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核酸酶

指数 核酸酶

核酸酶(nuclease)是以核酸为底物,催化磷酸二酯键水解的一类酶。.

25 关系: 基因工程去氧核糖核酸酶单链DNA结合蛋白信使核糖核酸嘌呤代谢周质空间內切酶CRISPR端粒续命汤EcoRI適體輪狀病毒脱氧核糖核酸蛋白酶KRNA剪接TBE緩衝液TE缓冲液核糖體核糖核酸核糖核酸外切酶核糖核酸酶核酶水解酶消化作用

基因工程

基因工程(genetic engineering,又称为遺傳工程、转基因、基因修饰)是一组使用生物技术直接操纵有机体基因组、用于改变细胞的遗传物质的技术。包括了同一物种和跨物种的基因转移以产生改良的或新的生物体。可以通过使用分子克隆技术分离和复制需要的遗传物质以产生DNA序列,或通过合成DNA,然后插入宿主生物体,以此将新的遗传物质插入宿主基因组中。可以使用核酸酶除去或“敲除”基因。基因靶向是使用同源重组来改变内源基因的不同技术,并且可以用于缺失基因,去除外显子,添加基因或引入点突变。 通过基因工程产生的生物体被认为是转基因生物体(GMO)。第一种转基因生物是1973年产生的细菌和1974年的转基因小鼠。利用细菌产生胰岛素在1982年商业化,转基因食品自1994年以来一直销售。作为宠物设计的第一种转基因生物GloFish于2003年12月首先在美国销售。 遗传工程技术已经应用于许多领域,包括研究、农业、工业生物技术和医学。用于洗衣洗涤剂和药物如胰岛素和人生长激素的酶现在在转基因(GM)细胞中制造,实验性转基因细胞系和转基因动物例如小鼠或斑马鱼正用于研究目的,并且转基因作物已经商业化。.

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去氧核糖核酸酶

去氧核糖核酸酶(英語:Deoxyribonuclease;縮寫:DNase)又稱DNA酶,是指能經由水解作用,將DNA骨架上的磷酸雙酯鍵切斷的酶。DNA酶是核酸酶(nuclease)中的一種,目前已知的DNA酶有許多不同類型,主要差異在於受質專一性、化學反應機制,以及生物學上的功能。 Category:EC 3.1.21.

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单链DNA结合蛋白

单链DNA结合蛋白(Single-stranded DNA-binding protein,缩写SSB或SSBP)又称单链结合蛋白,是专门负责与DNA单链区域结合的一种蛋白质,为DNA复制、重组和修复所必需的成分。.

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信使核糖核酸

信使RNA(messenger RNA,縮寫:mRNA),是由DNA經由轉錄而來,帶著相應的遺傳訊息,為下一步轉譯成蛋白質提供所需的訊息。在细胞中,mRNA從合成到被降解,經過了數個步驟。在轉錄的過程中,第二型RNA聚合酶(RNA polymerase II)從DNA中複製出一段遺傳訊息到前mRNA(尚未經過修飾或是部份經過修飾的mRNA,稱作pre-messenger RNA,pre-mRNA,或是heterogeneous nuclear RNA,hnRNA)上。在原核生物中,除了5'加帽之外mRNA並未被進一步處理(但有些罕有的特例),而經常是邊轉錄邊轉譯。在真核生物中,轉錄跟轉譯發生在細胞的不同位置,轉錄發生在儲存DNA的細胞核中,而轉譯是發生在細胞質中。不過,曾有研究學者認為真核生物亦有邊轉錄邊轉譯的現象,只是這個觀點並未被廣泛接受。 在真核生物中,mRNA在準備好轉譯前需要經過多個處理步驟:.

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嘌呤代谢

許多生物利用代謝途徑來合成或分解嘌呤。.

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周质空间

周质空间(periplasmic space),又称为周质(periplasm)或壁膜间隙,是革蘭氏陰性菌的细胞膜与外膜(Outer membrane)之间的间隔区域。 在革兰氏阴性菌中,一般指其外膜与细胞膜之间的狭窄空间(宽约12-15nm),呈胶状。在周质空间中,存在着许多种周质蛋白,包括:.

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內切酶

核酸内切酶(-)在核酸水解酶中,为可水解分子链内部磷酸二酯键生成寡核苷酸的酶,与核酸外切酶相对应。从对底物的特异性来看,可分为DNaseⅠ、DNaseⅡ等分解DNA的酶;RNase、RNaseT1等分解RNA的酶。一般来说,大都不具碱基特异性,但也有诸如脾脏RNase、RNaseT1等或限制性内切酶那种能够识别并切断特定的碱基或碱基序列的酶。其中的限制內切酶又稱限制酶,可切割特定的DNA位置。.

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CRISPR

CRISPR(IPA:/ˈkrɪspər/;DJ:/ˈkrispə/;KK:/ˈkrɪspɚ/)是存在于细菌中的一类基因组,该类基因组中含有曾攻击过该细菌的病毒的基因片段。细菌通过这些基因片段来侦测并抵御类似病毒的攻击,摧毁其DNA。这类基因组是细菌免疫系统的关键组成部分。通过这类基因组,人类可以准确有效地编辑有机体内的部分基因,也即CRISPR/Cas9基因编辑技术。 CRISPR/Cas系統,為目前發現存在於多數細菌与绝大多数的古菌中的一種後天免疫系統,以消滅外來的質體或者噬菌體,并在自身基因组中留下外来基因片段作为“记忆”。全名為常間回文重複序列叢集/常間回文重複序列叢集關聯蛋白系統(Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeats/CRISPR-associated proteins)。 目前已發現三種不同類型的 CRISPR/Cas系統,存在于大约40%和90%已测序的细菌和古菌中。其中第二型的組成較為簡單,以Cas9蛋白以及嚮導RNA(gRNA)為核心的組成。 Cas9是第一个被廣泛應用的CRISPR核酸酶,其次是Cpf1,其在的CRISPR/Cpf1系统中被发现。其他这样的系统被认为存在。 由於其對DNA干擾(DNAi)的特性(参见RNAi),目前被積極地應用於遺傳工程中,作為基因體剪輯工具,與鋅指核酸酶(ZFN)及類轉錄活化因子核酸酶(TALEN)同樣利用非同源性末端接合(NHEJ)的機制,於基因體中產生脱氧核醣核酸的雙股斷裂以利剪輯。二型CRISPR/Cas並經由遺傳工程的改造應用於哺乳類細胞及斑馬魚的基因體剪輯。其設計簡單以及操作容易的特性為最大的優點。未來將可應用在各種不同的模式生物當中。.

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端粒

端粒()是真核生物染色體末端的DNA重複序列,作用是保持染色體的完整性和控制細胞分裂週期。 由於DNA複製的機制,每次染色體複製後,上的染色體末端必無法被複製。因此,真核生物在染色體末端演化出端粒以作為可被重複遺棄的片段。一旦端粒消耗殆盡,細胞將會立即啟動凋亡機制。因此,端粒被推測和細胞老化有明顯的關係。人體的部分細胞,例如精原母細胞、癌症細胞等,含有端粒酶,能在DNA末端接上新的端粒片段,其端粒不會隨著分裂次數增加而縮短,因此能無限複製。.

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续命汤

续命汤,是中国古代治疗中风的药方,起源于东晋,经历代变化,现今仍有使用。.

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EcoRI

EcoRI(「I」是「1」的意思)是一種核酸酶,來自某些特定品系的大腸桿菌(E.

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適體

適體 (源自拉丁文「aptus」表示”適合”的意思,和希臘文「meros」表示”部位”的意思)是指與特定的目標分子結合的寡聚核酸或是 肽鏈。適體常常從大量的隨機序列被挑選出來,但自然的適體依舊存在如核糖开关中。適體可以用在學術研究亦可以當作大分子藥物應用在臨床診斷上。在適體的目標分子存在的情況下,適體能與核酶結合並進行自我剪切的動作,這些複合物能應用在研究、工業與臨床診斷上。 有高度專一性的適體能如下分類.

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輪狀病毒

輪狀病毒(Rotavirus,簡稱RV)是一種雙鏈核糖核酸病毒,屬于呼腸孤病毒科。它是引起嬰幼兒腹瀉的最常見原因,幾乎世界上小孩在大約五歲時都曾感染過輪狀病毒至少一次。然而,每一次感染后人体免疫力會逐漸增強,因此之後再次感染的影响就会减轻,到成人階段就很少受其影響。輪狀病毒總共有八個種,以英文字母編號為A、B、C、D、E、F、G與H。其中,A種是最為常見的一種,超過90%人類輪狀病毒感染是由該種造成。 輪狀病毒是藉由糞口途徑傳染的。它會感染與小腸壁上的並且產生腸毒素(enterotoxin),腸毒素會引起腸胃炎,導致嚴重的腹瀉,有時候甚至會因為脫水而導致死亡。雖然輪狀病毒於1973年就被由澳洲的所發現,而且造成嬰兒與幼兒總計超過50%以上因為嚴重腹瀉而住院治療的案例,但是在公共衛生社群中它仍然沒有被廣泛地重視,特別是在發展中國家更是如此。除了對人類健康的影響之外,輪狀病毒也會感染動物,是家畜的病原体之一。 輪狀病毒的治療並不複雜,但每年仍有超過450,000名五歲以下的嬰幼兒因為輪狀病毒的感染而死亡,而且每年有幾乎兩百萬以上的兒童因此患重病。在美國實施疫苗施打計畫之前,輪狀病毒每年造成270萬個兒童嚴重腸胃炎的案例,有近60,000名兒童需住院治療,並且每年平均有37個死亡案例.

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脱氧核糖核酸

--氧核醣核酸(deoxyribonucleic acid,縮寫:DNA)又稱--氧核醣核酸,是一種生物大分子,可組成遺傳指令,引導生物發育與生命機能運作。主要功能是資訊儲存,可比喻為「藍圖」或「配方」。其中包含的指令,是建構細胞內其他的化合物,如蛋白質與核醣核酸所需。帶有蛋白質編碼的DNA片段稱為基因。其他的DNA序列,有些直接以本身構造發揮作用,有些則參與調控遺傳訊息的表現。 DNA是一種長鏈聚合物,組成單位稱為核苷酸,而糖類與磷酸藉由酯鍵相連,組成其長鏈骨架。每個糖單位都與四種鹼基裡的其中一種相接,這些鹼基沿著DNA長鏈所排列而成的序列,可組成遺傳密碼,是蛋白質氨基酸序列合成的依據。讀取密碼的過程稱為轉錄,是根據DNA序列複製出一段稱為RNA的核酸分子。多數RNA帶有合成蛋白質的訊息,另有一些本身就擁有特殊功能,例如核糖體RNA、小核RNA與小干擾RNA。 在細胞內,DNA能組織成染色體結構,整組染色體則統稱為基因組。染色體在細胞分裂之前會先行複製,此過程稱為DNA複製。對真核生物,如動物、植物及真菌而言,染色體是存放於細胞核內;對於原核生物而言,如細菌,則是存放在細胞質中的拟核裡。染色體上的染色質蛋白,如組織蛋白,能夠將DNA組織並壓縮,以幫助DNA與其他蛋白質進行交互作用,進而調節基因的轉錄。.

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酶(Enzyme( ))是一类大分子生物催化劑。酶能加快化學反應的速度(即具有催化作用)。由酶催化的反應中,反應物稱爲底物,生成的物質稱爲產物。幾乎所有細胞內的代謝過程都離不開酶。酶能大大加快這些過程中各化學反應進行的速率,使代謝產生的物質和能量能滿足生物體的需求。細胞中酶的類型對可在該細胞中發生的代謝途徑的類型起決定作用。對酶進行研究的學科稱爲「酶學」(enzymology)。 目前已知酶可以催化超過5000種生化反應。大部分酶是蛋白質,有少部分酶是具有催化活性的RNA分子,这些酶被称为核酶。酶的特異性是由其獨特的三級結構決定的。 和所有的催化劑一樣,酶通過降低反應活化能加快化學反應的速率。一些酶可以將底物轉化爲產物的速率提高數百萬倍。一個比較極端的例子是。該酶可以使在無催化劑條件下需要進行數百萬年的化學反應在幾毫秒內完成。從化學原理上講,酶和其它所有催化劑一樣,反應不會使其物質量發生變化。酶亦不能改變化學平衡,這一點和其它催化劑也是一樣的。酶和其它催化劑的不同之處在於,它們的專一性要強得多。一些分子可以影響酶的活性。如酶抑制劑能降低酶的活性,酶激活劑能提高酶的活性。許多藥物及毒物是酶的抑制劑。當超出適宜的溫度和pH值後,酶的活性會顯著下降。 酶在工业和人们的日常生活中的应用也非常广泛。例如,药厂用特定的合成酶来合成抗生素;洗衣粉中添加酶能加速附着在衣物上的蛋白质、淀粉或脂肪漬的分解;嫩肉粉中加入木瓜蛋白酶能將蛋白質分解爲稍小的分子,使肉的口感更嫩滑。.

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蛋白酶K

在分子生物学中蛋白酶K(Proteinase K,,也被称为内肽酶K(endopeptidase K)、腐生真菌碱性蛋白酶(Tritirachium alkaline proteinase)、腐生真菌丝氨酸蛋白酶(Tritirachium album serine proteinase)、腐生真菌蛋白酶K(Tritirachium album proteinase K),是一种用途广泛的丝氨酸蛋白酶。这种酶于1974年在真菌 (Engyodontium album)的提取物中发现。蛋白酶K能消化天然的角蛋白(Kerati),而得名蛋白酶K。其主要的切割位点是脂肪族氨基酸和芳香族氨基酸的羧基端肽键。由于其广泛地的切割能力,在实验室中很常用。此蛋白酶属于丝氨酸蛋白酶SB超家族中的S8家族(枯草杆菌蛋白酶也属于这个超家族)。蛋白酶K的分子量为28.9千道尔顿。.

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RNA剪接

剪接(splicing,又稱拼接),是一种基因重组現象,在分子生物學中,主要是指細胞核內基因資訊在轉錄過程中或是在轉錄過後的一种修飾,即將內含子移除及合併外顯子——內含子與外顯子的名稱是通用於編碼基因的DNA及其轉錄後的RNA——是真核生物的前mRNA變成mRNA的過程之一。剪接過程是剪接體內核糖核酸(RNA)核苷酸之間的一連串生化反應,並由剪接體內小核核糖蛋白(snRNP)中的snRNA負責催化並作用。此外,也有一些類型不需外在催化物質,而是在特定二價金屬離子存在的情況下,以RNA自我催化的方式進行剪接,如第一型或第二型內含子 (group-I or group-II intron)或核酸酶(ribozyme)。這也是真核生物與原核生物的区别之一(请参看顺反子)。成熟的mRNA會接著進行蛋白質生物合成中的翻譯,以產生蛋白質,稱轉譯作用。.

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TBE緩衝液

TBE或Tris/Borate/EDTA,是一種緩衝液,含有三羥甲基氨基甲烷(Tris)、硼酸,和EDTA。 在分子生物學上,TBE和經常用於溶解核酸,最常見於電泳實驗。由於Tris類的緩衝液皆呈弱鹼性,因此可將DNA脫除氫離子而有帶電性,更容易溶於水中。EDTA則是一種雙價陽離子螯合劑,特別是對鎂離子(Mg2+)。由於核酸酶需要這些離子,EDTA可以將這些離子牢牢抓住,避免核酸降解。但要注意的是,鎂離子同時是很多酵素的輔助因子,如限制酶、DNA聚合酶等等,因此EDTA的濃度一般不會太高(通常在1mM左右)。 近期研究顯示,TBE和TAE在電泳中是可以互相置換的。.

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TE缓冲液

TE缓冲液(TE buffer)是分子生物学中常用的缓冲溶液,尤其是涉及到DNA、cDNA或RNA的步骤中。“TE”这个单词得名于其组分:Tris(常用的 pH缓冲液)及EDTA(用于螯合如Mg2+等阳离子的分子)。使用TE溶液的目的是:在溶解DNA或RNA的同时保护其不被降解。.

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核糖體核糖核酸

核糖體RNA(ribosomal RNA, rRNA)是生物细胞中主要的核糖核酸之一,是一种具有催化能力的核糖酶,但其单独存在时不能如其他核糖核酸那樣发挥作用,仅在与多种核糖体蛋白质共同构成核糖體(一种无膜细胞器)后才能执行其功能。23S和28S rRNA在翻译过程中作为肽酰转移酶催化多肽(包括蛋白质)中氨基酸之间肽键的形成。rRNA是单链RNA,但通过折叠形成了广泛的双链区域。.

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核糖核酸外切酶

核糖核酸外切酶(Exoribonucleases)是核糖核酸(RNA)的外切酶,是一種能降解RNA,並在5'端或3'端的核苷酸移除的酶。能移除5'端核苷酸的這種酶稱作「5'-3'核糖核酸外切酶」,而能移除3'端的則稱作「3'-5'核糖核酸外切酶」。 此類酶有兩種機理,分別是以水(水解活性)或以無機磷酸鹽(磷酸解活性)去破壞RNA上的核苷酸-核苷酸鍵。水解核糖核酸外切酶分類在EC3.1中,因以水去降解RNA,因此生成單磷酸核苷;而以無機磷酸鹽降解的則因有外在磷酸鹽加在生成分子上,因此形成二磷酸核苷。 核糖核酸外切酶存在於所有生命的界別中,包括細菌、古菌及所有真核生物。能對不同類別的RNA種類作用,包括信使RNA、tRNA、核糖體RNA及微RNA。核糖核酸外切酶可簡單如單個蛋白質分子的(如核糖核酸酶D和核糖核酸酶PH),亦可以複雜至包含多個蛋白質分子的外切體複合物(當中包括核糖核酸外切酶的四個家族)。.

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核糖核酸酶

核糖核酸酶(ribonuclease,常用縮寫:RNase)或稱RNA酶,是一種可將RNA水解成小分子組成的核酸酶(nuclease)。可粗分為核糖核酸內切酶(endoribonuclease)與核糖核酸外切酶(exoribonuclease),這些酶分別歸屬於EC 2.7(磷酸化酶)與EC 3.1(水解酶)中的多個次分類。.

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核酶

核酶(ribozyme,又譯核糖酶),又称核酸类酶、酶RNA、类酶RNA,是具有催化特定生物化学反应的功能的RNA分子,类似于蛋白质中的酶。.

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水解酶

水解酶【拼音:shuǐ-jiě méi;英文:Hydrolase】是一種催化化學鍵的水解的酶。舉例來說,一種酶催化以下的化學反應就是水解酶:.

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消化作用

消化作用是指將食物(大分子)分解成足夠小的水溶性分子(小分子),可以溶解在血漿,讓身體能夠吸收利用的過程。有些生物體會透過小腸吸收小分子,帶到血液系統中。消化作用是生物异化作用(分解代謝)的一環,可以分為兩個階段,首先藉由機械性的作用(機械消化,mechanical digestion)將食物碎裂成小裂片,其次是化學性的作用(化學消化,chemical digestion),經由酵素的催化,將大分子水解成小分子單體。而無法消化的殘渣則會再排出體外。 大多數食物中所含的有機物包括蛋白質、脂肪和碳水化合物。由於這些大分子聚合物無法穿過細胞膜進入細胞內,而且動物需要用單體來合成自身身體所需的聚合物,因此動物需要藉由消化作用將食物中的大分子分解成單體。例如將蛋白質分解為胺基酸,多醣及雙醣分解為單醣,脂肪分解為甘油及脂肪酸等。.

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