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173 关系: 基因组进化，假定型生物化学，卤键，单链DNA，反夏因-达尔加诺序列，双乙酸钠，双氢键，变性 (生物化学)，含氮鹼基，向光性，向觸性，壓電效應，外星生命，尼龙，丁二酮肟，三磷酸腺苷，三级氢键，三聚氰酸，三氟乙醇，三溴化金，一氧化碳脱氢酶，丙二酸二乙酯，乙醇，乙酸，亚硒酸，亮氨酸拉链，人類基因組，二級結構，二酮，二氨基二硝基乙烯，弗赖斯重排反应，化学键，化學，包涵体，分子间作用力，分子晶体，嘧啶，咪唑，催化三联体，冠醚，冰，冰晶，凝膠電泳，共价键，共晶体，四面体形分子构型，四正丁基氟化铵，环醇假说，硝酸，硫醇，...，硫酸鹽，硫酸根，硼酸，碳酸氢盐，磷鎢酸，离子键，离散剂，笼形复合物，精氨酸，索烃，縮合反應，纳米技术，羧酸，真核起始因子4E，烯醇，組織蛋白，疏水性，生物化学，生物化学概述，生長素，甲酸，特魯頓規則，盐酸胍，D環，DNA复制，DNA微陣列，螺旋-轉角-螺旋，聚丙烯酸，聚酰胺，萊納斯·鮑林，萬古黴素，非共价作用力，非金属元素，頭髮，風筒，親脂性，親水性，高分子，鳥嘌呤，质子溶剂，超分子，超分子化學，黏合剂，转录，范德华力，胸腺嘧啶，胺，胆红素，阿司匹林，门秀金反应，钴化合物，键线式，脎，脯氨酸，脱氧核糖核酸，醚，醇，量子穿隧效應，自組裝，里宾斯基五规则，金，镍化合物，配位聚合物，配體 (生物化學)，酮，酮-烯醇互变异构，酸度系数，酸碱电子理论，腺嘌呤，苯基硼酸，雜交探針，蛋白質生物合成，蛋白质，蛋白质结构，蛋白质折叠，蛋白脆饼，雙硫鍵，G-四聯體，GC含量，Hajos–Parrish–Eder–Sauer–Wiechert反应，Π螺旋，Α螺旋，Β-转角，Β折叠，TATA盒，抗体，抓氢键，构效关系，杂化材料，核糖体小亚基，核糖体蛋白质，核酸二级结构，核酸热力学，核酸結構，植物體無機鹽運送途徑，氟化氢，氟化氢根，氢，氢氧化镁，氢氧化镉，氧，氮杂双烯狄尔斯–阿尔德反应，氯化钠，水，水分子簇，水的性質，水稻基因組，活性位点，淀粉，溶劑化，溶劑效應，溶剂，未解决的化学问题，朱莉娅-科隆纳环氧化反应，机械键，有机催化，有机磷化合物，有机氟化学，感情纽带，拉乌尔定律，16S 核糖体RNA，2-氨基苯酚，5,5-二甲基-1,3-环己二酮。 扩展索引 (123 更多) »
基因组进化
基因组进化 是 基因组 的结构（序列）或大小随时间变化过程。 基因组进化的研究涉及多个领域，如基因组的结构分析，基因组寄生虫的研究，基因和古代基因组重复，多倍体和比较基因组学。由于原核生物和真核生物的基因序列是稳定增加的，故基因组进化是一个不断变化和发展的领域，况且这些基因序列可以从科学界和广大公众中获取。.
假定型生物化学
假定型生物化学（Hypothetical types of biochemistry）不同于现有的生物化学形式的推测，在科学上是可行的，但现在不能证明实际存在。 地球上已确认的生物物种通常使用含碳有机物的基本构造和进行代谢功能，用水作为溶剂，用DNA或RNA引導生物發育與生命機能運作，可能有未被发现的生命形式存在根本不同的基本结构和不同于已知的生物化学形式。.
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卤键
卤键(XB)是一种卤原子（路易斯酸）和路易斯碱形成的非共价键，尽管卤原子已经形成其他化学键。卤键具体是指卤原子作亲电试剂时形成的相互作用。.
单链DNA
DNA分子以两条反向平行的单链DNA通过碱基对之间的氢键相连组成的双螺旋结构存在。单链DNA可以由DNA分子经过热处理或碱处理而产生的。.
反夏因-达尔加诺序列
反夏因-达尔加诺序列（英文：anti-Shine-Dalgarno sequence）是位于原核细胞核糖体小亚基16S rRNA3'端的段短核苷酸序列，可以按碱基互补配对原理与待翻译的信使RNA（messager RNA，简称mRNA）5'端上游靠近起始密码子处的一段称作“夏因-达尔加诺序列”的短核苷酸序列通过氢键结合，并起始原核翻译。.
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双乙酸钠
双乙酸钠是一种化学式为的化合物，通常用做调味剂以及抗微生物剂。.
双氢键
双氢键是氢键的一种，是金属氢化物与OH或NH基团或其它含质子基团的相互作用。Brown 和 Heseltine 首先发现这一现象。 他们发现在(CH3)2NHBH3的红外光谱的3300和3210cm−1处有强烈的吸收峰。能量较高的峰对应普通的N-H键振动，而能量较低的峰则是N-H键与B-H键结合的结果。如果将溶液稀释，3300 cm−1处的吸收峰会增强，而3210 cm−1处的吸收则明显减弱，证明了这是一个分子间的相互作用。 硼烷氨的晶体检测结果，再一次使大家的目光集中在了双氢键。在这个分子中，如同 Brown 和 Hazeltine 研究的那样，氮上的氢带有部分正电荷，表示为Hδ+，而硼上的氢则带有负电荷，表示为Hδ-。 换句话说，该胺是一个质子酸而硼烷端则带有一个负电荷，因此而形成的。B－H...
变性 (生物化学)
变性（Denaturation）在生物化学中是指蛋白质或核酸受到某些理化因素的作用，其高级结构发生破坏从而丧失生物活性的现象。.
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含氮鹼基
含氮鹼基（nitrogenous base）是一類擁有氮原子的化合物，在性質上為鹼性，是一種鹼基。而胺類是最典型的含氮鹼基。另外組成DNA與RNA的鹼基，如嘧啶類，也是含氮鹼基，又稱核鹼基。.
向光性
向光性（phototropism）是向性的一種，指生物的生長由光源的方向而影響的性質，常見於植物之中。朝向有光的一面生長稱為正向光性，反之稱為負向光性。大部分植物的莖部都是正向光性的，這可幫助葉的光合作用。而根部通常是負向光性的，不過向地性對根部生長方向更為重要。 在部分植物中，莖部的正向光性是由一種由莖頂分泌的生长素（auxin）造成的。受光的一面生长素合成受阻，背光的一面因此会含有更多的生长素并向下运输。生长素一方面能够刺激细胞膜上的质子泵，质子由胞浆流入胞壁，造成胞壁酸化。氢键和细胞壁多糖之间的键裂解，细胞壁松弛，细胞水势下降。细胞外水分流入造成细胞的伸长生长。另一方面，生长素会在基因水平上调节蛋白质合成，如周期蛋白，促进植物生长。.
向觸性
向觸性（）是向性的一種，指生物的生長接觸到物體時而影響的性質，常見於植物之中。部分植物莖部的向觸性是由莖頂分泌的生長素造成的。接觸到物體的一面生長素合成受阻，另一面因此會含有相對較多生長素並向下運輸。生長素一方面能夠刺激細胞膜上的質子泵，質子由細胞漿流入細胞壁，造成細胞壁酸化。氫鍵和細胞壁多糖之間的鍵裂解，細胞壁鬆弛，細胞水勢下降，細胞外水分流入造成細胞延長。另一方面，生長素會在基因水平上調節蛋白質合成，如周期蛋白，促進植物生長。.
壓電效應
压电效应（Piezoelectricity），是电介质材料中一种机械能與电能互换的现象。压电效应有两种，正压电效应及逆压电效应。压电效应在声音的产生和侦测，高电压的生成，电频生成，微量天平（microbalance），和光学器件的超细聚焦有着重要的运用。.
外星生命
外星生命指存在于地球以外的生命体。这个概念囊括了简单的细菌到具有高度智慧的“外星人”。研究和测试关于外星生命猜想的学科被称作地外生物学或天体生物学。自从20世纪中叶以来，人类一直使用包括探测地球之外的电波、天文望远镜观测潜在的宜居行星等方法探测外星生命存在的迹象，但迄今为止并没有确切证据表明外星生命的存在。有人認為發現外星人的機率很小，也有很多人认为外星生命几乎必定存在。 世界各地一直有关于外星人的遐想，在各種史書中也留下不少疑似关于外星人的奇异記載。有人猜测古印度人、古玛雅人、古埃及人建造的發達古文明受到了外星生物科技的影響，更有人宣称曾目睹外星人或与之接触。伴随大量关于外星人的報導、科幻小說和電影的充斥，使得外星生命的传闻绘声绘色。.
尼龙
尼龙（Nylon），又譯為奈綸、耐綸、尼綸、尼龍、锦纶，是一种人造聚合物、纖維、塑料，發明於1935年2月28日，發明者為美国威尔明顿杜邦公司的华莱士·卡罗瑟斯。1938年Nylon正式上市，最早的Nylon制品是Nylon製的牙刷刷子，於1938年2月24日开始出售；妇女穿的尼龙袜，於1940年5月15日上市。Nylon纤维是多种人造纤维的原材料，而硬的Nylon也被用在建筑业中。.
丁二酮肟
丁二酮肟是一種化學為CH3C(NOH)C(NOH)CH3的化學物質，可簡寫為dmgH2。它是丁二酮（或稱雙乙酰）的二肟衍生物，可用於檢驗鈀及鎳。其錯合物在理論化學上頗受關注，可成為酶或催化劑的模型。許多相關的配體可由其他的二酮，如二苯基乙二酮合成。.
三磷酸腺苷
三磷酸腺苷（adenosine triphosphate, ATP；也称作腺苷三磷酸、腺嘌呤核苷三磷酸）在生物化學中是一种核苷酸，作为細胞内能量传递的“分子通货”，储存和传递化学能。ATP在核酸合成中也具有重要作用。它也是RNA序列中的鳥嘌呤二核苷酸，在DNA進行轉錄或複製時可做為替補。.
三级氢键
三级氢键（tertiary hydrogen bond）指在转移核糖核酸(tRNA)折叠成倒L字母形结构中，各种不同的氢键供体与接纳体基团之间所形成的氢键。三级氢键并非普通双螺旋RNA片段中碱基对间的氢键，而是用来维系tRNA三级折叠结构的氢键。.
三聚氰酸
三聚氰酸（化学式：(CNOH)3）是一个三嗪类有机化合物。它是白色無味的固體，被用作漂白水、殺菌劑和除草劑的成分或生产原料。1997年，全球產量超過1.6億公斤。Klaus Huthmacher, Dieter Most "Cyanuric Acid and Cyanuric Chloride" Ullmann's Encyclopedia of Industrial Chemistry" 2005, Wiley-VCH, Weinheim.
三氟乙醇
三氟乙醇或2,2,2-三氟乙醇（化學式：CF3CH2OH），是一種有機化合物 ，缩写為TFE，它是無色、能與水相溶的液體，帶有跟乙醇相似的氣味。由于三氟甲基的强吸电子效应，三氟乙醇的酸性比乙醇强得多，可与杂环化合物生成氢键键连的穩定配合物（例如：THF或吡啶）。.
三溴化金
三溴化金是一个深红色至黑色的水晶固体Macintyre, J. E. (ed.) Dictionary of Inorganic Compounds; Chapman & Hall: London, 1992; vol.
一氧化碳脱氢酶
一氧化碳脱氢酶（carbon monoxide dehydrogenase，缩写为CODH）是一种存在于许多需氧和厌氧微生物中的一类脱氢酶，其催化的是一氧化碳（CO）氧化为二氧化碳（CO2）的反应或其逆反应，在这些微生物的代谢途径中扮演着关键的角色。 不同来源的一氧化碳脱氢酶具有不同的结构和催化机理。需氧细菌中的一氧化碳脱氢酶是一类含钼（Mo）金属蛋白，需氧细菌利用它们在呼吸作用中氧化一氧化碳来获得能量。而在厌氧微生物，包括厌氧细菌和古菌中，其属于含镍（Ni）金属蛋白，在不同种属的微生物中发挥着不同的作用。特别在厌氧微生物固定一氧化碳和二氧化碳的Wood-Ljungdahl代谢途径中，一氧化碳脱氢酶可以与乙酰辅酶A合成酶（同为镍蛋白）结合形成双功能酶，共同发挥作用，将一氧化碳和二氧化碳转化为重要的代谢中间物乙酰辅酶A。 由于一氧化碳脱氢酶能够高效地催化对动物和人体有很高毒性的一氧化碳氧化为二氧化碳，因此对于其催化机理的研究有助于治理环境中的一氧化碳污染。.
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丙二酸二乙酯
丙二酸二乙酯（DEM）是丙二酸的二乙醇酯，无色有苹果味的液体，天然存在于葡萄和草莓中。属于β-二羰基化合物，用作有机合成和药物合成的中间体，可以合成巴比妥酸、维生素B1、维生素B6和人工香料等。类似的化合物还有乙酰乙酸乙酯、丙二酸二甲酯、乙酸乙酯、乙酰丙酮等。 丙二酸二乙酯可通过用氯乙酸为原料，用氰离子增碳生成氰乙酸，再与乙醇酯化制得： 丙二酸二乙酯或取代的丙二酸二乙酯经过“酮式分解”或“酸式分解”，可以得到乙酸或乙酸的衍生物。.
乙醇
乙醇（Ethanol，結構简式：CH3CH2OH）是醇类的一种，是酒的主要成份，所以也俗稱酒精，有些地方俗稱火酒。化學結構通常縮寫為, 或 EtOH，Et代表乙基。乙醇易燃，是常用的燃料、溶剂和消毒剂，也用于有机合成。工業酒精含有少量有毒性的甲醇。医用酒精主要指体积浓度为75%左右（或质量浓度为70%）的乙醇，也包括医学上使用广泛的其他浓度酒精。 乙醇与甲醚是同分异构体。.
乙酸
乙酸，也叫醋酸、冰醋酸，化学式CH3COOH，是一种有机一元酸和短链饱和脂肪酸，为食醋内酸味及刺激性气味的来源。纯正而且无水的乙酸（冰醋酸）是无色的吸湿性固体，凝固点为16.7℃（62℉），凝固后为无色晶体。尽管乙酸是一种弱酸，但是它具有腐蚀性，其蒸汽对眼和鼻有刺激性作用，聞起來有一股刺鼻的酸臭味。 乙酸是一种简单的羧酸，由一個甲基一個羧基組成，是一种重要的化学试剂。在化学工业中，它被用来制造聚对苯二甲酸乙二酯，后者即饮料瓶的主要部分。乙酸也被用来制造电影胶片所需要的醋酸纤维素和木材用胶粘剂中的聚乙酸乙烯酯，以及很多合成纤维和织物。家庭中，乙酸稀溶液常被用作除垢剂。食品工业方面，在食品添加剂列表E260中，乙酸是规定的一种酸度调节剂。 每年世界范围内的乙酸需求量在650万吨左右。其中大约150万吨是循环再利用的，剩下的500万吨是通过石化原料直接制取或通过生物发酵制取。.
亚硒酸
亚硒酸（化学式：H2SeO3，或写作(HO)2SeO），是硒的含氧酸的一种，其中硒的氧化态为+4。它是白色正交晶系晶体，极易溶于水，由二氧化硒溶于少量水缓慢蒸發结晶并用氢氧化钾干燥得到。晶体中稍许畸变的SeO3基团，靠较强的氢键相互连接。 亚硒酸是二元中强酸，中和程度不同时会分别得到亚硒酸氢盐（含HSeO3−）和亚硒酸盐（含SeO32−）： 浓度超过4mol/L的亚硒酸会发生二聚生成H2Se2O5，并脱去一分子水。它与亚硫酸不同，溶液不游离出二氧化硒，固态亚硒酸加热至150°C分解为二氧化硒。 亚硒酸是一个中强的氧化剂，动力学上不活泼。酸性溶液中，它可以氧化二氧化硫、硫化氢、硫脲、碘化钾、硫代硫酸钠、氨、肼、羟胺等还原性物质，半反应为： 碱性溶液中： 它在有机合成中用于制取1,2-二羰基化合物（如乙二醛）。 在更强的氧化剂（如臭氧、氯气、高锰酸根离子）作用下，亚硒酸也可以被氧化为硒酸。亚硒酸有很高毒性，中毒症状可能延迟数小时，包括昏迷、恶心、低血压，严重时可能致死。.
亮氨酸拉链
亮氨酸拉链（leucine zipper，亦称为亮氨酸剪刀）是蛋白质中一种常见的三维结构模体，常见于许多转录因子的DNA结合结构域，因此涉及基因的表达调控。亮氨酸拉链在真核生物和原核生物的蛋白中都有发现，但以真核生物居多。 亮氨酸拉链是一种作为二聚体化结构域的超二级结构，且使相互平行的α-螺旋之间产生粘附力。一个亮氨酸拉链包含了多个亮氨酸残基，通常每七个氨基酸残基就出现一次，这形成了一条两性的α-螺旋，疏水区只在其中一侧。这个疏水区提供了二聚化的区域，使得基序可以像“拉链”一样拉起来。此外，疏水亮氨酸区域对于其结合到DNA是不可或缺的。.
人類基因組
人類基因組，又称人類基因體，是智人的基因組，由23對染色體组成，其中包括22對體染色體、2或1条X染色體和0或1条Y染色體。人类基因组含有約30億個DNA鹼基對，鹼基對是以氫鍵相結合的兩個含氮鹼基，以胸腺嘧啶（T）、腺嘌呤（A）、胞嘧啶（C）和鳥嘌呤（G）四種鹼基排列成鹼基序列，其中A与T之间由两个氢键连接，G与C之间由三个氢键连接，碱基对的排列在DNA中也只能是A对T，G对C。其中一部分的鹼基對組成了大約20000到25000個基因。 全世界的生物學與醫學界在人類基因組計畫中，調查人類基因組中的真染色質基因序列，發現人類的基因数量比原先預期的少得多，其中的外顯子，也就是能夠製造蛋白質的編碼序列，只佔總長度的1.5% 。.
二級結構
蛋白質二級結構（Protein secondary structure）在生物化學及結構生物學中，是指一個生物大分子，如蛋白質及核酸（DNA或RNA），局部區段的三維通式。然而它並不描述任何特定的原子位置（在三級結構中描述）。 二級結構是由生物大分子在原子分辨率結構中所观察到的氫鍵來定義的。蛋白質的二級結構通常是以主鏈中氨基之間的氫鍵模式來定義〈与主链－侧链间以及侧链－侧链间的氢键无关〉，亦即DSSP的定義。而核酸的二級結構是以鹼基之間的氫鍵來定義。 在二级结构中，特定的氫鍵模式往往伴随着其他一些結構特徵；但如果只考虑这些结构特征而忽略氢键本身，则会导致所定義的二級結構不准确。例如，蛋白質的螺旋中的残基都分布在拉氏图（以主鏈二面角为坐标）的特定區域，因此二面角位于这一区域的残基都會被认为参与形成「螺旋」，而不論它是否真正的存在对应氫鍵。其他稍微不准确的定義多是應用曲線微分幾何的觀念，如曲率及扭量。也有一些結構生物學家以肉眼观察通过软件显示的蛋白质结构來決定其二級結構。 對生物大分子的二級結構含量可以以光譜來初步估計。對於蛋白質，最常用的方法是圓二色性(Circular dichroism), （利用長紫外線，波長范围170-250nm）。在获得的光谱吸收曲线上，α螺旋結構会在208nm及222nm两处同时出现极小值，而204nm和207nm处出现单个极小值則分別表示存在无规卷曲和β折疊結構。另一個較常用的方法是紅外光譜，它可以偵測因氫鍵所造成胺基的震盪。而光譜中，测定二級結構最準確的方法是利用核磁共振光谱所纪录的化學位移，由于仪器和样品制备上的原因，这一方法较为少用。.
二酮
二酮指含有两个酮羰基的有机化合物。最简单的二酮是丁二酮，即2,3-丁二酮。丁二酮、乙酰丙酮、2,5-己二酮分别是1,2-、1,3-、1,4-二酮的例子，也可分别称为α-、β-、γ-二酮。环状二酮的例子如双甲酮。 二酮是“二羰基化合物”的子分类，后者涵盖更广范围的羰基化合物，如醛类、羧酸类，等等。.
二氨基二硝基乙烯
二氨基二硝基乙烯，化学名1,1-二氨基-2,2-二硝基乙烯，缩写FOX-7是一种综合性能优异的新型钝感的高能炸药，在较宽温度范围内具有较高的热稳定性。它对撞击、摩擦和静电火花均不敏感，被公认是一种热稳定性好且有较高能量水平的重要含能化合物。由于它的分子内和分子间存在大量氢键，可以降低感度，增加稳定性。它的能量接近HMX，而感度接近TATB。它的相容性好，并且具有较高的热稳定性和化学稳定性。由于其优越的爆炸性能，FOX-7被认为很有希望替代现今使用的RDX炸药。爆轰初期的化学反应机理对于深入探索FOX-7材料的爆炸性质有着重要的意义，越来越受到人们的重视。自1998年首次合成以来，引起了含能材料研究者的高度重视。在中国国内,也先后开展了有关FOX-7的理论、合成方法、合成机理分析以及热分解的研究。.
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弗赖斯重排反应
弗赖斯重排反应是酚酯在路易斯酸或布朗斯特酸催化下重排为邻位或对位酰基酚的反应。 反应由德国化学家 Karl Theophil Fries 首先报道。 反应常用的路易斯酸催化剂有三氯化铝、三氟化硼、氯化锌、氯化铁、四氯化钛、四氯化锡和三氟甲磺酸盐。也可以用氟化氢或甲磺酸等质子酸催化。邻、对位产物的比例取决于原料酚酯的结构、反应条件和催化剂的种类等。一般来说，对位产物是动力学控制产物，邻位产物是热力学控制产物。反应在低温（100°C 以下）下进行时主要生成对位产物，而在较高温度时一般得到邻位产物。可利用邻、对位性质上的差异来分离这两者。一般邻位异构体可以生成分子内氢键，可随水蒸气蒸出。 脂肪或芳香羧酸的酚酯都可以发生重排。因取代基影响反应，底物不能含有位阻大的基团。当酚组分的芳香环上有间位定位基存在时，重排一般不能发生。 这个方法是在酚的芳环上引入酰基的重要方法。.
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化学键
化學鍵（Chemical Bond）是一種粒子間的吸引力，其中粒子可以是原子或分子。透過化學鍵，粒子可組成多原子的化學物質。鍵由兩相反電荷間的電磁力引起，電荷可能來自電子和原子核，或由偶極子造成。化學鍵種類繁多，其能量大小、鍵長亦有所不同。 在原子中，帶負電、繞原子核運行的電子與核內帶正電的質子互相吸引，而位於兩原子核之間的電子則皆受兩方吸引。因此，原子核和電子間最穩定的組態，是當電子位處兩原子核間之時。這些電子使原子核能夠彼此相吸，形成所謂的化學鍵。然而，化學鍵並不能減少個別粒子所構成的體積。由於電子的質量較小且具有物質波性質，它們相較於原子核而言佔據了極大部分的體積，使原子核之間距離較遠。 一般而言，強化學鍵的形成伴隨著原子間電子的共用或轉移。分子、晶體、金屬和雙原子氣體，事實上幾乎生活中所有外在環境，都是由化學鍵所維繫而來；它決定了物質的結構。.
化學
化學是一門研究物質的性質、組成、結構、以及变化规律的基礎自然科學。化學研究的對象涉及物質之間的相互關係，或物質和能量之間的關聯。傳統的化學常常都是關於兩種物質接觸、變化，即化學反應，又或者是一種物質變成另一種物質的過程。這些變化有時會需要使用電磁波，當中電磁波負責激發化學作用。不過有時化學都不一定要關於物質之間的反應。光譜學研究物質與光之間的關係，而這些關係並不涉及化學反應。准确的说，化学的研究范围是包括分子、离子、原子、原子团在内的核-电子体系。 「化學」一詞，若單從字面解釋就是「變化的學問」之意。化学主要研究的是化学物质互相作用的科学。化學如同物理皆為自然科學之基礎科學。很多人稱化學為「中心科學」，因為化學為部分科學學門的核心，連接物理概念及其他科學，如材料科學、纳米技术、生物化學等。 研究化學的學者稱為化學家。在化學家的概念中一切物質都是由原子或比原子更細小的物質組成，如電子、中子和質子。但化学反应都是以原子或原子团为最小结构进行的。若干原子通过某种方式结合起来可构成更复杂的结构，例如分子、離子或者晶體。 當代的化學已發展出許多不同的學門，通常每一位化學家只專精於其中一、兩門。在中學課程中的化學，化學家稱為普通化學（Allgemeine Chemie，General Chemistry，Chimie Générale）。普通化學是化學的導論。普通化學課程提供初學者入門簡單的概念，相較於專業學門領域而言，並不甚深入和精確，但普通化學提供化學家直觀、圖像化的思維方式。即使是專業化學家，仍用這些簡單概念來解釋和思考一些複雜的知識。.
包涵体
包涵体（inclusion bodies），或包含体，是无定形的蛋白质的聚集，不被任何膜所包围。细胞破碎后，包涵体呈颗粒状，致密，低速离心就可以沉淀。包涵体难溶于水中，在变性剂溶液（如盐酸胍、脲）中才能溶解。在这些溶液中，溶解的蛋白质呈变性状态，即所有的氢键、疏水键全被破坏，疏水侧链完全暴露，但一级结构和共价键不被破坏。因此当除去变性剂时，一部分蛋白质可以自动折叠成具有活性的正确构型，这一折叠过程称为蛋白质的复性。 包涵体主要由蛋白质构成，其中大多是基因表达产物。这些基因表达产物没有生物活性。为此，欲获得天然活性态的目标产物，必需分离包涵体后，溶解包涵体并使其中的目标蛋白恢复应有的天然活性。所以，包涵体的出现不仅增加了生化工程师生物分离设计的难度，也为生物化学家的蛋白质折叠（protein folding）机理研究提出了新的课题。 重组DNA技术为大规模生产目标蛋白质提供了崭新的途径，开辟了现代生物技术发展的新纪元。但是，人们在分离纯化基因工程表达产物时遇到了意想不到的困难，很多利用大肠杆菌为宿主细胞的外源基因表达产物（如尿激酶、人胰岛素、人生长激素、白细胞介素－６、人γ－干扰素等）不仅不能分泌到细胞外、而且在细胞内凝聚成没有生物活性的固体颗粒－包涵体（inclusion bodies IBs)。.
分子间作用力
分子间作用力（Intermolecular force），亦稱分子間引力，指存在于分子与分子之间或高分子化合物分子内官能基之间的作用力，简称分子间力。它主要包括：.
分子晶体
分子晶体指的是物质内部由范德华力（又称作范德瓦耳斯力或分子间作用力）将分子结合起来的固体物质。.
嘧啶
嘧啶（，音同「密定」，英語：Pyrimidine）為1,3-二氮杂苯，是一种杂环化合物。嘧啶由2个氮原子取代苯分子间位上的2个碳形成，是一种二嗪。和吡啶一样，嘧啶保留了芳香性。.
咪唑
咪唑（Imidazole），即1,3-二氮唑，是一个五元杂环芳香性有机化合物，化学式。它也是一个生物碱。白色或浅黄色固体结晶，可溶于水、氯仿、醇、醚，具有酸性，也具有碱性。氢原子在两个氮原子之间移动，因此存在两个互变异构体。 咪唑环结构在生物分子中广泛存在，例如组氨酸和对应的荷尔蒙组胺。很多药物也包含有咪唑环，例如硝基咪唑和咪唑类抗真菌药物。.
催化三联体
催化三联体通常指在水解酶和转移酶的活性位点中心同时作用的三个氨基酸残基（如蛋白酶、酰胺酶、酯酶、酰基转移酶、脂酶和β-内酰胺酶）。用于共价催化的亲核残基一般是酸-碱-亲核三联体。残基会形成一个电荷中继网络，以极化和活化亲核试剂，来进攻底物形成共价中间体，然后中间体水解，再生出游离的酶。亲核试剂大多是丝氨酸或半胱氨酸，也有少量是苏氨酸。 因为酶会折叠成复杂的三维结构，催化三联体的残基可能在其所在的氨基酸序列（一级结构）中离得很远，但最后它们将会折叠到一起。 虽然在功能上（甚至是三联体中的亲核体）进化趋异，催化三联体却是趋同进化的最好案例。对催化的化学约束使得至少23个独立的进化出了相同的催化方法。生物化学中，研究得最透彻之一的就是这些反应的作用机理。.
冠醚
冠醚是一种杂环有机化合物，包含有多个醚基团。最常见的冠醚就是乙撑氧的低聚物，其中重复的单位是乙烯氧基（-CH2CH2O- 可看作是环氧乙烷断裂碳氧键后的剩余基团）。这一系列中最重要的是四聚体、五聚体和六聚体。之所以用“冠”来命名，是因为就像皇冠可以戴在头上一样，冠醚能够和一个阳离子成键。在冠醚的命名法中，前面那个数字代表了环内的原子数，第二个数字代表氧的个数。冠醚的概念远远大于乙撑氧的低聚物，另外一个很重要的系列是鄰苯二酚的衍生物。 冠醚一般通过卤代烃与醇盐的威廉姆逊合成反应制取。.
冰
冰，也就是凍結成固態的水。取決於冰內含的雜質（如土壤或氣泡顆粒），冰可以是透明的、或著帶有一點不透明的藍白色。 在太陽系中冰的含量非常豐富。從最接近太陽的水星，到離太陽極遠的歐特雲，都會生成冰。在太陽系以外的地方，英文稱“凍結成固態的水”為"interstellar ice"(星際冰)。冰在地球表面存量極大 - 尤其是在極地地區和雪線以上- 而且，作為地表沉澱物和沉積物的一種常見形式，冰在地球的水循環和氣候上起著關鍵的作用。它可能以雪花、冰雹、霜、冰錐或冰柱......等形式出現。 冰分子可依溫度和壓力，表現出高達十六種不同的形態(分子堆疊形狀)。當水被迅速冷卻後，根據其經過的壓力和溫度，可生成多達三種不同型態的“冰”。當水慢慢冷卻，到達20K以下(約−253.15℃)時，量子穿隧效應可能引起宏觀的量子現象。幾乎所有在地球表面和大氣層裡的冰，都是六角形晶體結構; 相較之下，地表只會產生微量的立方體形冰。其中最常見的生成方式為：當液態水在標準大氣壓(1atm)下冷卻到低於0°C(273.15K，32°F)時，產生六角形晶體冰。冰也可通過水蒸汽直接沉積(凝華)，如霜的形成就是一個很好的例子。從冰變成水的過程被稱為熔化，而從冰直接變成水蒸的過程則被稱為昇華。 冰在各種地方都被廣泛地運用著，包括製冷、冬季運動、和做成冰雕等。.
冰晶
冰晶（ice crystal）是冰的宏观晶体形式。冰晶在光学及电学等物理性质方面有各向异性，并且具有较高的介电常数。冰晶常呈六角柱状、六角板状、枝状、针状等形状，由于大气中的冰晶一般由水蒸气凝華产生，因此具有非常對稱的外型。在不同的環境溫度和濕度中，可以產生不同的對稱外形。当环境因素改变时，冰晶的形成方式也可能会改变，因此最终形成的晶体可能是多种样式混合而成的，例如冠柱晶。空中的冰晶下落时倾向以其侧棱平行于地平线，因此能以增强的差动反射率在偏振天气雷达信号（polarimetric weather radar）中被发现。冰晶带电后，下落的方向便不再平行于地平线。带电的冰晶也很较容易被偏振天气雷达检测出来。.
凝膠電泳
凝胶电泳（英语：Gel electrophoresis）或称胶体电泳，是一种用于大分子（如DNA、RNA、蛋白质）以及其碎片的分离、分析技术。该技术被科学工作者用于分离具有不同物理性质（大小、电荷、等电点）的分子。凝胶电泳通常用于分析用途，但也可以作为预处理技术，在进行质谱、聚合酶链式反应、克隆、DNA测序或者免疫印迹等检测之前，进行分子的纯化。 凝胶电泳在用于分离核酸分子时，带有负电荷的核酸分子在外加电场的作用下穿过凝胶组成的网格。由于较小的分子更容易通过网孔，较小的分子凝胶基质中穿行地更快，并且可以移动得更远。这与分子筛的现象类似。 在分离蛋白质分子时，蛋白质分子往往由于太大而不能穿过凝胶中的网孔，因此蛋白质的分离是依靠蛋白质分子上带的电荷来进行的。 除了分离核酸和蛋白质等分子，凝胶电泳还可以用于分离纳米微粒。 之所以选用凝胶而不是液体作为电泳的介质，有以下因素的考量：首先，外加电场可以引起液体的热对流，在胶体中这种对流会被抑制；其次，有的凝胶可以起到一种分子筛的作用；凝胶还可以延缓分子穿越的速度，并且能在电泳后保持分离结果，为后续的染色提供机会。.
共价键
共价键（Covalent Bond），是化学键的一种。两个或多个非金屬原子共同使用它们的外层电子(砷化鎵為例外)，在理想情况下达到电子饱和的状态，由此组成比较稳定和坚固的化学结构叫做共价键。与离子键不同的是进入共价键的原子向外不显示电荷，因为它们并没有获得或损失电子。共价键的强度比氢键要强，比离子键小。 同一種元素的原子或不同元素的原子都可以通過共價鍵結合，一般共價鍵結合的產物是分子，在少數情況下也可以形成晶體。 吉爾伯特·路易斯于1916年最先提出共价键。 在简单的原子轨道模型中进入共价键的原子互相提供单一的电子形成电子对，这些电子对围绕进入共价键的原子而属它们共有。 在量子力学中，最早的共价键形成的解释是由电子的复合而构成完整的轨道来解释的。第一个量子力学的共价键模型是1927年提出的，当时人们还只能计算最简单的共价键：氢气分子的共价键。今天的计算表明，当原子相互之间的距离非常近时，它们的电子轨道会互相之间相互作用而形成整个分子共用的电子轨道。.
共晶体
共晶体或共晶（英语：cocrystal）是晶体学中的概念，人们对其定义有着争议，一种认为共晶体是由至少两种组分组成的晶体，其组分可以是原子、分子或离子。另一种认为共晶体是由至少两种组分组成的、具有独特性质的晶体。.
四面体形分子构型
四面体形分子构型是指一分子中的中心原子和四個原子鍵結，四個原子形成四面體4個頂點的分子构型。若和中心原子鍵結的4個原子都是同一種原子（例如甲烷CH4），則其鍵角為cos−1(−1/3) ≈ 109.5°。週期表中有許多元素的化合物都是四面体形分子构型，理想分子有Td的對稱點群，但大部份四面体形构型分子的對稱性較低。四面体分子可能會具有手性。.
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四正丁基氟化铵
四正丁基氟化铵或简写为：TBAF是一种季铵盐，具有化学式（CH3CH2CH2CH2)4N+F-）。这种化合物的三水合物或其四氢呋喃溶液属于商业市售试剂。 在实验室中，四丁基氟化氨的四氢呋喃溶液形式常常用于有机可溶性的氟离子，可用其脱除硅醚保护基。它还可用于相转移催化剂和一种温和的碱。通过加热，该化合物还可以对酰氨发生N-烷基化反应。 由于氟原子是一种很强的氢键受体，因此该化合物几乎不可能得到完全干燥的样品。当其在真空下加热到77 °C时，化合物会分解为氟化氢根盐， 当样品在高真空下40 °C干燥，仍然会得到10-30 mol%含水量以及10%的二氟盐。.
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环醇假说
环醇假说（cyclol hypothesis），為第一个折叠的球状蛋白质结构模型概念 ，这是多萝西·林奇在20世纪30年代基于三个假设提出的。首先，该假设假设两个肽键由Cyclol反应交联而成（图1），这些交联键是共价的肽的同系物之间的氢键，而非“共价键”。这些反应已被发现存在于麦角肽和其他化合物中。第二，该假设提出在某些条件下，氨基酸会自然地在最大数量上进行Cyclol交联反应，生成Cyclol分子（图2）和Cyclol结构（图3）。这些Cyclol分子和Cyclol结构从来没有被观察到。最后，该假设认为球状蛋白质的三级结构对应的正多面體和半规则的多面体形成的Cyclol结构是没有自由边缘的。这种“封闭式的Cyclol”分子也没有被观察到。 尽管后来的数据表明，这种本源的球状蛋白质结构需要被修正，几种元素的Cyclol模型也得到了验证，比如Cyclol反应本身和该假设，即疏水性相互作用主要负责蛋白质的折叠。Cyclol假设是一个更精确的DNA双螺旋结构和蛋白质二级结构模型假设，同时激励许许多多的科学家研究蛋白质结构和化学性质的相关问题。Cyclol假设的提出和测试也为经验证伪性作为科学方法的一部分提供了一个很好的例证。.
硝酸
硝酸（分子式：）是一种强酸，其水溶液俗称硝镪水。纯硝酸为无色液体，沸点83℃，在-42℃时凝结为无色晶体，与水混溶，有强氧化性和腐蚀性。其不同浓度水溶液性质有别，市售浓硝酸为共沸物，溶质质量分数为69.2%，一大气压下沸点为121.6℃，密度为1.42g·cm-3，约16mol·L-1，溶质重量百分比足够大（市售浓度最高为98%以上）的，称为发烟硝酸，硝酸是一种重要的化工原料。 硝酸的酸酐是五氧化二氮（）。.
硫醇
硫醇（Thiol）是包含巯基官能团（-SH）的一类非芳香化合物，是一类有机硫化合物。可以看成醇中的氧原子被硫原子替换。.
硫酸鹽
硫酸盐，由硫酸根离子（）与其他金属离子组成的化合物，幾乎都是电解质，且大多数溶于水。.
硫酸根
硫酸根的化学式为SO42−，是硫酸二级电离出的负离子。.
硼酸
酸（分子式：H3BO3）是无机酸，主要用于消毒、殺蟲、防腐，在核電站控制鈾核分裂的速度，以及制取其他硼化合物。其為白色粉末或透明結晶，可溶於水；有時也會以礦物的形式存在，常存在溶解於某些礦物、火山湖水或溫泉。.
碳酸氢盐
碳酸氢盐是碳酸形成的酸式盐，含有碳酸氢根离子—HCO3−。大多数碳酸氢盐对热不稳定，会分解为碳酸盐、二氧化碳和水。碱金属碳酸氢盐溶于水，水溶液呈碱性，与酸迅速反应放出二氧化碳气体，加碱则得到相应的正盐碳酸盐。 钾、钠和铵的碳酸氢盐溶解度都小于相应的正盐，这是由于HCO3−通过氢键形成多聚链状离子。 碳酸氢根在生理学上也有很重要的作用，血液中含有H2CO3-HCO3−组成的缓冲溶液，以抵御大幅度的pH值变化，为酶等生物分子维持适宜的酸碱度。Biology.arizona.edu - October 2006.
磷鎢酸
磷鎢酸（Phosphotungstic acid），簡稱PTA，英文名稱也作tungstophosphoric acid，簡稱TPA，是化學式為31240的雜多酸，平常會以水合物的形式出現，EPTA是磷鎢酸乙醇溶液的簡稱，常用在生物學中。磷鎢酸為小顆粒，灰色或淺黃綠色的晶體，熔點為89 °C（24 H2O的水合物），磷鎢酸可溶於水（200 g/100 ml），水溶液呈無色。磷鎢酸沒有顯著的毒性，是有微酸性的刺激物。 磷鎢酸的離子中含有12個鎢原子，一些早期的研究者不曉得其化學結構，例如生物化學家吳憲Contribution to the chemistry of phosphomolybdic acids, phosphotungstic acids and allied substances H Wu The Journal of Biological Chemistry 43, 1, (1920), 189， 稱其為磷-24-鎢酸，化學式為3H2O.P2O5 24WO3.59H2O，(P2W24O80H6).29H2O，其中鎢、磷和氧的數量有誤，但比例是正確的，一直到1970年代還有論文用到此不正確的化學式On phosphotungstic staining, I G Quintarelli, R Zito, J.A Cifonelli The Journal of Histochemistry and Cytochemistry 19, 11, (1971, 641。 在组织学中磷鎢酸常用在細胞樣本的染色，常和苏木精一稱使用，稱為。磷鎢酸會和结缔组织中的纖維蛋白、膠原蛋白及纖維結合，形成不同的顏色。 磷鎢酸是電子緻密的物質，在電子下是不透明的。在透射电子显微镜中，可以用磷鎢酸來針對病毒、神經、多糖及其他生物組織進行负染色。.
离子键
离子键又被称为盐键，是化学键的一种，通过两个或多个原子或化学基团失去或获得电子而成为离子后形成。带相反电荷的原子或基团之间存在静电吸引力，两个带相反电荷的原子或基团靠近时，周围水分子被释放为自由水中，带负电和带正电的原子或基团之间产生的静电吸引力以形成离子键。 此类化学键往往在金属与非金属间形成。失去电子的往往是金属元素的原子，而获得电子的往往是非金属元素的原子。带有相反电荷的离子因电磁力而相互吸引，从而形成化学键。离子键较氢键强，其强度与共价键接近。 仅当总体的能级下降的时候，反应才会发生（由化学键联接的原子较自由原子有着较低的能级）。下降越多，形成的键越强。 现实中，原子间并不形成“纯”离子键。所有的键都或多或少带有共价键的成分。成键原子之间电平均程度越高，离子键成分越低。.
离散剂
离散剂（chaotropic agent）是一种打断如蛋白质与核酸（如DNA与RNA）等大分子结构并使其变性的物质。.
笼形复合物
形复合物是由包围或包含分子的晶格所构成的化学物质。传统上，笼形复合物由聚合物完全包围客体分子构成，但现在也可以指主客体复合物和包合物。J.
精氨酸
精氨酸（Arginine）是一種α-胺基酸，亦是20種普遍的自然胺基酸之一。在分子遺傳學上，信使核糖核酸的結構，CGU，CGC，CGA，CGG，AGA和AGG。是在蛋白質合成時核苷酸鹼基或遺傳密碼子代碼為精氨酸的三元組。在哺乳動物生活中，精氨酸被分類為半必要或條件性必要的胺基酸(非必需胺基酸)，身體能自行產生，但在壓力或疾病的時候，可能需要更多。也視乎生物的發育階段及健康狀況而定。早產兒體內不能合成精氨酸，使得補充他們營養中的精氨酸變得非常重要。於1886年精氨酸是首先由瑞士化學家恩斯特·舒爾茨從扁豆苗萃取物中分離出來。.
索烃
索烃是一个机械互锁分子，包含有两个或两个以上互锁的大环分子。除非环分子内部的共价键断裂，否则互锁的环不能够分开。索烃的英文名（Catenane）源自拉丁文的Catena，意思是“链”。索烃和其他机械互锁分子有着概念上的联系，例如：轮烷、分子扭结和分子博洛米尼结。最近，人们用机械键这样一个新的术语来描述索烃环之间的连接。.
縮合反應
縮合反應（condensation reaction）是化學反應的一種，當中兩個分子透過官能團的變化結合成一個新的分子，過程中有細小的分子失去。如所失去的小分子為水，這個過程則稱作脫水反應。其他常見的小分子包括氯化氫、甲醇或乙酸等。 當兩個獨立的分子反應，這縮合反應屬於分子間的。一個簡單的例子就如兩個氨基酸透過形成肽鍵而結合成二肽，並透過不斷重複這一步驟形成多肽及蛋白質。與脫水反應相反的反應就是水解反應，當中水分子以氫氧離子及氫離子的形式與反應物反應，並使目標反應物分解。 如結合的過程中均由同一分子的原子或官能團參與，這縮合反應就屬於分子內的，而這類反應常導致環的生成。其中一個例子為狄克曼缩合反应，當中一個二酯分子的兩個酯官能團互相反應，透過失去一個醇分子而生成β-酮酯。.
纳米技术
納米技术（Nanotechnology）是一门应用科学，其目的在于研究于奈米规模时，物质和设备的设计方法、组成、特性以及应用。奈米科技是许多如生物、物理、化学等科学领域在技术上的次级分类，美国将其定义为「1至100奈米尺寸尤其是现存科技在奈米规模时的延伸」。奈米科技的世界为原子、分子、高分子、量子点集合，并且被表面效应所掌控，如范德瓦耳斯力、氢键、电荷、离子键、共价键、疏水性、亲水性和量子穿隧效应等，而惯性和湍流等巨观效应则小得可以被忽略掉。举个例子，当表面积对体积的比例剧烈地增大时，开起了如催化学等以表面为主的科学新的可能性。 微小性的持续探究使得新的工具诞生，如原子力显微镜和扫描隧道显微镜等。结合如电子束微影之类的精确程序，这些设备将使我们可以精密地运作并生成奈米结构。奈米材质，不论是由上至下制成（将块材缩至奈米尺度，主要方法是从块材开始通过切割、蚀刻、研磨等办法得到尽可能小的形状（比如超精度加工，难度在于得到的微小结构必须精确）。或由下至上制成(由一颗颗原子或分子来组成较大的结构，主要办法有化学合成，自组装和定点组装（positional assembly）。难度在于宏观上要达到高效稳定的质量，都不只是进一步的微小化而已。物体内电子的能量量子化也开始对材质的性质有影响，称为量子尺度效应，描述物质内电子在尺度剧减后的物理性质。这一效应不是因为尺度由巨观变成微观而产生的，但它确实在奈米尺度时占了很重要的地位。 纳米科技的神奇之处在于物质在纳米尺度下所拥有的量子和表面现象，因此可以有许多重要的应用，也可以制造许多有趣的材质。.
羧酸
酸（Carboxylic acid），有機酸的一種，是帶有羧基的有機化合物，通式是R-COOH。羧基的化學式為-C(.
真核起始因子4E
真核起始因子4E（英文：eukaryotic initiation factor 4E，简称“eIF4E”）是一种帽结合蛋白，可以特异性地识别mRNA的5'端的帽子结构，它在真核翻译的起始过程中发挥重要作用。 eIF4E可以与eIF4A和eIF4G共同组成eIF4F复合物参与真核翻译起始。因此，通过与mRNA的5'端的帽子结构结合，eIF4E就可以将eIF4A带到mRNA的5'端，让eIF4A发挥解旋酶活性来打开mRNA的5'端的二级结构。.
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烯醇
烯醇（Enol）指的是双键碳上连有羟基的一类化合物，其（下图右）与羰基化合物（下图左）成互变异构： 通常在平衡中烯醇式占的很少。这是由于氧的电负性大于碳，因而碳氧双键更加稳定。 随着α氢的活泼性增大，失去氢后形成的碳负离子稳定性增大，烯醇式也能成为平衡中主要的存在形式。比如1,3-二羰基化合物中烯醇式的比例明显增加。类似的例子还可以是1,1,1-三氟-2,4-戊二酮。 酮式及烯醇式的含量和溶剂的极性也很有关系，非质子溶剂对烯醇式有利，因为可以帮助分子内氢键的形成。如乙酰乙酸乙酯的烯醇式含量在乙醇中为10%-13%，而在正己烷中为49%。 天然存在的维生素C即具有烯二醇的结构，因此维生素C具有酸性，又称为抗坏血酸。.
組織蛋白
組織蛋白（histone ）是真核生物体细胞染色质中的碱性蛋白质，其将DNA包装和组织成被命名为核小体的结构单元。它们是染色质的主要蛋白质组分，作为DNA缠绕的线轴，并在中发挥作用。没有组织蛋白，染色体中未缠绕的DNA将非常长（人类DNA中的长宽比超过1000万比1）。例如，每个人类二倍体细胞（含有23对染色体）具有约1.8米长的DNA，但是在组織蛋白上缠绕它具有大约90微米（0.09毫米）的染色质，当在有丝分裂期间复制和浓缩时，其导致约120微米的染色体。.
疏水性
在化學裡，疏水性指的是一個分子与水互相排斥的物理性質。这种分子称为疏水物。 疏水性分子偏向於非極性，並因此較會溶解在中性和非極性溶液（如有机溶剂）。疏水性分子在水裡通常會聚成一團，而水在疏水性溶液的表面時則會形成一個很大的接觸角而成水滴状。 舉例來說，疏水性分子包含有烷烴、油、脂肪和多數含有油脂的物質。 疏水性通常也可以稱為親脂性，但這兩個詞並不全然是同義的。即使大多數的疏水物通常也是親脂性的，但還是有例外，如矽橡膠和碳氟化合物（Fluorocarbon）。.
生物化学
生物化学（biochemistry，也作 biological chemistry），顾名思义是研究生物体中的化学进程的一门学科，常常被简称为生化。它主要用于研究细胞内各组分，如蛋白质、糖类、脂类、核酸等生物大分子的结构和功能。而对于化学生物学来说，则着重于利用化学合成中的方法来解答生物化学所发现的相关问题。 虽然存在着大量不同的生物分子，但实际上有很多大的复合物分子（称为“聚合物”）是由相似的亚基（称为“单体”）结合在一起形成的。每一类生物聚合物分子都有自己的一套亚基类型。例如，蛋白质是由20种氨基酸所组成，而脱氧核糖核酸（DNA）由4种核苷酸构成。生物化学研究集中于重要生物分子的化学性质，特别着重于酶促反应的化学机理。 在生物化学研究中，对细胞代谢和内分泌系统的研究进行得相当深入。生物化学的其他研究领域包括遗传密码（DNA和RNA）、 蛋白质生物合成、跨膜运输（membrane transport）以及细胞信号转导。.
生物化学概述
生物化学 – 是对生物体体内化学过程的研究。旨在阐释所有生命体和生命活动的化学机理。.
生長素
生長素是第一個獲發現的植物激素。生長素中最重要的化學物質為3-吲哚乙酸。生長素有调节茎的生长速率、抑制侧芽、促进生根等作用，在农业上用以促进插枝生根，效果显著。.
甲酸
酸（英文：Formic acid）又称作蚁酸，化学式为HCOOH。蚂蚁和蜜蜂等膜翅目昆蟲的分泌液中含有蚁酸，当初人们蒸馏蚂蚁时制得蚁酸，故有此名。甲酸无色而有刺激气味，且有腐蚀性，人类皮肤接触后会起泡红肿。熔点8.4℃，沸点 100.8℃。由于甲酸的结构特殊，它的一个氢原子和羧基直接相连。也可看做是一个羟基甲醛。因此甲酸同时具有酸和醛的性质。在化学工业中，甲酸被用于橡胶、医药、染料、皮革种类工业。.
特魯頓規則
特魯頓規則（Trouton's rule）是指不同種類液體的\Delta \bar S_大致維持一個定值，約在85~88 J·K−1 mol−1 之間，此數值也稱為特魯頓常數。汽化熵定義為每摩爾汽化熱和沸點之間的比值，因此此數值也稱為特魯頓比值。特魯頓規則得名自愛爾蘭物理學家。 在數學上，特魯頓規則也可以表示為： 其中R為氣體常數。 特魯頓規則適用於許多液體，例如甲苯的汽化熵為87.30 J·K−1 mol−1，苯的汽化熵為89.45 J·K−1 mol−1，而三氯甲烷的汽化熵為為87.92 J·K−1 mol−1。在一液體的沸點已知時，常用特魯頓規則來來估計其汽化熱。 不過也有不適用特魯頓規則的液體，例如水、甲醇及乙醇的汽化熵和特魯頓規則的數值差距很大，特魯頓規則無法適用在這些分子間會產生氫鍵的物質。 以下是適用範圍更廣的特魯頓規則 若令T.
盐酸胍
酸胍是胍的盐酸盐，通常可以缩写为GuHCl，有时也会写作GdnHCl或GdmCl。.
D環
D環（D-loop），或稱置換環（displacement loop）在分子生物學中是指一個雙鏈DNA的兩條單鏈互相分離，並被另外一條（第三條）核酸鏈隔開的結構。第三條核酸鏈與與之配對的核酸鏈具有互補的鹼基序列。D環區域形成了結構。正如插圖所示，因爲這種結構類似於大寫的「D」（被置換的那條DNA鏈像「）」而新形成的雙鏈像「|」）而得名「D環」。 在不少過程中，D環均會出現，比如DNA修復。另外，在線粒體DNA中（作爲一種半穩定的結構）以及端粒中，亦存在D環結構。.
DNA复制
DNA复制是指DNA双链在细胞分裂分裂间期进行的以一个亲代DNA分子为模板合成子代DNA链的过程。复制的结果是一条双链变成两条一样的双链（如果复制过程正常的话），每条双链都与原来的双链一样（排除突变等不定因素）。 DNA复制是一种在所有的生物体内都会发生的生物学过程，是生物遗传的基础。对于双链DNA，即绝大部分生物体内的DNA来说，在正常情况下，这个过程开始于一个亲代DNA分子，最后产生出两个相同的子代DNA分子。亲代双链DNA分子的每一条单链都被作为模板，用以合成新的互补单链，这一过程被称为半保留复制。细胞的校正机制确保了DNA复制近乎完美的准确性。 在细胞当中，DNA复制起始于基因组的特殊位点，称为“起始位点”。起始于起始位点的DNA解链和新链的合成会形成复制叉。除了DNA聚合酶外，一些酶通过添加和模板相配的核苷酸来合成新DNA,一些和复制叉连接的其他蛋白对DNA的复制起始和延伸起辅助作用。 DNA复制也可以在体外（即人工地）进行，从细胞中分离的DNA聚合酶和人造的DNA复制引物可以用来启动以已知序列的DNA分子为模板的复制，聚合酶链式反应（PCR）是一种常见的实验室技术，这种采用了循环方式的人工合成，在一个DNA池中扩增出特定的DNA片段。.
DNA微陣列
DNA微陣列（DNA microarray）又稱DNA陣列或DNA晶片，比較常用的名字是基因晶片（gene chip）。是一塊帶有DNA微阵列（microarray）的特殊玻璃片或矽晶元片，在數平方公分之面積上佈放數千或數萬個核酸探針；檢體中的DNA、cDNA、RNA等與探針結合後，藉由--或電流等方式偵測。經由一次測驗，即可提供大量基因序列相關資訊。它是基因组学和遗传学研究的工具。研究人員應用基因芯片就可以在同一時間定量的分析大量（成千上万个）的基因表現，具有快速、精確、低成本之生物分析檢驗能力。.
螺旋-轉角-螺旋
螺旋-轉角-螺旋（helix-turn-helix，简称为HTH）是一種蛋白質的結構基序（structural motif），可與DNA進行結合。此結構是由一條氨基酸短鏈將兩個α螺旋連結在一起，可見於許多專門調節基因表現的蛋白質。與DNA的結合，是經由蛋白質與鹼基之間的氫鍵及凡得瓦力來進行，結合位置是DNA的大凹槽（參見DNA條目，例外：TATA联结蛋白的该结构结合位置为小凹槽）。.
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聚丙烯酸
聚丙烯酸（英语：Poly(acrylic acid)，简称为PAA，商品名为卡波姆（Carbomer）），是一种单体为丙烯酸的合成聚合物。聚丙烯酸材料有可能是丙烯酸的自身均聚物，也可能是通过季戊四醇的烯丙醚，蔗糖的烯丙醚或者丙烯的烯丙醚交联而成的交联聚合物。 聚丙烯酸是一种较弱的阴离子聚电解质，其所含羧基的电离程度与溶液的pH有关。当溶液酸性较强，即pH较低时，聚丙烯酸的电离被抑制，多以分子形式存在，能够与多种非离子聚合物（如聚环氧乙烯，聚乙烯基吡咯，聚丙烯腈和某些纤维素醚）通过氢键结合，从而形成跨聚合物复合体。水溶液为中性时，聚丙烯酸会部分电离出氢离子，产生带负电的聚丙烯酸根。带有负电的分子链之间开始互相排斥，使聚丙烯酸呈现溶胀的状态。当水溶液碱性较强时，聚丙烯酸根离子之间的排斥力可以使其体积可以胀大到原始体积的很多倍，也可以和多种带正电的离子如表面活性剂，壳聚糖等形成复合结构。.
聚酰胺
聚酰胺（Polyamide，PA）是由含有羧基和氨基的單體通過醯胺鍵聚合成的高分子。他們可能是自然生成，例如羊毛，絲等等的各種蛋白質，也可能是人工通過逐步聚合或固相聚合，例子是尼龍，芳香聚酰胺和鈉聚（天冬氨酸）。由於其極端的耐用性和強度，人工聚酰胺聚合物通常用於紡織品，汽車零件，地毯，運動裝，食物包裝，眼鏡架，鏡片，飛機，自行車輪胎，護甲，防護手套，防火衣，防火頭盔等用途。.
萊納斯·鮑林
萊納斯·卡爾·鮑林（Linus Carl Pauling，），美國化学家，量子化學和結構生物學的先驱者之一。1954年因在化學鍵方面的工作取得诺贝尔化学奖，1963年因反對核彈在地面測試的行動获得1962年度的诺贝尔和平奖，成為获得不同诺贝尔奖项的兩人之一（另一人為居里夫人）；也是唯一的一位每次都是独立地获得诺贝尔奖的获奖人。其後他主要的行動為支持維他命C在醫學的功用。鮑林被认为是20世纪对化学科学影响最大的人之一，他所撰写的《化学键的本质》被认为是化学史上最重要的著作之一。他以量子力學入手分析化學問題，結論卻以直觀、淺白的概念重新闡述，即便未受量子力學訓練的化學家亦可利用準確的直觀圖像研究化學問題，影響至為深遠，比如他所提出的許多概念：电负度、共振論、价键理论、混成軌域、蛋白质二級結構等概念和理论，如今已成為化学領域最基础和最广泛使用的觀念。 他晚年过度吹捧营养补充品的药用价值，并提倡使用高剂量的维生素C治疗感冒，给自己的声誉带来了负面影响。.
萬古黴素
萬古黴素（Vancomycin，INN）是一種糖肽類抗生素，用來治療許多细菌感染的抗细菌药抗生素，治療皮膚感染、敗血症、心內膜炎, 骨關節感染以及因耐甲氧西林金黄色葡萄球菌（MRSA）引起的脑膜炎時，通常建議採用靜脈注射藥物作為第一線治療；而投藥時，劑量將依患者的血液濃度作調整。萬古黴素也是一種治療嚴重偽膜性結腸炎的口服藥，然而口服時藥效將會大為降低。，用來預防和治療革蘭氏陽性菌所造成的感染。傳統上，萬古黴素被用作「」，用來治療所有抗生素均無效的嚴重感染。但由於越來越多的抗萬古黴素耐藥性病菌的出現，其地位漸漸被利奈唑胺和達托黴素所取代。 常見的副作用包含注射至局部時的疼痛、过敏，有時候也可能引發聽力問題、低血壓或骨髓抑制等問題；對母乳餵養的患者似乎沒有問題，而對於懷孕患者的影響尚不明確，但目前沒有證據顯示會造成危害。萬古黴素係為一種糖肽類抗生素，藉由阻斷細胞壁生成來發揮作用。 萬古黴素於1954年上市，在最基本的健康照護系統中最必要的藥物清單世界卫生组织基本药物标准清单登錄有案，是一種常見藥物 ，一劑靜脈注射的批發價約在1.70-6美元左右；因為在美國靜脈注射劑型相當昂貴 ，靜脈注射的投藥方式可能會被取代。萬古黴素目前由土壤細菌Amycolatopsis orientalis培養得來。.
非共价作用力
非共價鍵並不依賴電子間的共享，而是依賴正負電荷間的吸引力，因此吸力較弱，故僅需較小的力量就可將之打斷。非共價鍵主要出現于超分子化學中，所擔任的角色為：維持脱氧核糖核酸（DNA，生命的起源物質）或蛋白質的三度空間外型及功能。它包含有氫鍵、疏水相互作用及范德華力等，一般數量級在1-5kcal/mol（約4-21kJ/mol）之間。 Category:化学键 Category:超分子化学.
非金属元素
非金属元素是元素的一大类，在所有的118种化学元素中，非金属占了23种。在周期表中，除氢以外，其它非金属元素都排在表的右侧和上侧，属于p区。包括氢、硼、碳、氮、氧、氟、硅、磷、硫、氯、砷、硒、溴、碲、碘、-zh-hans:砹;zh-hk:砈;zh-tw:砈;-、氦、氖、氩、氪、氙、氡、Og。80%的非金属元素在现在社会中占有重要位置。.
頭髮
頭髮，或稱髮，是指長在人類頭部上的毛髮。頭髮的顏色及其他特徵是由基因決定，一般而言常見的有黑色、金黃色、棕色及紅色等，當人類老化時，頭髮通常會變成銀白色。不同民族的頭髮硬度、自然卷曲度也不同。頭髮由角蛋白所組成。 只有人类的头发才会始终生长，所以人类需要时常理发，而动物界则没有这种现象。其中原因尚不清楚。 头发可以保护头部和大脑。夏天可防烈日，冬天可御寒冷。细软蓬松的头发具有弹性，可以抵挡较轻的碰撞；还可以帮助头部汗液的蒸发。目前尚不清楚头发在人类进化中的作用。.
風筒
是一種可將頭髮吹乾的電器，在19世紀末發明。現代風筒以電動方式加速空氣流動速度，故產生風，並同時提高空氣溫度的機械裝置。大部分的風筒都會經過發熱線吹出熱風，加速水份蒸發，而冷風則對頭髮的傷害相對地小。 吹風機吹出來的風，是攜帶提高動能的空氣分子，在碰撞微小水珠表面的水分子的過程中轉移動能，使之打斷水分子之間的氫鍵，脫離原本附著的表面(即蒸發)，頭髮因而變乾。如吹出的是熱風，其能量更能提高空氣分子與水分子震盪與碰撞的能量，並加速蒸發，所以增加乾燥的效率。 工業用途的吹風機常稱為熱風槍，運作原理相同，但風量通常較小、吹出的熱風溫度較高，在電子業常用來解焊電子零件。.
親脂性
親脂性是指一個化合物融解在脂肪、油、脂質或非極性溶劑的能力。這些非極性溶劑本身就親脂，所以這告訴我們“相似相溶”。因此親脂性的物質就會溶在親脂的溶劑，親水性的物質就會溶於親水性的溶劑內。 當我們以倫敦力的角度來看，親脂性、疏水性和非極性可以互相替換，然而，親脂性和疏水性並不是同義字，我們可以藉由矽氧樹脂和氟化碳確認這點，因為他們是疏水性但非親脂性。.
親水性
親水性指分子能夠透過氫鍵和水分子形成短暫鍵結的物理性質。因為熱力學上合適，這種分子不只可以溶解在水裡，也可以溶解在其他的極性溶液內。 一個親水性分子，或說分子的親水性部份，是指其有能力極化至能形成氫鍵的部位，並使其對油或其他疏水性溶液而言，更容易溶解在水裡面。親水性和疏水性分子也可分別稱為極性和非極性分子。 肥皂擁有親水性和疏水性兩端，以使其可以溶解在水裡，也可以溶解在油裡。因此可得，肥皂可以去除掉水和油之間的界面。.
高分子
分子（Macromolecule）化合物是一個非常大的分子，如蛋白質，通常由較小的亞基（單體）的聚合產生。它們一般由數千或更多的原子組成。通过一定形式的聚合反应生成具有非常高的分子量的大分子，一般指聚合物和结构上包括聚合物的分子。在生物化学中，这个术语被应用于三个传统的生物聚合物（核酸、蛋白质、和碳水化合物），以及具有大分子量的非聚合分子，例如脂类和。这些分子有时也被称为生物大分子。 聚合物高分子的各个构成分子被称为单体。 人工合成的高分子包括塑料。金属和晶体虽然也是由许多原子组成的，其内部通过类似分子的键联合在一起，但是它们一般不被认为是高分子。有时不同的高分子之间通过分子间力（但不是通过化学键）组合到一起，尤其是假如这样的组合是自然发生的，而且其组成部分一般不单独出现的话，那么这样的混合物也会被称为高分子。实际上这样的混合物更应该被称为高分子复合物。在这种情况下组成这个复合物的单个高分子往往被称为下单位。由高分子组成的物质往往有不寻常的物理特性。液晶和橡胶就是很好的例子。许多高分子在水中需要特殊的小分子帮助才能溶解。许多需要盐或者特殊的离子来溶解。.
鳥嘌呤
鳥嘌呤（Guanine，又稱鳥糞嘌呤）是五種不同碱基中的其中之一，並同時存在於脱氧核醣核酸（DNA）及核醣核酸（RNA）中。鳥嘌呤是嘌呤的一種，並與胞嘧啶（cytosine）以三個氫鍵相連。.
质子溶剂
在化学中，质子溶剂指分子中带有羟基或氨基的溶剂。更加笼统的说，任何可以给出H+的溶剂都可以被叫做质子化溶剂，例如氢氟酸。非质子溶剂则与此相反，不能贡献氢离子。.
超分子
超分子（supermolecule）是在1937年由德国化學家K.L. Wolf提出，最早是形容由氫鍵鍵結的乙酸二聚體。超分子化學是有關分子錯合物非共價鍵結的相關研究。「超分子」一詞有時是指超分子組裝，是由二個或多個彼此沒有形成共價鍵結的分子（一般是高分子）所組成的錯合物 。在生物化學中，「超分子」是指像肽及寡核苷酸等由生物分子組成的錯合物。.
超分子化學
超分子化學（英語：Supramolecular chemistry）是化學的一門分支，專注於分子之間的非共價鍵結作用。相較於傳統化學上所研究的共價鍵，超分子化學的研究對象是一些較弱且較具可恢復性的分子間作用，例如氫鍵、金屬配位、π-π堆積、厭水性效應、范德华力以及重疊作用等。而超分子化學從這些研究中闡明了一些新概念，例如分子的自組裝、、（molecular recognition）、（host-guest chemistry）等。在生物學領域中，借助了許多超分子化學領域研究方法及成果來了解生物系統的運作。.
黏合剂
黏著劑也稱膠黏劑、黏合劑，在1742年被美國人亨利·庫特博士（Dr.
转录
转录（）是遗传信息由DNA转换到RNA的过程。作为蛋白质生物合成的第一步，转录是mRNA以及非編碼RNA（tRNA、rRNA等）的合成步骤。 转录中，一段基因会被读取、複製为mRNA；就是说一特定的DNA片段作为模板，以DNA依赖的核糖核酸聚合酶（RNA聚合酶或RNA合成酶）作为催化剂而合成前mRNA的过程。 转录尚有未清楚的部分，例如是否需要DNA解旋酶，一般来说是需要的，但某些地区称RNA聚合酶可代替其行使识别DNA上的有关碱基以开始转录的功能。 mRNA转录时，DNA分子双链打开，在RNA聚合酶的作用下，游离的4种核糖核苷酸按照碱基互补配对原则结合到DNA单链上，并在RNA聚合酶的作用下形成单链mRNA分子。至此，转录完成。 转录通常是多起点多向复制。 转录时所转录的仅为DNA上有遗传效应的片段（DNA），不包括内含子。 转录按以下一般步骤进行：.
范德华力
范德华力（Van der Waals force）在化学中指分子之间非定向的、无饱和性的、较弱的相互作用力，根据荷兰物理学家约翰内斯·范德瓦耳斯命名。范德华力是一种电性引力，但它比化学鍵或氢键弱得多，通常其能量小於5kJ/mol。范德华力的大小和分子的大小成正比。 范德华力的主要来源有三种机制：.
胸腺嘧啶
胸腺嘧啶（Thymine，簡寫為 T），又稱為5-甲基尿嘧啶（5-methyluracil），為嘧啶類鹼基，是形成DNA核苷酸中四種鹼基（G－C－A－T）的其中一種。.
胺
胺（英語：amine）是氨分子（NH3）中的氢被烃基取代后形成的一类有机化合物。氨基（－NH2、－NHR、－NR2）是胺的官能团。 如果氮原子连着羰基(C.
胆红素
胆红素（英文：Bilirubin）是胆色素的一种，是人類胆汁的主要色素，呈橙黄色。它是体内血紅素的主要代谢产物，有毒性，可对大脑和神经系统引起不可逆的损害，但也有抗氧化剂功能，可以抑制亚油酸和磷脂的氧化。胆红素是临床上判定黄疸的重要依据，也是肝功能的重要指标。.
阿司匹林
阿司匹林或译作--、--、--（Aspirin），也称乙酰水杨酸（acetylsalicylic acid），是水杨酸类药物，通常用作止痛剂、和消炎药，亦能用於治療某些特定的發炎性疾病，例如川崎氏病、心包炎，以及風溼熱等等。心肌梗塞後馬上給藥能降低死亡的風險。本品也能防止血小板在血管破损处凝集，有抗凝作用。高心血管風險患者长期低剂量服用可预防心脏病、中风与血栓。该药还可有效预防特定幾种癌症，特别是直肠癌。。對於止痛及發燒而言，藥效一般會於30分鐘內發揮。阿司匹林是一种非甾体抗炎药（NSAID），在抗發炎的角色上與其他NSAID類似，但阿斯匹靈還具有抗血小板凝集的效果。 阿司匹林的其中一個常見的副作用是會引起胃部不適。更嚴重的副作用則包含胃潰瘍、等等，也可能會使氣喘惡化。其中年長者、酗酒者，以及還有服用其他非甾体抗炎药或抗凝剂者，出血風險更高，妊娠後期也不建議用藥。有感染的孩童不建議用藥，因为这会增加患瑞氏综合征的风险。。高劑量者可能會引起耳鸣。 虽然它们都有名为水杨酸的类似结构，作用相似（解热、消炎、镇痛），抑制的环氧化酶（COX）也相同，但阿司匹林的不同之处在于其抑制作用不可逆，而且对环氧化酶-1（COX-1）的抑制作用比对环氧化酶-2的（COX-2）更强。 阿司匹林衍生自柳树皮中发现的化学物质。早在2400年前柳树皮就用来治病，希波克拉底就用它来治头痛。1763年，在牛津大学的沃德姆学院，首次从柳树皮中发现了阿司匹林的有效成分水杨酸。1853年，化學家將水杨酸钠以乙酰氯處理，首次合成出乙醯水楊酸。此後五十年，化學家們逐步提升生產的效率。1897年，德国拜耳開始研究乙醯水楊酸的醫療用途，以代替高刺激性的水楊酸類藥物。到1899年，拜耳以阿司匹林（Aspirin）為商標，將本品銷售至全球。此後五十年，阿斯匹靈躍升成為使用最廣泛的藥物之一。目前，拜耳公司在很多國家對於「阿司匹靈」一名的專利權已經過期，或是已經賣給其他公司。 本品是当今世界上应用最广泛的药物之一，每年的消费量约40,000公噸（約500至1200億錠）。本品列名於世界卫生组织基本药物标准清单之中，為基礎公衛體系必備藥物之一。，每劑在发展中国家的批發價約介於0.002至0.025美元之間。，每月劑量在美國的價格低於25.00美金。本品目前屬於通用名药物。.
门秀金反应
Menshutkin反应（Menshutkin reaction），以俄国化学家 Nikolai Menshutkin (1890) 的名字命名。 叔胺与卤代烃生成季铵盐的反应。 反应产率高、操作简便，可用于某些相转移催化剂的制备，例如从三乙胺和氯化苄制备苄基三乙基氯化铵。 极性非质子溶剂和高温有利于反应进行。各种卤代烃中，碘代烃中卤离子最容易离去，其离去能力按照碘、溴、氯的顺序递减。.
钴化合物
钴化合物是钴和其它元素形成的化合物。钴在化合物中，最稳定的价态是+2价，在特定配体的存在下，也有+3价的稳定化合物。此外，还存在着高氧化态+4、+5和低氧化态-1、0、+1的钴化合物。.
键线式
键线式（），也称骨架式、拓扑式、折线简式，是在纸面表示分子结构的最常用的方法，在表示有机化合物的立体结构时尤其常用。用键线式表示的结构简明易懂，并且容易书写。.
脎
脎（Osazone，sà），也称糖脎，是糖类的苯肼衍生物。糖脎为难溶于水的黄色结晶，由糖与苯肼反应生成，分解又得到原来的糖，因此可以用于糖的提纯。费歇尔在当年研究糖的构型时，采用了分析各种糖生成的糖脎的方法，因为不同的脎结晶形状不同，熔点不同，生成时间也不同。 以葡萄糖为例，生成糖脎的反应需用三分子的苯肼与一分子的糖进行反应。当苯肼用量为一摩尔时，得到苯腙。而后经互变异构发生1,4-消除，转化为亚氨基酮，再与两分子的苯肼成脎。 苯肼只和糖的C-1和C-2成脎后，分子内氢键使其形成较为稳定的六元环结构，从而糖的其他碳原子不再成脎。.
脯氨酸
脯氨酸（Proline，縮寫為Pro 或P ）是一個α-氨基酸，20個DNA編碼的其中之一。其對應密碼子為CCU，CCC，CCA和CCG。 脯氨酸不是一種必需氨基酸，人體可以自行合成。在20個蛋白質形成氨基酸中，其最特別之處在於胺氮被綁定到並非一個而是兩個烷基基團，因此使它具有仲氨，L型較常具有S立體化學。.
脱氧核糖核酸
--氧核醣核酸（deoxyribonucleic acid，縮寫：DNA）又稱--氧核醣核酸，是一種生物大分子，可組成遺傳指令，引導生物發育與生命機能運作。主要功能是資訊儲存，可比喻為「藍圖」或「配方」。其中包含的指令，是建構細胞內其他的化合物，如蛋白質與核醣核酸所需。帶有蛋白質編碼的DNA片段稱為基因。其他的DNA序列，有些直接以本身構造發揮作用，有些則參與調控遺傳訊息的表現。 DNA是一種長鏈聚合物，組成單位稱為核苷酸，而糖類與磷酸藉由酯鍵相連，組成其長鏈骨架。每個糖單位都與四種鹼基裡的其中一種相接，這些鹼基沿著DNA長鏈所排列而成的序列，可組成遺傳密碼，是蛋白質氨基酸序列合成的依據。讀取密碼的過程稱為轉錄，是根據DNA序列複製出一段稱為RNA的核酸分子。多數RNA帶有合成蛋白質的訊息，另有一些本身就擁有特殊功能，例如核糖體RNA、小核RNA與小干擾RNA。 在細胞內，DNA能組織成染色體結構，整組染色體則統稱為基因組。染色體在細胞分裂之前會先行複製，此過程稱為DNA複製。對真核生物，如動物、植物及真菌而言，染色體是存放於細胞核內；對於原核生物而言，如細菌，則是存放在細胞質中的拟核裡。染色體上的染色質蛋白，如組織蛋白，能夠將DNA組織並壓縮，以幫助DNA與其他蛋白質進行交互作用，進而調節基因的轉錄。.
醚
醚（漢語拼音：mí，Ether）是具有醚官能团的一类有机化合物。醚官能团是由一个氧原子连接两个烷基或芳基所形成，醚的通式为：R–O–R。它还可看作是醇或酚羟基上的氢被烃基所取代的化合物。 醚类中最典型的化合物属：乙醚，它常用于有机溶剂与医用麻醉剂。由于其在化学中的常用性（乙醚是最常用的醚类提取溶剂），我们还有时将乙醚直接简称为“醚”。醚类化合物的应用常见于有机化学和生物化学，它们还可作为糖类和木质素的连接片段。.
醇
醇是有機化合物的一大類，是脂肪烴、脂環烴或芳香烴側鏈中的氫原子被羥基取代而成的化合物。在化學中，醇是任何有機化合物，其中羥基官能團（-OH）被綁定到一個飽和碳原子。通常意义上泛指的醇，是指羟基与一个脂肪族烃基相连而成的化合物；羥基與苯環相連，則由于化学性质与普通的醇有所不同而分类为酚；羥基與sp2雜化的双键碳原子相連，属烯醇类，该类化合物由于会互变异构为醛（只有乙烯醇能變乙醛）或酮，因此大多无法稳定存在。.
量子穿隧效應
在量子力學裏，量子穿隧效應（Quantum tunnelling effect）指的是，像电子等微观粒子能夠穿入或穿越位勢壘的量子行為，儘管位勢壘的高度大於粒子的總能量。在經典力學裏，這是不可能發生的，但使用量子力學理論卻可以給出合理解釋。 量子穿隧效應是太陽核聚變所倚賴的機制。量子穿隧效應限制了太陽燃燒的速率，是太陽聚變循環的瓶頸，因此維持太陽的長久壽命。許多現代器件的運作都倚賴這效應，例如，隧道二極管、場致發射、約瑟夫森結、等等。扫描隧道显微镜、原子鐘也應用到量子穿隧效應。量子穿隧理論也被應用在半導體物理學、超導體物理學等其它領域。 至2017年為止，由於對於量子穿隧效應在半導體、超導體等領域的研究或應用，已有5位物理學者獲得諾貝爾物理學獎。.
自組裝
自組裝（英語：Self-assembly，或譯自我組裝）是用來形容一無序系統在沒有外部的干預下，由個別部件間之互動（如吸引和排斥，或自發生成化學鍵），而組成一個有組織的結構之過程。近年自組裝特別吸引注意，因它提供自下而上（bottom-up）、可控制的方法組裝原子或分子成較大的結構（像奈米結構、微型機器等）。 自组装至少有三个特征使其成为一个独特的概念.
里宾斯基五规则
里宾斯基五规则，有时简称五规则，是辉瑞公司资深药物化学家在1997年提出的筛选类药分子的五条基本法则，符合里宾斯基五规则的化合物会有更好的药代动力学性质，在生物体内代谢过程中会有更高的生物利用度，因而也更有可能成为口服药物。在药物研发领域，里宾斯基五规则被用于对化合物库的初筛，以期摒除那些不适合成为药物的分子，缩小筛选的范围并降低药物研发成本。在长期的实践过程中，药物化学家们对里宾斯基五规则作出简化，形成“四规则”和“三规则”，但是四规则和三规则有时仍然被称作“五规则”，这里的五指的是各条规则的判别值均为5或5的整数倍。.
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金
金（gold）是化学元素，化学符号Au（来自aurum），原子序数79。纯金是有明亮光泽、黄中带红、柔软、密度高、有延展性的金属。金在元素周期表中在11族，属过渡金属，是化学性质最不活泼的几种元素之一。金在标准状况下是固体，在自然界中常以游离态单质形式（自然金）存在，如岩石、地下及沖積層中堆积的砂金或金粒。金能和游离态的银形成固溶体琥珀金，在自然界中也能和铜、钯形成合金。矿物中的金化合物不太常见，主要是碲化金。 金的原子序数在宇宙中天然存在的元素中是较高的。据信这种重元素是在两颗中子星碰撞时的超新星核合成中产生，在太阳系形成前的尘埃中就已存在。由于地球形成之初还处于熔化状态，的金几乎都已沉入地核。因此，现在地球上地壳和地幔的金多是拜后来后期重轰炸期（约40亿年前）的小行星撞击事件所赐。 金能抵抗单一酸的侵蚀，但却能被王水溶解（“王水”因此得名）。这种混合酸能和金反应生成四氯合金酸根离子。金也能溶于碱性氰化物溶液，这是其开采和电镀的原理。能夠溶解銀及卑金屬的硝酸不能溶解金，这些性質是黃金精煉技術的基础，也是用硝酸来鉴别物品裡是否含有金的原理，这一方法是英語諺語「acid test」的語源，意指用「測試黃金的標準」来測試目標物是否名副其實。此外，金能溶于水銀，形成汞齊（也是一种合金），但这并非化学反應。 金在有历史记载以前就是一種廣受歡迎的貴金屬，用于貨幣、保值物、珠寶和艺术品。以前国内和国际通常实行以金为基础的金本位货币制度，但1930年代时金币已停止流通。70年代，随着布雷頓森林協定的结束，世界范围内的金本位制终于让位给法定货币制度。不过因其稀有，易于熔炼、加工和铸币，色泽独特，抗腐蚀，不易和其他物质反应等特点，金的价值不减。 底，人类总共开采18.36万公噸（相当于9513立方米）的金。 产量中的50%用于珠宝，40%用于投资，还有10%用于工业。 因其高延展性，抗腐蚀性，在大多数反应中的惰性和导电性，金一直在各类电子设备中用作耐腐蚀的电子连接器，这是它的主要工业用途。此外它还用于屏蔽红外线，生产和金箔，以及修补牙齿。有些金盐在医学上仍作为消炎药使用。.
镍化合物
镍化合物是镍和其它元素形成的化合物。镍在化合物中，最稳定的价态是+2价，此外，还存在+3、+4两种高价态和+1、0、-1、-2四种低价态。镍的配位化合物是多彩的，不同配体能使镍(II)产生不同的颜色，如最常见的2+是以水为配体的配离子，它显绿色。.
配位聚合物
配位聚合物是無機或含有金屬陽離子中心金屬有機聚合物藉由有機配體相連的結構。更正式的配位聚合物說法是具有重複的1，2或3個維度上延伸的配位實體。 配位聚合物的重複單元是配合物。配位聚合物包含子類的配位網絡就是配位化合物的延伸，為1個維度上透過配位實體重複，與具有兩個或更多個單獨的鏈、環、螺形鏈接或透過配位實體在2或3維度上延伸在配位化合物之間的交叉連接。這些含有空洞的有機配體所產生的配位網絡有潛力應用在金屬-有機骨架材料方面。 配位聚合物與許多領域相關，例如有機和無機化學，生物化學，材料學，電化學，和藥理學，都有很大應用潛力。這個跨學科性質，使其在過去的幾十年裡一直被廣泛的研究。 配位聚合物可以根據它們的結構和組成分成許多不同的方法。一個重要的分類被稱為維度。一個結構可以被決定為一維，二維或三維是取決於在空間中其延伸方向的排列。一維結構以直線延伸（沿著x軸）；二維結構在平面中延伸（兩個方向為X和Y軸）；而三維結構向三個方向延伸（X，Y，和Z軸）。敘述於右圖：.
配體 (生物化學)
在生物化學和藥理學中，配體（ligand）是指一種能與受体結合以產生某種生理效果的物質。在蛋白質—配體複合物中，配體通常是與靶蛋白特定結合位點相連的信號觸發分子。而在DNA—配體複合物中，與DNA雙鏈相連的配體在一般情況下可以是任何的小分子或離子甚至是蛋白質。值得注意的是，生物化學中的配體和化學中定義的配體（比如銅氨絡離子中，氨是銅離子的配體）並無實際聯繫，配體未必要結合在金属原子上。 配體與受體的連接由諸如離子鍵的化學鍵或氫鍵、范德華力等分子間作用力維繫。它們的連接過程通常是可逆的，配體與受體之間形成的真正難以斷開的共價鍵在生物界是相當罕見的。 配體在與受體結合後，可以改變它們的立體構型，而立體構型又常常決定了蛋白質的功能。配體包括底物、酶抑制劑、酶激活劑、以及神經遞質。配體與受體結合的難易度與結合後的強度叫做親和力。兩者越容易結合，結合後結合的強度越大，則親和力越強，反之亦然。親和力不僅由配體和受體間的直接的相互作用決定，還由溶劑效應決定，后者間接主導溶液中的非共價性結合。 用放射性同位素標記的已被用作正電子發射計算機斷層掃描（PET）中的放射性示蹤劑。此外，這種物質還被用於在體外進行的配體—受體結合研究。.
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酮
酮是一类有机化合物，通式RC(.
酮-烯醇互变异构
在有機化學中，酮-烯醇互變異構（Keto-Enol Tautomerism）是指因酮或醛和烯醇之間的化學平衡。酮或醛和烯醇稱為互變異構體。 此平衡出現的原因是，酮和醛等羰基化合物具有酸性的α-質子，在不同的pH值下進行質子的轉移，形成酮式和烯醇式。所以，烯醇式是酮和醛的一種存在形式，不同的酮在溶液中，有不同的烯醇式含量，可以經由1H核磁共振所測定。一般烯醇式的含量由5%至95%不等，視乎羰基化合物的结构、溫度、溶劑和pH值等。.
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酸度系数
酸度系數（英語：Acid dissociation constant，又名酸解離常数，代號Ka、pKa、pKa值），在化學及生物化學中，是指一個特定的平衡常數，以代表一種酸解離氫離子的能力。 該平衡狀況是指由一種酸（HA）中，將氫離子（即一粒質子）轉移至水（H2O）。水的濃度是不會在系數中顯示的。一种酸的pKa越大则酸性越弱，pKa越小则酸性越强（反過來說，Ka值越大，解離度高，酸性越強，Ka值越小，部份解離，酸性越弱）。pKa\mbox_ + \mbox_2\mbox_ \leftrightarrow \mbox_3\mbox^+_ + \mbox^-_ 平衡狀況亦會以氫離子來表達，反映出酸質子理論： 平衡常數的方程式為： 由於在不同的酸這個常數會有所不同，所以酸度系數會以常用對數的加法逆元，以符號pKa，來表示： 在同一的濃度下，較大的Ka值（或較少的pKa值）離解的能力較強，代表較強的酸。一般来说，Ka>1（或pKa<0），则為強酸；Ka<10-4（或pKa>4），则為弱酸。 利用酸度系數，可以容易的計算酸的濃度、共軛鹼、質子及氫氧離子。如一種酸是部份中和，Ka值可以用來計算出緩衝溶液的pH值。在亨德森-哈塞爾巴爾赫方程亦可得出以上結論。.
酸碱电子理论
酸碱电子理论，也称广义酸碱理论、路易斯酸碱理论，是1923年美国化学家吉尔伯特·路易斯提出的一种酸碱理论。该理论认为：凡是可以接受外来电子对的分子、基团或离子为酸（路易斯酸）；凡可以提供电子对的分子、基团或离子为碱（路易斯碱）。因為跳脫了限定氫離子與氫氧根的酸鹼概念，这种理论包含的酸碱范围很广，但是，它对确定酸碱的相对强弱来说，没有统一的标度，对酸碱的反应方向难以判断。后来，提出的软硬酸碱理论弥补了这种理论的缺陷。 常見的路易斯酸有：.
腺嘌呤
腺嘌呤（Adenine，簡稱A，旧称维生素B4）是一種嘌呤，在生物化學上具有許多不同的功用。於細胞呼吸中，是以富有能量的腺苷三磷酸（ATP），以及輔因子煙醯胺腺嘌呤二核苷酸（NAD）、黃素腺嘌呤二核苷酸（FAD）等形式發生作用。並且在蛋白質生物合成過程裡作為DNA與RNA的組成物。.
苯基硼酸
苯基硼酸（化学式：PhB(OH)2）是一种烷基硼酸，由硼酸中的一个羟基为苯基所替换而得到。.
雜交探針
交探針（Hybridization probe）是一小段單鏈DNA片段（十幾到幾百個鹼基），用於檢測與其互補的核酸序列。雙鏈DNA加熱變性成爲單鏈，隨後用放射性同位素（通常用32P）、螢光染料或者酶（如辣根過氧化物酶）標記成爲探針。32P通常被摻入組成DNA的四種核苷酸之一的磷酸基團中，而螢光染料和酶與核酸序列以共價鍵相連。 當將探針與樣品雜交時，探針和與其互補的核酸（DNA或RNA）序列通過氫鍵緊密相連，隨後，未被雜交的多餘探針被洗去。最後，根據探針的種類，可進行放射自顯影、螢光顯微鏡、酶聯放大等方法來判斷樣品中是否含有，或者何位置含有被測序列（即與探針互補的序列）。.
蛋白質生物合成
蛋白質生物合成是指在生物細胞內製造新的蛋白質，它是通過蛋白酶解或細胞蛋白的損耗被平衡。翻译，蛋白質的核糖體組裝，是生物合成途徑的一個重要組成部分，隨著生成的信使RNA（mRNA），轉移RNA（tRNA的）氨酰化，合作翻譯轉運，並翻譯後修飾。蛋白質的生物合成在多個步驟有嚴格的调控，和已建立錯誤檢查機制。 順反子DNA被轉錄成RNA的各種中間體。最後的版本被用作在合成多肽鏈的模板。蛋白質通常會直接從基因通過翻譯的mRNA合成。 這個名詞曾經是指蛋白質的翻譯，但現時則是指一個多重的步驟，以轉錄開始及翻譯作結。 原核生物的蛋白質生物合成雖然與真核生物的很相似，但是它们有所不同。.
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蛋白质
蛋白质（protein，旧称“朊”）是大型生物分子，或高分子，它由一个或多个由氨基酸残基组成的长链条组成。氨基酸分子呈线性排列，相邻氨基酸残基的羧基和氨基通过肽键连接在一起。蛋白质的氨基酸序列是由对应基因所编码。除了遗传密码所编码的20种“标准”氨基酸，在蛋白质中，某些氨基酸残基还可以被改變原子的排序而发生化学结构的变化，从而对蛋白质进行激活或调控。多个蛋白质可以一起，往往是通过结合在一起形成稳定的蛋白质复合物，发挥某一特定功能。 与其他生物大分子（如多糖和核酸）一样，蛋白质是地球上生物体中的必要组成成分，参与了细胞生命活动的每一个进程。酶是最常见的一类蛋白质，它们催化生物化学反应，尤其对于生物体的代谢至关重要。除了酶之外，还有许多结构性或机械性蛋白质，如肌肉中的肌动蛋白和肌球蛋白，以及细胞骨架中的微管蛋白（参与形成细胞内的支撑网络以维持细胞外形）。另外一些蛋白质则参与细胞信号传导、免疫反应、细胞黏附和细胞周期调控等。同时，蛋白质也是动物饮食中必需的营养物质，这是因为动物自身无法合成所有氨基酸，动物需要和必须从食物中获取必需氨基酸。通过消化过程将蛋白质降解为自由氨基酸，动物就可以将它们用于自身的代谢。.
蛋白质结构
蛋白质结构是指蛋白质分子的空间结构。作为一类重要的生物大分子，蛋白质主要由碳、氢、氧、氮、硫等化学元素组成。所有蛋白质都是由20种不同的L型α氨基酸连接形成的多聚体，在形成蛋白质后，这些氨基酸又被称为残基。蛋白质和多肽之间的界限并不是很清晰，有人基于发挥功能性作用的结构域所需的残基数认为，若残基数少于40，就称之为多肽或肽。要发挥生物学功能，蛋白质需要正确折叠为一个特定构型，主要是通过大量的非共价相互作用（如氢键，离子键，范德华力和疏水作用）来实现；此外，在一些蛋白质（特别是分泌性蛋白质）折叠中，二硫键也起到关键作用。为了从分子水平上了解蛋白质的作用机制，常常需要测定蛋白质的三维结构。由研究蛋白质结构而发展起来了结构生物学，采用了包括X射线晶体学、核磁共振等技术来解析蛋白质结构。 一定数量的残基对于发挥某一生物化学功能是必要的；40-50个残基通常是一个功能性结构域大小的下限。蛋白质大小的范围可以从这样一个下限一直到数千个残基。目前估计的蛋白质的平均长度在不同的物种中有所区别，一般约为200-380个残基，而真核生物的蛋白质平均长度比原核生物长约55%。更大的蛋白质聚合体可以通过许多蛋白质亚基形成；如由数千个肌动蛋白分子聚合形成蛋白纤维。.
蛋白质折叠
蛋白质折叠（Protein folding）是蛋白质获得其功能性结构和构象的过程。通过这一物理过程，蛋白质从无规则卷曲折叠成特定的功能性三维结构。在从mRNA序列翻译成线性的氨基酸链时，蛋白质都是以去折叠多肽或无规则卷曲的形式存在。 蛋白質的基本單位為胺基酸，而蛋白質的一級結構指的就是其胺基酸序列，蛋白質會由所含胺基酸残基的親水性、疏水性、帶正電、帶負電……等等特性通过残基间的相互作用而摺疊成一立體的三级結構。 根据克里斯琴·B·安芬森（1972年的諾貝爾化學獎得主）的研究，蛋白質可由加熱或置於某些化學環境而变性，三级结构解体；而當環境回復到原本的狀態時，蛋白質可於不到一秒的時間折疊至原先的立體結構，不論試驗幾次，蛋白質都僅此一種立體結構，於是Anfinsen提出一個結論：蛋白质分子的一级结构决定其立體结构。 安芬森的研究结果非常重要，因為蛋白質的功能取決於其立體結構，而目前根据已知某基因序列可翻译获得对应蛋白质的胺基酸序列，既蛋白質的一級結構；如果從蛋白質的一級結構就能知道立體結構，那麼即可直接從基因推测其编码蛋白质所對應的生物学功能。虽然蛋白質可在短時間中從一級結構摺疊至立體結構，研究者卻無法在短時間中從胺基酸序列計算出蛋白质結構，甚至无法得到准确的三维结构。因此，研究蛋白质折叠的过程，可以说是破译“第二遗传密码”——折叠密码（folding code）的过程。 目前蛋白质的再折叠依然遵从先使用胍或脲变性，然后逐渐降低胍或者脲的浓度，也就是逐渐降低对蛋白质天然“回缩”能力的干扰。使其自然回到天然的最低能量状态。只是这个过程无法很好的控制肽链与肽链之间和肽链内部形成错误折叠的干扰。.
蛋白脆饼
蛋白脆饼（Meringue）是一种泡沫蛋糕甜点，经常与法国或瑞士烹饪法相关联。它的口感清淡，轻快并甘甜。主要通过搅拌蛋白和白糖而制成，蛋白脆饼也可以根据不同菜色变化而加入塔塔粉，醋和沸腾的糖浆。最好的蛋白脆饼需要僵硬的，像高峰一般的顶端。通常，自制的蛋白脆饼带有柔软的内部和香脆的外表，但商业化的脆饼内部和外部都是脆的。.
雙硫鍵
雙硫鍵在化學上是一條從結合硫醇而衍生的單共價鍵。它又稱為二硫鍵或雙硫橋，大部分用於生物化學的範疇。其正式名稱應為過硫化物，但卻甚少使用。與過氧化物（R-O-O-R）相似，它的整體連結是R-S-S-R。雙硫鍵一般都是從巯基的氧化形成： 三個硫原子按序列連結有時被稱為三硫鍵，但其實只是兩個雙硫鍵。雙硫鍵在橡膠的硫化有著重要的地位。.
G-四聯體
G-四聯體（英語：G-quadruplex、G-tetrads或G4-DNA）是一種由富含鳥嘌呤的核酸序列所構成的四股型態。含有經由氫鍵維持穩定，並由鳥嘌呤以正方形方式排列而成的結構。在方形中央有一個單價陽離子（通常是鉀）。這種結構可見於DNA、RNA、LNA（鎖核酸）與PNA（肽核酸）；根據形成四聯體的各股的方向，可能有（intramolecular）、雙分子（bimolecular）或四分子（tetramolecular）等不同類型。 在四聯體的結構中，我們可以根據四股的方向，將結構分為平行和。.
GC含量
GC含量是在所研究的对象（例如放线菌）的全基因组中，（鸟嘌呤）（Guanine）和胞嘧啶（Cytosine）所占的比例。一种生物的基因組或特定DNA、RNA片段有特定的GC含量。 在DNA链中G和C是以三个氢键相连，而T和A则是两个氢键相连的。氢键的多少体现连接的能量，氢键多的不容易被打断。 在双链DNA中，腺嘌呤与胸腺嘧啶（A/T）之比，以及鸟嘌呤与胞嘧啶（G/C）之比都是1。但是，（A+T）/（G+C）之比则随DNA的种类不同而异。GC含量愈高，DNA的密度也愈高，同时热及碱不易使之变性，因此利用这一特性便可进行DNA的分离或测定。 测定GC含量的方法有：Tm法，HPLC法.
Hajos–Parrish–Eder–Sauer–Wiechert反应
Hajos–Parrish–Eder–Sauer–Wiechert反应（Hajos–Parrish–Eder–Sauer–Wiechert reaction） 由脯胺酸催化的不对称羟醛反应。此反应以其在罗氏（Hajos、Parrish）和先灵公司（Eder、Sauer、Wiechert）的早期研究者的名字而命名。这是有机催化的早期例子，也是第一个实现的非金属催化的羟醛反应。 最早是在20世纪70年代由 Hajos 和 Parrish 发现，如下图所示： 他们以非手性的三酮作为原料，用天然存在的手性脯胺酸作为催化剂，用3mol％的(S)-(-)-脯氨酸，就可以100％产率和93％ee实现底物的分子内羟醛反应。反应是在二甲基甲酰胺中进行，温度适中。他们也因此分离出了羟醛加成产物——双环酮醇。该加成产物最近才有人利用该实验再次分离出来。 先灵公司的研究组则将反应在非生理条件下进行，以47mol％的(S)-脯氨酸催化，80°C下，在 1N 高氯酸的乙腈溶液中进行反应。他们因此无法分离出酮醇产物，只得到了失水后产生的羟醛缩合产物（(7aS)-7a-甲基-2,3,6,7-四氢吲哚-1,5-二酮）。 Hajos 和 Parrish 接下来又用圆二色谱和单晶X射线衍射对上述酮醇产物的结构进行了分析，结果显示酮醇中的六元环为椅型构象，其中角甲基占据直键、羟基占平键，与洋地黄糖苷元（digitoxigenin）中CD环的构象类似（左下图）。 但是，酮醇产物的7a-乙基类似物则不然，该分子中乙基处于平键、羟基处于直键，以避免另一构象中乙基与 C-4 和 C-6 之间更为强烈的1,3-二轴交互作用（右下图）。 2000年，List 和 Barbas 等人尝试用简单的仲胺来模拟以烯胺活化机理催化羟醛反应的天然Ⅰ型醛缩酶，选用(S)-脯氨酸来做丙酮和对硝基苯甲醛的分子间直接羟醛反应，实现了68％产率、76％ee。 一般认为这标志着有机催化复兴的开始。 有机催化的分子间羟醛反应也被称为 List-Barbas 羟醛反应。 上述反应的副反应有酮与脯氨酸生成噁唑啉酮，以及醛与脯氨酸生成亚甲胺叶立德。List 等以高浓度的丙酮作为底物以抑制副反应的发生。 他们还考察了一些脯氨酸的类似物，但是发现大多数催化能力不如脯氨酸，还是最便宜的脯氨酸几乎是最好的催化剂。 不过5,5-二甲基噻唑-4-羧酸的催化效果也十分良好。 同年 Notz 和 List 又将此反应拓展至邻二醇的合成： 1985年有人将该反应用于 Wieland-Miescher酮的不对称合成，利用丁烯酮与2-甲基-1,3-环己二酮先发生麦克尔加成，然后再在脯氨酸催化下，发生羟醛反应成环制得产物。 总过程是一种罗宾逊成环反应。产物 W-M 酮是许多固醇类和萜类化合物的合成前体。 2000年，Barbas 等实现了脯氨酸催化下利用串联麦克尔-羟醛反应制取 Wieland-Miescher 酮的不对称合成。 2002年，美国的 MacMillan（大卫·麦克米兰）用脯氨酸作催化剂首次实现了不同的醛之间的羟醛反应。克服了做醛的交叉羟醛反应时醛的自身缩合问题。.
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Π螺旋
π螺旋（π-helix），蛋白质二级结构之一，它在膜蛋白中尤其多见。.
Α螺旋
α螺旋是蛋白质的二级结构。它和β折叠一起被称为「规则二级结构」，因为他们都具有重复的Φ和Ψ值（Cα-N夹角和Cα-C夹角）。 α螺旋一般是右手螺旋。在α螺旋中，平均每个螺旋周期包含3.6个氨基酸残基，残基侧链伸向外侧，同一肽链上的每个残基的酰胺氢原子和位于它后面的第4个残基上的羰基氧原子之间形成氢键，N－O距离是2.8Å。这种氢键大致与螺旋轴平行。一条多肽链呈α螺旋构象的推动力就是所有肽键上的酰胺氢和羰基氧之间形成的链内氢键。在水环境中，肽键上的酰胺氢和羰基氧既能形成内部（α螺旋内）的氢键，也能与水分子形成氢键。如果后者发生，多肽链呈现类似变性蛋白质那样的伸展构象。疏水环境对于氢键的形成没有影响，因此，更可能促进α螺旋结构的形成。 α螺旋中，氨基酸的R基团指向外和向下。这样以来就避免了与多肽链的主干部分之间的的位阻影响。螺旋的核心部分紧密结合，原子之间以范德华力联系在一起。 因为其特殊的环状R基团，脯氨酸一般不出现在α螺旋中，而经常出现在α螺旋的开始处。.
Β-转角
β-转角是是多肽链中常见的二级结构。.
Β折叠
β折叠（β-sheet），又称β片层结构（β-pleated sheet）或β转角，是蛋白质的一种二级结构。 在β折叠中，两条以上氨基酸链（肽链），或同一条肽链之间的不同部分形成平行或反平行排列，成为“股”。肽平面之间呈手风琴状折叠，股与股之间会通过氢键固定，但氢键主要在股间而不是股内。氨基酸残基的R侧链分布在片层的上下。 β折叠层并不是平的，因为侧链的存在使得它看上去像手风琴一样波纹起伏。（英语pleated）这样每一股会更紧密排列，氢键更容易建立。氢键的距离为7埃。在蛋白质结构中β折叠通常会用箭头表示。肽链的氮端在同侧为顺式，两残基间距为0.65nm；不在同侧为反式，两残基间距为0.70nm。反式较顺式平行折叠更加稳定。 能形成β折叠的氨基酸残基一般不大，而且不带同种电荷，这样有利于多肽链的伸展，如甘氨酸、丙氨酸在β折叠中出现的几率最高。免疫球蛋白有大量的β折叠层。 另一种常见的蛋白质模序是α螺旋和三种不同的β转角。不属于一个模序的蛋白质一级结构部分被称之为不规则螺旋。这些部分对蛋白质的空间构象非常重要。.
TATA盒
TATA盒（英語：TATA box）又稱高得堡-哈葛尼斯箱（英語：Goldberg-Hogness box），是一段DNA序列，位於真核生物和古細菌的轉錄啟動子上，大約位在轉錄起始點上游第25個鹼基對。TATA盒是RNA聚合酶II結合的位置。原核生物的細胞中也有相似的序列，稱為普里布諾盒（Pribnow box）。 TATA盒在轉錄的過程中，時常和一種TATA结合蛋白（TATA binding protein，TBP）結合，TBP負責把DNA雙螺旋鬆開；由於TATA盒富含T和A，使得這個過程較為容易（A、T之間只有2條氫鍵）。 在RNA聚合酶II接上之前，轉錄因子IID（TFIID）率先接上TATA盒，隨後TFIIA、TFIIB、TFIIF、TFIIE、TFIIH等轉錄因子也分別接到TFIID結合位的上下游，形成一團複合物。最後，RNA聚合酶II辨認出轉錄因子的複合物，並附著上去開始轉錄。 Category:基因表現.
抗体
抗體，又稱免疫球蛋白（immunoglobulin，簡稱Ig），是一种主要由浆细胞分泌，被免疫系统用来鉴别与中和外来物质如细菌、病毒等病原体的大型Y形蛋白质，仅被发现存在于脊椎动物的血液等体液中，及其B细胞的细胞膜表面。抗体能通过其可变区唯一识别特定外来物的一个独特特征，该外来目标被称为抗原。蛋白上Y形的其中两个分叉顶端都有一被称为互补位（抗原結合位）的锁状结构，该结构仅针对一种特定的抗原表位。这就像一把钥匙只能开一把锁一般，使得一种抗体仅能和其中一种抗原相结合。 抗体和抗原的结合完全依靠非共价键的相互作用，这些非共价键的相互作用包括氢键、范德华力、电荷作用和疏水作用。这些相互作用可以发生在侧链或者多肽主干之间。正因这种特异性的结合机制，抗体可以“标记”外来微生物以及受感染的细胞，以诱导其他免疫机制对其进行攻击，又或直接中和其目标，例如通过与入侵和生存至关重要的部分相结合而阻断微生物的感染能力等，就像通緝犯上了手銬和腳鐐一樣。针对不同的抗原，抗体的结合可能阻断致病的生化过程，或者召唤巨噬细胞消灭外来物质。而抗体能够与免疫系统的其它部分交互的能力，是通过其Fc区底部所保留的一个糖基化座实现的 。体液免疫系统的主要功能便是制造抗体。抗体也可以与血清中的补体一起直接破壞外来目标。 抗體主要由一種B细胞所分化出来的叫做漿細胞的淋巴細胞所製造。抗体有两种物理形态，一种是从细胞分泌到血浆中的可溶解物形态，另一种是依附于B细胞表面的膜结合形态。抗体与细胞膜结合后所形成的复合体又被称为B细胞感受器（B Cell Receptor，BCR），这种复合体只存在于B细胞的细胞膜表面，是激活B细胞以及后续分化的重要结构。B细胞分化后成为生产抗体的工厂的浆细胞，或者长期存活于体内以便未来能迅速抵抗相同入侵物的记忆B细胞。在大多数情况下，与B细胞进行互动的辅助型T细胞对于B细胞的完全活化是至关重要的，因为辅助型T细胞负责识别抗原，并促使B细胞能分化出能与该抗原相结合的抗体的浆细胞和记忆型B细胞。而可溶性抗体则被释放到血液等体液当中（包括各种分泌物），持续抵抗正在入侵的外来微生物。 抗体是免疫球蛋白超家族中的一种醣蛋白 。它们是血浆中丙种球蛋白的主要构成成分。抗体通常由一些基础单元组成，每一个抗体包括：两个長（大）的重链，以及两个短（小）的轻链。而輕鏈和重鏈之間以雙硫鍵連接。輕鏈和重鏈又分為可變區和恆定區，而不同类型的重链恆定區，将会导致抗体种型的不同。在哺乳类动物身上已知的不同种型的抗体有五种，它们分别扮演不同的角色，并引导免疫系统对所遇到的不同类型外来入侵物产生正确的免疫反應。 尽管所有的抗体大体上都很相似，然而在蛋白质Y形分叉的两个顶端有一小部分可以发生非常丰富的变化。这一高变区上的细微变化可达百万种以上，该位置就是抗原结合位。每一种特定的变化，可以使该抗体和某一个特定的抗原结合。这种极丰富的变化能力，使得免疫系统可以应对同样非常多变的各种抗原。之所以能产生如此丰富多样的抗体，是因为编码抗体基因中，编码抗原结合位（即互补位）的部分可以随机组合及突变。此外，在免疫种型转换的过程中，可以修改重链的类型，从而制造出对相同抗原專一性的不同种型的抗体，使得同种抗体可以用于不同的免疫系统过程中。.
抓氢键
抓氢键（又称agostic键）是一种烷基、烯基、炔基或芳基中的氢与过渡金属间形成的3c2e键。.
构效关系
构效关系指的是药物或其他生理活性物质的化学结构与其生理活性之间的关系，是药物化学的主要研究内容之一。狭义的构效关系研究的对象是药物，广义的构效关系研究的对象则是一切具有生理活性的化学物质，包括药物、农药、化学毒剂等。最早期的构效关系研究以直观的方式定性推测生理活性物质结构与活性的关系，进而推测靶酶活性位点的结构和设计新的活性物质结构，随着信息技术的发展，以计算机为辅助工具的定量构效关系成为构效关系研究的主要方向，定量构效关系也成为合理药物设计的重要方法之一。.
杂化材料
杂化材料（Hybrid material）是由两种纳米或分子级别成分组成的混合物。在自然界中通常是由一种无机物同一种有机物的混合，因此他们与通常意义上的混合物的差异在于一般的混合物是宏观量级（微米或者毫米）。在微观量级的混合会导致均匀混合的物质会体现出介于两种成分之间的特性甚至是一些新的特性。.
核糖体小亚基
核糖体小亚基（英文：Ribosomal Small Subunit，简称“SSU”）是核糖体中较小的核糖体亚基。每个核糖体都由一个核糖体小亚基与一个核糖体大亚基共同构成。小亚基在核糖体翻译过程中负责信息的识别。 原核细胞中的70S核糖体、真核细胞细胞质中的80S核糖体与真核细胞线粒体中的线粒体核糖体各拥有一种不同的核糖体小亚基：70S核糖体中包含30S核糖体亚基，80S核糖体中包含40S核糖体亚基，线粒体核糖体中则包含28S核糖体亚基。.
核糖体蛋白质
核糖体蛋白质（Ribosomal Protein，简称“核糖体蛋白”或“RP”）是参与构成核糖体的所有蛋白质的统称。由于核糖体蛋白质需要高浓度的盐溶液和强解离剂（如含高浓度Mg2+的67%的CH3COOH或3mol/L LiCl~4mol/L (NH2)2CO）才能将其分离，所以这类蛋白质相对于“核糖体相关蛋白质”也被称为“真核糖体蛋白质”。 因为在核糖体自组装过程中，这类蛋白质逐批与rRNA结合形成核糖体的大、小亚基，所以这些蛋白质又按与rRNA结合的顺序分为“初级结合蛋白”、“次级结合蛋白”与“迟结合蛋白”等几组。 当前，对核糖体蛋白质的了解主要来自对大肠杆菌（E.
核酸二级结构
核酸二级结构（Nucleic acid secondary structure）是单个核酸聚合物内或两个聚合物之间的碱基对相互作用。它可以被表示为在核酸分子中配对的碱基的一个列表。 生物DNA的和RNA的二级结构往往有所不同：生物DNA主要以完全碱基配对的双螺旋的形式存在，而生物RNA是单链的，并且由于来自核糖中额外的羟基增加的形成氢键的能力而形成错综复杂的碱基配对相互作用。 在非生物学背景下，由于碱基对的模式最终决定了分子的整体结构，因此二级结构对于DNA纳米技术和DNA运算的核酸结构的至关重要。.
核酸热力学
核酸熱力學是指溫度影響雙鏈DNA（dsDNA）的核酸結構。DNA变性（DNA denaturation）又稱DNA融化（DNA melting）是DNA雙螺旋解開成為兩條單股長鏈的過程。在過程中，使兩股長鏈上的鹼基相連的氫鍵會斷裂。 DNA的變性可以是溫度升高而產生的作用，也可能是其他化學物質如尿素的誘導。使DNA解開的融化溫度（Tm）是依DNA鏈的長度，以及特定核苷酸序列的組成形式而定。.
核酸結構
核酸結構（Nucleic acid structure）是指如DNA与RNA的核酸。从化学角度上讲，DNA与RNA是非常相似的。DNA与RNA的结构常分为四个不同水平：一级、二级、三级及四级。 能夠直接計算出DNA機械性質的實驗技術相對較新，且要在溶液中進行高解析度觀察也較困難，不過科學家仍然解出了許多關於DNA機械性質的數據。關於DNA機械性質的研究，包括不同型態的DNA雙螺旋、DNA超螺旋、非螺旋型態、鹼基配對鍵結、熔點等。.
植物體無機鹽運送途徑
植物體無機鹽運送途徑指的是維管束植物體內水及無機鹽的運送方法，包括由根吸收到木質部，以及由木質部運送到全身兩個部份。.
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氟化氢
氟化氫（化學式：HF）是氫的氟化物，有強烈的腐蝕性，有剧毒。它是無色的氣體，在空氣中，只要超過3ppm就會產生刺激的味道。 氫氟酸是氟化氫的水溶液，可以透過皮膚黏膜、呼吸道及腸胃道吸收。若不慎暴露於氫氟酸，應立即用大量清水沖洗20至30分鐘，然後以葡萄酸鈣軟膏或藥水塗抹，并緊急送醫處理；若不小心誤飲，則要立即喝下大量的高鈣牛奶，然後緊急送醫處理。.
氟化氢根
氟化氢根，是化学式为HF2−的离子。这个中心对称的三原子阴离子具有已知最强的氢键，F-H键键长为114pm，键能大于155 kJ mol−1。一个分子轨道图显示，三个原子形成了一个三中心四电子键。需要注意的是，氢、氟按1:2结合的化合物HF2是不存在的。根据等电子体假设，HeF2也是不存在的。而氟氦阴离子FHeO−的存在性是值得怀疑的。.
氢
氫是一種化學元素，其化學符號為H，原子序為1。氫的原子量為，是元素週期表中最輕的元素。單原子氫（H）是宇宙中最常見的化學物質，佔重子總質量的75%。等離子態的氫是主序星的主要成份。氫的最常見同位素是「氕」（此名稱甚少使用，符號為1H），含1個質子，不含中子；天然氫還含極少量的同位素「氘」（2H），含1個質子和1個中子。 氫原子最早在宇宙復合階段出現並遍佈全宇宙。在標準溫度和壓力之下，氫形成雙原子分子（分子式為H2），呈無色、無臭、無味非金屬氣體，不具毒性，高度易燃。氫很容易和大部份非金屬元素形成共價鍵，所以地球上大部份的氫都以分子的形態存在，比如水和有機化合物等。氫在酸鹼反應中尤其重要，因為在這類反應中各種分子須互相交換質子。在離子化合物中，氫原子可以獲得一個電子成為氫陰離子（H−），或失去一個電子成為氫陽離子（H+）。雖然在一般寫法中，氫陽離子就是質子，但在實際化合物中，氫陽離子的實際結構是更為複雜的。氫原子是唯一一個有薛定諤方程式解析解的原子，所以對氫原子模型的研究在量子力學的發展過程中起到了關鍵的作用。 16世紀，人們通過混合金屬和強酸，首次製備出氫氣。1766至1781年，亨利·卡文迪什第一次發現氫氣是一種獨立的物質，燃燒後會產生水。安東萬-羅倫·德·拉瓦節根據這一性質，將其命名為「Hydrogen」，在希臘文中意為「生成水的物質」。19世纪50年代，英国医生合信编写《博物新编》（1855年）时，把元素名翻译为“轻气”，成為今天中文「氫」字的來源。 氫氣的工業生產主要使用天然氣的蒸汽重整過程，或通過能源消耗更高的水電解反應。大部份的氫氣都在生產地點直接使用，主要應用包括化石燃料處理（如裂化反應）和氨生產（一般用於化肥工業）。在冶金學上，氫氣會對許多金屬造成氫脆現象，使運輸管和儲存罐的設計更加複雜。.
氢氧化镁
氢氧化镁（化学式：Mg(OH)2）是镁的氢氧化物，为白色晶体或粉末，难溶于水，广泛用作阻燃剂、抗酸剂和胃酸中和剂。氢氧化镁在水中的悬浊液称为氢氧化镁乳剂，简称镁乳，用于中和过多的胃酸和治疗便秘。.
氢氧化镉
氢氧化镉是一种无机化合物，化学式为Cd(OH)2。它是一种离子化合物，为白色晶体。它在鎳鎘電池中是一种关键性的化合物Karl-Heinz Schulte-Schrepping, Magnus Piscator "Cadmium and Cadmium Compounds" in Ullmann's Encyclopedia of Industrial Chemistry, 2007 Wiley-VCH, Weinheim.
氧
氧（IUPAC名：Oxygen）是一種化學元素，符號為O，原子序為8，在元素週期表中屬於氧族。氧屬於非金屬，是具有高反應性的氧化劑，能夠與大部分元素以及其他化合物形成氧化物。氧在宇宙中的總質量在所有元素中位列第三，僅居氫和氦之下。Emsley 2001, p.297在標準溫度和壓力下，兩個氧原子会自然鍵合，形成無色無味的氧氣，即雙原子氧（）。氧氣是地球大氣層的主要成分之一，在體積上佔20.8%。地球地殼中近一半的質量都是由氧和氧化物所組成。 氧是細胞呼吸作用中重要的元素。在生物體中，主要有機分子，如蛋白質、核酸、碳水化合物和脂肪等，還有組成動物外殼、牙齒和骨骼的無機化合物，都含有氧原子。生物體絕大部分的質量都由含氧原子的水組成。光合作用利用陽光的能量把水和二氧化碳轉化為氧氣。氧氣的化學反應性強，容易與其他元素結合，所以大氣層中的氧氣成分只能通過生物的光合作用持續補充。臭氧（）是氧元素的另一種同素異構體，能夠較好地吸收中紫外線輻射。位於高海拔的臭氧層有助阻擋紫外線，從而保護生物圈。不過，在地表上的臭氧屬於污染物，為霧霾的副產品之一。在低地球軌道高度的單原子氧足以對航天器造成腐蝕。 卡爾·威廉·舍勒於1773年或之前在烏普薩拉最早發現氧元素。約瑟夫·普利斯特里亦於1774年在威爾特郡獨立發現氧，因為其成果的發表日期較舍勒早，所以一般被譽為氧的發現者。1777年，安東萬-羅倫·德·拉瓦節進行了一系列有關氧的實驗，推翻了當時用於解釋燃燒和腐蝕的燃素說。他也提出了氧的現用IUPAC名稱「oxygen」，源自希臘語中的「ὀξύς」（oxys，尖銳，指酸）和「-γενής」（-genes，產生者）。這是因為命名之時，人們曾以為所有酸都必須含有氧。許多化學詞彙都在清末傳入中國，其中原法文元素名「oxygène」被譯為「養」，後譯為「氱」，最終演變為今天的中文名「氧」。 氧的應用包括暖氣、內燃機、鋼鐵、塑料和布料的生產、金屬氣焊和氣割、火箭推進劑、及航空器、潛艇、載人航天器和潛水所用的生命保障系統。.
氮杂双烯狄尔斯–阿尔德反应
氮杂双烯狄尔斯–阿尔德反应（azadiene Diels–Alder reaction或aza-Diels–Alder reaction）是利用亚胺与双烯合成四氢吡啶类物质的环加成反应。这种有机化学反应是狄尔斯–阿尔德反应的变种，氮原子取代了原反应中双烯或双烯亲和物中亚甲基或次甲基。此反应反应物中的亚胺往往是由胺和甲醛在原位（in situ）产生的，比如环戊二烯与苯甲胺生成氮杂降冰片烯的反应，反应过程如下图所示： 在苯胺类物质的对映选择性氮杂双烯狄尔斯–阿尔德反应中，即使双烯被修饰掩蔽，在甲醛水溶液里(S)-脯氨酸（或其衍生物）的催化下也能与α,β-不饱和环酮及芳胺发生反应。 如右图所示，(S)-脯氨酸催化对映选择性氮杂双烯狄尔斯–阿尔德反应的催化循环从芳香胺与甲醛产生亚胺开始。在反应的第一步中，酮与脯氨酸脱水缩合产生的氮杂双烯和生成的亚胺结合。反应的第二步是内型-平面型体系环化反应（endo-trig cyclisation），因为亚胺中的氮原子与脯氨酸残基中羧基si-面（si-face）上的氢原子间形成了氢键，所以只会产生两种可能的对映异构体之一（99%ee）。反应进入第三步后，第二步产生的有机化合物发生水解，得到产物与脯氨酸，脯氨酸作为催化剂再次进入循环。 有研究发现大量发生在各种亚胺与丹尼谢夫斯基双烯（Danishefsky's diene）间的的氮杂双烯狄尔斯–阿尔德反应能由咪唑盐催化，并拥有较高产率。其反应过程如下图所示：.
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氯化钠
氯化钠（化学式：NaCl），是一种离子化合物。钠离子和氯离子的原子质量分别为22.99和35.45g/mol。也就是说100g的氯化钠中含有39.34 g的钠和 60.66 g的氯。氯化钠是海水中盐分的主要组成部分，它的存在也使得海水有其特有的咸味苦味。氯化钠也是细胞外液的主要盐类，0.9%的氯化鈉水溶液俗称为生理盐水。其可食用的形态是食盐的主要成分，多用于食物的调味和保存。 在工業中，主要用于制造氢氧化钠和氯以及应用于聚氯乙烯、塑料、木浆（紙漿）等許多其他產品的生产过程。由于它可以降低水的冰点，偶尔也用于解冻冰冻的路面。.
水
水（化学式：H2O）是由氢、氧两种元素组成的无机物，在常温常压下为无色无味的透明液体。水是地球上最常见的物质之一，是包括人类在内所有生命生存的重要资源，也是生物体最重要的组成部分。水在生命演化中起到了重要的作用。人类很早就开始对水产生了认识，东西方古代朴素的物质观中都把水视为一种基本的组成元素，水是中國古代五行之一。人體有百分之七十是水。.
水分子簇
水分子簇，又称水团簇、水簇、水分子团是一种不连续的氢键结构形成的水分子簇合物。这些簇合物有的被实验所证实，有的通过理论计算推测存在。它们有多种存在的形式：在冰中、在晶格中以及在液态水中。其中最简单的就是（化学式：(H2O)2）。继续进行科学研究十分重要，因为这使人们意识到水能自发地形成簇合物，而不是各向同性的无序物质。这可能可以解释水的许多反常性质，例如其密度不完全遵守热胀冷缩的规律。水分子簇也与一些特定超分子结构的稳定性有关。人类目前对自由水中水分子簇的了解很少，因此这被认为是未解决的化学问题之一。.
水的性質
水分子（化学式：H2O）是地球表面上最多的分子，除了以气体形式存在于大气中，其液体和固体形式占据了地面70-75%的组成部分。标准状况下，水分子在液体和气体之间保持动态平衡。室温下，它是无色，无味，透明的液体。作为通用溶剂之一，水可以溶解许多物质。因此，自然界极少有水的纯净物。.
水稻基因組
水稻基因組（英語：Rice genome）是水稻（Oryza sativa）的基因組。共組成12個染色體。大約含有4億3千萬個DNA鹼基對（以氫鍵相結合的兩個含氮鹼基），其中的一些鹼基對，組成了約38000個基因，這個數字約是人類基因--數目的1.7倍。 來自11個國家的團隊，在國際水稻基因組定序計劃中調查水稻與一些栽培亞種的基因組DNA序列，在2005年8月發表了初步的結果。.
活性位点
活性位点（Active site），又称活化位置，是指一個酵素中具有催化能力與結合位置的部位。其結構與化學性質可供辨識受質，並與受質結合。活化位置通常是酵素表面上一個類似口袋的區域，內部含有可與特定受質發生反應的殘基。.
淀粉
淀粉（starch, amylum）是由通過糖苷鍵連接的大量葡萄糖單元組成的聚合碳水化合物，属于一种多醣。制造淀粉是绿色植物贮存能量的一种方式。淀粉也是人类饮食中最常见的碳水化合物，广泛存在于马铃薯，小麦，玉米，大米，木薯等主食中。 纯淀粉是一种白色，无味，无臭的粉末，不溶于冷水或酒精，分子式为(C6H10O5)n。淀粉因分子内氢键卷曲成螺旋结构的不同，可分为直链淀粉（糖淀粉）和支链淀粉（胶淀粉）。前者为无分支的螺旋结构；后者以24~30个葡萄糖残基以α-1,4-糖苷键首尾相连而成，在支链处为α-1,6-糖苷键。直链淀粉遇碘呈蓝色，支链淀粉遇碘呈紫红色。这是由于淀粉螺旋中央空穴恰能容下碘分子，由于范德华力，两者形成一种蓝黑色錯合物。实验证明，单独的碘分子不能使淀粉变蓝，实际上使淀粉变蓝的是三碘阴离子（I3-）。 淀粉在食品工业中被加工以产生多种糖。淀粉在温水中溶解产生糊精，这可以用作增稠剂，硬化則作為粘接剂。淀粉在非食品工业最广泛的用途是在造纸过程中作为粘合剂。.
溶劑化
溶劑化，有時也稱為溶解，為一吸引帶有分子離子溶劑的溶液聚集的過程。當離子在溶劑中溶解，且會被溶劑分子所包圍。.
溶劑效應
溶劑效應是指溶劑所產生的一連串化學反應，會影響主要化學反應的反應速率、反應平衡、溶解度、穩定性甚至是反应机理；換而言之，化學反應中的熱力學和動力學可藉由選擇適當溶劑來控制。.
溶剂
溶剂是一种可以溶解固体，液体或气体溶质的液体，继而成为溶液。在日常生活中最普遍的溶剂是水。而所谓有机溶剂即是包含碳原子的有机化合物溶剂。溶剂通常拥有比较低的沸点和容易挥发。或是可以由蒸馏来去除，从而留下被溶物。因此，溶剂不可以对溶质产生化学反应。它们必须为低活性的。溶剂可从混合物萃取可溶化合物，最普遍的例子是以热水冲泡咖啡或茶。溶剂通常是透明，无色的液体，他们大多都有独特的气味。 溶液的浓度取决于溶解在溶剂内的物质的多少。溶解度则是溶剂在特定温度下，可以溶解最多多少物质。 有机溶剂主要用于干洗（例如四氯乙烯），作涂料稀释剂（例如甲苯、香蕉水、松香水、松节油），作洗甲水或去除胶水（例如丙酮，醋酸甲酯，醋酸乙酯），除锈（例如己烷），作洗洁精（柠檬精），用于香水（酒精）跟用于化学合成。.
未解决的化学问题
未解决的化学问题往往指以下这些类型的问题：“我们能制备某种化合物吗？”、“我们能分析它吗？”、“我们能提纯它吗？”等等。这些问题通常都能很快解决，但可能需要付出相当大的努力才行。然而，一些问题有着很深的内涵。本文旨在介绍化学研究的中心领域仍未解决的难题。当某个领域的专家认为该问题未解决，或者几位专家不同意某问题的解释时，该问题会被视作未解决的化学问题。.
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朱莉娅-科隆纳环氧化反应
朱莉娅-科隆纳环氧化反应（Juliá–Colonna epoxidation）是一个以聚亮氨酸为催化剂的碳-碳双键不对称环氧化反应。该反应在1980年由塞巴斯蒂安·朱莉婭（Sebastian Juliá）报道，以及由朱莉婭和斯蒂法諾·科隆納（Stefano Colonna）同时做的进一步阐述。 原始的反应模式为三相反应，包含了水相、有机相和催化剂相。作为反应物的查耳酮衍生物溶于有机溶剂（例如甲苯或四氯化碳）中，成为有机相。碱性过氧化氢溶液为水相。反应则发生在既不溶于水相，也不溶于有机相的催化剂聚亮氨酸的表面。两相甚至均相的改进方法也已开发出来，改进后的反应活性和速率均有显著提高。 该反应是在温和条件下，立体选择性地环氧化双键的有效手段，因而在有机合成上具有重大的价值:环氧化物不仅是许多有机合成的中间体，许多天然产物也都是过氧化物。此外，经 （Bayer）和（Evonik）等人的工作，该反应已经能够有效地应用于工业生产。最后，该反应的催化剂聚氨基酸具有类似酶的性质，因而该反应也有助于对生源合成的研究。.
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机械键
机械键（mechanical bond）是出現在輪烷及索烃等機械互鎖分子結構的化學鍵。机械键和傳統分子結構不同，互鎖的兩個化學結構之間沒有共價鍵的鍵結，是兩個獨立的結構，但因為其幾何結構的關係，讓兩個分子需維持一定的距離或是特定幾何關係，只有破壞其中一個結構的共價鍵才能 破壞互鎖分子之間的机械键。 有些分類會將机械键歸類在超分子化學中，不過此名詞是比較新的名詞，不像共價鍵、氫鍵、離子鍵那麼常用。.
有机催化
有机催化（Organocatalysis）是指只含碳、氢、硫和其他非金属元素的“有机催化剂”对化学反应的催化作用。Special Issue: 这是目前有机合成中最热门的领域之一。它又可按照催化机理分为烯胺活化、亚胺离子活化、SOMO活化、氢键活化（硫脲催化、手性质子酸催化、寡肽催化、金鸡纳生物碱催化）、手性相转移催化剂活化和氮杂环卡宾活化等。 有机催化反应实际上很早就有报道。20世纪70年代发现的Hajos-Parrish-Eder-Sauer-Wiechert反应就是脯氨酸催化的分子内羟醛反应。2000年，List等将此反应用于不对称的分子间羟醛反应，在JACS上发表题为《脯氨酸催化的直接不对称羟醛反应》的通讯，标志着有机催化的复兴。同年MacMillan创制出“有机催化”一词，并提出一种全新的有机催化机理——亚胺活化。.
有机磷化合物
有机磷化合物指含有碳-磷键的有机化合物，它們主要用於蟲害控制以作為長期存在於環境中的氯化烴、滴滴涕等替代物。研究有机磷化合物性质和反应的有机化学分支稱作有机磷化学。磷元素与氮同族，具有类似的价电子层结构，因此有机磷化合物的性质与有机含氮化合物有些相似。 但除了3s和3p轨道外，磷还可以用3d轨道成键，因此也存在很多特殊高价的有机磷化合物，它们都不存在对应的氮化合物。磷的电负性也小于氮，碱性较弱，因此形成化合物的性质也存在很多差别。 磷是生命必需元素之一，与生命体密切相关，例如普遍存在于生物体中的核酸便含有大量的磷酸酯基团。由于磷-氧键键能较高，因此核苷酸类的三磷酸腺苷（ATP）被称为“能量分子”，用于储存和传递化学能。磷酸根离子也存在于血液中。 很多农药和化学武器也含有有机磷化合物成分。.
有机氟化学
有机氟化学是研究有机氟化合物——含有碳－氟键（C-F）化合物的性质的有机化学分支。氟原子的引入常常导致有机化合物产生独特的物理、化学性质和生理活性，因而在许多尖端技术和重大工业项目及医药、农药和催化工业中都对含氟化合物进行广泛而深入的研究和应用。另一方面，有些有机氟化合物也是环境污染物，造成臭氧层破坏、全球变暖、生物累积和生物毒性。.
感情纽带
感情纽带（也称链结，Human Bonding）是指人与人之间形成的一种亲近的人际关系。也指人与动物之间建立的联系。建立感情纽带的过程则称为建立链结，或简言之为结链。感情纽带大多存在于亲人、朋友之间，不过和一个队伍（例如球队）或一个人长时间的相处也可以建立感情纽带。感情纽带和普通的好感有所不同，它是一种相互的、互动的过程。 感情纽带通常在浪漫伙伴、密友和亲子产生和发展。这种联系是以类似于喜欢和信任的情感为特征的。任意两个总在一起消磨时间的人都可能形成感情纽带。男性链结指的是通常男性在一起而不包括女性在内的活动。另一个名词女性链结使用频率较低，指的是女性之间形成的亲近的人际关系。.
拉乌尔定律
拉烏爾定律（Raoult's law）描述了溶液的蒸氣壓與其濃度的關係，由法國物理家麻痺拉烏爾於1887年根據試驗結果得到。它指出一定温度下，理想溶液内每一組分的蒸氣壓等於该組分的摩尔分数與其作純溶劑時的蒸气压的乘積，且總的蒸氣壓等於各組分的蒸氣壓之和。 其數學表示爲： 每個組分的蒸氣壓p_： 其中p為溶液的蒸氣壓，p^_為組分作純溶劑時的蒸氣壓，x_為溶劑的摩尔分数。 拉烏爾定律亦可以蒸氣壓下降表述爲：「理想溶液在一定溫度下的蒸氣壓下降與溶質的摩爾分數成正比。」 此時其數學表示爲： 其中\Delta p爲溶液的蒸氣壓下降，p爲純溶劑的飽和蒸氣壓，x爲溶質的摩尔分数。 若用質量摩爾濃度代替摩爾分數，可作如下近似處理： 其中m爲溶質的質量摩爾分數，K一般稱爲蒸氣壓下降常數。 需要注意的是，拉烏爾定律僅適用於理想溶液，應用於難揮發的非電解質稀溶液時所得結果是近似的。不過若溶質與溶劑皆具有揮發性且不發生相互作用時，其仍可視作理想溶液，拉烏爾定律仍然適用，溶液的總蒸氣壓等於溶質與溶劑的蒸氣壓之和。.
16S 核糖体RNA
16S核糖体RNA（16S ribosomal RNA），简称16S rRNA，是原核生物的核糖体中30S亚基的组成部分。16S rRNA的长度约为1,542 nt。卡尔·乌斯和乔治·福克斯是率先在系统发育中使用的16S rRNA基因的两个先驱者。 一个细菌的细胞中可包含多个具有不同序列的16S rRNA。.
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2-氨基苯酚
2-氨基苯酚是一種有機化合物，化學式為C6H4(OH)NH2。它是氨基苯酚的同分異構體之一，另外兩種異構體為3-氨基苯酚和4-氨基苯酚。它是一種兩性物質和還原劑，亦是生成其他染料及雜環化合物的試劑Mitchell, S.C. & Waring, R.H. “Aminophenols.” In Ullmann’s Encyclopedia of Industrial Chemistry; 2002 Wiley-VCH,.
5,5-二甲基-1,3-环己二酮
5,5-二甲基-1,3-环己二酮（Dimedone），白色至绿黄色菱状或针状结晶，难溶于水，溶于乙醇、甲醇、氯仿、乙酸、苯和50％醇水溶液。用作醛的鉴定试剂，也用于有机合成，可用作有机并环杂环化合物的合成原料。 其他名称：二甲基环己二酮、二甲基二氢间苯二酚、双甲酮、达米东、哒咪酮、醛试剂、待米酮、地麦冬、双美酮。.
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