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核糖核酸外切酶

指数 核糖核酸外切酶

核糖核酸外切酶(Exoribonucleases)是核糖核酸(RNA)的外切酶,是一種能降解RNA,並在5'端或3'端的核苷酸移除的酶。能移除5'端核苷酸的這種酶稱作「5'-3'核糖核酸外切酶」,而能移除3'端的則稱作「3'-5'核糖核酸外切酶」。 此類酶有兩種機理,分別是以水(水解活性)或以無機磷酸鹽(磷酸解活性)去破壞RNA上的核苷酸-核苷酸鍵。水解核糖核酸外切酶分類在EC3.1中,因以水去降解RNA,因此生成單磷酸核苷;而以無機磷酸鹽降解的則因有外在磷酸鹽加在生成分子上,因此形成二磷酸核苷。 核糖核酸外切酶存在於所有生命的界別中,包括細菌、古菌及所有真核生物。能對不同類別的RNA種類作用,包括信使RNA、tRNA、核糖體RNA及微RNA。核糖核酸外切酶可簡單如單個蛋白質分子的(如核糖核酸酶D和核糖核酸酶PH),亦可以複雜至包含多個蛋白質分子的外切體複合物(當中包括核糖核酸外切酶的四個家族)。.

19 关系: 去氧核糖核酸酶古菌外切體複合物外切酶微RNA信使RNA磷酸鹽细菌真核生物EC編號脱氧核糖核酸外切酶TRNA核糖體RNA核糖核酸核糖核酸內切酶核糖核酸酶核酸酶核苷酸方向性

去氧核糖核酸酶

去氧核糖核酸酶(英語:Deoxyribonuclease;縮寫:DNase)又稱DNA酶,是指能經由水解作用,將DNA骨架上的磷酸雙酯鍵切斷的酶。DNA酶是核酸酶(nuclease)中的一種,目前已知的DNA酶有許多不同類型,主要差異在於受質專一性、化學反應機制,以及生物學上的功能。 Category:EC 3.1.21.

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古菌

古菌(Archaea,来自,意为“古代的东西”)又稱古細菌、古生菌或太古生物、古核生物,是单细胞微生物,构成生物分类的一个域,或一个界。这些微生物属于原核生物,它們與细菌有很多相似之處,即它们没有细胞核与任何其他膜结合细胞器,同時另一些特徵相似於真核生物,比如存在重复序列与核小体。 过去曾经将古菌和细菌一同归为原核生物,并将其命名为“古细菌”,但这种分类方式已过时。事实上古菌有其独特的进化历程,并与其它生命形式有显著的生化差异,所以现在将其列为三域系统中的一个域。在这个系统中,古菌、细菌与真核生物各为一个域,并进一步划分为界与门。到目前为止,古菌已被划分为公认的四个门,随着进一步研究,还可能建立更多的门类。在这些类群中,研究最深入的是泉古菌门与广古菌门。但对古菌进行分类仍然是困难的,因为绝大多数的古菌都无法在实验室中纯化培养,只能通过环境宏基因组检测来分析。 古菌和细菌的大小和形状非常相似,但少数古菌有不寻常的形状,如嗜鹽古菌拥有平面正方形的细胞。尽管看起来与细菌更相似,但古菌与真核生物的亲缘关系更为密切,特别是在一些代谢途径(如转录和转译)有关酶的相似性上。古菌还有一些性状是独一无二的,比如由依赖醚键构成的细胞膜。与真核生物相比,古菌有更多的能量来源,从熟悉的有机物糖类到氨到金属离子直到氢气。(如)可以以太阳光为能源,其它一些种类的古菌能进行;但不像蓝藻与植物,没有一种古菌能同时做到这两者而进行光合作用。古菌通过分裂、出芽、断裂来进行无性生殖,但没有发现能产生孢子的种类。 一开始,古菌被认为都是一些生活在温泉、盐湖之类极端环境的嗜极生物,但近来发现它们的栖息地其实十分广泛,从土壤、海洋、到河流湿地。它们也被发现在人类的大肠、口腔、与皮肤。尤其是在海洋中古菌特别多,一些浮游生物中的古菌可能是这个星球上数量最大的生物群体。现在,古菌被认为是地球生命的一个重要组成部分,在碳循环和氮循环中可能扮演重要的角色。目前没有已知的作为病原体或寄生虫的古菌,他们往往是偏利共生或互利共生。一个例子是,生活在人和反刍动物的肠道中帮助消化,还被用于沼气生产和污水处理。嗜极生物古菌中的酶能承受高温和有机溶剂,在被生物技术所利用。.

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外切體複合物

外切体复合物(exosome complex,或PM/Scl complex,上下文意思清楚时,可以直接称為exosome)简称外切酶体、外切体,是一种蛋白质复合物,能够降解各种不同的核糖核酸。由于复合物表现为核糖核酸外切酶活性,所以被命名为外切体。外切体复合物只存在于真核细胞和古菌中;而细菌中则对应有组成和结构更为简单的“降解体”复合物来发挥类似的功能。 外切体的核心是一个由六个亚基组成的环状结构,外围的亚基都结合在这一环状结构上。在真核细胞中,这一核心存在于细胞质和细胞核(特别是核仁)等细胞区室中;在不同的区室中,与之结合的蛋白质也不尽相同,从而可以调控外切体的活性以特异性地降解特定区室的RNA底物。外切体的底物包括信使RNA(mRNA)、核糖体RNA(rRNA)以及多种非编码RNA。外切体具有核糖核酸外切酶功能,也就意味着它可以从RNA的一端(3'端)开始降解作用,而不是从特定位点开始剪切RNA。 虽然没有已知疾病与外切体直接相关,但复合物中的多个蛋白亚基是一些特定自身免疫性疾病(特别是“硬化性肌炎”(Scleromyositis))病人自身抗体的靶标,也是治疗癌症的一些抗代谢化学疗法(能够阻断外切体的活性)的靶标。.

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外切酶

外切酶,或核酸外切酶(exonucleases)可以是單獨存在的酶,或是大型酶複合物的一部分。此類酵素能將聚核苷酸鏈分解成核苷酸。作用方式是將3'或5'端上的磷酸酯鍵水解。.

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微RNA

#重定向 小分子核糖核酸.

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信使RNA

#重定向 信使核糖核酸.

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磷酸鹽

磷酸鹽(phosphate,符号:),是磷酸的鹽,在無機化學、生物化學及生物地質化學上是很重要的物質。.

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细菌

細菌(学名:Bacteria)是生物的主要類群之一,屬於細菌域。也是所有生物中數量最多的一類,據估計,其總數約有5×1030個。細菌的個體非常小,目前已知最小的細菌只有0.2微米長,因此大多--能在顯微鏡下看到它們;而世界上最大的細菌可以用肉眼直接看見,有0.2-0.6毫米大,是一種叫納米比亞嗜硫珠菌的細菌。細菌一般是單細胞,細胞結構簡單,缺乏細胞核以及膜狀胞器,例如粒線體和葉綠體。基於這些特徵,細菌屬於原核生物。原核生物中還有另一類生物稱做古細菌,是科學家依據演化關係而另闢的類別。為了區別,本類生物也被稱做真細菌(Eubacteria)。古細菌與真細菌在生活環境、營養方式以及遺傳上有所不同。細菌的形狀相當多樣,主要有球狀、桿狀,以及螺旋狀。 細菌廣泛分佈於土壤和水中,或著與其他生物共生。人體身上也帶有相當多的細菌。據估計,人體內及表皮上的細菌細胞總數約是人體細胞總數的十倍。此外,也有部分種類分布在極端的環境中,例如溫泉,甚至是放射性廢棄物中,它們被歸類為嗜極生物,其中最著名的種類之一是海棲熱袍菌,科學家是在意大利的一座海底火山中發現這種細菌的。甚至在太空梭上也能生長。然而,細菌種類是如此多,科學家研究過並命名的種類只佔其中的小部份。細菌域下所有門中,只有約一半能在實驗室培養的種類。 細菌的營養方式有自养及异养,其中异养的腐生細菌是生态系统中重要的分解者,使碳循環能順利進行。部分細菌會進行固氮作用,使氮元素得以轉換為生物能利用的形式。細菌也對人類活動有很大的影響。一方面,細菌是許多疾病的病原體,包括肺結核、淋病、炭疽病、梅毒、鼠疫、砂眼等疾病都是由細菌所引發。然而,人類也時常利用細菌,例如乳酪及酸奶和酒釀的製作、部分抗生素的製造、廢水的處理等,都與細菌有關。在生物科技領域中,細菌有也著廣泛的運用。 總的來說,這世界上約有5×1030 隻細菌。其生物量遠大於世界上所有動植物體內細胞數量的總和。細菌還在營養素循環上扮演相當重要的角色,像是微生物造成的腐敗作用,就與氮循環相關。而在海底火山和在冷泉中,細菌則是靠硫化氫和甲烷來產生能量。2013年3月17日,研究者在深約11公里的馬里亞納海溝中發現了細菌。其他研究則指出,在美國西北邊離岸2600米的海床下580米深處,仍有許多的微生物根據這些研究人員的說法:「你可以在任何地方找到他們,他們的適應力遠比你想像的還要強,可以在任何地方存活。.

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真核生物

真核生物(学名:Eukaryota)是其细胞具有细胞核的单细胞生物和多细胞生物的总称,它包括所有动物、植物、真菌和其他具有由膜包裹着的复杂亚细胞结构的生物。 真核生物与原核生物的根本性区别是前者的细胞内含有细胞核,因此以真核来命名这一类细胞。许多真核细胞中还含有其它细胞器,如粒線體、叶绿体、高尔基体等。 由于具有细胞核,因此真核细胞的细胞分裂过程与没有细胞核的原核生物也大不相同。 真核生物在进化上是单源性的,都属于三域系统中的真核生物域,另外两个域为同属于原核生物的细菌和古菌。但由于真核生物与古菌在一些生化性质和基因相关性上具有一定相似性,因此有时也将这两者共同归于新壁總域演化支。 科學家相信,從基因證據來看,真核生物是細菌與古菌的基因融合體,它是某種古菌與細菌共生,異種結合的產物。.

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EC編號

EC編號或EC號是為酶所製作的一套編號分類法,是以每種酶所催化的化學反應為分類基礎。這套分類法亦同時會為各種酶給予一個建議的名稱,所以亦稱為酶學委員會命名法。.

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脱氧核糖核酸外切酶

去氧核糖核酸外切酶(exodeoxyribonuclease,或稱外切去氧核糖核酸酶)是一類可參與切割DNA分子的酶,屬於EC3.1.11。是一種酯酶。.

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TRNA

#重定向 转运核糖核酸.

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核糖體RNA

#重定向 核糖體核糖核酸.

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核糖核酸

核糖核酸(Ribonucleic acid),簡稱RNA,是一類由核糖核苷酸通過3',5'-磷酸二酯鍵聚合而成的線性大分子。自然界中的RNA通常是單鏈的,且RNA中最基本的四種鹼基爲A(腺嘌呤)、U(尿嘧啶)、G(鳥嘌呤)、C(胞嘧啶)通過轉錄後修飾,RNA可能會帶上(Ψ)這樣的稀有鹼基,相對的,與RNA同爲核酸的DNA通常是雙鏈分子,且含有的含氮鹼基爲A(腺嘌呤)、T(胸腺嘧啶)、G(鳥嘌呤)、C(胞嘧啶)四種。 RNA有着多種多樣的功能,可在遺傳編碼、翻譯、調控、基因表達等過程中發揮作用。按RNA的功能,可將RNA分爲多種類型。比如,在細胞生物中,mRNA(信使RNA)爲遺傳信息的傳遞者,它能夠指導蛋白質的合成。因爲mRNA有編碼蛋白質的能力,它又被稱爲編碼RNA。而其他沒有編碼蛋白質能力的RNA則被稱爲非編碼RNA(ncRNA)。它們或通過催化生化反應,或通過調控或參與基因表達過程發揮相應的生物學功能。比如,tRNA(轉運RNA)在翻譯過程中起轉運RNA的作用,rRNA(核糖體RNA)於翻譯過程中起催化肽鏈形成的作用,(小RNA)起到調控基因表達的作用。此外,RNA病毒甚至以RNA作爲它們的遺傳物質。 RNA通常由DNA通過轉錄生成。RNA在細胞中廣泛分佈,真核生物的細胞核、細胞質、粒線體中都有RNA。.

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核糖核酸內切酶

核糖核酸內切酶(Endoribonuclease)是一种RNA酶,对核糖核酸内一定碱基序列中某一定位置发生作用(可以是单链,也可以是双链),把这位置的链切开,再由核糖核酸外切酶进行分解剪切。可以是单个蛋白,如RNase III、RNase A、RNase T1和RNase H,也可以是单个或多个蛋白与RNA的复合体,如核酶RNase P和RNA誘導沉默複合體(RNA-induced silencing complex,RISC)。.

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核糖核酸酶

核糖核酸酶(ribonuclease,常用縮寫:RNase)或稱RNA酶,是一種可將RNA水解成小分子組成的核酸酶(nuclease)。可粗分為核糖核酸內切酶(endoribonuclease)與核糖核酸外切酶(exoribonuclease),這些酶分別歸屬於EC 2.7(磷酸化酶)與EC 3.1(水解酶)中的多個次分類。.

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核酸酶

核酸酶(nuclease)是以核酸为底物,催化磷酸二酯键水解的一类酶。.

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核苷酸

核苷酸(Nucleotide)为核酸的基本组成单位。核苷酸由一個含氮鹼基作為核心,加上一個五碳糖和一個或者多个磷酸基團組成。含氮碱基有五种可能,分别是腺嘌呤、鸟嘌呤、胞嘧啶、胸腺嘧啶和尿嘧啶。五碳糖为脱氧核糖者称为脱氧核糖核苷酸(DNA的單體),五碳糖为核糖者称为核糖核苷酸(RNA的單體)。 根据构成核酸的核苷酸数量分为寡核苷酸(少于或等于15个核苷酸)和多核苷酸(15个核苷酸以上)。.

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方向性

#重定向 方向性 (分子生物学).

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Exoribonuclease核酸外切酶

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