是後天性細胞免疫功能出現缺陷而導致嚴重隨機感染及/或繼發腫瘤並致命的一種疾病。愛滋病毒起源於1920年代的非洲金沙萨，自1981年在美國被識別並發展為全球大流行。人類免疫缺陷病毒通常也俗稱為「艾滋病病毒」或「艾滋病毒」。 人類免疫缺陷病毒作為反轉錄病毒，在感染後會整合入宿主細胞的基因組中，而目前的抗病毒治療並不能將病毒根除。世界衛生組織（WHO）在2016年估計全球約有3670萬名愛滋病毒感染者，流行狀況最為嚴重的仍是撒哈拉以南非洲，其次是南亞與東南亞，成長幅度最快的地區是東亞、東歐及中亞。 在人類免疫缺陷病毒感染病程的一些時期，特別是早期及末期，具有感染性的病毒顆粒會存在於含有免疫細胞、血漿、淋巴液或組織液的某些體液中，如血液、精液、 前列腺液、陰道分泌液、乳汁或傷口分泌液；另一方面，病毒在體外環境中極不穩定。因此，人類免疫缺陷病毒的傳播途徑主要是不安全的性接觸、靜脈注射、輸血、分娩、哺乳等；而通常的工作、學習、社交、或家庭接觸，比如完整皮膚間的接觸、共用坐便器、接觸汗液等，不會傳播人類免疫缺陷病毒；與唾液或淚液的通常接觸（如社交吻禮或短暫接吻）也未有導致傳播人類免疫缺陷病毒的報告；但美國疾病控制與預防中心說已感染病毒的母親，可將病毒透過先嚼過的食物（唾液內含血液）傳給孩子。.
信号转导及转录激活蛋白
信号转导及转录激活蛋白（Signal Transducer and Activator of Transcription或Signal Transduction And transcription，简称为STAT蛋白）在细胞的存活、生长和分化等许多方面起调节作用的转录因子家族，并由JAK激酶激活。 此途徑的失效常常在腫瘤發展初期觀察到，導致血管新生、腫瘤抗性加強，以及免疫抑制。 基因敲除的研究證明STAT蛋白與免疫系統的發育以及作用上相關，也與免疫耐受及偵測癌細胞有關。.
刺猬信号通路
刺猬信号通路（Hedgehog signaling pathway）是重要的信号传导通路。 刺猬信号通路是动物发育的关键调控之一，在所有的两侧对称动物中都有表达。刺猬信号通路得名于在其多肽配体——Drosophila果蝇中发现的一种名为Hh的细胞间信号分子。Hh是 Drosophila体节极性基因的表达物，是果蝇体形发育形成的基础。该分子在后期胚胎开成及变态期及起重要作用。。 共有五種刺蝟因子：音蝟因子（Sonic hedgehog，SHH）、沙漠刺蝟因子（desert hedgehog，DHH）、印度刺蝟因子（Indian hedgehog，IHH）、Echidna Hedgehog，EHH和Tiggywinkle Hedgehog，TwHH）。仅在鱼类中发现有EHH和TwHH，哺乳类和其他动物中没有这两种刺蝟因子。 哺乳动物有三种刺猬信号路径同系物，DHH、IHH及SHH,其中Sonic研究得最深入。该路径在脊椎动物胚胎發育中同样的重要。缺乏该路径组件的基因敲除小鼠，其大大脑、骨骼、肌肉系统、胃肠道及肺都未能正正常发育。近期研究表明刺猬信号路径在调节对成人组织起到维护及再生作用的成体干细胞中的作用。同样该路径也与某些癌症的发生的关系。几家制药公司正在积极地开发针对刺猬信号传导以对抗癌症的药物。.
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响应元件
响应元件或应答元件（Response elements）是基因啟動子区域的一段短的DNA序列，能与特异的转录因子结合，调控基因的转录。 在接受外界刺激条件下，转录激活蛋白会结合到响应元件上启动相应基因的转录。如果不同的基因在其调控区域有着相同的响应元件，这些基因会被相同的刺激条件激活，产生协同的应答。.
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内胚窦瘤
内胚窦瘤、内胚窦层瘤（Endodermal sinus tumor, EST），也成卵黄囊瘤（yolk sac tumor, YST）是一类生殖细胞瘤。它也是一类最常见的小于三岁的儿童睾丸肿瘤，也被称为幼稚型胚胎性癌（infantile embryonal carcinoma）。这类疾病有很好的预后；而在成人体内发现的原位癌则伴发其他种类的生殖细胞瘤，特别是畸胎瘤或胚胎性癌。畸胎瘤通常为良性肿瘤，胚胎性癌则是恶性肿瘤。.
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啟動子
啟動子（promoter）在遺傳學中是指一段能使基因進行轉錄的脱氧核糖核酸（DNA）序列。啟動子可以被RNA聚合酶辨認，並开始轉錄。在核糖核酸（RNA）合成中，啟動子可以和决定转录的开始的转录因子产生相互作用，控制基因表达（转录）的起始时间和表达的程度，包含核心启动子区域和调控区域，就像“开关”，决定基因的活动，繼而控制細胞开始生產哪一種蛋白質。 启动子本身并无编译功能，但它拥有对基因轉譯胺基酸的指挥作用，就像一面旗帜，其核心部分是非编码区上游的RNA聚合酶结合位点，指挥聚合酶的合成，这种酶指导RNA的复制合成。因此该段位的启动子发生突变（变异），将对基因的表达有着毁灭性作用。 完全的啟動子稱為規範序列。.
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八聚体转录因子
八聚体转录因子（octamer transcription factor）是一类能结合到序列"ATTTGCAT"上的转录因子。 例子包括：.
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C-Myc
C-Myc或Myc是编码转录因子的。这一基因编码的蛋白在细胞核内被磷酸化，有多种功能：在细胞周期进程、细胞凋亡和细胞轉化中发挥作用。.
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CDX1
同源框蛋白CDX-1（Homeobox protein CDX-1）是一种由基因CDX1编码的蛋白质。 该基因是尾型同源框转录因子基因家族的一员。其编码的DNA结合蛋白用以调控肠道特异性基因的表达和肠上皮细胞的分化。已知它能诱导肠道碱性磷酸酶的表达，并抑制β-连环素和T细胞因子的转录活性。.
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CTCF
转录阻抑物CTCF（又叫11-锌指蛋白或CCCTC-结合因子），是CTCF基因编码的转录因子，与绝缘子的活性相关。.
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碱性螺旋-环-螺旋
性螺旋-環-螺旋（basic Helix-Loop-Helix，简称为bHLH）是表征一种转录因子家族的蛋白質结构模体。 擁有此蛋白質結構域的蛋白質成為一個蛋白質家族，這些蛋白質大多可以調控轉錄作用。bHLH蛋白質常形成雙體(dimer)而後辨識DNA，並調控基因的轉錄。 它們參與許多重要的發育與生理功能，包含肌肉的發育、神經系統的分化、氣管生成、低氧感應、芳香烴感應、生物時鐘等。.
线粒体拟核相关蛋白质
线粒体拟核相关蛋白（mitochondrial nucleoid-associated protein）是存在于线粒体拟核中的蛋白质的统称，主要包括转录因子、单链DNA结合蛋白以及众多参与线粒体中代谢途径的多功能蛋白。这些蛋白质均由核基因编码, 在细胞质基质中合成再转运至线粒体基质内执行功能。除了参与转录，线粒体拟核相关蛋白在线粒体DNA（mtDNA）折叠和线粒体拟核结构组织中也发挥重要作用。线粒体拟核的结构与功能的完整性都依赖于这些蛋白之间以及蛋白与mtDNA间的相互作用。多种线粒体拟核相关蛋白的缺失也会使拟核结构不稳定，并最终导致DNA损伤。.
结构域
蛋白质结构域（protein domain）是蛋白质中的一类结构单元，是构成蛋白质（三级）结构的基本单元。 有些球形蛋白的一条肽链，或以共价键相连的两条或多条肽链在空间结构上可以区分为若干个球状的子结构，其中的每一个球状子结构就被称为一个结构域。 同一个蛋白的各个结构域之间是以肽链相互链接的，而链接两个蛋白质结构域的绝大多数都是单股肽链，只有在极个别的情况下会有少数的双股肽链联系不同的结构域。在X射线晶体学衍射实验绘制的电子密度图中，可以清楚地看到有些球状蛋白地的部存在一些裂隙，这些裂隙就是各个结构域之间的链接部分，蛋白质结构域之间的链接虽然是松散的，但他们仍然属于同一条肽链，靠肽链链接这一点和蛋白质的各个亚基之间依靠非键相互作用维系结构有着本质的区别。 蛋白质结构域在空间上具有临近相关性：即在蛋白质一级结构上相互临近的氨基酸残基，在蛋白质结构域的三维空间结构上也相互临近，在蛋白质一级结构上相互远离的氨基酸残基，在蛋白质结构域的空间结构上也相互远离，甚至分别属于不同的蛋白质结构域。 蛋白质结构域与蛋白质完成生理功能有着密切的关系，有时几个结构域共同完成一项生理功能，有时一个结构域就可以独立完成一项生理功能，但是一个结构不完整的蛋白质结构域是不可能产生生理功能的。因此蛋白质结构域是蛋白质生理功能的结构基础，但必须指出的是，虽然蛋白质结构域与蛋白质的功能关系密切，但是蛋白质结构域和功能域的概念并不相同。.
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细胞内受体
细胞内受体（Intracellular receptor）是指位于细胞膜内部的细胞质或细胞核中的受体，这类受体都为转录因子。因为其激素要穿越细胞膜才能进入细胞内与其结合，所以通常都为脂溶性激素如类固醇激素、甲状腺素等。.
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细胞凋亡
细胞凋亡（apoptosis，源自απόπτωσις，有堕落，死亡之意），為一種細胞程序性死亡。相对于细胞坏死（necrosis），细胞凋亡是细胞主动实施的。細胞凋亡一般由生理或病理性因素引起。而細胞壞死則主要為缺氧造成，两者可以很容易通过观察区分开来。在细胞凋亡过程中，细胞缩小，DNA被核酸内切酶降解成180bp-200bp片段屬於有層次之斷裂，（可以通过凝胶电泳证明），而细胞坏死时，细胞肿胀，细胞膜被破坏，通透性改变。细胞器散落到细胞间质，需要巨噬细胞去清除，结果是该局部组织发炎。相比起细胞坏死，细胞凋亡是更常见的细胞死亡形式。 细胞凋亡受到抑凋亡因子和促凋亡因子的调控。.
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细胞因子
细胞因子，也翻译为細胞激素（cytokine），是一组蛋白质及多肽，在生物中用作信号蛋白。这些类似激素或神经递质的蛋白用作细胞间沟通的信号。细胞因子多是水溶性蛋白和糖蛋白，分子量小（8-30千道耳顿）。 细胞因子可以由多种细胞释放，尤其重要的是在先天性免疫反应和适应性免疫反应。由于其免疫系统中的作用，细胞因子参与免疫性疾病、炎症及传染性疾病。不过，并非所有的功能仅限于免疫系统，细胞因子还涉及多个胚胎發育环节。 细胞因子是由多种细胞类型（如造血性和非造血细胞）产生。并能对邻近细胞或整个机体有作用。这些效应强烈依赖于其他化学因子和细胞因子的存在。.
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细胞核
细胞核（nucleus）是存在於真核細胞中的封閉式膜狀细胞器，內部含有細胞中大多數的遺傳物質，也就是DNA。這些DNA與多種蛋白質，如組織蛋白複合形成染色質。而染色質在細胞分裂時，會濃縮形成染色體，其中所含的所有基因合稱為核基因組。細胞核的作用，是維持基因的完整性，並藉由調節基因表現來影響細胞活動。 細胞核的主要構造為核膜，是一種將細胞核完全包覆的雙層膜，可使膜內物質與細胞質、以及具有細胞骨架功能的網狀結構核纖層分隔開來。由於多數分子無法直接穿透核膜，因此需要核孔作為物質的進出通道。這些孔洞可讓小分子與離子自由通透；而如蛋白質般較大的分子，則需要攜帶蛋白的幫助才能通過。核運輸是細胞中最重要的功能；基因表現與染色體的保存，皆有賴於核孔上所進行的輸送作用。 細胞核內不含有任何其他膜狀的結構，但也並非完全均勻，其中存在許多由特殊蛋白質、RNA以及DNA所複合而成的次核體。而其中受理解最透徹的是核仁，此結構主要參與核糖體的組成。核糖體在核仁中產出之後，會進入細胞質進行mRNA的轉譯。.
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缺氧誘導因子
缺氧誘導因子（Hypoxia-inducible factors，HIFs）是一種在細胞環境中的轉錄因子，因氧含量而產生不同反應的，主要是在氧氣減少或缺氧 的情況下活化。.
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生物
生物（拉丁语，德语: Organismus， ，又称有機體）是指稱類生命的个体。在生物学和生态学中， 地球上约有870萬種物種（±130萬），其中650萬種物種在陆地上，220万种生活在水中。 生物最重要和基本的特徵在生物會進行新陳代謝及遺傳兩點，前者說明所有生物一定會具備合成代谢以及分解代谢（兩個是完全相反的兩個生理反應過程），並且可以將遺傳物質複製，透過自我分裂生殖(無性生殖)或有性生殖，交由下一代繁殖下去以避免滅絕，这是類生命现象的基础。 生命的起源和生命各个分支之间的关系一直存在争议，古早的生命分類已經過時，近代古典生物學的分類又受到分子生物學的挑戰。一般而言，我們將生物分為兩大類：原核生物和真核生物。原核生物分为兩大域：细菌（Bacteria）和古菌（Archaea），这两个域相互之间的关系并不比他们和真核生物的关系更为接近。在演化史的研究上，原核生物和真核生物之间一直缺乏联系。類似麻煩的還有病毒與內共生細菌等的分類，隨著現代生物化學的研究逐漸深入，出現了有如物理學中存在量子現象一般，在特定微觀世界下許多傳統認知出現錯誤，導致以往常理被顛覆的情況。 真核生物的特徵是有細胞核以及其他膜狀細胞器（例如動物和植物體內的粒線體粒線體也可以說是植物動物體的發電廠因為他可以製造很多的能量，以及植物及藻類中的葉綠素），一種假說是叶绿体和线粒体是由内共生细菌（endosymbiotic bacteria）演化而来T.Cavalier-Smith (1987) The origin of eukaryote and archaebacterial cells, Annals of the New York Academy of Sciences 503, 17–54 。多细胞生物（又稱至於生物實在30班一年且出來則指包含多于一个细胞的生物，在地質學上直到五億年前才出現大爆發。.
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生物化学概述
生物化学 – 是对生物体体内化学过程的研究。旨在阐释所有生命体和生命活动的化学机理。.
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甲状腺激素
腺激素（thyroid hormones）是由甲状腺滤泡上皮细胞合成的酪氨酸碘化物。主要是四碘甲腺原氨酸（又名甲状腺素，缩写为T4）和三碘甲腺原氨酸（缩写为T3），此外，还有少量逆-三碘甲腺原氨酸（缩写为rT3）。注意，甲状腺分泌的激素除了甲状腺激素外，还有降钙素。由于降钙素是甲状腺滤泡旁细胞产生的，所以，不属于甲状腺激素的范畴。 T4和T3均有生理活性，区别在于作用时间和强度：T4活性低、起效较慢，但持续时间长；T3活性高、起效快，但持续时间短。体内研究显示，在细胞水平发挥生理作用的主要是T3；绝大多数T4需转化为T3之后才能发挥生理效应，从这个意义上讲，T4更像是一种前激素。 rT3没有明显的生理活性，因此，在多数语境下，“甲状腺激素”只是指T4和T3。 到目前为止，甲状腺激素是唯一一类含碘的生理物质。.
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癌基因
基因（Oncogene，亦称为致癌基因）是细胞遗传物质的一部分, 它们参与细胞从正常生长状态到肿瘤的过程。它们通过诱导或突变被激活。.
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癌变
变（carcinogenesis）通常用來形容正常细胞转变成癌细胞的致癌过程，是细胞DNA受损突变后发生在细胞及基因级别上的、从而导致细胞不受机体控制恶性增殖的一系列改变，最终引起恶性肿瘤的形成。癌变是个复杂、受到多种因素控制的多阶段演变过程，它也是个可逆转的细胞转化过程。细胞内基因的突变和肿瘤的发生与遗传，环境等多种因素有关。.
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癌症
症（英語：Cancer）又名為腫瘤（英語：Malignant tumor），指的是細胞不正常增生，且這些增生的細胞可能侵犯身體的其他部分；中医学中称岩，為由控制細胞分裂增殖机制失常而引起的疾病。癌细胞除了分裂失控外，还会週遭正常組織甚至經由体内循環系統或淋巴系統转移到身體其他部分。不是所有的腫瘤都會癌化，有些細胞增生不會侵犯身體其他部分，稱為良性腫瘤。癌症常見的徵象與症狀包括新發生的腫塊、異常的出血、慢性咳嗽、無法解釋的體重減輕、以及腸胃蠕動的改變等等，但其他疾病也可能會出現這些症狀，因此發現這些症狀並不一定表示得了癌症。在人類身上，目前已知的癌症超過一百種。 癌症有許多類型，因吸菸而罹癌者佔了癌症死者中的22%，肥胖、飲食不佳、運動不足、飲酒則共佔了10%。其他可能造成癌症的因素還包括某些感染、暴露於游離輻射、以及環境汙染因子。在發展中國家約有20%的癌症是由於感染症（如B型肝炎、C型肝炎、以及人類乳突病毒等）造成。致癌因子通常是透過改變細胞中的遺傳物質運作，通常許多這類遺傳物質的變化是癌症產生所必要的。約5-10%的癌症是由於遺傳自雙親的基因異常。癌症可以由症狀和徵候或透過的方式發現，然後再以影像檢查和切片檢查來確診。癌細胞持續生長而不受外在訊息調控，可能是原本正常的原癌基因被激活，将细胞引入到癌变状态，但主要还是因为一些与控制細胞分裂有关的蛋白质出现異常，如腫瘤抑制基因的功能失常。导致这种局面，可能是为该蛋白编码的DNA因突变而出现了损伤，轉译而出的蛋白质因此也出现错误。要將一個正常細胞轉化成一個惡性腫瘤細胞通常需要許多次突變，或是基因轉譯為蛋白質的过程受到干扰。引起基因突變的物质被稱為致癌物質，又以其造成基因損傷的方式可分為化學性致癌物與物理性致癌物。例如接觸放射性物質，或是一些環境因子，例如，香煙、輻射、酒精。还有一些病毒可將本身的基因插入細胞的基因裡，激活癌基因。但突变也会自然產生，所以即使避免接觸上述的致癌因子，仍然無法完全預防癌症的產生。发生在生殖细胞的突变有可能傳至下一代。 許多癌症都可以預防，預防的方式包括戒烟、不要攝取太多酒精、多吃蔬菜水果及類食品、減少紅肉與速食（包含）的攝取、維持健康體重、多運動、減少陽光曝曬、以及施打疫苗預防某些感染症等等。透過篩檢早期發現，對於部分的癌症（包括大腸直腸癌和子宮頸癌等）有用，但乳癌篩檢的價值則有爭議性。對癌症的治療方式通常結合化學療法、放射療法、手術以及標靶治療等。疼痛控制與症狀控制是癌症治療中重要的一環，而安寧緩和醫療對於癌症晚期的病人來說相當重要。癌症病人的存活率端看癌症的種類與開始治療時的疾病狀況。在已開發國家兒童癌症病人的五年存活率平均高達80%，在美國的成年癌症病人的平均五年存活率則有66%。而病症的嚴重程度取決於癌細胞所在部位以及惡性生長的程度。多數癌症根據其類型、所處的部位和發展的階段可以治療甚至治癒。一旦診斷確定，癌症通常以結合手術、化療和放射療法的方式進行治療。隨著科學研究的進步，開發出許多針對特定類型癌症的藥物，也增進治療上的效果。如果癌症未經治療，通常最終結果將導致死亡，也有出現因癌症未及時治療或是改用另類療法而延誤正規治療，因此影響病情的情形。 在2012年，大約有1,410萬人得到癌症，並且造成820萬人身亡（相當於全年總死亡人數的14.6%）。男性身上最常見的癌症包括肺癌、前列腺癌（攝護腺癌）、大腸直腸癌、以及胃癌；在女性身上最常見的則是乳癌、大腸直腸癌、肺癌和子宮頸癌。兒童以急性淋巴性白血病和腦瘤最常見，不過非洲除外，非何杰金氏淋巴瘤在那裡更常見。2012年，大約16.5萬個15歲以下的兒童被診斷出罹患癌症。各個年齡層的人都有可能產生癌症，由於DNA的損傷會隨著年齡而累積增加，罹癌的風險會隨著年齡的增長而升高，同時有數種癌症在已開發國家較常見。美国每年逝世的5个人当中有一人是因癌症致死，这一数字在世界范围则是100-350/100000。癌症在发达国家中已成為主要死亡原因之一，在台灣則是長年位居十大死因之首。隨著人類越來越長壽及開發中國家生活習慣的改變，全球的罹癌率整體而言在上升中。.
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Daf-16
DAF-16是人FOXO家族蛋白在线虫动物门（如秀麗隱桿線蟲）中的同源基因，在线虫的胰岛素样生长因子1受体同源基因daf-2产生延长寿命的突变后，DAF-16是被激活的主要的转录因子。.
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DNA结合位点
DNA结合位点（DNA binding sites）是存在于DNA上的与其它分子相绑定的各类结合位点。DNA结合位点与其它结合位点的区别在于：（1）它们是DNA序列（如一个基因组）中的一部分；（2）它们被DNA结合蛋白所绑定。DNA结合位点常常与一类被称为转录因子的特殊蛋白相联系起来，并因此联系到转录调控。针对特定的一个转录因子的DNA结合位点总和常被命名为该转录因子的顺反组。DNA结合位点也包括了其它蛋白的靶点，如限制性核酸内切酶、位点特异性重组酶（见位点专一重组）及甲基转移酶类。 因此，DNA结合位点可被定义为：特异性地被一种或多种DNA结合蛋白或蛋白复合物所结合的一段短DNA序列（典型的是4～30个碱基长，对重组位点来说则长达200bp）。.
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EGR4
早期生长反应蛋白4（Early growth response protein 4，EGR-4），也被称为AT133，是一个由人类基因EGR4编码的蛋白质。 EGR-4是一种锌指结构转录因子早期生长反应蛋白家族（EGF）的一员.
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EPAS1
内皮PAS结构域包含蛋白-1（Endothelial PAS domain-containing protein 1，缩写EPAS1，也被称为缺氧诱导因子-2α亚基，Hypoxia-inducible factor-2alpha，缩写HIF-2α）是一种由人类基因 EPAS1 所编码的蛋白质。.
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花
花是被子植物（被子植物门植物，又称有花植物或開花植物）的繁殖器官，其生物学功能的是结合雄性精细胞与雌性卵细胞以产生种子。这一进程始於传粉，然後是受精，从而形成种子并加以传播。对於高等植物而言，种子便是其下一代，而且是各物种在自然分布的主要手段。同一植物上着生的花的组合称为花序。 “花”在生活中亦常称为“花朵”或“花卉”。广义的花卉可指一切具有观赏价值的植物（或人工栽插的盆景），而狭义上则单指所有的開花植物。 花卉一直广受人们的喜爱和使用，主要用於觀賞，还能當食材或提煉原料。.
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花色素苷
花色素苷（Anthocyanin，简称花色苷）是花色素的糖苷衍生物的統稱，是一類常见的水溶性植物色素。視乎pH值，花色素苷顯紅、紫或藍色。花色素苷廣泛分佈在陸生植物，尤其是越橘屬和懸鉤子屬植物，在藍莓、紅莓、櫻桃、茄子、葡萄等食物含量豐富。花色素苷本身也是種經核准的食品添加劑。花色素苷有助植物對抗由非生物因素導致的活性氧類壓力，並為某些植物提供保護色。.
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芳香烃受体
芳香烃受体（Aryl hydrocarbon receptor，或称为芳烃受体或芳基烃受体，简称为AhR或AHR）是基本螺旋-环-螺旋转录因子家族中的一个成员。此受体的生理学配体未知，但他会结合一些例如天然植物黄酮类化合物、多酚类与吲哚类等外源配体，人造的多环芳烃以及二噁英样物质同样也是。AhR是一种通常情况下无活性而与一些共分子伴侣胞质溶胶结合的转录因子。一旦配体结合到例如2,3,7,8-四氯二苯二氧芑（TCDD）等化学物质上时，分子伴侣离解并导致AhR转移到细胞核中并与ARNT（芳香烃受体核转运体）二聚化，致使基因转录产生改变。.
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遗传学
遗传学是研究生物体的遗传和变异的科学，是生物学的一个重要分支Hartl D, Jones E (2005)。史前时期，人们就已经利用生物体的遗传特性通过选择育种来提高谷物和牲畜的产量。而现代遗传学，其目的是寻求了解遗传的整个过程的机制，则是开始于19世纪中期孟德尔的研究工作。虽然孟德尔并不知道遗传的物理基础，但他观察到了生物体的遗传特性，某些遗传单位遵守简单的统计学规律，这些遗传单位现在被称为基因。 基因位于DNA上，而DNA是由四类不同的核苷酸组成的链状分子，DNA上的核苷酸序列就是生物体的遗传信息。天然DNA以双链形式存在，两条链上的核苷酸互补，而每一条链都能够作为模板来合成新的互补链。这就是生成可以被遗传的基因的复制方式。 基因上的核苷酸序列可以被细胞翻译以合成蛋白质，蛋白质上的氨基酸序列就对应着基因上的核苷酸序列。这种对应性被称为遗传密码。蛋白质的氨基酸序列决定了它如何折叠成为一个三维结构，而蛋白质结构则与它所发挥的功能密不可分。蛋白质执行细胞中几乎所有的生物学进程来维持细胞的生存。DNA上的一个基因的改变可以改变其编码的蛋白质的氨基酸，并可能改变此蛋白质的结构和功能，进而对细胞甚至整个生物体造成巨大的影响。 虽然遗传学在决定生物体外形和行为的过程中扮演着重要的角色，但此过程是遗传学和生物体所经历的环境共同作用的结果。 例如，虽然基因能够在一定程度上决定一个人的体重，人在孩童时期的所经历的营养和健康状况也对他的体重有重大影响。.
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鍾邦柱
鍾邦柱，現任中研院分子生物所特聘研究員，第五屆台灣女科學家「傑出獎」得主。專長是類固醇功能與調控, 斑馬魚發育, 小鼠動物模式與基因調控。.
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顺反组
顺反组（cistrome）指的是“全基因组尺度下反式作用因子的顺式作用靶点的集合，也可以说是在体情况下转录因子结合位点或组蛋白修饰在全基因组上的位置”。“顺反组”这一术语是cistron（顺反子）和genome（基因组）的混成詞，最初由达纳-法伯癌症研究所和哈佛医学院的研究者命名。 染色质免疫沉淀等技术结合微阵列分析“ChIP-on-chip”或大规模并行DNA测序“ChIP-Seq”极大地方便了对转录因子及其它染色质相关蛋白的顺反组的定义。.
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袋状蛋白家族
袋状蛋白家族（Pocket protein family）是一个肿瘤抑制蛋白家族。这个名字来源于一个袋状结构域，以使他们能够结合自己的目标分子。 它们通过与E2F转录因子家族蛋白质的相互作用在细胞周期中起重要作用。 包括三种蛋白：.
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视网膜母细胞瘤蛋白
视网膜母细胞瘤蛋白（retinoblastoma protein，常缩写为Rb、RB或RB1）又译为成视网膜细胞瘤蛋白是一种抑癌蛋白，并在几种主要的癌症发生时失活。Rb的功能之一是通过抑制细胞周期进程直到细胞准备妥当来防止细胞过度生长。当细胞准备好要分裂时，Rb蛋白会被磷酸化为pRb而失去抑制活性，从而使细胞周期进行下去。 Rb是袋状蛋白家族的一员，其特点是有一个口袋状的结构用以结合其它蛋白。使得一些致癌变蛋白，比如高危险群人类乳突病毒所感染的细胞产生的蛋白，结合并抑制pRb，最终导致癌症。.
調控序列
調控序列（英語：Regulatory sequence，又譯調節序列）是DNA中一段包含啟動子、強化子，以及其他可與調節蛋白，如轉錄因子結合的位置。這些序列調控了基因的表現，進而影響蛋白質的生產。 除此之外，mRNA也有調控序列，可與RNA結合蛋白或其他RNA結合。.
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记忆T细胞
2.其中大部分T细胞分化为效应T细胞（E）并产生细胞因子（辅助型T细胞）或杀死细胞（细胞毒T细胞）3.剩下的一部分将成为记忆T细胞（M）进入休眠态，并将在体内长期存活直至再次被相同抗原激活。--> 记忆T细胞是T淋巴细胞的一个子类，该种细胞曾经遇到过某种特定抗原且产生过反应。这些细胞可以识别外来入侵物，比如细菌、病毒、癌细胞等。记忆T细胞的形成通常是因为曾受特定抗原的感染、经历癌症或接种疫苗。当同一个抗原再次进入人体时，记忆T细胞可以更快地产生比首次接触此抗原更强烈的免疫反应。这一行为被用于T细胞增殖化验来验证曾经是否接触过某种抗原。.
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诱导性多能干细胞
诱导性多能干细胞（Induced pluripotent stem cell），又稱人工誘導多能幹細胞，常簡稱爲iPS細胞（iPSC），是一種由哺乳動物成體細胞經轉入轉錄因子等手段脫分化形成的多能幹細胞，最早由日本學者山中伸彌的研究團隊於2006年發現。山中伸彌團隊在發表iPS誘導技術時使用實驗材料爲小鼠細胞。2007年，研究人員又證明iPS誘導技術可以應用於人體細胞。最初由山中伸彌團隊發現的誘導方法是通過慢病毒載體將Oct4、Sox2、c-Myc、四種轉錄因子基因轉入成體細胞將其轉化爲類似於胚胎幹細胞的多能幹細胞。其後，研究人員又先後發現了更優化的誘導方法，如使用質粒載體轉染、腺病毒感染、脂質體導入等非基因組整合的方法進行誘導、通過細胞融合誘導、使用小分子藥物進行誘導、轉入miRNA（微干擾RNA）進行誘導等。 iPS細胞與胚胎幹細胞擁有相似的再生能力，理論上可以分化爲成體的所有器官、組織。而相比胚胎幹細胞，iPS細胞面臨的倫理道德爭議較小，且應用該技術可以產生基因型與移植受體完全相同的幹細胞，規避了排異反應的風險，因而iPS細胞在一定程度上衝擊了胚胎幹細胞在再生醫學中的地位，被認爲在再生醫學及組織工程方面擁有較爲廣闊的應用前景，有望爲治癒糖尿病、關節炎等疾病提供新的思路。同時，iPS細胞在新藥開發、疾病模型構建領域也有望得到應用。但iPS誘導技術同樣面臨着誘導效率低、用於治療可能存在長期風險等挑戰。 iPS技術的發明人山中伸彌於2012年與核移植及克隆技術研究的先驅者約翰·格登爵士一同獲諾貝爾生理醫學獎。.
识别序列
识别序列（recognition sequence），有时也被称为识别位点（recognition site）of any DNA-binding protein motif that exhibits binding specificity, refers to the 核酸序列 (or subset thereof), to which the domain is specific.
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谷口維紹
谷口維紹（，），日本免疫學家、腫瘤學家、分子生物學家，美國國家科學院外籍院士。現任東京大學特任教授、紐約大學醫學院兼任教授。文化功勞者。 谷口教授是干擾素與的先驅，曾獲得德國醫學最高獎羅伯·柯霍獎的「科霍獎」，也是國際期刊《美国国家科学院院刊》、《eLife》、《Immunity (journal)》的編輯.
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輔助型T細胞
辅助T细胞（T helper cells，Th）是一种T细胞（白细胞的一种），它的表面有抗原受体，可以辨識抗原提呈細胞的MHC - II 类分子呈獻的抗原片段。 一旦受到抗原刺激，Th细胞就增殖和分化成作用性Th细胞（effector Th）和记忆Th（memory Th）细胞。.
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转录
转录（）是遗传信息由DNA转换到RNA的过程。作为蛋白质生物合成的第一步，转录是mRNA以及非編碼RNA（tRNA、rRNA等）的合成步骤。 转录中，一段基因会被读取、複製为mRNA；就是说一特定的DNA片段作为模板，以DNA依赖的核糖核酸聚合酶（RNA聚合酶或RNA合成酶）作为催化剂而合成前mRNA的过程。 转录尚有未清楚的部分，例如是否需要DNA解旋酶，一般来说是需要的，但某些地区称RNA聚合酶可代替其行使识别DNA上的有关碱基以开始转录的功能。 mRNA转录时，DNA分子双链打开，在RNA聚合酶的作用下，游离的4种核糖核苷酸按照碱基互补配对原则结合到DNA单链上，并在RNA聚合酶的作用下形成单链mRNA分子。至此，转录完成。 转录通常是多起点多向复制。 转录时所转录的仅为DNA上有遗传效应的片段（DNA），不包括内含子。 转录按以下一般步骤进行：.
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过氧化物酶体增殖物活化受体
過氧化物酶體增殖物活化受體 或稱為 脂小體增生活化受體（Peroxisome proliferator-activated receptor，PPAR）在分子生物學的領域裡，是一組核受體蛋白 ，具有轉錄因子的功能，以調控基因表達。這組核受體蛋白對高等生物的細胞分化、發育與新陳代謝（、、）及癌变的發生有着關鍵的作用，能夠控制环境与饮食刺激。其中受体α主要参与肝细胞的氧化过程。受体δ则参与了脂肪细胞的分解过程，受体γ与脂肪细胞的生成过程有关，这两个受体被认为与肥胖有关。本类受体只有與（RXR）结合后才会发生作用。.
阿司匹林
阿司匹林或译作--、--、--（Aspirin），也称乙酰水杨酸（acetylsalicylic acid），是水杨酸类药物，通常用作止痛剂、和消炎药，亦能用於治療某些特定的發炎性疾病，例如川崎氏病、心包炎，以及風溼熱等等。心肌梗塞後馬上給藥能降低死亡的風險。本品也能防止血小板在血管破损处凝集，有抗凝作用。高心血管風險患者长期低剂量服用可预防心脏病、中风与血栓。该药还可有效预防特定幾种癌症，特别是直肠癌。。對於止痛及發燒而言，藥效一般會於30分鐘內發揮。阿司匹林是一种非甾体抗炎药（NSAID），在抗發炎的角色上與其他NSAID類似，但阿斯匹靈還具有抗血小板凝集的效果。 阿司匹林的其中一個常見的副作用是會引起胃部不適。更嚴重的副作用則包含胃潰瘍、等等，也可能會使氣喘惡化。其中年長者、酗酒者，以及還有服用其他非甾体抗炎药或抗凝剂者，出血風險更高，妊娠後期也不建議用藥。有感染的孩童不建議用藥，因为这会增加患瑞氏综合征的风险。。高劑量者可能會引起耳鸣。 虽然它们都有名为水杨酸的类似结构，作用相似（解热、消炎、镇痛），抑制的环氧化酶（COX）也相同，但阿司匹林的不同之处在于其抑制作用不可逆，而且对环氧化酶-1（COX-1）的抑制作用比对环氧化酶-2的（COX-2）更强。 阿司匹林衍生自柳树皮中发现的化学物质。早在2400年前柳树皮就用来治病，希波克拉底就用它来治头痛。1763年，在牛津大学的沃德姆学院，首次从柳树皮中发现了阿司匹林的有效成分水杨酸。1853年，化學家將水杨酸钠以乙酰氯處理，首次合成出乙醯水楊酸。此後五十年，化學家們逐步提升生產的效率。1897年，德国拜耳開始研究乙醯水楊酸的醫療用途，以代替高刺激性的水楊酸類藥物。到1899年，拜耳以阿司匹林（Aspirin）為商標，將本品銷售至全球。此後五十年，阿斯匹靈躍升成為使用最廣泛的藥物之一。目前，拜耳公司在很多國家對於「阿司匹靈」一名的專利權已經過期，或是已經賣給其他公司。 本品是当今世界上应用最广泛的药物之一，每年的消费量约40,000公噸（約500至1200億錠）。本品列名於世界卫生组织基本药物标准清单之中，為基礎公衛體系必備藥物之一。，每劑在发展中国家的批發價約介於0.002至0.025美元之間。，每月劑量在美國的價格低於25.00美金。本品目前屬於通用名药物。.
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钙离子/钙调素依赖性蛋白激酶
钙离子／钙调素依赖的蛋白激酶或钙调蛋白激酶（英文：Ca2+/calmodulin-dependent protein kinases or CaM kinases ）是一种丝氨酸／苏氨酸特性的蛋白激酶，被钙／钙调蛋白复合物所调节。这个种系的蛋白在活化時表現出一種记忆效应。.
肝X受体
肝X受体（liver X receptor）是核受体超家族转录因子的一员，属于类甲状腺素受体的第一亚家族，同过氧化物酶体增殖物活化受体、类法尼醇x受体、视黄醇X受体有密切的联系。肝X受体的激素为氧化固醇，是胆固醇代谢的感受器。同时它还在脂肪形成、糖代谢、免疫与炎症反应等环节起到调节作用。 肝X受体有两个亚型被分辨出来，分别是肝X受体α与肝X受体β，根据核受体命名规则这两个亚型分别被命名为NR1H3（LXRα）与NR1H2（LXRβ）。肝X受体的两个亚型在1994、1995年间先后被分离出来。肝X受体α是由两个研究小组独立发现的，他们分别授予其RLD-1与LXR的名称。这两个亚型核受体结构相同，DNA结合域与配体结合域中有77%的氨基酸序列保持一致。肝X受体α主要在肝脏组织细胞中表达，胰脏、脾脏与小肠中也有所发现，而肝X受体β则可在全身各处细胞中检测到。.
查看 转录因子和肝X受体
锌
锌（zinc）是一种化学元素，它的化学符号是Zn，它的原子序数是30，相对原子质量是65.39，是一种浅灰色的过渡金属；鋅由於形、色類似鉛，故也稱為亞鉛，古稱倭鉛。 外觀呈現銀白色，主要用途為鍍鋅，在現代工業中對於電池製造上有不可磨滅的地位，最具代表性之用途為「鍍鋅鐵板」，該技術被廣泛用於汽車、電力、電子及建築等各種產業中，於生活中相當重要的金屬。.
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锌指蛋白
锌指蛋白（zinc finger protein)是哺乳动物细胞内含量最丰富的蛋白质模体(motif)，是各种特异性DNA结合蛋白质中最大的一个类别。具统计大约有2%的人类基因(700至900个)编码锌指蛋白。这些锌指蛋白与真核基因的表达调控密切相关。锌指蛋白最早由诺贝尔奖获得者Klug和同事在爪蟾转录因子IIIA (TFIIIA)蛋白质中首先发现的。.
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锌指核酸酶
锌指核酸酶（Zinc-finger nucleases, ZFNs），是人工改造的限制酶，通过融合锌指结构的结合DNA结构域和分解DNA结构域而成。可通过基因工程改造锌指结构域使锌指核酸酶针对复杂基因组里的特定DNA顺序。借助内源DNA的修复机制，锌指核酸酶可以精确改变高等动物的基因组。.
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脱氧核糖核酸
--氧核醣核酸（deoxyribonucleic acid，縮寫：DNA）又稱--氧核醣核酸，是一種生物大分子，可組成遺傳指令，引導生物發育與生命機能運作。主要功能是資訊儲存，可比喻為「藍圖」或「配方」。其中包含的指令，是建構細胞內其他的化合物，如蛋白質與核醣核酸所需。帶有蛋白質編碼的DNA片段稱為基因。其他的DNA序列，有些直接以本身構造發揮作用，有些則參與調控遺傳訊息的表現。 DNA是一種長鏈聚合物，組成單位稱為核苷酸，而糖類與磷酸藉由酯鍵相連，組成其長鏈骨架。每個糖單位都與四種鹼基裡的其中一種相接，這些鹼基沿著DNA長鏈所排列而成的序列，可組成遺傳密碼，是蛋白質氨基酸序列合成的依據。讀取密碼的過程稱為轉錄，是根據DNA序列複製出一段稱為RNA的核酸分子。多數RNA帶有合成蛋白質的訊息，另有一些本身就擁有特殊功能，例如核糖體RNA、小核RNA與小干擾RNA。 在細胞內，DNA能組織成染色體結構，整組染色體則統稱為基因組。染色體在細胞分裂之前會先行複製，此過程稱為DNA複製。對真核生物，如動物、植物及真菌而言，染色體是存放於細胞核內；對於原核生物而言，如細菌，則是存放在細胞質中的拟核裡。染色體上的染色質蛋白，如組織蛋白，能夠將DNA組織並壓縮，以幫助DNA與其他蛋白質進行交互作用，進而調節基因的轉錄。.
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自體免疫調節因子
自體免疫調節因子（Autoimmune regulator）是人體內由AIRE基因表現的蛋白質。AIRE是在胸腺髓質表現的轉錄因子，使人體不會被自身的免疫系統攻擊。 每個T細胞都會辨識由抗原呈現細胞上MHC分子複合體呈現的特定抗原，这一识别需要T細胞表面的T細胞受体。T細胞受体由VDJ重組片段所製造，所以T細胞多樣性很高，而每個T細胞都有專一性。接著，會辨識自身蛋白質的T細胞受器必須在還在胸腺內時消除。透過AIRE作用，胸腺髓質上皮細胞（mTEC）會表現身體其他各個地方的主要蛋白質（所謂的 TRA），而且將會和這些蛋白質反應的T細胞透過細胞程序性死亡（细胞凋亡）的方式消除。因此AIRE針對自體辨識的T細胞進行。當AIRE受損時，會辨識人體自身抗原的T細胞會離開胸腺，進入血液循環，並可能導致許多的自體免疫疾病。.
金属蛋白
金属蛋白（Metalloprotein）是一类含有配位结合的金属离子作为辅因子的结合蛋白质。所有蛋白质中有大量是属于这一类。.
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長期增強作用
長期增強作用（Long-term potentiation，LTP）又稱长时程增强作用、長期增益效應，是由于同步刺激两个神经元而发生在两个神经元信号传输中的一种持久的增强现象。这是与突触可塑性——突触改变强度的能力相关的几种现象之一。由于记忆被认为是由突触强度的改变来编码的，LTP被普遍视为构成学习与记忆基础的主要分子机制之一。 LTP是1966年泰耶·勒莫在兔海马体中发现的，一直以来是研究的热门主题。许多现代的LTP研究试图更好地了解其生物学基本原理，而其他一些研究则以探索LTP和行为学习之间的因果关系为目标。还有一些则试图开发通过提高LTP改善学习和记忆的方法，不管是采用药物手段还是其他手段。LTP还是临床研究的主题，比如在阿兹海默病和领域。.
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酵母菌雙雜合系統
酵母菌雙雜合系統，英文為Yeast two-hybrid system，亦簡稱Two-hybrid screening，是一種研究蛋白質交互作用 或蛋白質和DNA交互作用 的實驗技術。 此系統的基本原理是報導基因上游的啟動區域與轉錄因子結合後，使下游的報導基因表現。在酵母菌雙雜合系統中將轉錄因子設計為結合區(Binding domain, BD)和活化區(Active domain, AD)，結合區可與基因上游的啟動區域結合，活化區負責活動下游報導基因開始轉錄。.
色素細胞
色素細胞，有時稱為色素體，是两栖动物、鱼类、爬行动物、甲壳动物、头足纲动物中的一種含有生物色素的細胞。色素細胞是由胚胎中的神经嵴發展而來，對於產生皮膚色彩和眼睛色彩扮演重要角色。色素細胞依據白光下所呈现的颜色，可以分为黃色素細胞、紅色素細胞、彩虹色素細胞、白色素細胞、黑色素細胞與藍色素細胞。 有些物種的色素細胞，能夠透过色素位置的改變，以及反光结构方向的重新定位，达到快速改变色彩的目的。不同物种有不同的改变色彩方法，例如屬於頭足類的章魚，是利用肌肉來控制结构复杂的色素細胞器官；而屬於脊椎動物的變色龍，則利用細胞信號达到變色的目的。与變溫動物不同，恆溫動物中的鸟类和哺乳類只擁有一種類似色素细胞的黑素细胞，而變溫動物身上與其作用相当的「载黑素细胞」，被科学家作為研究人类疾病以及开发药物的一种工具。.
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苯丙胺
安非他命（英文名稱：Amphetamine为一种中樞神經刺激劑，用來治療注意力不足過動症、嗜睡症、和肥胖症。“Amphetamine”一名擷取自。 安非他命是在西元1887年發現的，以兩種對映異構體的形式存在 ，分別是左旋安非他命和右旋安非他命。 准确来说，安非他命指的是特定的化學物質-外消旋，這個物質等同於安非他命的的兩個對映異構體：左旋安非他命和右旋安非他命的等比化合物之純胺類型態。 然而，實際上安非他命一詞已被廣泛的用來表示任何由安非他命對映異構體構成的物質或安非他命對映異構體本身。 安非他命是一种中樞神經興奮劑，適度適量地使用能提升整體抑制控制能力。在醫療用的劑量範圍內，安非他命能帶來情緒以及執行功能的變化，例如：欣快感的增强、性欲的改變、清醒度的提升、大腦執行功能的進化。安非他命所改變的生理反應包含：減少反應時間、降低疲勞、以及肌耐力的增強。然而，若攝取劑量远超过醫療用的劑量範圍，將會導致大腦執行功能受損以及橫紋肌溶解症。 攝取過份超越醫療用劑量範圍的安非他命可引发嚴重的藥物成癮。然而長期攝取醫療劑量範圍的安非他命並不會產生上癮的風險。 此外，服用远超醫療用劑量範圍的安非他命會引起精神疾病（例如：妄想、偏執）。然而長期攝取醫療劑量範圍的安非他命並不會引起上述疾病。 那些为享乐而摄入的安非他命通常会遠超過醫療用劑量範圍，且伴隨著非常嚴重甚至致命的副作用。 历史上，安非他命也曾被用來治療鼻塞和抑鬱。 安非他命也被用來、促進大腦的認知功能及在助興時（非醫療用途情況下）被作為增強性慾和欣快感促進劑。 安非他命在許多國家為合法的處方藥。然而，私自散布和囤積安非他命被視為非法行為，因為安非他命被用於非醫療用途的助興可能性極高。 首個藥用安非他命的藥品名稱為Benzedrine。當今以下列幾種形式存在：外消旋安非他命、阿得拉尔 、右旋安非他命，或對人體無藥效的前驅藥物甲磺酸赖氨酸安非他命。 安非他命藉著自身作用於兒茶酚胺神經傳導元素：正腎上腺素及多巴胺的特點來活化 ，進而增加单胺类神经递质和神经递质在腦內的活動。 安非他命屬於類的物質。由安非他命衍伸出的物質被歸納在的分類中，比如說：安非他酮、 、 MDMA、 和 甲基苯丙胺。安非他命也與人體內可自然生成的兩個屬於痕量胺的神經傳導物質——特別是苯乙胺和 ——有關。 Phenethylamine 是安非他命的原始化合物，而則是安非他命的位置異構體（只有在甲基族中才會區分出此位置異構體）。.
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雄激素受体
素受体（androgen receptor，简称为AR），亦被称为NR3C4（核受体亚家族3，家族C，成员4）是一类核受体，当雄性激素睾酮或二氢睾酮在细胞质中与之结合后会使之激活继而转运进核内。雄激素受体与孕酮受体之间的关系很密切，高剂量的黄体制剂可阻断雄激素受体。 雄激素受体的主要功能是作为调控基因表达的一种结合DNA的转录因子；然而雄激素受体也有其它方面的功能。受雄激素调控的基因在男性性表型的发育及维持中起到重要作用。.
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蛋白二聚体
在生物化學中，雙聚體為由兩個分子組合而成的高分子配合物，常以非共價鍵鍵結。像是蛋白質或是核酸皆為高分子。是一種蛋白質四級結構。 同源雙聚體，可由兩個相同的分子組合而成(此過程稱為同源二聚作用 homodimerization)。而異源二聚體則是由兩種不同的高分子所形成(稱為異源二聚作用heterodimerization) 生物化學中的大部分雙聚體皆不是用共價鍵相連結的。例如: 反轉錄酶為一種非共價鍵連接的異源二聚體酵素，是由兩種不同的胺基酸鏈連結的。另一個例外為雙聚體蛋白NEMO，由雙硫鍵連結的雙聚體。 有些蛋白會包含特殊的區域，確保二聚作用(二聚區域)的形成。.
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蛋白质列表
关于蛋白质（包括蛋白质复合物）的列表。此表旨在编理蛋白质界的相关信息。 除了标示有“*”的蛋白质，其余的蛋白质均存在于人类蛋白质组中。 若某一蛋白质拥有EC编号，那么该蛋白质已列入酶列表中，所以本页不再收入（不论该蛋白质是否属于以下某个分类）。 更多关于蛋白质的分类的资料，见蛋白质分类列表。.
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蛋白酶体
蛋白酶体（Proteasomes）是一种巨型筒状蛋白质复合物，主要作用是通过打断肽键来实现降解细胞不需要的或受到损伤的蛋白质。 目前所有已知的真核生物和古菌皆有蛋白酶體，在一些原核生物中也存在。在真核生物中，它位于细胞核和细胞质中。能够发挥这一作用的酶被称为蛋白酶。蛋白酶体是细胞用来调控特定蛋白质的浓度和除去错误折叠蛋白质的主要机制。经过蛋白酶体的降解，蛋白质被切割为约7-8个氨基酸长的肽段；这些肽段可以被进一步降解为单个氨基酸分子，然后被用于合成新的蛋白质Lodish, H, Berk A, Matsudaira P, Kaiser CA, Krieger M, Scott MP, Zipursky SL, Darnell J.
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陰蒂
蒂（clitoris，又稱陰核），是一個位於哺乳類和鸵鸟等动物身上的雌性性器官。人类陰蒂的肉眼可見部分（陰蒂頭）形似按钮，且位於小陰唇前方會合處附近、尿道口之上。陰蒂不像同源的阴茎般包含用以排尿的尿道末端構造，且其一般沒有生殖上的功能；不過少數動物能透過陰蒂排尿或輔助生殖——斑點鬣狗便是其中之一，其陰蒂相對較大，且能透過其來排尿、交配和分娩。像狐猴和蜘蛛猴般的哺乳動物的陰蒂亦相對較大。 陰蒂是女性最為敏感的性部位，且在解剖學的角度而言其是女性性快感的最主要來源，對於人类等哺乳類動物而言，它是從胚胎的生殖结节發展而成的，該結節最終發展成陰莖還是陰蒂則取決於「存在與否」這點，睾丸决定因子是一種由Y染色體上的基因獨立編碼的蛋白質。陰蒂的結構複雜，且其大小和敏感度可能因人而異。女性陰蒂的頂端（陰蒂頭）形狀尺寸大致如同豌豆，並已有估計指其擁有超過8000條的感覺神經末梢。 在性學、心理學和醫學上，陰蒂仍是某些爭議的核心；它亦是部分社会建构主义研究和分析的核心議題 。該些探討主題包括陰蒂的生理结構、性別不平等現象、残割女性生殖器，以及G點是否只是陰蒂的延伸。儘管人類陰蒂唯一已知的用途就是提供性快感，但研究者之間仍對其在生殖上所發揮的作用，以及「其是一種痕跡器官還是適應的產物」这些問題存有爭議。不同社会對陰蒂的认知存有差異，差異點包括陰蒂對女性性快感的重要性、人們對陰蒂理想尺寸和深度的假定，以及對阴蒂整形術的看法（其包括阴蒂增大术、陰蒂穿洞、阴蒂切除術）。女性會因美觀、健康以及文化等理由而進行陰蒂整形術。 文化觀念會顯著影響社會對陰蒂的認識。研究指出，對其存在的了解和解剖學知識明顯較其他性器官為少；此外，在教育中多教授關於陰蒂的知識能有助減輕針對女性身體和性快感的社會污名，因為這能化解「陰蒂与女陰在外观上不讨喜」、「女性一旦自慰便會犯禁」以及「男人应要掌握和控制让女性高潮的技巧」等固有觀念。.
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FOSB
FBJ murine osteosarcoma viral oncogene homolog B,又名為FOSB 或 FosB，是一個在人體中由FOSB 基因編碼（encoded）的蛋白質。 FOS 基因家族由四個成員組成：、 FOSB、 、和。 這些基因組成（encode） 亮氨酸拉链（leucine zipper）蛋白質。這種蛋白質可以與 這個蛋白質及其家族 (e.g., 、) 二聚體化（dimerize），然後形成转录因子（transcription factor）綜合區－AP-1转录因子。 如同這些，FOS蛋白質就被表示成關於細胞增加、細胞差異化、細胞轉型的調節者。 FosB与其選擇性剪接形成的产物——“ΔFosB”和进一步剪接而成的“'Δ2ΔFosB”都参与到了的过程之中，但 Δ2ΔFosB 没有已知的，无法通过AP-1 复合物影响转录过程。.
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FOXM1
FOXM1(Forkhead box protein M1)是一种转录因子蛋白质，有关调节细胞周期的重要作用。当FOXM1从小鼠中去除后，幼鼠在出生后不久因心臟衰竭而死亡，由于心肌细胞和肝细胞多倍体的发展。研究显示了FOXM1对染色体偏析和基因组稳定性有重大作用。FOXM1因子失调表达了会造成异常的细胞增殖，导致引发癌症。.
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G2期
G2 期是间期的第三个也是最后一个阶段。细胞在S期完成了DNA复制后进入G2期，G2期结束后，前期随即开始，染色质凝聚为染色体，核膜也开始解体。.
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JAK激酶
JAK激酶（Janus kinase，缩写JAK）是一个细胞内非受体酪氨酸激酶家族，介导细胞因子产生的信号，并通过JAK-STAT信号通路传递下去。它们最初被命名为"just another kinase"1和2（因为这只是基于PCR的筛选发现的大量激酶中的两个）但最后发表为“Janus kinase”。“Janus”这个名字起自罗马神话中代表开始与结束的两面神雅努斯，因为JAK激酶具有两个几乎一样的转移磷酸基团的结构域。其中一个结构域表现出激酶活性，而另一个结构域调控第一个激酶的活性。.
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MKL1
MKL/megakaryoblastic leukemia 1（巨核细胞白血病）是一种由人类基因 MKL1 编码的蛋白质。 此基因编码的蛋白能与转录因子心肌素（myocardin，一种调控平滑肌细胞分化的关键转录因子）相互作用。此蛋白主要存在于细胞核中，帮助信号从细胞质到细胞核的转导。在一个特异的染色体易位中，此基因会与1号染色体上的RNA结合基序蛋白15基因融合，这一易位与急性巨核细胞白血病相关。.
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NEUROD1
NEUROD1，（小鼠的同源蛋白質記爲NeuroD1）在人體內是NeuroD蛋白家族下的一個轉錄因子，由NEUROD1基因編碼。NEUROD1在神經系統發育中扮演重要角色，於發育中參與調控多種神經系細胞的分化過程。 證據表明NEUROD1與II型糖尿病的發生關係密切。一項研究表明在小鼠大腦內過表達NEUROD1可使神經膠質細胞轉分化爲神經元。.
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Peak calling
Peak calling是一种用于鉴定经染色质免疫沉淀-测序或MeDIP-测序实验后所得到的比对读段富集在基因组哪些区域中的一种计算方法。当免疫沉淀的蛋白质是一种转录因子时，那么DNA的富集区域就是这种它的转录因子结合位点（TFBS）。主流的Peak calling软件有MACS等。 Peak calling可应用于转录组/外显组测序，亦可用于对MeRIP-测序或m6A-测序的RNA表观基因组测序数据进行分析；利用如exomePeak等的软件程序，可检测出转录后RNA修饰位点。.
PITX2
PITX2（Paired-like homeodomain transcription factor 2（類成對同源框轉錄因子2）/pituitary homeobox 2（垂體同源框2））是一個位於人第四號染色體上的基因，由其編碼的蛋白為PITX2。.
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RAR相关孤儿受体
RAR相关孤儿受体（RAR-related orphan receptor，RORs）是核受体的一个家族，是细胞内转录因子的一员。有三个ROR家族成员：ROR-α、-β和-γ分别由基因、、编码。RORs的不寻常之处在于它们是以单体形式结合到上的，而其它大部分核受体都是以二聚体形式发挥作用。.
RNA聚合酶
RNA聚合酶（RNA polymerase、RNAP、RNApol、DNA-dependent RNA polymerase，EC2.7.7.6）或稱核糖核酸聚合酶，是一種負責從DNA或RNA模板製造RNA的酶。RNA聚合酶是通過稱為轉錄的過程來建立RNA鏈，以完成這個工程。在科學上，RNA聚合酶是一個在RNA轉錄本3'端聚合核糖核甘酸的核苷轉移酶。RNA聚合酶是一種非常重要的酶，且可在所有生物、細胞及多種病毒中可見。 RNA聚合酶是於1960年分別由山姆·懷斯及霍維茲同時發現。但在此之前，於1959年，諾貝爾獎頒發給了塞韋羅·奧喬亞，因為他的發現當時認為是RNA聚合酶，但其實是核糖核酸酶。.
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RNA聚合酶Ⅱ
RNA聚合酶Ⅱ（RNA polymerase II，亦被称为RNAPⅡ或PolⅡ）是一个存在于真核生物细胞中的酶。它催化脱氧核糖核酸转录，合成mRNA及大多数snRNA和微RNA的前体。RNA聚合酶Ⅱ是含12个亚基的550kDa大的复合物，也是RNA聚合酶中被研究得最多的一类。在它结合到基因上游的启动子并开始转录前需要大量转录因子。.
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Sox2
SRY盒-2（SRY：性別決定區，Sex Determining Region Y），又稱「Sox2」（人的Sox2應寫爲SOX2），是一種對未分化的胚胎幹細胞（ESC）、神經幹細胞等再生能力以及多能性維持至關重要轉錄因子。對Sox2的研究對幹細胞生物學、再生醫學的發展有重要意義。 Sox2隸屬於Sox轉錄因子家族。Sox轉錄因子家族在哺乳動物的發育過程中扮演重要角色。該家族的蛋白質都有一個保守的DNA結合結構域，長約80個氨基酸殘基，稱爲（High-mobility group，高遷移律組）盒結構域。.
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STAT1
STAT1是转录因子中信号转导及转录激活蛋白（STAT蛋白）家族的一员。STAT1涉及I型、II型或III型干扰素激活基因的正调控。在干扰素-γ刺激下，STAT1会组成同源二聚体或与STAT3组成异二聚体结合到GAS（Interferon-Gamma-Activated Sequence，干扰素γ激活序列）启动子上；而在干扰素-α或干扰素-β刺激下，STAT1会与STAT2组成异二聚体结合到ISRE（Interferon-Stimulated Response Element，干扰素激活反应元件）启动子上。在这两种情况下，STAT二聚体与启动子的结合都会导致ISG（Interferon-Stimulated Genes，干扰素激活基因）的表达。 Expression of STAT1 can be induced with diallyl disulfide, a compound in garlic.
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STAT3
信号转导及转录激活蛋白3（Signal transducer and activator of transcription 3，STAT3）是一种由人类基因STAT3 编码的转录因子。.
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STAT4
STAT4是转录因子中信号转导及转录激活蛋白（STAT蛋白）家族的一员。 It is required for the development of Th1 cells from naive CD4+ T cells and IFN-γ production in response to IL-12.
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STAT6
信号转导及转录激活蛋白6（Signal transducer and activator of transcription 6，STAT6）是一种由人类基因STAT6 编码的转录因子。.
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TATA盒
TATA盒（英語：TATA box）又稱高得堡-哈葛尼斯箱（英語：Goldberg-Hogness box），是一段DNA序列，位於真核生物和古細菌的轉錄啟動子上，大約位在轉錄起始點上游第25個鹼基對。TATA盒是RNA聚合酶II結合的位置。原核生物的細胞中也有相似的序列，稱為普里布諾盒（Pribnow box）。 TATA盒在轉錄的過程中，時常和一種TATA结合蛋白（TATA binding protein，TBP）結合，TBP負責把DNA雙螺旋鬆開；由於TATA盒富含T和A，使得這個過程較為容易（A、T之間只有2條氫鍵）。 在RNA聚合酶II接上之前，轉錄因子IID（TFIID）率先接上TATA盒，隨後TFIIA、TFIIB、TFIIF、TFIIE、TFIIH等轉錄因子也分別接到TFIID結合位的上下游，形成一團複合物。最後，RNA聚合酶II辨認出轉錄因子的複合物，並附著上去開始轉錄。 Category:基因表現.
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T细胞受体
T细胞受体（T cell receptor, TCR）是T细胞表面的特异性受体，负责识别由主要组织相容性复合体（MHC）所呈递的抗原，与B细胞受体不同，并不能识别游离的抗原。通常情况下，T细胞受体与抗原间拥有较低的亲和力，因而同一抗原可能被不同的T细胞受体所识别，某一受体也可能识别许多种抗原。 T细胞受体是异源二聚体，由两个不同的亚基所构成。95%的T细胞的受体由α亚基和β亚基构成，另外5%的受体由γ亚基和δ亚基构成。这个比例会因为个体发育或是疾病而变化。 T细胞受体与MHC所呈递的多肽的特异性结合会引发一系列生化反应，并通过众多的辅助受体、酶和转录因子激活T细胞，促进其分裂与分化。.
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Wnt信号通路
Wnt'''信号通路'''是一个复杂的蛋白质作用网络，其功能最常见于胚胎發育和癌症，但也参与成年动物的正常生理过程D.
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ZEB1
锌指结构E-box-结合同源框1（Zinc finger E-box-binding homeobox 1）是一个由人类基因ZEB1编码的蛋白质。 ZEB1（以前称为TCF8）编码一种带有锌指结构域和同源框结构域的转录因子，结合位点为白细胞介素-2基因转录起始位点上游100个bp处，通过负调控来抑制白介2的表达。。ZEB1和其哺乳动物中的旁系同源蛋白ZEB2都属于同源框转录因子家族中的锌指结构家族中的Zeb家族。ZEB1蛋白质有7个锌指结构和1个同源框结构，见右侧图。.
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染色体构象捕获
染色体构象捕获（Chromosome conformation capture，简称为3C）是一种用于分析细胞自然状态下染色体组织形式的高通量分子生物学技术。对于理解并评价基因调控、DNA复制和修复来说，研究染色体的结构性质和空间组织是尤为重要的。 影响基因表达的染色质相互作用的例子之一是：染色体区域折叠可以将增强子及相关转录因子带到基因附近，这一点首次在结构域中获得证实。染色体构象捕获使得研究者们可以根据上述的细胞机制来研究对染色质活性产生影响的因素。这一技术对研究模式生物和人体中遗传学及表观遗传学很有帮助。 基于原始的3C技术，现已发展出多项新的技术，这些技术可增加一条染色体与其它染色体及其它蛋白之间进行定量的通量。这些所有的3C相关的技术大致可被分为四类：（1）3C和ChIP版本的3C（ChIP-loop assay）、（2）4C和ChIP版本的4C（增强型4C）、（3）5C和3D检测以及（4）基因组构象捕获（GCC）相关技术（Hi-C）和ChIP版本的GCC（也被称为6C）。在4C、5C和Hi-C中通过微阵列和高通量测序手段对DNA片段进行分析的应用使得对染色体交互作用的分析进入全基因组规模。.
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染色质免疫沉淀
染色质免疫沉淀（Chromatin Immunoprecipitation，简称为ChIP）被用来研究细胞内DNA与蛋白质相互作用，具体来说就是确定特定蛋白（如转录因子）是否结合特定基因组区域（如启动子或其它DNA结合位点）——可能定义顺反组。ChIP还被用来确定基因组上与组蛋白修饰相关的特定位点（即组蛋白修饰酶类的靶标）。 此方法的简要过程是：细胞裂解液里的蛋白和相关染色质暂时结合；染色质(DNA)-蛋白复合物被剪切，与所研究蛋白相关的DNA片断被选择性免疫沉淀；相关DNA片断被纯化，顺序被测定。一般认为这些DNA顺序在活体内与所研究蛋白结合。.
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核受体
核受体是细胞内一类转录因子的统称。核受体超家族的成员在细胞生长、发育、分化与新陈代谢均起到了重要的作用。由于核受体都位于细胞内部，因此它们的激素均为溶脂性，这样才能穿越由脂肪构成的细胞膜。对核受体的研究始于20世纪70年代，70年代末期第一批核受体被提取、分离了出来。核受体同激素结合后被激活，激活后的核受体复合物负责引导靶基启动因子的转录。 核受体的一个独特性质是将它们与其他类别的受体区分开来，这是它们直接与基因组DNA表达相互作用和控制其表达的能力。 因此，核受体在胚胎发育和成体内平衡中发挥关键作用。 如下所述，核受体可根据机制或同源性进行分类。.
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核纖層
核纖層旧称“核周层”、“核衬层”或“核层”，是位于细胞核内染色质与核膜之间的高电子密度网络片层结构，由中间丝与膜相关蛋白（membrane associated proteins）交织形成，普遍存在于真核细胞的细胞核中。核纤层处于核基质中，在核内与核内膜（inner nuclear membrane，INM）相连，在核外则与内质网相连。核纤层是支撑细胞核的一种结构，对调节DNA自我复制、DNA转录、细胞凋亡与细胞分裂过程中核膜的破裂及重建也起到一定作用。此外，核纤层还可以辅助组织染色质并锚定核孔复合物（nuclear pore complexes，NPCs）、核膜蛋白及转录因子。.
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植烷酸
植烷酸（Phytanic acid，或3,7,11,15-四甲基十六烷酸）是一种支链脂肪酸，人类可以通过食用乳制品、反刍动物脂肪以及某些鱼类而获得该物质。估计西方饮食每天可以提供50～100毫克的植烷酸。在一项牛津大学做的研究中，食用肉食的个人，平均来说血浆中植烷酸浓度的几何平均数比纯素食主义者高6.7倍。.
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次黃嘌呤-鳥嘌呤磷酸核苷轉移酶
次黃嘌呤-鳥嘌呤磷酸核苷轉移酶（Hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase，簡稱HGPRT）為人體內一個轉譯自HPRT1基因的酵素 HGPRT為一種轉移酶，可以催化將次黃嘌呤轉換為肌苷酸（IMP），也可將鳥嘌呤的反應轉為單磷酸鳥苷。這兩個反應都是將PRPP的5-磷酸核苷轉移至嘌呤上。HGPRT在核苷酸再利用合成途徑中扮演重要角色。.
木酮糖-5-磷酸
D-木酮糖-5-磷酸（D-Xylulose 5-phosphate）是一个磷酸戊糖途径中的中间代谢产物，由酮糖核酮糖-5-磷酸而来。最近的研究表明，此物质在基因表达中也有重要作用，主要与转录因子ChREBP有关。.
方向性 (分子生物学)
方向性（Directionality，亦称为定向性）在分子生物學中，是指一個核酸股的端對端化學方位。在核苷五碳糖命名碳原子的規則會形成有「3'端」及「5'端」。沿著核酸結構的相同位置，包括基因、轉錄因子及聚合酶等，都一般是以「上游」（接近5'端）或「下游」（接近3'端）來表示的。 這種命名方法的重要性是容易表示只會從5'至3'合成的核酸，而建立新股的聚合酶，必須以磷酸雙脂鍵附在新核苷的3'羥基。傳統上，脫氧核糖核酸（DNA）及核糖核酸（RNA）序列是由5'至3'表示的。.
无后基因
无后基因（Fruitless，符号为fru）是黑腹果蝇的一种基因，能够编码好几种转录因子蛋白。普通的fru基因的功能对发展一些求偶必须的解剖结构是必要的，包括支配果蝇进行性行为的肌肉所需要的运动神经元。该基因在哺乳动物中没有同源基因，但在冈比亚按蚊这样亲缘关系较远的物种中对性别决定起作用。无后基因是一个或一组基因如何控制涉及先天行为的神经元的功能或发育的典型例子。Fru基因的研究得到了大众媒体的关注，因为它引发了关于人类性取向遗传学和以及性别与攻击性关联的讨论。.
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早期生长反应蛋白
早期生长反应蛋白（early growth response proteins）是一个锌指结构转录因子蛋白家族。 其成员包括：.
拟南芥
阿拉伯芥（Arabidopsis thaliana），又名--、鼠耳芥、阿拉伯草，是一种原生于欧亚大陆的小型开花植物。拟南芥被认为是一种杂草;它是在路边和被扰动土地上被找到的。 拟南芥是一个生命周期相对较短的冬季一年生植物，它是植物生物学和遗传学领域的流行的模式生物。对于一个复杂的多细胞真核生物，拟南芥有一个相对较小的基因组，大约135兆碱基对（Mbp）。拟南芥是第一个基因组被完整测序的植物。它是理解许多植物性状的一种流行的分子生物学工具，包括花的发育和向光性。.
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拟核
擬核（英語：nucleoid；意指「與核相似」，又譯類核），也稱核區（nuclear region）、核體（nuclear body）或染色質體（chromatin body）。 存在於原核生物，是没有由核膜包被的细胞核，也没有染色体，只有一个位于形狀不規則且边界不明显区域的环形DNA分子。內含遺傳物質。裡面的核酸為雙股螺旋形式的環狀DNA，且同時具有多個相同的複製品。 实验显示，拟核的主要成分是占60%的DNA和少量RNA以及蛋白质。后两种成分主要是信使RNA和转录因子蛋白质。拟核蛋白质使核酸保持超螺旋结构，尽管在功能上与真核中的组蛋白类似，但实际上并不相同。 類核可於高倍數電子顯微鏡下觀測，外表並不一定，但可明顯與細胞質基質區分，有時還可見其中的DNA。若DNA經過福爾根染色（Feulgen stain）處理，那麼將使類核可見於光學顯微鏡中。.
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性交
性交（Sexual intercourse），或稱性交媾，也被人們稱為陰道交（vaginal sex）或阴道性交（vaginal intercourse），指的是將一般為勃起狀態的陰莖跟陰道互相接合及在內磨擦的過程，主要目的是为了令自身獲得性快感、繁殖下一代Sexual intercourse most commonly means penile–vaginal penetration for sexual pleasure and/or sexual reproduction; dictionary sources state that it especially means this, and scholarly sources over the years agree.
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5S 核糖体RNA
doi.
亦称为 Transcription factor。