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核酸序列

指数 核酸序列

核酸序列(Nucleic acid sequence,亦称为核酸的一级结构)使用一串字母表示的真实的或者假设的携带基因信息的DNA分子的一级结构。每个字母代表一种核鹼基,两个碱基形成一个碱基对,碱基对的配对规律是固定的,A-T,C-G。三个相邻的碱基对形成一个密码子。一种密码子对应一种氨基酸,不同的氨基酸合成不同的蛋白质。在DNA的复制及蛋白质的合成过程中,碱基配对规律是十分关键的。 可能的字母只有A, C, G和T,分别代表组成DNA的四种核苷酸-腺嘌呤,胞嘧啶,鸟嘌呤,胸腺嘧啶。典型的他们无间隔的排列在一起,例如序列AAAGTCTGAC。任意长度大于4的一串核苷酸被称作一个序列。 关于它的生物功能,则依赖于上下文的序列,一个序列可能被正读,反读;包含编码 或者无编码。DNA序列也可能包含非編碼DNA。 核酸也具有二级结构和 。 一级结构有时被错误地称为一级序列。 相反,没有并行的二级或三级序列概念。.

28 关系: 基因序列异裂酶化学工程分子人类学哮喘Bursaphelenchus石之海环形细菌染色体猩猩人瓦片阵列生物聚合物DNA序列DNA微陣列DNA聚合酶遗传信息识别序列腹足綱的譜系學分類蛔形下目蛋白質一級結構FASTA格式FASTQ格式RNA溫度計核糖核酸编辑核酸演化網路最大簡約法日本DNA数据库28S rRNA

基因序列

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异裂酶

异裂酶(Neoschizomers)是指识别相同的核酸序列,但酶切位点不同的限制酶,在一些特殊的实验中有很大的应用价值。 例如: 限制酶 MaeII 的酶切位点为 A^CGT 限制酶 TaiI 的酶切位点为 ACGT^ 限制酶 ApaI 的酶切位点为 GGGCC^C 限制酶 Bsp120I 的酶切位点为 G^GGCCC 以及其它一些例子。 识别相同序列,酶切位点也相同的限制酶称为同裂酶。.

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化学工程

化學工程,簡稱化工,是研究以化學工業為代表以及其他過程工業(例如石油煉制、冶金、食品及印染工業等)生產過程中有關化學過程與物理過程的一般原理和規律,並且應用這些規律來解決過程及裝置的開發、設計、操作及改善問題的工程技術學科。它主要研究大規模改變物料中的化學組成及其機械和物理性質。簡單地定義化學工程的本質,它是以數學及少量的物理觀念為基礎應用於化學工業上,來替生產各式化學品或是物料的工廠提供一個最節省成本的反應流程設計方式。實驗研究、理論分析和科學計算已經成為當代化工研究中不可或缺的三種主要手段。.

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分子人类学

分子人类学(英语:Molecular Anthropology)是人类学的分支,是在人类基因组等研究基础上发展形成的一门新兴交叉学科,利用分子水平的遗传信息来分析人类起源、当代和古代人类群体的演化以及古代社会文化结构等多方面多层次的问题。主要方法是比较DNA序列或蛋白质序列,但是早期方法亦包括血清学的比较研究。 通过考察在不同人群中的DNA序列,科学家可以判断的有关种群之间(或群体内部)的亲密关系。基因构成一定的相似性,能让分子人类学家确定不同的人群是否属于同一个单倍群(haplogroup),进而确定是否他们都有一个共同的地理发源地。这是意义重大的,因为它允许人类学家追踪迁移的和定居的模式,这提供了帮助洞察到现代人群是如何形成的并且将是如何继续向未来发展的。.

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哮喘

--(英語:asthma,又稱--)是常见的气道慢性炎症疾病,主要特征是多变和复发的症状、可逆性气流阻塞,和。常见症状表现为喘息 、咳嗽、胸腔紧迫、胸闷和呼吸困难。 普遍認為哮喘是因為基因和共同导致的。環境因素通常包含:暴露於空氣汙染和过敏原(allergen) 。 其他可能的誘發因子包含阿司匹林和β受體阻斷藥之類的藥物。 对哮喘的诊断通常基于症状的类型、不同时间下对治疗的反应,及。医学上对哮喘的分类依据是发病频率、一秒内用力呼吸量()和呼气流量峰值來分類。哮喘也可以分为(外来的)或非特应性(固有的),此处特应性指的是向类别1型超敏性反应发展的倾向。。 當前氣喘無法根治,但可以有效控制。遠離氣喘誘發因子,例如:過敏原和刺激物,並且規律的吸入皮質類固醇(corticosteroids)對於控制病情十分有幫助。急性症状的治疗通常是通过短效β2激动药(例如沙丁胺醇,英文名稱:salbutamol)和口服皮质类固醇。在极其严重的病例中,才可能需要静脉注射糖皮质激素、硫酸镁和住院治疗。症状可以通过避免触发物来阻止,如过敏原和刺激物,和吸入皮质激素的使用以及引用吸入皮质激素。 在哮喘症状得不到控制的情况下,也可以使用(LABA)或作为对吸入皮质激素的补充。自20世纪70年代以后,哮喘病已经广泛的流行。到2011年,全球有2.35亿至3亿人受到影响,大约25万人因此失去生命。.

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Bursaphelenchus

Bursaphelenchus是線蟲的一個屬。本屬物種的食性基本上都,但有兩個物種以木為食,分別為Bursaphelenchus cocophilus和Bursaphelenchus xylophilus,分別是椰樹和松樹的重要寄生蟲。本屬物種的分類,除非有受過訓練的輔以顯微鏡或DNA排序 分析,否則要辨別並不容易。因此部分國家會將本屬所有物種均列入要隔離的類別。然而如果情況並非如此,這些線蟲其實很適合作為線蟲的發育生物學、生態學和遺傳學的模式生物。 ,本屬物種估計有約70 到 90個。新的分類單元仍然時常出現。.

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石之海

JoJo的奇妙冒險 第六部 石之海(ジョジョの奇妙な冒険 Part6 ストーンオーシャン)為日本漫畫家荒木飛呂彥所著的日本漫畫《JoJo的奇妙冒險》的第六部,自2000年起至2003年止在《週刊少年Jump》連載,收錄於單行本64集至80集之中。這是《JoJo的奇妙冒險》系列中首次、也是目前唯一以女性做為主角的作品。.

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环形细菌染色体

环形细菌染色体是指呈环形DNA分子的细菌染色体。和大多数真核生物的线性DNA不同,典型的细菌染色体是环形的。 大多数细菌的染色体组由环形的DNA分子构成,这种DNA是没有自由端的。自由端将会给DNA的复制及其稳定性带来巨大困难。含有带DNA端或端粒(大多数真核生物)的染色体的细胞,进化演变出了复杂的机制来克服这些困难。 然而,环形的染色体也给细胞带来了其他的挑战。复制后,两个子代环形染色体有时可能会依然相互连接着或纠缠在一起,必须解决这些问题才能使得在细胞分裂时两个子代细胞均能获得完整的染色体副本。.

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猩猩人

猩猩人是指人類與黑猩猩雜交的假設後代名稱。由於人類與猩猩的遺傳結構相當近似(當中DNA序列有95%相似,而DNA編碼更高達99%相似度),一些科學家猜測兩者交配或可生出後代。.

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瓦片阵列

片阵列(Tiling array,亦称为覆瓦阵列)是微阵列芯片中的一种子类型。类似于传统微阵列,瓦片阵列通过将标记的DNA或RNA靶分子杂交到固定在固体表面上的探针而发挥作用。 瓦片阵列与传统微阵列之间的不同之处在于探针的性质:瓦片阵列的探针并不是对散列在整个基因组中的已知或预测基因的序列进行探测,而是对连续区域内存在的已知序列进行密集地探测。这有助于表征已测序但功能却知之甚少的区域。瓦片阵列可用于:辅助转录物组作图、发现DNA/蛋白质相互作用(ChIP-chip和DamID)位点、DNA甲基化(MeDIP-chip)位点、DNA酶敏感(DNase Chip)位点及阵列比较基因组杂交。瓦片阵列除了可以检测之前未鉴定的基因及调控序列,还可能对转录产物进行深度定量。被称为“特征”的瓦片阵列单位中,特异性探针的拷贝数可上数百位(而在传统阵列中仅有少数几个),而密布在每张阵列上的特征数则在10,000到大于6,000,000个之多。可以通过调节探针与探针之间重叠的序列多少、探针序列间已知碱基的数量或探针长度而达到改变作图分辨率的目的。对于如拟南芥这样较小的基因组,瓦片阵列甚至可对全基因组进行探测。瓦片阵列是全基因组关联分析中应用的有力方法。.

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生物聚合物

生物聚合物(Biopolymer,又称为生物聚合体、生物多聚体或生物高分子)是由活的生物体产生的聚合物。因为他们是聚合物,生物聚合物包含有单体单元,相互之间以共价键相连以形成更大的结构。根据所使用的单体以及形成的生物聚合物的不同,主要有三大类主要的生物聚合物:多核苷酸是由13个或更多核苷酸单体所组成的长聚合物,多肽是氨基酸的短聚合物,而多糖通常是糖类线性链接而成的结构 。生物聚合物的其它实例包括橡胶,木栓质,黑色素和木质素。 纤维素是地球上最常见的有机化合物和生物聚合物。大约33%的所有植物物质是纤维素。棉花的纤维素含量为90%,而木材的是50%。.

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DNA序列

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DNA微陣列

DNA微陣列(DNA microarray)又稱DNA陣列或DNA晶片,比較常用的名字是基因晶片(gene chip)。是一塊帶有DNA微阵列(microarray)的特殊玻璃片或矽晶元片,在數平方公分之面積上佈放數千或數萬個核酸探針;檢體中的DNA、cDNA、RNA等與探針結合後,藉由--或電流等方式偵測。經由一次測驗,即可提供大量基因序列相關資訊。它是基因组学和遗传学研究的工具。研究人員應用基因芯片就可以在同一時間定量的分析大量(成千上万个)的基因表現,具有快速、精確、低成本之生物分析檢驗能力。.

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DNA聚合酶

DNA聚合酶(DNA Polymerase,EC編號2.7.7.7)是一種參與DNA複製的酶。它主要是以模板的形式,催化去氧核糖核苷酸的聚合。聚合後的分子將會組成模板鏈並再進一步參與配對。 DNA聚合酶以去氧核苷酸三磷酸(dATP、dCTP、dGTP、或dTTP,四者統稱dNTPs)為底物,沿模板的3'→5'方向,將對應的去氧核苷酸連接到新生DNA鏈的3'端,使新生鏈沿5'→3'方向延長。新鏈與原有的模板鏈序列互補,亦與模板鏈的原配對鏈序列一致。 已知的所有DNA聚合酶均以5'→3'方向合成DNA,且均不能「重新」(de novo)合成DNA,而只能將去氧核苷酸加到已有的RNA或DNA的3'端羥基上。因此,DNA聚合酶除了需要模板做為序列指導,也必需-zh-hans:引物; zh-hant:引子;-來起始合成。合成引物的酶叫做引發酶。 反應式:.

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遗传信息

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识别序列

识别序列(recognition sequence),有时也被称为识别位点(recognition site)of any DNA-binding protein motif that exhibits binding specificity, refers to the 核酸序列 (or subset thereof), to which the domain is specific.

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腹足綱的譜系學分類

本頁面旨在呈現腹足綱的系统发生学分類的一個可能性。利用樹狀結構,本頁面詳列出腹足綱之下各個物種的關係。頁面盡可能採納最新的分析證據,並把證據詳列於本文底部。不過,科學界對於部分分類的意見未必一致。 腹足纲是软体动物门中重要的组成部分,是软体动物门中最大的纲,约60,000到80,000生存种。包括约409个现生的科,另外还有约202个化石科。.

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蛔形下目

蛔形下目(學名:Ascaridomorpha),即傳統分類中的 蛔目(學名:Ascaridida)或蛔蟲目, 原是胞管腎綱旋尾亞綱之下的一個目, 現時被降為小桿目旋尾亞目之下的一個下目級分類單元。然而,目前大多數分類依然使用「蛔目」這個名稱。 蛔形下目包括有多個寄生性圓蟲的科。這些蠕蟲包括有多個對人及家畜的重要寄生蟲,蛔蟲、海獸胃線蟲及犬弓首蛔蟲等都是本目的成員。這些物種的前端都有三片「唇片」。.

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蛋白質一級結構

蛋白质一级结构(Protein primary structure)是肽或蛋白质中氨基酸的线性序列。按照惯例,蛋白质的一级结构被报道从氨基末端(N)端到羧基末端(C)端。蛋白质生物合成最通常由细胞中的核糖体进行。肽也可以在实验室中合成。蛋白质一级结构可以被直接测序,或从DNA序列推断。 在生物化學裡,生物分子的一級結構是其分子組成和分子間化學鍵結的精確模樣。對於一典型的無分支、無交叉的生物聚合物(如DNA、RNA或典型的細胞內蛋白質等分子),其第一結構等同於描述其單體單位的序列,即如DNA序列和肽序列。「一級結構」這一名詞在Linderstrom-Lang於1951年的Lane Medical Lectures上首次被提到。一級結構和一級序列有一點相似,即使在二級或三級結構中並沒有平行的概念。.

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FASTA格式

在生物信息学中,FASTA格式是一种用于记录核酸序列或肽序列的文本格式,其中的核酸或氨基酸均以单个字母编码呈现。该格式同时还允许在序列之前定义名称和编写注释。这一格式最初由软件包定义,但现今已是生物信息学领域的一项标准。 FASTA简明的格式降低了序列操纵和分析的难度,令序列可被文本处理工具和诸如Python、Ruby和Perl等脚本语言处理。.

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FASTQ格式

FASTQ格式是一种保存生物序列(通常为核酸序列)及其测序质量得分信息的文本格式。序列与质量得分皆由单个ASCII字符表示。 该格式最初由开发,旨在将FASTA格式序列及其质量数据整合在一起。而目前,FASTQ格式已经成为了保存高通量测序结果的事实标准。.

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RNA溫度計

RNA溫度計(RNA thermometer),亦稱RNA溫度傳感器(RNA thermosensor)是一類對溫度敏感的非編碼RNA,能隨溫度變化調控基因表达。RNA溫度計主要調控與熱休克和冷休克反應有關的基因,但與致病性、飢餓狀態等過程相關的基因調控也有關係。 RNA溫度計一般通過二級結構的改變對溫度變化做出反應。結構的改變會使RNA上等重要區域暴露或遮蔽,進而改變對應編碼基因的轉譯速率。 RNA溫度計與核糖開關一樣,都是支持RNA世界假說的有力證據。RNA世界假說認爲RNA為早期生命的唯一組成成分,但隨生物進化,RNA攜帶遺傳信息的功能由DNA取代,RNA的生物催化活性由蛋白質取代,形成了今日的DNA-RNA-蛋白質系統。 RNA溫度計的實例有、、以及。.

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核糖核酸编辑

核糖核酸编辑(RNA editing),缩写为RNA编辑,是指一种在核糖核酸(RNA)由聚合酶生成之后其转录自脱氧核糖核酸(DNA)的核酸序列又发生改变的分子生物学过程。和其它转录后修饰方式(如RNA剪接、5'-加帽、3'-加尾)相比,RNA编辑现象相对较为罕见。RNA编辑通常包括碱基的插入、丢失和替换。 RNA编辑已在一些古菌、原核、真核及其病毒的tRNA、rRNA、mRNA或miRNA分子中发现。RNA编辑会出现在细胞核与细胞质乃至线粒体和色素體中。在脊椎动物中,编辑现象较为罕见,受影响的分子只有少数碱基发生变化。在其它生物体中,有可能产生丰富的RNA编辑,在某些情况下,mRNA序列中的大多数核苷酸都可能经过编辑。.

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核酸

核酸(nucleic acids)是一种通常位于细胞核内的大型生物分子,負責生物体遗传信息的携带和传递。核酸有兩大類,分別是脱氧核糖核酸(DNA)和核糖核酸(RNA)。 核酸的单体结构为核苷酸。每一个核苷酸分子由三部分组成:一个五碳糖、一个含氮碱基、和一个磷酸基。如果其五碳糖是脱氧核糖則為脱氧核糖核苷酸,此單體之聚合物是DNA。如果其五碳糖是核糖則為核糖核苷酸,此單體之聚合物是RNA。核苷酸也被称为核苷酸磷酸盐。 核酸是最重要的生物大分子(其余为氨基酸/蛋白质,糖/碳水化合物,脂质和/脂肪)。它们大量存在于所有活的东西,功能有编码,传递和表达遗传信息 - 换句话说,信息通过核酸序列被传递。DNA分子含有生物物种的所有遗传信息,为双链分子,其中大多数是链状结构大分子,也有少部分呈环状结构,分子量一般都很大。RNA主要是负责DNA遗传信息的翻译和表达,为单链分子,分子量要比DNA小得多。 核酸存在于所有动植物细胞、微生物和病毒、噬菌体内,是生命的最基本物质之一,对生物的生长、遗传、变异等现象起着重要的决定作用。 核酸是在1869年被科学家弗雷德里希·米歇尔发现。核酸实验研究构成了现代生物学和医学研究的重要组成部分,形成了基因组和法医学,以及生物技术和制药行业的基础。.

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演化網路

演化網路(Phylogenetic network)是以圖來表示生物的核酸序列、基因、染色體、基因組、和物種D.

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最大簡約法

最大簡約法(Maximum parsimony)是一種常使用於系統發生學計算的方式,可用來根據分子序列的變異程度,來分析生物之間的演化關係,進而建構出演化樹。 「簡約」一般有「經濟的」或「儉省的」之義,但在生物學中,「簡約法」是屬於無母數統計的一種統計方法以估計親緣關係。以最大簡約法建構的親緣關係樹是以演化過程具有最少次變化為前提,表示現存資料在過去的演化過程應由最少次步驟所形成。這項概念由Walter M. Fitch在1971年所提出。.

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日本DNA数据库

日本DNA数据库(日本DNAデータバンク、DNA Data Bank of Japan,缩写:DDBJ)是日本国立遗传学研究所(静冈县三岛市)建造的DNA核酸序列的序列数据库。它也是(INSDC)的成员。 它每天与欧洲生物信息研究所(EMBL-EBI)的欧洲分子生物学实验室,和美国国家生物技术信息中心(NCBI)的GenBank交换数据。因此,这三大国际数据库在任何给定时间包含相同的数据。 DDBJ于1986年在国立遗传学研究所开始了数据库的运作,并且仍然是亚洲唯一的核苷酸序列数据库。尽管DDBJ主要是从日本研究者那里收到数据,但它可以接受来自任何其他国家的贡献者的数据。DDBJ主要是由日本文部科學省(MEXT)资助。DDBJ有一个国际咨询委员会,由9名成员组成,其中来自欧洲,美国和日本每个成员国家各自有3个成员。该委员会每年一次向DDBJ提供有关其维护,管理和未来计划的建议。除此之外,DDBJ还有一个国际合作委员会,就与国际合作相关的各种技术问题提供咨询,并由工作层面参与者所组成。.

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28S rRNA

28S rRNA(rRNA意爲核糖體RNA(ribosomal RNA))是組成真核生物核糖體大亞基的核糖體RNA,是所有真核細胞都會含有的化學組分之一。28S rRNA和原核生物的23S rRNA具有同源性。 編碼28S rRNA的基因稱爲28S rDNA。28S rDNA的基因序列常用於構建系統發生圖的分子分析。.

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核酸的一级结构

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