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导水管周围灰质
中脑导水管周围灰质（Periaqueductal gray，简称PAG）位於中腦的，是聚集在中脑导水管周围的神经细胞构成的灰质。PAG的已知功能包括对疼痛的下行调控、防卫行为、生殖行为和发声（Vocalization）功能，此區的細胞會分泌抑制疼痛。.
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小脑
小脑（cerebellum，指「大腦後下方的腦」）是位于的脑组织。小脑在感觉感知、协调性，和运动控制中扮演重要角色；它也和注意、语言等很多认知功能相关，亦能调控恐惧和欢乐等反应，其中最为人们确知的是其运动相关功能。小脑不會主動发起动作，但會接收來自脊髓感覺系統和其他腦區的訊號，影响运动协调、精确度和准确的时机控制。小脑通过丘脑等通路与大脑皮层相连，从而起到支配运动协调性的作用；下小脑接受来自以及下橄榄核等结构的输入，整合多方面的信息，来微调运动的准确性，协调性和连贯性。正由于小脑的功能是“微调”运动技能，所以小脑的损伤不会带来诸如瘫痪的严重症状，但是会导致、、姿势和方面的症状。18世纪的科学研究表明，小脑受损的病人表现出运动协调性障碍；19世纪的小脑研究则主要基于动物损伤实验。这类实验发现，动物的小脑受损以后，表现出动作异常、步态笨拙，以及肌肉无力。这些观察最终使学者得出结论：小脑的主要功能是运动控制。不过，现代生物医学研究表明，除了运动以外，小脑还有许多其他功能，例如认知功能，注意力和语言处理，音乐处理，在时机控制方面也有重要作用。 在解剖外观上，小脑是一个位于脑下方的独立结构，藏在大脑半球之下。小脑与中脑、脑桥基底、延髓相连，可以分为前庭小脑、脊髓小脑与大脑小脑。它的皮质表面遍布着构造精细的平行沟槽，和大脑皮质宽阔而不规则的沟回形成鲜明对比。这些平行沟槽的结构，常常会使人忘记小脑其实是一个连续的薄片状组织，它像手风琴那样紧密地折合起来。在这个薄片里，有多种神经元高度有序地组合，其中最重要的是和。复杂的神经组织赋予了小脑巨大的信息处理能力，但是几乎所有的输出，都经过一个位于小脑内部称为小脑深部核团的组织。 小脑除了在动作控制方面的功能，它还是多种动作学习，也就是调制所必需的器官。人们建立了许多模型，来解释小脑的突触可塑性是如何校准感觉和动作的关系。它们大多源于大卫·马尔和的模型，这个模型的基础，是每个小脑浦肯野细胞都接受两种完全不同的输入：一种是来自平行纤维的数千种输入，另一种是来自的极强的输入。马尔-阿尔布斯模型的基本概念是，爬行纤维提供“指导信号”，导致平行纤维输入强度的长时变化。在平行纤维输入所观察到的长期抑制作用支持了这类理论，但是它们的有效性还有争议。.
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屏状体
屏状体，又名屏狀核，位于大脑的外囊和极外囊之间的一块厚为1-2毫米的扁平形灰质。外囊分隔屏状体和豆状核（壳部分）。极外囊分隔屏状体和岛叶。虽然已知屏状体和大脑皮层有往复连接，但目前对屏状体的功能知之甚少。有些学者认为屏状体是豆状核的一部分，另一些学者认为屏状体应算作岛叶的一部分，更有一部分学者主张屏状体可分为豆状体部和岛叶部两部分。也有一些当代神经解剖学家认为屏状体和杏仁核一同属于基底核。 神经科学家佛朗西斯·克里克和克里斯托夫·科赫认为因为屏状体与大脑皮层多个区域有双向连接，所以可能在意识的产生中有重要作用。 直到2014年，才有研究人员意外发现，对屏状体进行电脉冲刺激，似乎能够开/关意识。研究者用高频率电流发出脉冲刺激一名癫痫病女患者的这个区域，这名女子失去了意识，停止了语言与肢体动作，毫无表情，记忆出现了“断片儿”，对视觉刺激毫无反应，呼吸变慢了。当刺激停止的一瞬间，她立刻恢复了意识并对刚发生的一切彻底失忆。.
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中樞神經系統
中枢神经系统（英文：central nervous system，縮寫：CNS）是神经系统中神经细胞集中的结构，在脊椎动物包括腦和脊髓；在高等无脊椎动物如环节动物和昆虫等，则主要包括腹神经索和一系列的神经节。 人的中枢神经系统构造最复杂而完整，特别是大脑半球的皮层获得高度的发展，成为神经系统最重要和高级的部分，保证了机体各器官的协调活动，以及机体与外界环境间的统一和协调。 中樞神經系統與周围神经系统組成了神經系統，控制了生物的行為。 整個中樞神經系統位於背腔，腦在顱腔，脊髓在脊椎管；顱骨保護腦，脊椎保護脊髓。.
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甲基苯丙胺
基苯丙胺或甲基安非他命（英語：Methamphetamine，全名是)）是強效的中樞神經系統刺激劑，主要被用於娛樂用途，較少被用於治療注意力不足過動症和肥胖症，即便有也被當成第二線療法。甲基苯丙胺是在1893年發現，有二種对映异构：分別是左旋甲基苯丙胺（levo-methamphetamine）及右旋甲基苯丙胺（dextro-methamphetamine）。「甲基苯丙胺」一般是指左旋甲基苯丙胺及右旋甲基苯丙胺各佔一半的外消旋混合物。甲基安非他命較少被醫師處方，因為可能會，以及有用作春藥和欣快感促進劑等風險。而且已有療效相同，而對人體危害風險更低的替代藥物。 在美國能直接在市面上購買主成分為左旋甲基苯丙胺的吸入型因為它被視為非处方药。 甲基苯丙胺常因為它們的藥效動力學屬性而被非法交易，用於娛樂用途。非法使用甲基苯丙胺在亚洲部分地区、大洋洲和美国最为普遍。在美国，消旋以及左旋、右旋甲基苯丙胺均为。 Levomethamphetamine is available as an over-the-counter (OTC) drug for use as an inhaled in the United States.
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狂犬病
病（俗稱：瘋狗症；字根來自rabies，意為“瘋狂”）是一種由狂犬病病毒引起之人畜共患病，可於恆溫動物身上造成嚴重腦炎。沒有接受疫苗免疫的感染者，當神經症狀出現後幾乎必然死亡，通常的死亡原因都是由于中枢神经（脑-脊髓）被病毒破坏，病毒大量存在于发病者的脑脊液、唾液和体液中，絕大部份通过咬伤傳播，很多時令染病的人或动物特別活躍，在沒有被激怒的情况下发起攻擊，展現其他不尋常的行為。狂犬病亦可以以麻痺方式出現，令患者顯得沉默内向。亦有未经确认的实例表明病毒可經飛沫由黏膜或呼吸道傳染，在探索有狂犬病蝙蝠的洞穴时被含有蝙蝠粪便的飛沫感染。最终死于自主神经系统受损导致的器官衰竭、呼吸衰竭。但是只要及時的接种疫苗，一般都能诱发身体产生足够的免疫力消灭病毒。狂犬病的早期症狀包括發燒與傷口的刺痛感，稍後則可能會出現暴力行為、不可自制的興奮感、恐水症、部分肢體癱瘓、意識混亂或。自染病到病發的時間為一至三個月，但因人而異的程度相當大：長可長至一年，短可短到一週內，一旦症狀出現，狂犬病的致命率幾乎百分之百。狂犬病症狀出現所花的時間主要受病毒侵犯至中樞神經系統的時間所影響。 狂犬病通常由其他動物傳染給人類，被染病動物或患病者抓傷或咬傷都可能感染，染病動物的唾液在與其他動物或人類的黏膜接觸時也具有傳染力。哺乳动物中，灵长目、食肉目、翼手目等都可能染病，如人、貓、狗、雪貂、鼬獾、貉、浣熊、臭鼬、狐狸、狼、熊、蝙蝠还有馬。大多數的人類狂犬病案例都是被染病犬隻咬傷（>99%)，尤其在非洲國家及印度等第三世界國家。在美國等發達的國家，因為犬隻普遍接受疫苗及流浪動物控管，因此蝙蝠則是最常見的狂犬病原因（狗造成的案例但是此時已經百分百致死率並幾乎不可治癒。 動物管制與疫苗施打計畫使得許多地區的犬隻感染狂犬病風險下降。對於感染狂犬病高風險者，一般建議在暴露於危險前施打疫苗。高風險者包括工作需要與蝙蝠接觸者與長期在狂犬病盛行的國家工作者。針對已經暴露狂犬病的患者，狂犬病疫苗與狂犬病抗體都能在症狀出現前阻止疾病的繼續惡化。被動物咬傷後以清水、肥皂、優碘、或人體用清潔劑清洗傷處十五分鐘或許可殺死病毒，並在某種程度上有效防止病毒傳播。狂犬病患者發病後存活率不高，僅有少數狂犬病發病者能在接受密集的密爾沃基療法後存活。 狂犬病每年在全世界造成26,000-55,000人死亡，當中有多於95%發生在亞洲與非洲，死亡病例絕大多數（97%）由狗引起。除了南極洲外，狂犬病遍佈世界其他六大洲中的150餘個國家。有三十億人居住在仍有狂犬病的國家中。狂犬病的人传人個案极为少见，曾出現於器官移植，极少出於人咬人或接吻。2004年在美国一个未诊断为狂犬病的患者过世之后捐献内脏，获得捐献的四个人因狂犬病身亡。2013年美國研究人員表示，一起罕見的人類感染浣熊狂犬病病例，造成美國一名腎臟捐贈者在2011年死亡，他的器官移植接受者也在18個月後病發身亡。在歐洲與澳洲，狂犬病只能在蝙蝠身上見到，許多島國則根本沒有狂犬病。.
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脑
脑是由稱為神經元的神經細胞所组成的神经系统控制中心，是所有脊椎动物和大部分无脊椎动物都具有的一个器官，只有少数的无脊椎动物没有脑，例如海绵、水母、成年的海鞘与海星，它们以分散或者局部的神经网络代替。 许多动物的脑位于头部，通常是靠近主要的感觉器官，例如视觉、听觉、前庭系统、味觉和嗅觉。脑是脊椎动物身体中最复杂的器官。在普通人类的大脑皮质（脑中最大的部分）中，包含150-330亿个神经元，每一个神经元都通过突触和其他数千个神经元相连接。这些神经元之间通过称作轴突的原生质纤维进行较长距离互相联结，可以将一种称作动作电位的冲动信号，在脑的不同区域之间或者向身体的特定接收细胞传递。脊椎动物的脑由颅骨保护。脑与脊髓构成中枢神经系统。中枢神经系统的细胞依靠复杂的联系来处理传递信息。脑是感情、思考、生命得以维持的中枢。它控制和协调行为、身体内穩態（身体功能，例如心跳、血压、体温等）以及精神活动（例如认知、情感、记忆和学习）。 从生理上来说，脑的功能就是控制身体的其他器官。脑对其他器官的作用方式，一是调制肌肉的运动模式，二是通过分泌一些称为荷尔蒙的化学物质。集中的控制方式，可以对环境的变化做出迅速而一致的反应。 一些基本的反应，例如反射，可以通过脊髓或者周边神经节来控制，然而基于多种感官输入，有心智、有目的的动作，只有通过脑中枢的整合能力才能控制。 关于单个脑细胞的运作机制，现今已经有了比较详细的了解；然而数以兆亿的神经元如何以集群的方式合作，还是一个未解决的问题。现代神经科学中，新近的模型将脑看作一种生物计算机，虽然运行的机制和电子计算机很不一样，但是它们从周围世界中获得信息、存储信息、以多种方式处理信息的功能是类似的，它有点像计算机中的中央处理器（CPU）。 本文会对各种动物的脑进行比较，特别是脊椎动物的脑，而人脑将被作为各种脑的其中一种进行讨论。人脑的特别之处会在人脑条目中探讨，因为其中很多话题在人脑的前提下讨论，内容会丰富得多。其中最重要的，是与脑损伤造成的后果，它会被放在人脑条目中探讨，因为人脑的大多数常见疾病并不见于其他物种，即使有，它们的表现形式也可能不同。.
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腦硫脂
腦硫脂（英語：sulfatide，硫酸腦苷脂、硫苷脂、硫脂類、半乳糖酰基鞘氨醇/3-O-sulfogalactosylceramide、SM4、硫酸化半乳糖/sulfated galactocerebroside）屬於一類，具體上是"硫酸醣脂"（sulfoglycolipid）的一類，因其含硫酸基糖脂。腦硫脂的合成主要在内质网開始而在高尔基体結束，過程中轉化成半乳糖之後硫化為腦硫脂。在髓磷脂的半乳糖脂中，有1/5是腦硫脂。腦硫脂主要被發現在由中樞神經系統的及周围神经系统中，施旺細胞所產生髓鞘细胞膜的胞膜外片上。然而，腦硫脂也存在於真核生物組織的許多細胞之细胞膜的胞膜外片上。 因為腦硫脂是一種多功能分子，它可以在多種生物學領域中使用。除了作為膜成分，腦硫脂功能作用在（靶向蛋白）、、神经可塑性、記憶及"神經膠質細胞軸突的相互作用"（glial-axon interaction）等功能上。腦硫脂也作用在一些生理過程及系統上，包括神经系统、免疫系统、胰岛素分泌、凝血、，及細菌感染等。其結果是，腦硫脂或可關聯於或也能夠結合到腎組織、癌症細胞/組織、红血球細胞及血小板的表面、免疫系統中的CD1a-d細胞、許多細菌細胞、一些病毒、髓鞘、神經元，以及星形膠質細胞等組織上。 硫脂顯出異常的代谢或改變也與各種病理病症有關包括在神經病理學（neuropathology）上，比如異染性腦白質退化症(MLD)、阿兹海默病及帕金森氏症。腦硫脂也與糖尿病，癌遠端轉移，及病毒包括HIV-1（HIV-1/Subtypes of HIV）、甲型流感病毒、丙型肝炎以及牛痘病毒（Vaccinia virus）等有關。此外，硫脂的過度顯現出與癫痫及「聽原性癲癇發作」（audiogenic seizures）以及其它神经系统裡的病理狀態有關。 過往及正在進行的研究將繼續闡明腦硫脂的多種生物學功能及其眾多的影響，且在病理学上已相關聯到腦硫脂。大多數研究利用小鼠模型，而且異源性表達（heterologous expression）系統也被利用，包括到但不限於"Madin-Darby犬腎細胞"及羰基硫-7細胞。.
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枕叶
枕葉（Occipital Lobe）是大脑皮层的一部分结构，属于哺乳动物四个脑叶之一。其已知的主要功能包括处理视觉信息，例如初级视皮层V1就位于枕叶。.
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亦称为 灰白質。