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莖環

指数 莖環

莖環(英語:Stem-loop,或譯主幹-迴圈)指一種分子內鹼基配對方式,與因此形成的結構,可發生於單股DNA,但在RNA分子中較為常見。當形成的迴圈較小時,也稱為髮夾(hairpin)或髮夾環。 此種結構會在某些條件下產生,通常是因為同一分子內的兩個區域的核苷酸排列具有迴文現象,這會使兩段序列因為鹼基的配對而形成一個狀似棒棒糖的雙螺旋結構,使RNA產生核酸二级结构。.

目录

  1. 13 关系: 假結結構天花小分子核糖核酸巴爾小體二級結構內環結構回文終止子脊髓灰質炎疫苗脱氧核糖核酸RNA溫度計核糖核酸核酸二级结构

假結結構

假結結構(pseudoknot)是一类RNA二级结构。假结结构包含至少两个茎环结构。其中,一个茎环结构的茎的一半插入了另一个茎环结构的茎结构中。假结结构最初于1982年在中发现。假结结构折叠成类似于绳结的三维结构,但却并不是真正的。.

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天花

天花是一種由天花病毒引起之人類傳染病。患者一般在染病後的12天內,出現包括發燒、肌肉疼痛、頭痛等近似普通感冒的症狀。幾天後,其口咽部分的粘膜會長出紅點,身體多處地方亦會長出皮疹(以臉部居多)。天花病毒共有兩類:主天花病毒及次天花病毒。根據患者的病情發展,由前者引發之天花又被劃分為四種形式:典型、惡性、出血型、緩和型。其中,多數未曾接種疫苗者均會出現典型天花的症狀。次天花病毒引起之病變程度比上述四種的都要溫和,但卻非常罕見。 天花主要透過空氣傳播。患者的呼吸道與皮膚皰疹分泌物均載有病毒,故避免與其近距離接觸可減低患病的風險。多種痘病毒疾病的病癥均與天花的如出一轍。專家需利用進行病毒培植以確定天花病毒的存在,聚合酶鏈式反應及限制性片段長度多態性測試可提供更多病毒的細節。接種天花疫苗為預防此病的最佳方法。目前並沒有認可的抗天花藥物。一旦出現確診病例,醫護人員會為病人注射疫苗提升免疫保護,有時亦會配以舒緩性療法加大療效。天花病毒不會造成慢性或復發性感染,但會導致各類併發症或後遺症(如失明)。不同類型的天花所引發的病死率有所參差;最為常見的典型天花約奪取了三成病患者的性命。 古埃及或為天花的起源地。已死去逾三千年的法老拉美西斯五世可能是史上首名天花病人,專家在其木乃伊身上找到了明顯的膿皰痕跡。早期的印度及中國文獻亦有記載這種疾病。在隨後的漫長歲月裡,天花於世界多個地方展開大流行,並奪取了無數人類的性命(尤其是兒童)。歷史上,有不少國家的君王及著名人物均染上過天花。19至20世紀期間,多番的防疫行動減低了此病對群眾的威脅。最終,世界衛生組織於1980年正式宣布撲滅天花,使之成為首個於世上絕跡的人類傳染病。.

查看 莖環和天花

小分子核糖核酸

小分子核糖核酸(microRNA,缩写为miRNA)又譯微核糖核酸,是真核生物中廣泛存在的一種長約21到23個核苷酸的核糖核酸(RNA)分子,可調節其他基因的表达。miRNA來自一些從DNA轉錄而來,但無法進一步轉譯成蛋白質的RNA(屬於非編碼RNA)。miRNA通過與目標信使核糖核酸(mRNA)结合,進而抑制转录後的基因表达,在调控基因表达、细胞周期、生物体发育时序等方面起重要作用。在动物中,一个微RNA通常可以调控数十个基因。 這些RNA是從初級轉錄本(primary transcript)出來的,也就是pri-miRNA,轉變成為稱為pre-miRNA的莖環結構,最後成為具有功能的成熟miRNA。 1989年,Victor发现秀丽隐杆线虫(C.

查看 莖環和小分子核糖核酸

巴爾小體

巴爾小體(Barr body,也譯作巴氏小體或巴爾氏體),得名自其發現者穆雷·巴爾,是具有兩個以上X染色體(或Z染色體)的細胞中,其中一條X或Z染色體去活化而成的緊密結構,如此會使該染色體上的基因不至於過度表現。X染色體去活化機制由「Xist基因」控制,該基因可使被去活化的X染色體受到較高度的DNA甲基化與較低度的(histone acetylation),使其成為一種異染色質,即巴爾氏體。 巴爾氏體上除了偽體染色體區(pseudoautosomal region)的基因仍可表現外,其餘片段的基因都受到抑制,這種現象稱為(gene silencing)。巴爾氏體產生的目的和避免雌性的X染色體(或雄性的Z染色體)劑量過多有關,造成雌性身體由關閉不同X染色體的兩群不同的細胞組成,稱為「」(mosaic),可以產生兩種不同的表現型,這也是花貓有三種毛色的原因。.

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二級結構

蛋白質二級結構(Protein secondary structure)在生物化學及結構生物學中,是指一個生物大分子,如蛋白質及核酸(DNA或RNA),局部區段的三維通式。然而它並不描述任何特定的原子位置(在三級結構中描述)。 二級結構是由生物大分子在原子分辨率結構中所观察到的氫鍵來定義的。蛋白質的二級結構通常是以主鏈中氨基之間的氫鍵模式來定義〈与主链-侧链间以及侧链-侧链间的氢键无关〉,亦即DSSP的定義。而核酸的二級結構是以鹼基之間的氫鍵來定義。 在二级结构中,特定的氫鍵模式往往伴随着其他一些結構特徵;但如果只考虑这些结构特征而忽略氢键本身,则会导致所定義的二級結構不准确。例如,蛋白質的螺旋中的残基都分布在拉氏图(以主鏈二面角为坐标)的特定區域,因此二面角位于这一区域的残基都會被认为参与形成「螺旋」,而不論它是否真正的存在对应氫鍵。其他稍微不准确的定義多是應用曲線微分幾何的觀念,如曲率及扭量。也有一些結構生物學家以肉眼观察通过软件显示的蛋白质结构來決定其二級結構。 對生物大分子的二級結構含量可以以光譜來初步估計。對於蛋白質,最常用的方法是圓二色性(Circular dichroism), (利用長紫外線,波長范围170-250nm)。在获得的光谱吸收曲线上,α螺旋結構会在208nm及222nm两处同时出现极小值,而204nm和207nm处出现单个极小值則分別表示存在无规卷曲和β折疊結構。另一個較常用的方法是紅外光譜,它可以偵測因氫鍵所造成胺基的震盪。而光譜中,测定二級結構最準確的方法是利用核磁共振光谱所纪录的化學位移,由于仪器和样品制备上的原因,这一方法较为少用。.

查看 莖環和二級結構

內環結構

內環結構(Internal loop)是一種RNA的高級結構,是RNA雙鏈中兩條鏈上對位的核苷酸殘基的鹼基無法配對產生的膨起環。內環分爲對稱和不對稱兩種。其中,對稱的內環是兩條鏈上對位的核苷酸殘基同時膨起產生的,而不對稱的內環結構中,只有一條鏈上有幾個核苷酸殘基膨起。對稱內環結構不是很穩定,一般只出現在RNA分子的移動過程中。而不對稱內環相對穩定。在核糖體RNA(rRNA)中就有較豐富的內環結構。 內環結構和莖環結構(髮卡結構)的區別在於,內環結構出現在RNA雙鏈的內部,「環」兩端都是閉合雙鏈。而莖環結構的「環」出現在雙鏈的一端。.

查看 莖環和內環結構

回文

--是正读反读都能读通的句子,亦有将文字排列成圆圈者,是一種修辭方式和文字游戏。回環運用得當,可以表現兩種事物或現象相互依靠或排斥的關係。.

查看 莖環和回文

終止子

終止子(Terminator)是一段位於基因或操縱組末端的DNA片段,可中斷轉錄作用。原核生物擁有兩種類型的終止子,包括:.

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脊髓灰質炎疫苗

-- 脊髓灰質炎疫苗(英語:Polio vaccines)又稱小兒麻痺疫苗。是一種用來對抗脊髓灰質炎(小兒麻痺)的疫苗,世界上主要通用類型有兩大類。第一類是由約納斯·沙克所研發出來的「沙克疫苗」,此疫苗於1952年首度試驗,內含一劑去活化脊髓灰質炎病毒。第二類則是由阿爾伯特·沙賓利用減毒性脊髓灰質炎病毒所研發出來的「沙賓疫苗」,這種疫苗的臨床試驗開始於1957年,並於1962年獲得許可。此兩種疫苗幾乎將脊髓灰質炎消滅殆盡,使全世界的病例從1988年的約35萬例,減少到2007年的1000余例,2014年是359名 。世界卫生组织建議全球兒童都應該接種以避免罹患小兒麻痺。 沙克疫苗是非常安全的疫苗,頂多注射的局部位置會發生輕微的泛紅或是疼痛症狀;沙賓疫苗則可能引起疫苗相關麻痺型脊髓灰質炎,大約每一百萬人中會出現三位這種症狀。兩種疫苗對妊娠人士、艾滋病患者皆相當安全且仍舊有效。 兩種疫苗皆列於最基本的健康照護系統中最必要的藥物清單世界衛生組織基本藥物清單登錄有案 2014年每劑口服疫苗批發價大約在0.24美元, 在美國注射疫苗大約需25-50美元。 沙克疫苗与沙賓疫苗相比,主要区别:.

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脱氧核糖核酸

--氧核醣核酸(deoxyribonucleic acid,縮寫:DNA)又稱--氧核醣核酸,是一種生物大分子,可組成遺傳指令,引導生物發育與生命機能運作。主要功能是資訊儲存,可比喻為「藍圖」或「配方」。其中包含的指令,是建構細胞內其他的化合物,如蛋白質與核醣核酸所需。帶有蛋白質編碼的DNA片段稱為基因。其他的DNA序列,有些直接以本身構造發揮作用,有些則參與調控遺傳訊息的表現。 DNA是一種長鏈聚合物,組成單位稱為核苷酸,而糖類與磷酸藉由酯鍵相連,組成其長鏈骨架。每個糖單位都與四種鹼基裡的其中一種相接,這些鹼基沿著DNA長鏈所排列而成的序列,可組成遺傳密碼,是蛋白質氨基酸序列合成的依據。讀取密碼的過程稱為轉錄,是根據DNA序列複製出一段稱為RNA的核酸分子。多數RNA帶有合成蛋白質的訊息,另有一些本身就擁有特殊功能,例如核糖體RNA、小核RNA與小干擾RNA。 在細胞內,DNA能組織成染色體結構,整組染色體則統稱為基因組。染色體在細胞分裂之前會先行複製,此過程稱為DNA複製。對真核生物,如動物、植物及真菌而言,染色體是存放於細胞核內;對於原核生物而言,如細菌,則是存放在細胞質中的拟核裡。染色體上的染色質蛋白,如組織蛋白,能夠將DNA組織並壓縮,以幫助DNA與其他蛋白質進行交互作用,進而調節基因的轉錄。.

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RNA溫度計

RNA溫度計(RNA thermometer),亦稱RNA溫度傳感器(RNA thermosensor)是一類對溫度敏感的非編碼RNA,能隨溫度變化調控基因表达。RNA溫度計主要調控與熱休克和冷休克反應有關的基因,但與致病性、飢餓狀態等過程相關的基因調控也有關係。 RNA溫度計一般通過二級結構的改變對溫度變化做出反應。結構的改變會使RNA上等重要區域暴露或遮蔽,進而改變對應編碼基因的轉譯速率。 RNA溫度計與核糖開關一樣,都是支持RNA世界假說的有力證據。RNA世界假說認爲RNA為早期生命的唯一組成成分,但隨生物進化,RNA攜帶遺傳信息的功能由DNA取代,RNA的生物催化活性由蛋白質取代,形成了今日的DNA-RNA-蛋白質系統。 RNA溫度計的實例有、、以及。.

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核糖核酸

核糖核酸(Ribonucleic acid),簡稱RNA,是一類由核糖核苷酸通過3',5'-磷酸二酯鍵聚合而成的線性大分子。自然界中的RNA通常是單鏈的,且RNA中最基本的四種鹼基爲A(腺嘌呤)、U(尿嘧啶)、G(鳥嘌呤)、C(胞嘧啶)通過轉錄後修飾,RNA可能會帶上(Ψ)這樣的稀有鹼基,相對的,與RNA同爲核酸的DNA通常是雙鏈分子,且含有的含氮鹼基爲A(腺嘌呤)、T(胸腺嘧啶)、G(鳥嘌呤)、C(胞嘧啶)四種。 RNA有着多種多樣的功能,可在遺傳編碼、翻譯、調控、基因表達等過程中發揮作用。按RNA的功能,可將RNA分爲多種類型。比如,在細胞生物中,mRNA(信使RNA)爲遺傳信息的傳遞者,它能夠指導蛋白質的合成。因爲mRNA有編碼蛋白質的能力,它又被稱爲編碼RNA。而其他沒有編碼蛋白質能力的RNA則被稱爲非編碼RNA(ncRNA)。它們或通過催化生化反應,或通過調控或參與基因表達過程發揮相應的生物學功能。比如,tRNA(轉運RNA)在翻譯過程中起轉運RNA的作用,rRNA(核糖體RNA)於翻譯過程中起催化肽鏈形成的作用,(小RNA)起到調控基因表達的作用。此外,RNA病毒甚至以RNA作爲它們的遺傳物質。 RNA通常由DNA通過轉錄生成。RNA在細胞中廣泛分佈,真核生物的細胞核、細胞質、粒線體中都有RNA。.

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核酸二级结构

核酸二级结构(Nucleic acid secondary structure)是单个核酸聚合物内或两个聚合物之间的碱基对相互作用。它可以被表示为在核酸分子中配对的碱基的一个列表。 生物DNA的和RNA的二级结构往往有所不同:生物DNA主要以完全碱基配对的双螺旋的形式存在,而生物RNA是单链的,并且由于来自核糖中额外的羟基增加的形成氢键的能力而形成错综复杂的碱基配对相互作用。 在非生物学背景下,由于碱基对的模式最终决定了分子的整体结构,因此二级结构对于DNA纳米技术和DNA运算的核酸结构的至关重要。.

查看 莖環和核酸二级结构

亦称为 Stem-loop,莖環結構。