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距离矩阵和近鄰結合法

快捷方式: 差异相似杰卡德相似系数参考

距离矩阵和近鄰結合法之间的区别

距离矩阵 vs. 近鄰結合法

在数学中, 一个距离矩阵是一个包含一组点两两之间距离的矩阵(即 二维数组)。因此给定N个欧几里得空间中的点,其距离矩阵就是一个非负实数作为元素的N×N的对称矩阵。这些点两两之间点对的数量,N×(N-1)/2,也就是距离矩阵中独立元素的数量。距离矩阵和邻接矩阵概念相似,其区别在于后者仅包含元素(点)之间是否互相连通,并没有包含元素(点)之间的连通的成本或者距离。因此,距离矩阵可以看成是邻接矩阵的加权形式。 举例来说,我们分析如下二维点a至f。在这里,我们把点所在像素之间的欧几里得度量作为距离度量。 其距离矩阵为: 距离矩阵的这些数据可以进一步被看成是图形表示的热度图(如下图所示),其中黑色代表距离为零,白色代表最大距离。 在生物信息学中,距离矩阵用来表示与坐标系无关的蛋白质结构,还有序列空间中两个序列之间的距离。这些表示被用在结构比对,序列比对,还有在核磁共振,X射线和结晶学中确定蛋白质结构。 有时候距离矩阵也被称作相似性矩阵。. 近鄰相接法(neighbor-joining method)是一種研究DNA而建立親緣關係的方法,在計算生物學、生物信息學、系統生物學、演化生物學與系統發生學中時常使用。在1987年由和根井正利建立該方法。 該方法,後來也應用在電腦演算法之中。 該法依賴距離矩陣資料,由序列建立支序圖或親緣關係圖的方法。先由序列算出每一對細菌間的演化距離,將所有的演化距離資料整理成一個距離矩陣,再利用距離矩陣的資料畫出樹型。.

之间距离矩阵和近鄰結合法相似

距离矩阵和近鄰結合法有(在联盟百科)0共同点。

上面的列表回答下列问题

距离矩阵和近鄰結合法之间的比较

距离矩阵有16个关系,而近鄰結合法有9个。由于它们的共同之处0,杰卡德指数为0.00% = 0 / (16 + 9)。

参考

本文介绍距离矩阵和近鄰結合法之间的关系。要访问该信息提取每篇文章,请访问:

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