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GROMACS

指数 GROMACS

GROMACS（全称：GROningen MAchine，全称格罗宁根华讯模拟体系）是一套分子动力学模拟程序包，主要用来模拟研究蛋白质、脂质、核酸等生物分子的性质。它起初由荷兰格罗宁根大学生物化学系开发，目前由来自世界各地的大学和研究机构维护。GROMACS是开源免费的软件，4.6版之前的版本使用GNU通用公共许可证(GPL)发行，而4.6版之后使用GNU宽通用公共许可证(LGPL)发行。.

目录

  1. 5 关系: 分子力学，自由及开放源代码软件列表，自由能微扰，Folding@home，Xmgrace。

分子力学

分子力学采用经典力学来模拟分子体系。在分子力学中，使用分子力场方法计算出所有系统的势能。分子力学可用于研究小分子，也可用于研究具有成千乃至上百万原子数的大型生物系统或材料。 全原子分子力学方法具有以下性质：.

查看 GROMACS和分子力学

自由及开放源代码软件列表

下面是自由及开放源代码软件包——即采用和开源许可证的计算机软件的列表。符合自由软件定义的软件可能称为自由软件更为适宜；GNU计划尤其反对他们的软件被称为“开源”。欲知更多有关开源软件信息及其理论背景，请参考开源软件运动和自由软件运动。不过，几乎所有的符合开源软件定义的软件都是自由软件，故而也在此列出。.

查看 GROMACS和自由及开放源代码软件列表

自由能微扰

自由能微扰 （Free Energy Perturbation, 縮寫：FEP）是用来计算自由能的一种常用方法。最早由R.

查看 GROMACS和自由能微扰

Folding@home

Folding@home（簡稱FAH或F@h）是一个研究蛋白质折叠、误折、聚合及由此引起的相关疾病的分布式计算工程。由斯坦福大学化學系的潘德实验室（Pande Lab）主持，於2000年10月1日正式啟動。Folding@home現時是世界上最大的分布式計算計劃，於2007年為吉尼斯世界纪录所承認。 2004年3月8日，研究基因結構的計劃終止，併入Folding@home。.

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Xmgrace

Grace是「GRaphing, Advanced Computation and Exploration of data」的缩写。它是在X Window系統和Motif下的所見即所得（所见及所得）的二维绘图软件。Grace可以运行在任何类Unix系统操作系统下。它也成功的运行在OpenVMS、OS/2和Microsoft Windows 9*/NT/2000/XP（Cygwin）。.

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