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22 关系: 多系群，學名，屬 (生物)，並系群，乳桿菌屬，内生孢子，光合作用，Bacillus subtilis，系統發生樹，細胞壁，细菌，病原菌，芽孢桿菌屬，芽孢桿菌綱，芽孢桿菌目，鏈球菌屬，革蘭氏陽性菌，腸球菌屬，GC含量，梭菌屬，支原體屬，放線菌門。
多系群
多系群(英语:Polyphyletic group)在生物系統發生學中，是指一個分類群當中的成員，在演化樹上分別位于相隔著其他分支的分支上；也就是說，該分類群並不包含其所有成員的最近共同祖先。一般而言，生物的科學分類會盡量避免使一個正式的分類群成為多系群。 舉例而言，「恆溫動物」（溫血動物）通常指鳥類與哺乳類，但是鳥類與哺乳類的祖先皆為變溫動物（冷血動物），因此哺乳類與鳥類的恆溫性是分別發展出來，也因此「恆溫動物」是一個多系群，且並非一個系統發生學上的分類群。.
學名
在生物分类学中，學名按字面即為科學名，名词组合基于拉丁文文法。它在科學，特別是生物學上使用的名稱。例如，廣為人所接受的植物 (生物)名稱；它也受到國際植物命名法規(ICBN)之規範。：「Scientific name: A formal, universally accepted name, the rules and regulations of which (for plants, algae, fungi and organisms traditionally treated as such) are provided by the International Code of Botanical Nomenclature.」。 學名的第一個字需大寫。而習慣上，在科學文獻的印刷出版時，學名之引用常以斜體表示，或是於正排体學名下加底線表示。學名内所指的有可能是一種生物、一屬的生物或一科的生物。这可因為不同的國際命名法規，有不同的變化。原則上，一種生物的學名只有一個，而這一個學名也只會用來稱呼這一種生物，但目前命名法規各自獨立，因此有可能出現同種動物、植物用同樣的學名。相對的親屬生物可能還有許多不同的名字，學名以外的名字均為俗名。學名使用拉丁化文字，而俗名沒有限制。除拉丁学名外的其他任何名称都是俗名。 目前已知最長的學名為雙翅目的，由42個字母組成，意思是「擁有近似黃蜂飛行姿態而接近水虻的」。最短的學名則分別為南蝠的 Ia io 和奇翼龍的 Yi qi，都僅有4個字母。.
屬 (生物)
#重定向 属.
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並系群
並系群（Paraphyletic group--是支序分类中的一种分类单元，此分類群中的成員皆擁有「最近共同祖先」，但該群中並不包含此最近共同祖先之所有後代。 一個類群是否為並系群，需依不同的分類標準，如不同的DNA序列的比對結果而決定。.
乳桿菌屬
乳桿菌屬（Lactobacillus）即為乳酸桿菌，是一群存在於人類體內的益生菌。乳桿菌因能夠將碳水化合物發酵成乳酸而得名，可用於製造液态酸奶、固态奶酪、德國酸菜、啤酒、葡萄酒、泡菜、醃漬食品和其他發酵食品。益生菌能夠幫助消化，有助人體腸臟的健康，因此酸奶被視為健康食品。.
内生孢子
内生孢子（endospore，又称芽孢或内孢子）是某些特殊种群的细菌，主要是芽孢杆菌属Bacillus与梭菌属Clostridium中细菌产生的特殊休眠体，這些細菌會在缺乏養分的環境時開始進入此休眠狀態，有极强的抗逆性，对热、碱、酸、高渗以及辐射均有强耐受性。通常使用的杀灭芽孢的方法为高压灭菌。普通的巴斯德消毒法无法杀灭芽孢。 這些孢子裡面含有細菌的遺傳物質、核糖體和大量的吡啶二羧酸(Dipicolinic Acid)，吡啶二羧酸是一種內生孢子特有的化學物質，作用是幫助維持孢子處於休眠狀態，在孢子裡佔了高至10%的乾重。.
光合作用
光合作用是植物、藻類等生產者和某些細菌，利用光能把二氧化碳、水或硫化氢變成碳水化合物。可分为產氧光合作用和不產氧光合作用。 植物之所以称为食物链的生产者，是因为它们能够透过光合作用利用无机物生产有机物并且贮存能量，其能量轉換效率約為6%。通过食用，食物链的消费者可以吸收到植物所贮存的能量，效率为10%左右。對大多數生物來説，這個過程是賴以生存的關鍵。而地球上的碳氧循环，光合作用是其中最重要的一环。.
Bacillus subtilis
#重定向 枯草桿菌.
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系統發生樹
系統發生樹（phylogenetic tree）又稱演化樹或进化树（evolutionary tree），是表明被認爲具有共同祖先的各物種間演化關係的樹状图。是一種親緣分支分類方法（cladogram）。在图中，每個節點代表其各分支的最近共同祖先，而節點间的綫段長度對應演化距離（如估計的演化時間）。.
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細胞壁
細胞壁（）是細胞的外層，在細胞膜的外面，細胞壁之厚薄常因組織、功能不同而異。它可以是坚韧的，有弹性，和有时坚硬的。它给细胞提供既有结构支承和保护，同时也作为一种过滤机制。植物、真菌、藻類和原核生物都具有細胞壁，而支原体属細胞不具有細胞壁。 细胞壁的组成随着不同物种而变化，并可能取决于细胞的类型和发展阶段。陆生植物的初生细胞壁（primary cell wall）的组成是多糖类的纤维素，半纤维素和果胶。在细菌中，细胞壁的组成是肽聚糖。古菌细胞壁有各种组分物组成，并可能由糖蛋白的S层，或多糖组成的。真菌具有葡糖胺的聚合物壳多糖组成的细胞壁，和藻类通常具有糖蛋白和多糖组成的细胞壁。与众不同的是，硅藻具有一个由组成的细胞壁。其他辅助分子往往也锚定到细胞壁中，例如木质素和几丁质。.
细菌
細菌（学名：Bacteria）是生物的主要類群之一，屬於細菌域。也是所有生物中數量最多的一類，據估計，其總數約有5×1030個。細菌的個體非常小，目前已知最小的細菌只有0.2微米長，因此大多--能在顯微鏡下看到它們；而世界上最大的細菌可以用肉眼直接看見，有0.2-0.6毫米大，是一種叫納米比亞嗜硫珠菌的細菌。細菌一般是單細胞，細胞結構簡單，缺乏細胞核以及膜狀胞器，例如粒線體和葉綠體。基於這些特徵，細菌屬於原核生物。原核生物中還有另一類生物稱做古細菌，是科學家依據演化關係而另闢的類別。為了區別，本類生物也被稱做真細菌（Eubacteria）。古細菌與真細菌在生活環境、營養方式以及遺傳上有所不同。細菌的形狀相當多樣，主要有球狀、桿狀，以及螺旋狀。 細菌廣泛分佈於土壤和水中，或著與其他生物共生。人體身上也帶有相當多的細菌。據估計，人體內及表皮上的細菌細胞總數約是人體細胞總數的十倍。此外，也有部分種類分布在極端的環境中，例如溫泉，甚至是放射性廢棄物中，它們被歸類為嗜極生物，其中最著名的種類之一是海棲熱袍菌，科學家是在意大利的一座海底火山中發現這種細菌的。甚至在太空梭上也能生長。然而，細菌種類是如此多，科學家研究過並命名的種類只佔其中的小部份。細菌域下所有門中，只有約一半能在實驗室培養的種類。 細菌的營養方式有自养及异养，其中异养的腐生細菌是生态系统中重要的分解者，使碳循環能順利進行。部分細菌會進行固氮作用，使氮元素得以轉換為生物能利用的形式。細菌也對人類活動有很大的影響。一方面，細菌是許多疾病的病原體，包括肺結核、淋病、炭疽病、梅毒、鼠疫、砂眼等疾病都是由細菌所引發。然而，人類也時常利用細菌，例如乳酪及酸奶和酒釀的製作、部分抗生素的製造、廢水的處理等，都與細菌有關。在生物科技領域中，細菌有也著廣泛的運用。 總的來說，這世界上約有5×1030 隻細菌。其生物量遠大於世界上所有動植物體內細胞數量的總和。細菌還在營養素循環上扮演相當重要的角色，像是微生物造成的腐敗作用，就與氮循環相關。而在海底火山和在冷泉中，細菌則是靠硫化氫和甲烷來產生能量。2013年3月17日，研究者在深約11公里的馬里亞納海溝中發現了細菌。其他研究則指出，在美國西北邊離岸2600米的海床下580米深處，仍有許多的微生物根據這些研究人員的說法：「你可以在任何地方找到他們，他們的適應力遠比你想像的還要強，可以在任何地方存活。.
病原菌
#重定向 病原细菌.
芽孢桿菌屬
芽孢桿菌屬（Bacillus）屬於革蘭氏陽性菌，包括模式生物枯草芽孢桿菌和著名的致病菌炭疽桿菌等。此屬細菌中有專性需氧菌或兼性厭氧菌，他們遍佈於各種環境，有些獨立存在亦有些會寄生於其他生物。在不適合生存的情況下，此屬細菌可以轉化為內生孢子以進入休眠狀態，此休眠狀態可以持續很久。 在芽孢桿菌屬中，其中枯草桿菌可以作為科學研究用的模式生物，還有可致病的炭疽桿菌和蠟樣芽孢桿菌。.
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芽孢桿菌綱
芽孢桿菌綱（学名：Bacilli）是厚壁菌門的一綱，包含有芽孢桿菌目和乳桿菌目兩目，其下包含有芽孢桿菌屬和其他如李斯特菌屬等革蘭氏陽性菌。 Category: 細菌.
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芽孢桿菌目
芽孢桿菌目（Bacillales）是厚壁菌門芽孢桿菌綱下的一個目，屬於革蘭氏陽性菌。該目下有代表的屬有芽孢杆菌屬、、葡萄球菌屬。.
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鏈球菌屬
鏈球菌（学名：Streptococcus）是一類球形的革蘭氏陽性細菌，屬於厚壁菌門的一個屬。這些細菌細胞分裂時總是沿一個軸，所以通常成對或者鏈狀的。因爲這些特徵，他們被稱作“鏈球菌”，區別於可以沿多個軸分裂而形成一团細胞的“葡萄球菌”（Staphylococcus）。鏈球菌屬包含了很多個種,其中多數是在人和动物表皮,呼吸道等处的共生菌（commensal flora）, 也有对人类有益的菌种如嗜热链球菌（Streptococcus thermophilus）,但其中也有相当数量的致病菌种.
革蘭氏陽性菌
革蘭氏陽性菌（英文：Gram Positive）是能夠用革蘭氏染色染成深藍或紫色的細菌，而革蘭氏陰性菌不能被染色(但会涂成红色以对比)。它們細胞壁中含有較大量的肽聚糖，但經常缺乏革蘭氏陰性菌所擁有的第二層膜和脂多糖層。多數的革蘭氏陽性菌都是益生菌，不會對人類致病，還能促進腸道菌種平衡，加強人體健康。 革蘭氏陽性菌包含細菌中的一個大門——厚壁菌門（Firmicutes），包括一些著名的屬，如芽孢桿菌(Bacillus)、李斯特菌（Listeria）、葡萄球菌（Staphylococcus）、鏈球菌（Streptococcus）、腸球菌（Enterococcus）和梭菌（Clostridium）。此外厚壁菌門還包括了柔膜菌綱（Mollicutes），如支原體（Mycoplasma），它們不能被革蘭氏法染色，但與這些革蘭氏陽性種類相關。 放線菌是另一大類革蘭氏陽性菌，根據DNA中鳥嘌呤（G）和胞嘧啶（C）的含量，放線菌被稱爲高G+C革蘭氏陽性菌，而厚壁菌被稱爲低G+C革蘭氏陽性菌。如果細胞的第二層膜是衍生特徵，這兩類革蘭氏陽性菌可能是細菌基部的分支，否則它們可能組成關係相對較近的單系群。它們被認爲可能是古細菌和真核生物的祖先，因爲它們都缺乏第二層膜，並且具有一些生化上的相似性，比如含有固醇類。此外，儘管恐球菌-棲熱菌（Deinococcus-Thermus）類細菌結構上類似革蘭氏陰性菌，但也可被染成革蘭氏陽性。.
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腸球菌屬
#重定向 肠球菌.
GC含量
GC含量是在所研究的对象（例如放线菌）的全基因组中，（鸟嘌呤）（Guanine）和胞嘧啶（Cytosine）所占的比例。一种生物的基因組或特定DNA、RNA片段有特定的GC含量。 在DNA链中G和C是以三个氢键相连，而T和A则是两个氢键相连的。氢键的多少体现连接的能量，氢键多的不容易被打断。 在双链DNA中，腺嘌呤与胸腺嘧啶（A/T）之比，以及鸟嘌呤与胞嘧啶（G/C）之比都是1。但是，（A+T）/（G+C）之比则随DNA的种类不同而异。GC含量愈高，DNA的密度也愈高，同时热及碱不易使之变性，因此利用这一特性便可进行DNA的分离或测定。 测定GC含量的方法有：Tm法，HPLC法.
梭菌屬
梭菌屬（Clostridium），菌體呈梭狀，又稱梭狀芽孢桿菌屬或厭氧芽孢桿菌屬，芽孢常比菌體大，是一類能產生内生孢子的厭氣性革蘭氏陽性菌。 梭菌屬廣泛分佈於自然界，以土壤中最多，芽孢圓形或橢圓形。除了產氣莢膜梭菌無鞭毛外，大多有鞭毛。大部份的梭菌屬可以水解糖、蛋白质，又可产生外毒素，成為一些疾病的原因。 *.
支原體屬
支原体是一类无细胞壁结构、介于独立生活和细胞内寄生生活之间的最小的原核生物。许多种类可使人和动物致病，有些腐生种类生活在土壤、污水和堆肥中。屬厚壁菌門柔膜菌綱，可以在培养基上形成极小的菌落。由於不具細胞壁，許多常見的抗生素，如盤尼西林或β－內醯胺類抗生素對支原體是無效的。許多種類的支原體可導致疾病，如肺炎支原體，是某些非典型肺炎與其他呼吸疾病的病原體。生殖道支原體則會引起骨盆腔發炎。 支原体少数可以自由生活在静水中，但多数存在于人类与动物的消化道、呼吸道和泌尿生殖道中，可导致疾病。有的支原体可导致植物病害。.
放線菌門
放線菌（Actinobacteria）是一類革蘭氏陽性細菌，可棲息於水中或陸地上，雖然一開始被認定為土壤菌，但淡水中的种类可能比陸地上的更豐富，它們具有分支的纖維和孢子，依靠孢子繁殖，表面上和屬於真核生物的真菌類似。曾經由於放线菌的形態，人们認爲它们是介於細菌和黴菌之間的物种，因此原来它们被分類爲「放線菌目」（Actinomycetes）。但因爲放線菌沒有核膜，且細胞壁由肽聚糖組成，和其它細菌一樣。目前通過分子生物學方法，放線菌被肯定爲細菌的一個大分支。放線菌用革蘭氏染色可染成紫色（陽性），和另一類革蘭氏陽性菌——厚壁菌門相比，放線菌的GC含量較高 。但2012年的研究顯示，一些淡水的放線菌的GC含量較低，這些淡水放線菌的GC比可以低至 42% 。 放線菌門是重要的細菌門之一，其下包含了最大的屬－鏈黴菌屬。系統發生學的分析可以以谷氨酰胺合成酶序列。 虽然一些最大的、最复杂的菌细胞是放线菌，但是海洋中生活的放线菌已经被描述为具有最小的自由生活的原核细胞。 放線菌重要的屬有：.
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厚壁菌门。
