系統分類學和门 (生物)

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系統分類學和门 (生物)之间的区别

系統分類學 vs. 门 (生物)

系統分類學（systematics）是研究物種的演化歷史，以及他與其它物種間的關係的學科。關係被可視化为進化樹（別名：進化樹，系統發生樹，系統發育）。系統發育有兩個組成部分，分支顺序（顯示組的關係）和分支長度（顯示進化的量）。利用生物物種在不同的環境，地區進行不同的演化，以基因或是基因產物，也就是蛋白質的資訊，將物種演化的歷史進行解析。比方說形態上的演化傾向等等。. （英文：動物界的門為Phylum，植物界的門為Division）是生物分类法中的一级，位于界和纲之间，有时在门下也分亚门。目前動物界擁有35個門，植物界則擁有16個門。现有系统发生学研究不同门的生物之间的关系，許多門的種類繁多，例如蜕皮动物與有胚植物。.

系统发生学

系统发生学（φυλογένεση，φύλο，现代希腊语：fílo - 种系，性别和γεννήση，现代希腊语：jénnissi - 新生，诞生。英语：Phylogenetics，又稱系統發育學，简称为譜系學）是指在地球历史发展过程中生物种系的发生和发展。 这个概念不单止用于动物种系的发生與发展，还会用在系统学各个层面的分类单元上面。它也会被用到某一特征的在生物发育过程中的进化这一方面。 系统发生学的研究是通过以下的手段实现的：.

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生物分類法

生物分类法（Taxonomy），又稱科學分類法，是用生物分类学方法來對生物的物種分组和歸類的辦法。以级别为基础的系统层次结构中使用的的一个固定数量的层次，域，界，門，綱，目，科，属，种。无级别系统使用任意数量的层次。分类的群体被称为分类单元。 現代生物分類法源於林奈的系統，他根據物種共有的生理特徵分類。在林奈之後，根據達爾文關於共同祖先的原則，此系統被逐漸改進。近年來，應用了生物信息學方法分析基因組DNA，正在大幅改動很多原有的分類。 生物分類法屬於系統分類學。.

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支序分類學

支序分類學（英語：Cladistics）又稱親緣分支分類學，是一種生物分類的哲學，其指只依據演化樹分支的順序，而不參考形態上的相似性來排列物種。此一學派的主要貢獻者一般認為是德國昆蟲學家威利·漢寧根，他稱此為種系發生系統學。 分支研究的最終結果是由被稱之為「分支圖」的樹狀關係圖來描繪出其假定的關係。 現代的系統學研究會收集各方面的資料，包括DNA序列、生化數據和形態學上的數據等。 在一個「分支圖」中，所有的生物體都如同一片樹葉，且每個內節點理想上都是二元（有兩條分歧）的，在此一分歧點兩端的分類群即稱為「旁系分類群」或「旁系群」。每一枝幹，不論其包含了上萬種類別或只有一種類別，都被稱做是一個分支。一個自然的類群應該會有包含在任一分支裡的所有生物體，這個分支會有著屬於此一分支的唯一祖先（一個不會是此一分支外的其他生命體的祖先）。每一分支都會有一些只共同出現在分支內每一個成員上，而不會出現在其他生命體上的特徵。這些特徵稱之為衍徵。例如，堅硬的前翅（鞘翅）是鞘翅目的衍徵，而幼葉卷疊式－由卷曲的幼芽舒展成叶子則是蕨類植物的衍徵。.

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