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44 关系: 动物，原生生物，卟吩，卟啉症，叶绿素，受質，吡咯，吡啶，对甲苯磺酸，尿素，三羧酸循环，人類孟德爾遺傳學，二氢卟吩，休克尔规则，异吲哚，咕啉，四吡咯，Claisen缩合，琥珀酰CoA，紫质症，美国化学会志，真菌，甘氨酸，EC編號，菌綠素，血紅素，超分子，胆色素原，關鍵步驟，邻苯二甲酸酐，脱羧反应，醛，酞菁，酶，酸碱电子理论，苯甲醛，染色体，杂环化合物，次甲基，氯化亚铜，氯化铁，溴化亚铁，有机化学期刊，2,3-二氯-5,6-二氰对苯醌。
动物
動物是多細胞真核生命體中的一大類群，統稱為動物界。動物身體的基本形態會隨著其發育而變得固定，通常是在其胚胎發育時，但也有些動物會在其生命中有變態的過程。 大多數動物能自發且獨立地移動探索，只有極少數的動物（如珊瑚）是固定在一點無法移動。動物行為學是研究動物行為的科學，較著名的行為理論為康納德·洛倫茨提出的本能理論。 已發現的動物化石，多是在五億四千萬年前的寒武紀大爆發時的海洋物種。.
原生生物
原生生物（学名：Protist，）指真核生物域中，不属于植物、动物和真菌的那些一般个体微小、多数为单细胞的、有细胞核和原生质膜包围的细胞器的真核生物。原生生物谱系是一个并系群而非单系群，因为它们并不是一个自然类群，各个大类群之间差异很大且不知道他们的派生关系，只是为了研究方便，将这些细胞结构、繁殖和生活史等方面表现出很大的差异的生物暂时归为一类。 原生生物主要生活在包含液态水的环境中。藻类等原生生物会进行光合作用，同时他们也是生态系统中的初级生产者，在海洋中这类生物属于浮游生物。其他的原生生物会导致一系列的较为严重的人类疾病，这类生物有比如动质体和顶复门动物等，导致的疾病包括部分種類的阿米巴原蟲、疟疾和非洲锥虫病等。 单细胞原生生物虽没有细胞分化，为了执行各种生物学功能，结构更为复杂。结构复杂、变异多样的始祖原生生物发展成为现代原生生物的祖先以及多细胞真核生物——植物、真菌和动物。.
卟吩
卟吩（bǔ fēn，Porphin），旧称“”（léi），是四个吡咯环的 α-碳原子通过四个次甲基（－CH＝）桥相连而成的共轭体系，是最简单的卟啉。.
卟啉症
#重定向 紫質症.
叶绿素
叶绿素是存在于植物、藻类和蓝藻中的光合色素。 光合作用的第一步是光能被叶绿素吸收并将叶绿素离子化。产生的化学能被暂时储存在三磷酸腺苷(ATP)中，并最终将二氧化碳和水转化为氧氣和碳水化合物。叶绿素a和叶绿素b的吸收光谱较为接近，两者在蓝紫光（430~480nm）和红光区（640~660nm）都有一吸收高峰，叶绿素ab对绿光的吸收很少，所以呈绿色。 并非只有叶子才有叶绿素，叶柄的薄壁细胞都有叶绿素的存在。就是在一片叶子之中，也并非只有叶肉细胞有叶绿素，维管束鞘和保衛細胞都有叶绿素。当秋天渐渐来临，日照时间和空气适度都逐渐变少时， 一层在叶柄和树的木质部的细胞就慢慢形成了。这层细胞妨碍了水和养料的输送，因此光合作用减产了，没有了叶绿素的叶子在短时间内就变成其他颜色了。.
受質
#重定向 酶底物 (生物学).
吡咯
吡咯（Pyrrole，1-氮杂-2,4-环戊二烯），杂环化合物之一。分子式，分子量：67.09，CAS号109-97-7。熔点-23℃，沸点129-131℃，密度0.967g/cm。 多个吡咯环可以形成更大的环系，如血红蛋白中的卟啉环，叶绿素中的卟吩环和维生素B12中的咕啉环。.
吡啶
吡啶（CHN，音同“比定”，，系统名氮杂苯）CAS号110-86-1。分子量79.10。 吡啶由苏格兰化学家于1849年在骨焦油中发现，两年后，安德森通过分馏得到纯品。由于其可燃性，安德森以πῦρ (τὸ)（pyr，意为火）命名。.
对甲苯磺酸
对甲苯磺酸（化学式：p-CH3C6H4SO3H，也写作TsOH）是一个不具氧化性的有机强酸，酸性是苯甲酸的一百万倍。白色针状或粉末结晶，易潮解，可溶于水、醇和其他极性溶剂。会使纸张、木材等脱水发生碳化。常见的是对甲苯磺酸一水合物TsOH·H2O。.
尿素
尿素(Urea) 是由碳、氮、氧和氢组成的有机化合物，又稱脲（與尿同音）。其化学公式为 CON2H4、(NH2)2CO 或 CN2H4O，分子质量60，国际非专利药品名称为 Carbamide（碳酰胺）。外观是无色晶体或粉末。它是动物蛋白质代谢后的产物，通常用作植物的氮肥。 尿素在肝合成，是哺乳类动物排出的体内含氮代谢物。這代謝过程称为尿素循环。 尿素是第一种以人工合成无机物质而得到的有机化合物。活力论從此被推翻。.
三羧酸循环
三羧酸循環（tricarboxylic acid cycle） ，亦作檸檬酸循環（citric cycle），是有氧呼吸的第二階段。該循環以循環中一個重要中間體檸檬酸命名，又因爲檸檬酸是一種，該反應又稱爲三羧酸循環。該循環亦因由德國生物化學家克雷布斯（Krebs）發現而稱爲克雷布斯循環（Krebs cycle），克雷布斯亦因此項貢獻獲1953年諾貝爾生理學或醫學獎。丙酮酸在經過丙酮酸脫氫酶系氧化，生成乙酰輔酶A（acetyl-CoA）後，與四碳二元羧酸草酰乙酸化合，生成檸檬酸，進入檸檬酸循環。隨後，經過一系列反應，兩個碳原子轉化爲二氧化碳（CO2）分子，檸檬酸中蘊藏的化學能轉化至還原的輔酶中。檸檬酸循環的終產物仍然是草酰乙酸，這使得該循環能源源不斷地氧化輸入循環的乙酰輔酶A。 一般情況下，檸檬酸循環產生的還原輔酶會連同糖酵解過程產生的還原輔酶一同，在氧化磷酸化過程中氧化，生成大量的ATP。一分子的乙酰輔酶A在被檸檬酸循環代謝後，可產生兩分子的CO2分子、三分子NADH、一分子FADH2，以及一分子GTP。 檸檬酸循環可以代謝糖類、脂質，以及大部分氨基酸，因爲這三類物質都能轉換爲乙酰輔酶A或檸檬酸循環的中間體，從而進入檸檬酸循環之中。另外，檸檬酸循環的許多中間體可供生物體利用。當中間產物不足時，可通過添補反應對中間產物進行補充。生物體最重要的填補反應是在丙酮酸羧化酶催化下，以一分子丙酮酸和一分子二氧化碳分子爲原料，合成一分子草酰乙酸的反應。 檸檬酸循環發生於線粒體基質中，但也會部分地在線粒體內膜或嵴膜上發生。.
人類孟德爾遺傳學
人類孟德爾遺傳學（Mendelian Inheritance in Man，缩写MIM）是一個數據庫將現時所知的遺傳病分類，並且連接相關的人類基因組中的基因。這個數據庫出版了名為《孟德爾遺傳定律說明》，最新的版本是第12版。它亦有網上版本，稱為在線人類孟德爾遺傳（英文：Online Mendelian Inheritance in Man，簡稱OMIM）。 OMIM™及Online Mendelian Inheritance in Man™是約翰·霍普金斯大學的商標。.
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二氢卟吩
有机化学中，二氢卟吩是一种大型杂环化合物，具有一个芳香环作为核心，由3个吡咯与一个吡咯啉通过四个CH-连接而成。不同于卟吩或卟啉的中央芳香环结构，二氢卟吩的芳香性不是通过环的整体周围。 含镁的二氢卟吩形成了叶绿素，是叶绿体的核心光敏色素。 相关的化合物，由两个吡咯与两个吡咯啉形成的分子称为细菌卟吩（bacteriochlorin）与异菌卟吩（isobacteriochlorin）。 由于具有光敏性，二氢卟吩用于试验性的光動力療法。.
休克尔规则
休克尔规则是有機化學的经验規則。它是指當闭合环状平面型的共轭多烯（輪烯）π电子数为4n+2时，具有芳香性。 例如，苯、18-轮烯具有芳香性，而环丁二烯和环辛四烯不具有芳香性。10-轮烯不具有芳香性，因为所有参与共轭的碳原子不都在同一平面上。 该规则的量子力学基础在1931年由物理化学家埃里希·休克尔（Erich Hückel）公式化并提出。4n+2规则的简洁表述在1951年由冯·多林（von Doering）提出，虽然几个作者当时同时使用了这种表达方式。 如果一种环状化合物如果π电子的数目等于4n+2（n为任意自然数），那么它就符合休克尔规则，然而，目前只在n的数值为0到6的分子中找到明显的例子。休克尔规则最早建立在休克尔分子轨道法的基础上，尽管考虑二维势箱中的粒子模型，原子轨道线性组合.
异吲哚
异吲哚（Isoindole）是一种苯并杂环化合物，是吲哚的位置异构体。其环结构存在于酞菁染料和一些生物碱中。.
咕啉
咕啉（Corrin）是一种杂环分子。在内圈的十五元环里，有四个氮原子作为配体。 因为它在维生素B12中与Co(III)离子形成四个配位键，具有中心（Core）地位，故得名。.
四吡咯
四吡咯（Tetrapyrroles）是一類化合物，除了其中的咕啉（corrin）之外，该种类化合物的其它物种含有4個吡咯，且這4個吡咯是經由單碳（如亞甲基或次甲基）橋進行連結，可分為線性或環狀兩大類。 而咕啉也含有四个吡咯环，但仅有三个单碳桥，结构可参见维他命B12。 線性四吡咯含有3個單碳橋，包括：.
Claisen缩合
#重定向 克莱森酯缩合反应.
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琥珀酰CoA
#重定向 琥珀酰辅酶A.
紫质症
#重定向 紫質症.
美国化学会志
《美国化学会志》（Journal of the American Chemical Society，或譯美國化學會期刊、美國化學學會期刊），常用缩写为J.
真菌
真菌即真菌界（学名：Fungi）生物的通称，又稱菌物界，是真核生物中的一大類群，包含酵母、黴菌之類的微生物，及最為人熟知的菇類。真菌自成一界，與植物、動物和原生生物相區別。真菌和其他三種生物最大不同之處在於，真菌的細胞有含幾丁質為主要成分的細胞壁，而植物的細胞壁主要是由纖維素組成。卵菌和黏菌、水黴菌等在構造上和真菌相似，但都不屬於真菌，而是屬於原生生物。研究真菌的學科稱為真菌學，通常被視為植物學的一個分支。但事實顯示，真菌和動物之間的關係要比和植物之間更加親近。 雖然真菌遍及全世界，但大部分的真菌不顯眼，因為它們體積小，而且它們會生活在土壤內、腐質上、以及與植物、動物或其他真菌共生。部分菇類及黴菌可能會在結成孢子時變得較顯眼。真菌在有機物質的分解中扮演著極重要的角色，對養分的循環及交換有著基礎的作用。真菌從很久以前便被當做直接的食物來源（如菇類及松露）、麵包的膨鬆劑及發酵各種食品（如葡萄酒、啤酒及醬油）。1940年代後，真菌亦被用來製造抗生素，而現在，許多的酵素是由真菌所製造的，並運用在工業上。真菌亦被當做生物農藥，用來抑制雜草、植物疾病及害蟲。真菌中的許多物種會產生有的物質，稱為（如生物鹼和聚酮），對包括人類在內的動物有毒。一些物種的孢子含有精神藥物的成份，被用在娛樂及古代的宗教儀式上。真菌可以分解人造的物質及建物，並使人類及其他動物致病。因真菌病（如）或食物腐敗引起的作物損失會對人類的食物供給和區域經濟產生很大的影響。 真菌各門的物種之間不論是在生態、生物生命周期、及形態（從單細胞水生的壺菌到巨大的菇類）都有很巨大的差別。人類對真菌各門真正的生物多樣性了解得很少，預估約有150萬-500萬個物種，其中被正式分類的則只有約5%。自從18、19世紀，卡爾·林奈、克里斯蒂安·亨德里克·珀森及伊利阿斯·馬格努斯·弗里斯等人在分類學上有了開創性的研究成果之後，真菌便已依其形態（如孢子顏色或微觀構造等特徵）或依生理學給予分類。在分子遺傳學上的進展開啟了將DNA測序加入分類學的道路，這有時會挑戰傳統依形態及其他特徵分類的類群。最近十幾年來在系统发生学上的研究已幫助真菌界重新分類，共分為一個亞界、七個門、及十個亞門。.
甘氨酸
氨酸（glycine，简写为Gly或G），即胺基乙酸，是20个蛋白氨基酸中分子量最小的一个。它是白色或浅黄色晶体，易溶于水，有甜味。甘氨酸的侧键是一个氢原子。甘氨酸的α碳连接两个氢原子，故不是旋光异构体。由于甘氨酸的侧键非常小，它可以占据其它氨基酸无法占据的空间，比如作为胶原螺旋内的氨基酸。 在一些蛋白质中（比如细胞色素、肌红蛋白和血红蛋白）它随着进化的演变变化相当小，因为假如一个比较大的氨基酸取代它的话整个蛋白质的结构就会变化。 大多数蛋白质只含少量甘氨酸，膠原蛋白是一个重要的例外，它含三分之一的甘氨酸。.
EC編號
EC編號或EC號是為酶所製作的一套編號分類法，是以每種酶所催化的化學反應為分類基礎。這套分類法亦同時會為各種酶給予一個建議的名稱，所以亦稱為酶學委員會命名法。.
菌綠素
菌綠素，或者稱細菌葉綠素（英文bacteriochlorophyll，简写BChl）是存在於多種細菌中的光合色素。它們和植物、真核藻類和藍藻中的葉綠素結構上類似。含有菌綠素的細菌能進行光合作用，但不產生氧氣。不同類群的細菌具有不同種類的菌綠素： 菌綠素a，b和g是細菌二氫卟酚，這意味著它們的分子具有含兩個吡咯環（B和D）的細菌二氫卟酚大環。 菌綠素c，d，e和f是二氫卟酚，這意味著它們的分子具有二氫卟酚大環以及一個吡咯環（D）。.
血紅素
血紅素在不同地區有不同含意，可以指：.
超分子
超分子（supermolecule）是在1937年由德国化學家K.L. Wolf提出，最早是形容由氫鍵鍵結的乙酸二聚體。超分子化學是有關分子錯合物非共價鍵結的相關研究。「超分子」一詞有時是指超分子組裝，是由二個或多個彼此沒有形成共價鍵結的分子（一般是高分子）所組成的錯合物 。在生物化學中，「超分子」是指像肽及寡核苷酸等由生物分子組成的錯合物。.
胆色素原
胆色素原（Porphobilinogen，亦称为卟胆原，简称为PBG）是一种作为卟啉(Porphyrin)生物合成中间体的吡咯(Pyrrole)衍生物，而卟啉(Porphyrin)為合成血基質的原料之一。 由两分子(下圖dALA) 在(又稱下圖之，圖上ALA dehydrogenase為誤植)催化下缩合、环化而成。 而后4分子胆色素原在（下圖右側 PB deaminase）催化下，将脱去侧链上的氨基，缩聚为含有4个吡咯(Pyrrole)环的。(見下圖右側 Hydroxymethyl bilane) 在急性間歇性紫質症患者之尿液中，胆色素原會有增加的情況。 File:Heme synthesis Dutch text.png|血紅素合成 Category:代谢 Category:吡咯 Category:羧酸 Category:胺.
關鍵步驟
酵素學中，關鍵步驟(Committed step；也被稱為第一關鍵步驟，first committed step)，發生於某些分子的生化合成反應之分歧點上，且可有效使需酶促反應之逆向進行。 如同其名稱所示，經過此步驟後，分子被”指定”(committed)到特定的代謝路徑中，最後仍會出現於此途徑的最終產物中。第一關鍵步驟不應該與速率決定步驟混淆，速率決定步驟為反應或代謝路徑中反應最慢的步驟。然而，在某些例子中，反應的第一關鍵步驟等同為速率決定步驟。.
邻苯二甲酸酐
邻苯二甲酸酐，简称苯酐，是邻苯二甲酸分子内脱水形成的环状酸酐。苯酐为白色固体，分子式C6H4(CO)2O，是化工中的重要原料，尤其用于增塑剂的制造。.
脱羧反应
脱羧反应是有机化合物中的羧基（-COOH）转变为氢（-H），同时放出二氧化碳（CO2）的反应。.
醛
醛（；aldehyde）是含有甲酰基的一类有机化合物。这种官能团具有结构通式：R-CHO，其中的羰基中心连接了一个氢原子与一个R基团。不带有R的基团称为醛基或甲酰基。醛与酮化合物的区别在于羰基所处的位置是在碳链骨架的末端或是在两个碳原子之间。醛在有机化学中很常见，许多的香水都属醛类。.
酞菁
酞菁（Phthalocyanine），是一类大环化合物，环内有一个空腔，直径约2.7 × 10−10m。中心腔内的两个氢原子可以被70多种元素取代，包括几乎所有的金属元素和一部分非金属元素。酞菁环的配位数是四，依金属的原子尺寸和氧化态，一个或两个(对部分碱金属而言)金属原子可以嵌入酞菁的中心腔内。如果金属趋向于更高的配位数，金属酞菁的分子会呈角锥体，四面体或八面体结构。锕系和镧系金属是八配位的，这两个系的金属酞菁呈现三明治型结构。.
酶
酶（Enzyme（ ））是一类大分子生物催化劑。酶能加快化學反應的速度（即具有催化作用）。由酶催化的反應中，反應物稱爲底物，生成的物質稱爲產物。幾乎所有細胞內的代謝過程都離不開酶。酶能大大加快這些過程中各化學反應進行的速率，使代謝產生的物質和能量能滿足生物體的需求。細胞中酶的類型對可在該細胞中發生的代謝途徑的類型起決定作用。對酶進行研究的學科稱爲「酶學」（enzymology）。 目前已知酶可以催化超過5000種生化反應。大部分酶是蛋白質，有少部分酶是具有催化活性的RNA分子，这些酶被称为核酶。酶的特異性是由其獨特的三級結構決定的。 和所有的催化劑一樣，酶通過降低反應活化能加快化學反應的速率。一些酶可以將底物轉化爲產物的速率提高數百萬倍。一個比較極端的例子是。該酶可以使在無催化劑條件下需要進行數百萬年的化學反應在幾毫秒內完成。從化學原理上講，酶和其它所有催化劑一樣，反應不會使其物質量發生變化。酶亦不能改變化學平衡，這一點和其它催化劑也是一樣的。酶和其它催化劑的不同之處在於，它們的專一性要強得多。一些分子可以影響酶的活性。如酶抑制劑能降低酶的活性，酶激活劑能提高酶的活性。許多藥物及毒物是酶的抑制劑。當超出適宜的溫度和pH值後，酶的活性會顯著下降。 酶在工业和人们的日常生活中的应用也非常广泛。例如，药厂用特定的合成酶来合成抗生素；洗衣粉中添加酶能加速附着在衣物上的蛋白质、淀粉或脂肪漬的分解；嫩肉粉中加入木瓜蛋白酶能將蛋白質分解爲稍小的分子，使肉的口感更嫩滑。.
酸碱电子理论
酸碱电子理论，也称广义酸碱理论、路易斯酸碱理论，是1923年美国化学家吉尔伯特·路易斯提出的一种酸碱理论。该理论认为：凡是可以接受外来电子对的分子、基团或离子为酸（路易斯酸）；凡可以提供电子对的分子、基团或离子为碱（路易斯碱）。因為跳脫了限定氫離子與氫氧根的酸鹼概念，这种理论包含的酸碱范围很广，但是，它对确定酸碱的相对强弱来说，没有统一的标度，对酸碱的反应方向难以判断。后来，提出的软硬酸碱理论弥补了这种理论的缺陷。 常見的路易斯酸有：.
苯甲醛
苯甲醛（C6H5CHO）为苯的氢被醛基取代后形成的有机化合物。苯甲醛为最简单的，同时也是工业上最常为使用的芳醛。在室温下其为无色液体，具有特殊的杏仁气味。苯甲醛为苦扁桃油提取物中的主要成分，也可从杏，樱桃，月桂树叶，桃核中提取得到。该化合物也在果仁和坚果中以和糖苷结合的形式（扁桃苷，Amygdalin）存在。当今苯甲醛主要由甲苯通过不同的途径制备。.
染色体
-- 染色體（chromosome）是真核生物特有的構造，主要由雙股螺旋的脱氧核糖核酸和5种被称为组蛋白的蛋白质构成，是基因的主要載體。染色体是细胞内具有遗传性质的遗传物质深度压缩形成的聚合体，易被碱性染料染成深色，所以叫染色体（由染色质组成）。染色质和染色体是同一物质在细胞分裂间期和分裂期的不同形态表现。染色体出现于分裂期。染色质出现于间期，呈丝状。其本质都是脱氧核糖核酸（DNA）和蛋白质的组合（即核蛋白组成的），不均匀地分布于细胞核中 ，是遗传信息（基因）的主要载体，但不是唯一载体（如细胞质内的線粒体）。.
杂环化合物
杂环化合物是分子中含有杂环结构的有机化合物。 杂环一概念与碳环相对，指的是成环的原子不仅包括碳，还包括氮、氧或硫等原子。简单的杂环环系从3到10員不等；可以是脂环（如四氢呋喃），也可以是芳环（如吡啶）。复杂的杂环系可以由2个或更多简单环并合而成（如吲哚）。 环中含有氮原子的化合物具有碱性。很多具有生物活性的化合物都是杂环化合物，如维生素B1、组氨酸、DNA的含氮碱基（ATCG）等。血红蛋白分子中含有复杂的卟啉环系。.
次甲基
次甲基（Methine）是指一個和甲烷對應的三價官能團（≡CH）。這個名稱通常使用於： 但有時也會用在.
氯化亚铜
氯化亞銅是銅(I)的氯化物，化學式為CuCl。氯化亞銅為無色固體，常作为制取其他铜化合物的原料。和其他第一列過渡元素的鹵化物不同，它可以和一氧化碳形成穩定的配合物。由于铜(I)常形成四面体型配合物，因此氯化亚铜晶体结构为闪锌矿型的。它是微溶于水的白色固体，易溶于浓盐酸，不纯的氯化亚铜样品因混有氯化铜而现绿色。.
氯化铁
氯化铁（FeCl3）又称三氯化铁，是三价铁的氯化物。它易潮解，在潮湿的空气会水解，溶于水时会释放大量热，并产生啡色的酸性溶液。这个溶液可蚀刻铜制的金属，甚至不锈钢。 无水的氯化铁是很强的路易斯酸，可用作有机合成的催化剂。啡黄色的六水物是氯化铁常见的商业制品，其结构为Cl·2H2O（参见三氯化铬）。 加热至约315℃，氯化铁便熔化，然后变成气态。气体内含有一些Fe2Cl6（参见氯化铝），会渐渐分解成氯化亚铁（FeCl2）和氯气（Cl2）。.
溴化亚铁
溴化亚铁，化学式FeBr2，棕黄色潮解固体，可溶于水。在室温下从水溶液中结晶出淡绿色的六水合物。温度升高时，也可结晶出四水合物和二水合物。400 °C时，在溴化氢气流中加热含水的溴化亚铁，可以得到无水盐。.
有机化学期刊
《有机化学期刊》（the Journal of Organic Chemistry，常缩写为 J. Org.
2,3-二氯-5,6-二氰对苯醌
2,3-二氯-5,6-二氰对苯醌（DDQ），一种醌类。.
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