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中華民國國防部
國防部為中華民國軍事及國防事務之最高主管機關，負責統轄中華民國國軍各部隊。除了國防部本部之外，下轄參謀本部、陸軍司令部、海軍司令部、空軍司令部、憲兵指揮部、後備指揮部、政治作戰局、主計局、軍備局、軍醫局等軍事機關／機構，以及所屬業務與學術單位。國防部是行政院下的所有部門裡唯一一個有設置副部長跟沒有設置政務次長的部門。.
中華民國總統行政專機
中華民國總統行政專機又稱空軍一號、空軍3701或總統專機，是中華民國用來護送中華民國總統或其他高級官員的行政專機。該架飛機是以波音737-800購買改裝而成，總造價4,500萬美元。2000年2月7日，美國波音公司將專機移交給中華民國空軍，並在同年3月20日正式成軍。當前總統專機由空軍松山基地指揮部成員擔任機組人員，並先後服務過中華民國總統陳水扁、馬英九和蔡英文。.
中華民國陸軍
中華民國陸軍（The Republic of China Army，缩写为 ROCA）是中華民國國軍的陸上武裝部隊，隸屬國防部陸軍司令部，現有3個軍團、4個防衛指揮部、4個地區指揮部、4個裝甲旅、3個機械化步兵旅、3個砲兵指揮部、1個砲兵群、2個航空旅、1個特戰指揮部，约10萬人，是陸海空三軍之中人数最多的。 2011年出版的《中華民國一百年國防報告書》指出中華民國陸軍的任務是：「平時戍守本島、外島各地，以建置基本戰力與整備應變作戰能力為主，執行應急戰備任務，協力維護重要目標安全，並依令支援反恐行動及主動協助地區災害防救；戰時各作戰區（防衛部）及所屬部隊，受國軍聯合作戰指揮中心指揮，聯合海軍、空軍地面兵力，遂行聯合作戰，擊滅進犯敵軍，確保國土安全。.
國家政軍指揮中心
國家政軍指揮中心為中華民國總統緊急及戰時的最高指揮中心，俗稱圓山指揮所，指揮所內設有可供總統專屬的生活設施及內閣進駐的辦公室，備有發電機、儲水系統，並可承受2千磅傳統炸藥、2萬噸的核爆炸與電磁脈衝攻擊。 國家政軍指揮中心前臨國防部總部，與國軍聯合作戰指揮中心（衡山指揮所）毗鄰通連。.
國防部參謀本部
國防部參謀本部是中華民國國防部執行軍隊指揮之特設單位，等於世界各國的總參謀部。《國防部參謀本部組織法》明定其為國防部部長之軍令幕僚、及三軍聯合作戰指揮機構，掌理提出建軍備戰需求、建議國防軍事資源分配、督導戰備整備、部隊訓練、律定作戰序列、策定並執行作戰計畫及其他有關軍隊指揮事項，其建軍備戰最高戰略指導原則為「有效嚇阻、防衛固守」的目標任務。.
衡山指揮所
#重定向 國軍聯合作戰指揮中心.