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49 关系: Allegro，字符编码，串行存在检测，开源操作系统比较，微软POSIX子系统，嵌入式SQL，Bash，Cmus，Coda，Cooperative Linux，Cygnus Solutions，Cygwin/X，Dd (Unix)，DotGNU，西交兵马俑BBS，辦公室套裝軟體比較，适用于 Linux 的 Windows 子系统，Freeciv，Gambas，GCC，Gerris，Git，GNU Guile，GNU TeXmacs，GNU工具链，Iconv，Irssi，Kill (命令)，Lighttpd，Linux发行版，Mathomatic，Md5sum，MinGW，Mosh，Newlib，Node.js，NTFS重解析点，PDFedit，PyMOL，Secure Shell，Squid (软件)，SSH客户端比较，Uname，Unistd.h，Windows API，Xmgrace，文件系统的对比，文件编辑器比较，时区信息数据库。
Allegro
Allegro是一个特别针对于电子游戏的开发的自由软件程式库。 该库提供基本二维图形、图像操作、音效输出、MIDI音乐、输入、计时器，以及额外的寻路矩阵计算、UNICODE、文件系统管理、有限而建基於軟件的三维图形。 其版本4.0可以运行在DOS、Microsoft Windows、BeOS、Mac OS X、多种类Unix，程序只需要嵌入其API即可使用。该库还有独立的AmigaOS 4移植版。 该库使用C语言编写，适用于C或C++，其附带很多文档和实例。.
字符编码
字符编码（Character encoding）、字集碼是把字符集中的字符编码为指定集合中某一对象（例如：比特模式、自然数序列、8位元组或者电脉冲），以便文本在计算机中存储和通过通信网络的传递。常见的例子包括将拉丁字母表编码成摩斯电码和ASCII。其中，ASCII将字母、数字和其它符号編號，並用7位元的二进制來表示这个整数。通常會額外使用一个扩充的位元，以便于以1个字节的方式存储。 在计算机技术发展的早期，如ASCII（1963年）和EBCDIC（1964年）这样的字符集逐漸成為標準。但这些字符集的局限很快就变得明显，于是人们开发了許多方法来扩展它们。对于支持包括东亚CJK字符家族在内的写作系统的要求能支持更大量的字符，并且需要一种系统而不是临时的方法实现这些字符的编码。.
查看 Cygwin和字符编码
串行存在检测
串行存在检测（serial presence detect，缩写SPD）是一种访问内存模块有关信息的标准化方式。 早期的72针SIMM包括五个引脚，提供5比特并行存在检测（PPD）数据，而168针DIMM标准更改为串行存在检测，以编码更多信息。 在普通的现代计算机开机时，它将进行一次加电自检（POST）。自从20世纪90年代中期以来，这个过程包括自动配置当前存在的硬件。SPD是一项内存硬件特性，可使计算机了解存在的内存以及访问内存要使用的时序。 部分计算机可以完全自动地适配硬件变更。在大多数情况下，有一个特殊的可选步骤可以访问BIOS参数，得以查看并可能更改相关设置。有些计算机可以控制如何使用SPD中存储的数据——可以选择性的修改内存时序，乃至完全覆盖（忽视）SPD数据，见超頻。.
开源操作系统比较
此列表列出了自由或开源的操作系统之间的比较。本列表中，若并非该操作系统的所有版本均支持所列出之特性，则会加注首个实现本特性的版本。.
微软POSIX子系统
微软POSIX子系统Windows NT家族操作系统的三个子系统之一（另两个是OS/2和Windows子系统）。 微软Windows只实现了POSIX标准的首个版本，即POSIX.1。POSIX.1的官方代码是ISO/IEC 9945-1:1990或IEEE标准1003.1-1990。引入此子系统是因为1980年代美國聯邦政府在聯邦資料處理標準（FIPS）151-2中列出的要求。 Windows NT 3.5、Windows NT 3.51和Windows NT 4被认定完全兼容FIPS 151-2。 此子系统是由两个文件提供的运行时环境：psxss.exe和psxdll.dll。POSIX应用程序使用psxdll.dll与此子系统通信，以及posix.exe在Windows桌面上提供显示功能。 此POSIX子系统在Windows XP和Windows Server 2003中已被移除。它被使用子系统的“”取代。.
嵌入式SQL
嵌入式SQL（英文: Embedded SQL）是一种将SQL语句直接写入C语言、COBOL、FORTRAN及Ada等编程语言源代码中的方法。藉此方法，可使得应用程序拥有了访问数据以及处理数据的能力。在这一方法中，将SQL文嵌入的目标源码的语言称为宿主语言。 在1986年发布的SQL86标准中定义了对于COBOL、FORTRAN及PI/L等语言的嵌入式SQL的规范。在1989年发布的SQL89规范中，定义了对于C语言的嵌入式SQL的规范。一些大型的数据库厂商发布的数据库产品中，都提供了对于嵌入式SQL的支持。比如Oracle、DB2等。.
Bash
bash，Unix shell的一種，在1987年由布萊恩·福克斯為了GNU計劃而编写。1989年釋出第一個正式版本，原先是計劃用在GNU作業系統上，但能运行于大多数类Unix系统的操作系统之上，包括Linux與Mac OS X v10.4都將它作為預設shell。它也被移植到Microsoft Windows上的Cygwin與MinGW，或是可以在MS-DOS上使用的DJGPP專案。在Novell NetWare與Android在上也有移植。1990年後，Chet Ramey成为了主要的维护者。 Bash是Bourne shell的後繼相容版本與開放原始碼版本，它的名稱來自Bourne shell（sh）的一个双关语（Bourne again / born again）：Bourne-Again SHell。 Bash是一个命令处理器，通常运行于文本窗口中，并能执行用户直接输入的命令。Bash还能从文件中读取命令，这样的文件称为脚本。和其他Unix shell 一样，它支持文件名替换（通配符匹配）、管道、here文档、命令替换、变量，以及条件判断和循环遍历的结构控制语句。包括关键字、语法在内的基本特性全部是从sh借鉴过来的。其他特性，例如历史命令，是从csh和ksh借鉴而来。总的来说，Bash虽然是一个满足POSIX规范的shell，但有很多扩展。 一个名为Shellshock的安全漏洞在2014年9月初被发现，并迅速导致互联网上的一系列攻击。这个漏洞可追溯到1989年发布的1.03版本。.
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Cmus
cmus（C* Music Player）是一个小型、快速的面向类Unix系统操作系统的控制台式音频播放器。cmus以GNU通用公共许可证（GPL）条款分发，并只通过内置的ncurses以操作。 这种纯文本设计减少了程序运行所需要的资源，使其成为了旧款或性能较弱的计算机，以及不具有图形环境（例如X Window System）系统的好选择。.
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Coda
Coda是Constant Data Availability的縮寫，是一套由卡內基美隆大學於1987年開始發展，由Mahadev Satyanarayanan主導研究的分散式檔案系統。本系統的前身由安德魯檔案系統（AFS-2）的舊版本分支出來，兩者提供很多相似的特性。InterMezzo檔案系統亦受到Coda的影響。本系統目前仍持續發展中，但從其官方網站的問題紀錄顯示，自2011年2月已再沒有開發紀錄。雖然有說系統現時已轉往商業應用，但根據Linux內核的開發紀錄來看，相關的開發紀錄其實並不多。.
查看 Cygwin和Coda
Cooperative Linux
Cooperative Linux 简称 coLinux，这个软件可以让Windows内核与Linux内核同时运行在一台机器上。 coLinux 指协作式虚拟机（CVM）。与传统的虚拟机相反， 协作式虚拟机共享宿主机器已有的资源。传统的虚拟机技术，宿主机资源需先被虚拟化，然后再给虚拟系统使用。不同于传统虚拟技术，coLinux的客体机对宿主机资源具有完全的控制权。在传统的虚拟技术里，客体机对实体机的访问一直处于某种未授权状态。.
Cygnus Solutions
Cygnus Solutions（最初名为Cygnus Support）是一家由John Gilmore、Michael Tiemann和David Henkel-Wallace于1989年创办的信息技术公司，旨在为自由软件提供商业支持。它的口号是：“让自由软件使用无忧”（Making free software affordable）。Cygnus是“Cygnus, Your GNU Support”（意为：Cygnus，你的GNU支持）的递归式首字母缩写词。 多年间，Cygnus Solutions的员工是GNU几个主要软件产品的维护者，这些软件包括GNU Debugger、GNU Binutils（包括GNU Assembler和GNU Linker）。该公司也是GCC项目的主要贡献者。Cygnus还开发了BFD软件库，并在许多接受保密协议研制新型芯片的软件开发移植工具情况下，利用它将GNU移植到许多计算架构上。 Cygnus还是Cygwin最早的开发者，Cygwin由一个POSIX层和一组移植到微软视窗系列操作系统的GNU工具集组成。 1999年11月15日，Cygnus Solutions宣布将与紅帽公司合并，2000年初起不再作为单独的公司存在。到2003年为止，许多Cygnus的员工仍继续在紅帽工作，包括Tiemann，他之前担任紅帽公司-zh-hans:首席技术官; zh-hant:技術長;-，现任负责开源事务的副总裁。 Category:软件公司 Category:Red Hat.
Cygwin/X
Cygwin/X 是运行在Microsoft Windows上的X Window System实现。它是自由软件。 Cygwin/X 是Cygwin计划的一部分，可以用Cygwin的标准安装程序进行安装。 Cygwin/X 原先使用 XFree86，但现在使用 X.Org 服务器，因为担心XFree86的新许可证同Cygwin所使用的GPL不兼容。 最近的发行版本添加了对"无根窗口"操作的支持，此时X的根窗口不会显示，X应用看起来像成熟的顶层应用程序运行在Windows桌面上。在引入这个功能以前，所有的X窗口被限制在一个独立的容器窗口之中（风格类似于MDI子窗口）。.
Dd (Unix)
dd是一个Unix和类Unix系统上的命令，主要功能为转换和复制文件。 在Unix上，硬件的设备驱动（如硬盘）和特殊设备文件（如/dev/zero和/dev/random）就像普通文件一样，出现在文件系统中；只要在各自的驱动程序中实现了对应的功能，dd也可以读取自和/或写入到这些文件。这样，dd也可以用在备份硬件的引导扇区、取得一定数量的随机数据等任务中。dd程序也可以在复制时处理数据，例如转换字节序、或在ASCII与EBCDIC编码间互换。 dd的名字可能来源于IBM的工作控制语言（JCL）中的DD语句，意为“Data Description”（数据描述）的缩写。该命令的语句与JCL中的相似，而与其他Unix命令较不同，因此这可能是个玩笑。另一种解释是“cc”（根据命令自身的描述，为“convert and copy”（转换和复制））已经被C语言编译器（C compiler）所占。 dd命令由单一UNIX规范的一部分，IEEE标准1003.1-2008所规定。.
DotGNU
DotGNU計畫是GNU為了提供Microsoft.NET一份自由软件替代品的一部份。這個計畫其它的目標包含了支援非Windows平台和支援更多的中央处理器。 DotGNU主要的目標是要提供一個百分之百相容於通用语言架构的類別庫。然而矛盾的是，另外一個開放源始碼的實作，Mono提供了百分之百相容於CLS規範的類別庫並且提供了目前由微軟所釋出的商業版本.NET的類別庫。DotGNU計畫則宣稱這些由微軟所釋出的商業版本之類別庫並沒有完全遵循在ECMA所發行的CLS標準規範。.
西交兵马俑BBS
西交兵马俑BBS是西安交通大学的官方BBS，中国教育网内较早的BBS之一，也是较有影响的BBS之一。下设开发技术、电脑应用、学术科学、社会科学、文学艺术、知性感性、体育运动、休闲音乐、游戏娱乐、兄弟院校、乡音乡情、校务信息、俱乐部区、本站系统、交通大学和新闻信息十六个大的讨论区。.
辦公室套裝軟體比較
下列是討論各種辦公室套裝軟體的一般功能與專業功能。如果要有更進一步的資訊請參考各軟體的條目。本表僅提供較廣泛籠統的說明。.
适用于 Linux 的 Windows 子系统
适用于 Linux 的 Windows 子系统（Windows Subsystem for Linux，简称WSL）是一个为在Windows 10上能够原生运行Linux二进制可执行文件（ELF格式）的兼容层。它是由微软与Canonical公司合作开发，目标是使纯正的Ubuntu 14.04 "Trusty Tahr"映像能下载和解压到用户的本地计算机，并且映像内的工具和实用工具能在此子系统上原生运行。 WSL提供了一个微软开发的Linux兼容内核接口（不包含Linux代码），来自Ubuntu的用户模式二进制文件在其上运行。 该子系统不能运行所有Linux软件，例如那些图形用户界面，以及那些需要未实现的Linux内核服务的软件。不过，这可以用在外部X服务器上运行的图形X Window系統缓解。 此子系统起源于命运多舛的Astoria项目，其目的是允许Android应用运行在Windows 10 Mobile上。此功能组件从Windows 10 Insider Preview build 14316开始可用。 File:WSL gui Firefox.png|运行于WSL中的Firefox File:WSL gui Synaptic.png|运行于WSL中的Synaptic.
查看 Cygwin和适用于 Linux 的 Windows 子系统
Freeciv
《Freeciv》是一個回合制策略遊戲。它的概念源自於席德·梅爾在1991年為美國微文公司（Micro Prose）所創造出來的一款電腦遊戲《文明帝國》。它是一個依據GNU通用公共许可证之下開發的自由軟體。其原始碼、圖片、音效等，都是世界各地的開發者供獻而成。.
Gambas
Gambas是一个面向对象的BASIC语言分支和一个附带的IDE，能在Linux以及其他类Unix系统计算机操作系统中运行。它提供一个与Visual Basic相似的用户体验。Gambas被设计成为一个针对迁移到Linux平台上Visual Basic开发者的Visual Basic替代产品。 'Gambas'是Gambas Almost Means Basic的递归缩写。Gambas在西班牙语中是表示虾，这也是Gambas标志的由来。 Gambas在1999年由Benoît Minisini在巴黎开始开发，Gambas是自由软件，在GNU通用公共许可证下发布。.
GCC
GNU编译器套裝（GNU Compiler Collection，縮寫為GCC），指一套编程語言编译器，以GPL及LGPL許可證所發行的自由軟體，也是GNU計畫的关键部分，也是GNU工具链的主要組成部份之一。GCC（特别是其中的C语言编译器）也常被认为是跨平台编译器的事实标准。1985年由理查德·马修·斯托曼開始發展，現在由自由軟體基金會負責維護工作。 原名為GNU C語言編譯器（GNU C Compiler），因為它原本只能處理C語言。GCC在发布后很快地得到擴展，變得可處理C++。之後也變得可處理Fortran、Pascal、Objective-C、Java、Ada，Go與其他語言。 許多操作系統，包括許多类Unix系統，如Linux及BSD家族都採用GCC作為标准编译器。蘋果電腦预装的Mac OS X操作系统也採用這個編譯器。 GCC原本用C開發，後來因為LLVM、Clang的崛起，它更快地將開發語言轉換為C++。許多C的愛好者在對C++一知半解的情況下主觀認定C++的性能一定會輸給C，但是Ian Lance Taylor給出了不同的意見，並表明C++不但性能不輸給C，而且能設計出更好，更容易維護的程式（、）。.
查看 Cygwin和GCC
Gerris
Gerris 是一个跨平台的计算流体力学软件, 并且是遵守GNU通用公共许可证的自由软件.
Git
git（，）是一个分散式版本控制软件，最初由林纳斯·托瓦兹（Linus Torvalds）創作，於2005年以GPL釋出。最初目的是为更好地管理Linux内核开发而设计。应注意的是，这与GNU Interactive Tools（一个类似Norton Commander界面的文件管理器）有所不同。 git最初的开发动力来自于BitKeeper和Monotone。git最初只是作为一个可以被其他前端（比如Cogito或Stgit）包装的后端而开发的，但后来git内核已经成熟到可以独立地用作版本控制。很多著名的软件都使用git进行版本控制，其中包括Linux内核、X.Org服务器和OLPC内核等项目的开发流程。.
查看 Cygwin和Git
GNU Guile
GNU Guile 是 GNU 计划首选的扩展系统，是 Scheme 程序设计语言的一种实现，首个版本于1993年问世。 Guile 提供了“libguile”可将语言嵌入至其他程序并通过 C API 紧密的结合。同样的，新的类型和子程序的定义也可以通过 C API 扩展 Guile 自身。.
GNU TeXmacs
GNU TeXmacs 是一个自由的科学文本编辑器和 GNU 项目的排版组件。它吸收了 TeX 和 Emacs 的特点，尽管未使用这两者的代码。TeXmacs 使用 TeX 字体。它由 Joris van der Hoeven 开发和维护。该程序能够以所见即所得的用户界面创建结构化文档。用户可以自行创建新的文档样式。编辑器采用高质量的排版算法和 TeX 字体用于专业出版。.
GNU工具链
GNU工具链（GNU toolchain）是一个包含了由GNU計劃所产生的各种编程工具的集合，由自由軟體基金會負責維護工作。这些工具形成了一条工具链，用于开发应用程序和操作系统。 GNU工具链在针对嵌入式系统的Linux内核、BSD及其它软件的开发中起着至关重要的作用。GNU工具链中的部分工具也被Solaris, Mac OS X, Microsoft Windows (via Cygwin and MinGW/MSYS) and Sony PlayStation 3等其它平台直接使用或进行了移植。.
Iconv
iconv是一个计算机程序以及一套应用程序编程接口的名称。它的作用是在多种国际编码格式之间进行文本内码的转换。支持的内码包括：.
查看 Cygwin和Iconv
Irssi
Irssi是一个文本用户界面的IRC客户端程序，遵循GPL发布。 最初Irssi是为了运行在Unix-like操作系统上的（包括Android），但也能运行于Microsoft Windows上的Cygwin。OS X平台上提供全功能的Irssi，包括文本模式下使用Fink的版本，一个原生GUI叫做Mac Irssi的版本，还有从前的Cocoa客户端Colloquy（基于他们自己的IRC库的实现）。 与其他IRC客戶端程式不同之處是，Irssi 並非是基于 ircII 代码，而是全部重新開發的。这使得开发者不用受已經存在的程式碼的限制。讓開發者可以維護並加強控制像是安全性還有客制化的問題。數量很多的模組還有Perl脚本客制化了Irssi的運作還有介面。 Irssi 可以透過本身的使用者介面來修改設定，必要時也可以透過手動修改設定檔，該設定檔使用類似 Perl 的結構。 2002年5月Irssi的autoconf操作檔configure被發現被值入後門長達兩個月，然而二進位執行檔沒有被值入。這個安全問題在被發現後馬上就被修正。.
查看 Cygwin和Irssi
Kill (命令)
在電腦運算中，kill是一个在多种流行操作系统上都可见到的命令，可向运行中的行程发送信号，以请求进程终止。.
Lighttpd
lighttpd（發音為lighty）是一套开放源代码的網頁伺服器，以BSD許可證釋出。相較於其他的網頁伺服器，lighttpd僅需少量的内存及CPU資源即可達到同樣的效能。.
Linux发行版
Linux 发行版（Linux distribution，也被叫做GNU/Linux 发行版），為一般使用者預先整合好的Linux作業系統及各種應用軟體。一般使用者不需要重新編譯，在直接安裝之後，只需要小幅度更改設定就可以使用，通常以软件包管理系统來進行應用軟體的管理。Linux发行版通常包含了包括桌面环境、办公套件、媒体播放器、数据库等应用软件。这些操作系统通常由Linux内核、以及来自GNU计划的大量的函式库，和基于X Window的图形界面。有些发行版考虑到容量大小而没有预装 X Window，而使用更加轻量级的软件，如：busybox, uclibc 或 dietlibc。现在有超过300个Linux发行版(Linux发行版列表)。大部分都正处于活跃的开发中，不断地改进。 由于大多数软件包是自由软件和开源软件，所以Linux发行版的形式多种多样——从功能齐全的桌面系统以及服务器系统到小型系统 (通常在嵌入式设备，或者启动软盘)。除了一些定制软件 (如安装和配置工具)，发行版通常只是将特定的应用软件安装在一堆函式库和内核上，以满足特定使用者的需求。 这些发行版可以分为商业发行版，比如Ubuntu（Canonical公司）、Fedora（Red Hat）、openSUSE（Novell）和Mandriva Linux；和社区发行版，它们由自由软件社区提供支持，如Debian和Gentoo；也有发行版既不是商业发行版也不是社区发行版，如Slackware。.
Mathomatic
Mathomatic是一个自由，便携式，通用计算机代数系统（CAS） 和计算器软件，可以符号式的解答、化简、结合并比较代数方程，执行复数和多项式的计算，等等。它也可以做符号化的微积分（导数，极值，泰勒级数，和多项式积分以及拉普拉斯变换）并且能操作所有的基本代数。三角函数可以被输入并使用欧拉公式处理。诸如f(x) 和log(x)，测绘，多倍长整数，以及矩阵等功能尚未被引入。Mathomatic不允许超长的表示式进行计算，因为这会耗费大量时间及内存。.
Md5sum
md5sum是一种计算机程序，用于计算与校验RFC 1321所描述的128位MD5哈希值，此处MD5散列值（或校验和）作一个文件的数字指纹使用。.
MinGW
MinGW（Minimalist GNU for Windows），又称mingw32，是将GCC编译器和GNU Binutils移植到Win32平台下的产物，包括一系列头文件（Win32API）、库和可执行文件。 另有可用于产生32位及64位Windows可执行文件的MinGW-w64项目，是从原本MinGW产生的分支。如今已经独立发展。.
查看 Cygwin和MinGW
Mosh
Mosh（mobile shell）是一套從用戶端連到伺服器端的軟體。類似於Secure Shell，但還針對對行動環境的特性調整。.
查看 Cygwin和Mosh
Newlib
Newlib，一種C標準函式庫，為自由軟體，主要用於嵌入式系統上。由Cygnus Solutions開發，目前由Red Hat公司的工程師Jeff Johnson負責維護工作。Cygwin目前即是使用Newlib來作為它的C標準函式庫。.
Node.js
Node.js 是一個能夠在伺服器端運行 JavaScript 的 開放原始碼、跨平台 JavaScript 執行環境。Node.js 由 Node.js 基金會持有和維護，並與 Linux基金會 有合作關係。Node.js 採用 Google 開發的 V8執行程式碼，使用 事件驅動、非阻塞 和 非同步輸入輸出 模型等技術來提高效能，可優化應用程式的傳輸量和規模。這些技術通常用於資料密集的實時應用程式。 Node.js 大部分基本模組都用 JavaScript 語言編寫。在 Node.js 出現之前，JavaScript 通常作為用戶端程式設計語言使用，以 JavaScript 寫出的程式常在用戶的瀏覽器上執行。Node.js 的出現使 JavaScript也能用於伺服器端編程。Node.js 含有一系列內置模組，使得程式可以脫離 Apache HTTP Server 或 IIS，作為獨立伺服器執行。 目前，Node.js 已被 IBM、Microsoft、Yahoo!、Walmart、Groupon、SAP、 LinkedIn、Rakuten、PayPal、Voxer和GoDaddy 等企業採用。.
NTFS重解析点
NTFS重解析点（NTFS reparse point），微软官方也译--，是NTFS文件系统中的一种对象类型。它在Windows 2000及之后版本中的NTFS v3.0及以上版本中可用。重解析点提供一种扩展NTFS文件系统的方法。一个重解析点包含一个重解析标签和数据，文件系统过滤器（file system filter）可以按标签解读它。微软提供了几个默认标签，包括NTFS符号链接、和NTFS卷挂载点。另外，重解析点在Windows 2000的中作为已移动文件的占位符。它还可以作为硬链接，并且不限于同分卷的文件：可以指向任何本地分卷中的目录。.
PDFedit
PDFedit是一个PDF文档编辑器。它是一个自由软件，支持类UNIX系统和安装了Cygwin的Windows系统。不过，PDFedit不支持编辑受保护或加密的文档，亦不支持文字处理器式的文本编辑。 PDFedit的图形界面基于Qt3和QSA引擎，所以全部操作都可用脚本执行。亦支持以ECMAScript写脚本来使用PDFedit。程序用于处理PDF的组件的一部分是命令行界面。Xpdf用于PDF的低级处理。 PDF是一个设计用来发布，而非编辑文档的复杂格式。PDFedit对于技术用户来说，是一个能提供PDF文档内部结构访问的低级工具。用户可能需要熟悉PDF文档结构才能做出实质性编辑。.
PyMOL
PyMOL是一个开放源码，由使用者贊助的分子三维结构显示软件。由Warren Lyford DeLano编写，並且由DeLano Scientific LLC將它商業化。DeLano Scientific LLC是一個私人的軟體公司，它致力於創造讓普遍的科學與教育社群都能取得的好用軟體工具。 PyMOL适用于创作高品質的小分子或是生物大分子（特别是蛋白質）的三维结构圖像。軟體的作者宣称，在所有正式发表的科學文獻中的蛋白質結構圖像中，有四分之一是使用PyMOL來製作。 PyMOL是少數可以用在結構生物学领域的开放源代码視覺化工具。 軟體以Py+MOL命名：“Py”表示它是由一种计算机语言Python所衍生出來的，“MOL”表示它是用于显示分子（英文为molecule）结构的软件。.
查看 Cygwin和PyMOL
Secure Shell
Secure Shell（安全外壳协议，简称SSH）是一种加密的网络传输协议，可在不安全的网络中为网络服务提供安全的传输环境。SSH通过在网络中建立来实现SSH客户端与服务器之间的连接。虽然任何网络服务都可以通过SSH实现安全传输，SSH最常见的用途是远程登录系统，人们通常利用SSH来传输命令行界面和远程执行命令。使用频率最高的场合类Unix系统，但是Windows操作系统也能有限度地使用SSH。2015年，微软宣布将在未来的操作系统中提供原生SSH协议支持。 在设计上，SSH是Telnet和非安全shell的替代品。Telnet和Berkeley 、rsh、等协议采用明文传输，使用不可靠的密码，容易遭到监听、嗅探和中间人攻击。SSH旨在保证非安全网络环境（例如互联网）中信息加密完整可靠。 不过，SSH也被指出有被嗅探甚至解密的漏洞。早在2011年，中國的網際網路審查機構已經有能力針對SSH連線的刺探及干擾。而後爱德华·斯诺登泄露的文件也指出，美国国家安全局有时能够把SSH协议传输的信息解密出来，从而读出SSH会话的传输内容。2017年7月6日，非营利组织維基解密确认美国中央情报局已经开发出能够在Windows或Linux操作系统中窃取SSH会话的工具。.
Squid (软件)
Squid Cache（簡稱為Squid）是HTTP代理服务器软件。Squid用途广泛的，可以作为缓存服务器，可以过滤流量帮助网络安全，也可以作为代理服务器链中的一环，向上级代理转发数据或直接连接互联网。Squid程序在Unix一类系统运行。由于它是开源软件，有网站修改Squid的源代码，编译为原生Windows版；用户也可在Windows里安装Cygwin，然后在Cygwin里编译Squid。 Squid的發展歷史相當悠久，功能也相當完善。除了HTTP外，對於FTP與HTTPS的支援也相當好，在3.0測試版中也支援了IPv6。但是Squid的上级代理不能使用SOCKS协议。.
SSH客户端比较
SSH客户端是一种使用Secure Shell（SSH）协议连接到远程计算机的软件程序。本文将比较较著名的SSH客户端。.
Uname
uname（unix name的简写）是一个Unix和类Unix操作系统上的程序，可以打印当前计算机和操作系统的名称、版本及其他细节。uname系统调用和命令第一次出现在PWB/UNIX上。这两个由POSIX指定。 一些Unix变种，如AT&T System V3.0版，包含了相关的setname程序，用来改变uname报告的值。 GNU版本的uname包含在“sh-utils”或“coreutils”包中。uname本身不是一个独立的程序。 ver command found in operating systems such as DOS, OS/2 and Microsoft Windows is similar to the uname command.
查看 Cygwin和Uname
Unistd.h
unistd.h 是 C 和 C++ 程序设计语言中提供对 POSIX 操作系统 API 的访问功能的头文件的名称。是Unix Standard的缩写。该头文件由 POSIX.1 标准（单一UNIX规范的基础）提出，故所有遵循该标准的操作系统和编译器均应提供该头文件（如 Unix 的所有官方版本，包括 Mac OS X、Linux 等）。 对于类 Unix 系统，unistd.h 中所定义的接口通常都是大量针对系统调用的封装（wrapper functions），如 fork、pipe 以及各种 I/O 原语（read、write、close 等等）。 类似于 Cygwin 和 MinGW 的 Unix 兼容层也提供相应版本的 unistd.h。.
Windows API
Windows操作系统应用程序接口（Windows API），有非正式的简称法为WinAPI，是微软对于Windows操作系统中可用的核心应用程序编程接口的称法。它被设计为各种语言的程序调用，也是应用软件与Windows系统最直接的交互方式。大多数驱动程序需要对Windows系统更底层次访问接口，由所用版本的Windows的Native API来提供接口。 Windows有一个软件开发套件（SDK, software development kit）提供相应的文档和工具，以使程序员开发使用Windows API的软件和利用Windows技术。.
Xmgrace
Grace是「GRaphing, Advanced Computation and Exploration of data」的缩写。它是在X Window系統和Motif下的所見即所得（所见及所得）的二维绘图软件。Grace可以运行在任何类Unix系统操作系统下。它也成功的运行在OpenVMS、OS/2和Microsoft Windows 9*/NT/2000/XP（Cygwin）。.
文件系统的对比
下列表格对比了一系列文件系统的一般和技术资料，文件系统的具体信息参见链接文章。.
文件编辑器比较
下面的表格对部分文本编辑器各方面进行比较。编辑器详情请浏览它们各自的介绍页面，本文仅供参考。.
时区信息数据库
时区信息数据库，又称TZ database、Zoneinfo database，是一个主要应用于电脑程序以及操作系统的，可协作编辑世界时区信息的数据库。由于该数据库由David Olson创立，因而有些地方也将其称作Olson数据库。数据库由Paul Eggert进行编辑和维护。 它的显著特色是由上面提到的Paul Eggert设计的一套通用时区命名规则，例如"America/New_York"和"Europe/Paris"。 数据库试图记录自1970年（Unix元年）以来时区和城市的变化 ， 并且还包含一些时间的转换，例如夏令时和闰秒。.