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斑馬魚

指数 斑馬魚

斑馬魚,是一种热带淡水鱼,又名藍條魚、花條魚、藍斑馬魚、印度魚、印度斑馬魚,為輻鰭魚綱鯉形目鯉科的其中一種。其原生于喜马拉雅地区,是一种受欢迎的观赏性鱼类。同时,其在科研领域也是一种重要的而且被广泛使用的有脊椎模式生物,尤其是在生物体再生能力的研究方面,并且有多种基因编辑后的转基因人工培育种。斑马鱼(Danio rerio)在被重新被划归为鿕屬 (Danio)之前,曾被归类为短鿕属(Brachydanio),因而在科研文献中被长期称为Brachydanio rerio,而非如今的Danio rerio。.

23 关系: 双头动物发育生物学人类基因组计划嗎啉基再生国家斑马鱼资源中心CRISPR维康桑格研究所绿色荧光蛋白细胞迁移热带鱼Danio rerio音猬因子螢光魚鍾邦柱魚鬚鲤科色素細胞GenBankP2X受体模式生物沙利度胺淡水鱼

双头动物

双头动物,顾名思义,就是拥有两个头的动物。是一个近年来并不少见的现象,箇中有不少是經加工過的照片所虛構的情況,但亦有部份是真實存在的個案。多发生于爬行类动物和两栖类动物中。在哺乳类动物中也有过双头现象的发生。现在,有的科学家也在尝试用人工方法培养出两个头甚至更多个头的动物。.

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发育生物学

育生物學(英语:Developmental biology)是對於生物體生長和發育過程的研究。發育生物學研究基因對細胞生長,分化和形態發生(Morphogenesis)的調控,這些過程使生物體形成組織和器官。胚胎學(Embryology)有時被比較明確地規範到生物體單一細胞階段,到獨立個體之間的研究。直到20世紀,胚胎學是一個比較偏重述敘的科學。時至今日,胚胎學或發育生物學處理討論一個生物體,如何形成個體正確及完整形態的各個步驟。进入21世纪70年代以后,发育生物学的研究主要着重于分子和细胞生物学水平上的胚胎学。 演化發育生物學的相關領域主要在1990年代形成,這是由分子發育生物學和演化生物學而來,研究不同物種間發育過程的差異性。經常被使用在發育生物學上的動物模式,有線蟲 (Caenorhabditis elegans)、黑腹果蠅(Drosophila melanogaster)、斑馬魚(Danio rerio)、小鼠(Mus musculus)和擬南芥(Arabidopsis thaliana,或稱阿拉伯芥)。發育生物學的研究結果,可幫助瞭解染色體異常引起的發育不全,例如唐氏症。.

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人类基因组计划

人类基因组计划(Human Genome Project, HGP)是一项规模宏大,跨国跨学科的科学探索巨型工程。其宗旨在于测定组成人类染色体(指单倍体)中所包含的六十亿对组成的核苷酸序列,从而繪製人类基因组圖譜,並且辨識其载有的基因及其序列,达到破译人类遗传信息的最终目的。基因组计划是人类为了探索自身的奥秘所迈出的重要一步。截止到2005年,人类基因组计划的测序工作已经基本完成(92%)。其中,2001年人类基因组工作草图的发表(由公共基金资助的国际人类基因组计划和私人企业塞雷拉基因組公司各自独立完成,并分别公开发表)被认为是人类基因组计划成功的里程。大多数政府资助的测序是在美国,英国,日本,法国,德国和中国的20所大学和研究中心进行。.

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嗎啉基

嗎啉基又稱嗎啉(英語:Morpholino),是一種用來修飾基因表現的分子,嗎啉基寡核苷酸是一種反義技術,可用來阻礙其他分子與特定核酸序列的結合。可阻擋RNA上約25個鹼基的區域。此分子可應用在一些模式生物的研究上,包括小鼠、斑馬魚、非洲爪蟾等。 除了組合成寡核苷酸之外,嗎啉基也可能出現在其他分子中。但「Morpholino」指其寡核苷酸形式,也就是磷醯二胺嗎啉代寡核苷酸(phosphorodiamidate morpholino oligomers,PMO)。吗啉基是对天然核苷酸结构重新设计获得的合成分子。长度多为25个碱基,以标准核苷酸碱基配对的方式与RNA互补结合。在结构上来看,吗啉基与DNA的区别在于尽管前者有标准的核苷酸碱基,这些碱基却连接在吗啉环上,而非脱氧核糖环。吗啉通过占据体内mRNA与其它分子作用位点来发生作用。.

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再生

在生物学中,再生是指由基因组、细胞、微生物和生态系统对在自然环境下所造成的自身损伤的一种重建、恢复和发育的过程。从细菌到人类,任何物种都有再生能力。再生可以是完全性再生,即损伤后由周围同种细胞来修复,或者是不完全性再生,即损伤后坏死组织由纤维结缔组织来修复。在再生开始阶段,再生是由DNA合成的分子过程介导的。生物学中的再生主要是指多细胞生物通过修复及保持他们的生理和形态的完整性的一种性狀。再生从根本上说是由基因调节的无性细胞过程。再生不同于繁殖。举例来说,水螅通过出芽生殖的方式进行再生而不是繁殖。 水蛭与涡虫长期作为具有极强适应性的再生能力的模型生物。一旦受伤,他们的细胞就被激活,并开始修复组织及器官回到初始状态。两栖动物中的其中一目有尾目(如蝾螈),很可能是脊椎动物中再生能力最强的生物,其四肢、尾、爪、眼睛和各种内部结构都有很强的再生能力。器官的再生是多细胞动物中一种常见和广泛的适应能力。在相关条件下,一些动物可以通过断裂、出芽或分裂的方式进行无性生殖。比如涡虫,首先通过中间部份的收缩、分割分裂成两半,并且每一半形成一个新的个体,成为原始的克隆。棘皮动物(如海星)、小龙虾,以及许多爬行动物和两栖动物有着很强的再生能力。一个很典型的例子就是自割,当动物察觉到危机时,会主动分离肢体或尾巴,以避免被捕获。肢体或尾巴自断后,断处细胞开始进行修复,组织将重新生成。生态系统也同样可以再生。如在森林火灾或者病虫害爆发之时,一些先鋒物種会占据并争夺生存空间,从而开拓他们新的栖息地。在生态学中,这种新的生长方式被称作再生。.

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国家斑马鱼资源中心

国家斑马鱼资源中心(英语:China Zebrafish Resource Center)位于武汉市武昌区东湖南路7号,是在中华人民共和国科技部和中国科学院支持下建立的非营利性科研服务性机构。.

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CRISPR

CRISPR(IPA:/ˈkrɪspər/;DJ:/ˈkrispə/;KK:/ˈkrɪspɚ/)是存在于细菌中的一类基因组,该类基因组中含有曾攻击过该细菌的病毒的基因片段。细菌通过这些基因片段来侦测并抵御类似病毒的攻击,摧毁其DNA。这类基因组是细菌免疫系统的关键组成部分。通过这类基因组,人类可以准确有效地编辑有机体内的部分基因,也即CRISPR/Cas9基因编辑技术。 CRISPR/Cas系統,為目前發現存在於多數細菌与绝大多数的古菌中的一種後天免疫系統,以消滅外來的質體或者噬菌體,并在自身基因组中留下外来基因片段作为“记忆”。全名為常間回文重複序列叢集/常間回文重複序列叢集關聯蛋白系統(Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeats/CRISPR-associated proteins)。 目前已發現三種不同類型的 CRISPR/Cas系統,存在于大约40%和90%已测序的细菌和古菌中。其中第二型的組成較為簡單,以Cas9蛋白以及嚮導RNA(gRNA)為核心的組成。 Cas9是第一个被廣泛應用的CRISPR核酸酶,其次是Cpf1,其在的CRISPR/Cpf1系统中被发现。其他这样的系统被认为存在。 由於其對DNA干擾(DNAi)的特性(参见RNAi),目前被積極地應用於遺傳工程中,作為基因體剪輯工具,與鋅指核酸酶(ZFN)及類轉錄活化因子核酸酶(TALEN)同樣利用非同源性末端接合(NHEJ)的機制,於基因體中產生脱氧核醣核酸的雙股斷裂以利剪輯。二型CRISPR/Cas並經由遺傳工程的改造應用於哺乳類細胞及斑馬魚的基因體剪輯。其設計簡單以及操作容易的特性為最大的優點。未來將可應用在各種不同的模式生物當中。.

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维康桑格研究所

维康桑格研究所(Wellcome Sanger Institute),以前称为桑格中心和威康信托基金桑格研究所,是一家非盈利的英国基因组学和遗传学研究机构,主要由惠康基金会资助。 它位于剑桥郊外Hinxton村的Wellcome Genome校园内。它与欧洲生物信息研究所共享此位置。它成立于1992年,以双重诺贝尔奖获得者弗雷德里克·桑格(Frederick Sanger)命名。它被认为是参与人类基因组计划的大规模DNA测序中心,并且继续对人类基因组的金标准序列做出最大贡献。该研究所自成立以来就建立并保持了数据共享政策,并开展了大量合作研究。 自2000年以来,研究所扩大了其使命,以理解“遗传在健康和疾病中的作用”。该研究所现雇用约900人并从事四个主要研究领域:人类遗传学,病原体遗传学,小鼠和斑马鱼遗传学和生物信息学。.

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绿色荧光蛋白

綠色螢光蛋白(Green fluorescent protein,簡稱GFP),是一个由约238个氨基酸组成的蛋白質,從藍光到紫外线都能使其激發,發出綠色螢光。虽然许多其他海洋生物也有类似的绿色荧光蛋白,但傳統上,绿色荧光蛋白(GFP)指首先从維多利亞多管發光水母中分离的蛋白质。這種蛋白質最早是由下村脩等人在1962年在維多利亞多管發光水母中發現。這個發光的過程中還需要冷光蛋白質水母素的幫助,且這個冷光蛋白質與鈣離子(Ca2+)可產生交互作用。 在維多利亞多管發光水母中發現的野生型綠色螢光蛋白,395nm和475nm分別是最大和次大的激发波长,它的发射波長的峰點是在509nm,在可見光譜中處於綠光偏藍的位置。绿色荧光蛋白的荧光(QY)为0.79。而從(sea pansy)所得的綠色螢光蛋白,僅在498nm有一個較高的激發峰點。 在細胞生物學與分子生物學中,綠色螢光蛋白(GFP)基因常用做報導基因(reporter gene)。,綠色螢光蛋白基因也可以轉殖到脊椎動物(例如:兔子)上進行表現,並拿來映證某種假設的實驗方法。通過基因工程,綠色螢光蛋白(GFP)基因能穩轉進不同物種的基因組,在後代中持續表達。現在,綠色螢光蛋白(GFP)基因已被导入并表达在许多物種,包括细菌,酵母和其他真菌,鱼(例如斑马鱼),植物,苍蝇,甚至人等的哺乳动物细胞。 2008年10月8日,日本科学家下村脩、美国科学家马丁·查尔菲和钱永健因为发现和改造绿色荧光蛋白而获得了当年的诺贝尔化学奖。.

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细胞迁移

细胞迁移,与细胞移动同义,与细胞运动義近,指的是细胞在接收到迁移信号或感受到某些物质的浓度梯度后而产生的移动。移動过程中,细胞不断重复着向前方伸出突觸/偽足,然后牵拉後方胞体的循环过程。细胞骨架和其结合蛋白,還有細胞間質是这個过程的物质基础,另外还有多种物质會对之进行精密调节。 若以移動方式與型態來比較,细胞迁移是通过胞体形变进行的定向移动,这有别于其他;如细胞靠鞭毛与纤毛的运动、或是细胞随血流而发生的位置变化,而且就移動速度來看,相比起后两者,细胞迁移要慢得多。舉例而言:成纤维细胞的移动速度为1微米每分,若以精子的平均游動速度56.44微米/每秒,即3384微米/每分來比較,兩者差距約3000倍以上。角膜细胞即使比成纤维细胞快上十倍,但是要完成从不来梅到汉堡这93公--的路程仍需要17123年。而且细胞用力甚轻。成纤维细胞胞体收缩的力只有2×10−7牛顿,而角膜细胞的则是2×10−8牛顿(一牛顿约为人用手举起一鸡蛋所用的力道)。 但此等「步缓力微」的細胞遷移,却是细胞觅食、傷口痊癒、胚胎發生、免疫反應、感染和癌症转移等等生理现象所涉及到的。因此细胞迁移是目前细胞生物学研究的一个主要課題,科学家們试图通过对细胞迁移的研究,在阻止癌症转移、異體植皮等医学应用方面取得更大成果。也因為細胞遷移獨有的运动特性,成為今生物学熱門研究方向。.

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热带鱼

熱帶魚是20世紀發展出來的觀賞魚分類,一般是產自南美洲、非洲和東南亞等熱帶或亞熱帶的小型、色彩斑斕的魚,由於需要較高和較穩定的水溫,飼養時一般需要調溫設施。相對於冷水性魚種如金魚、錦鯉,熱帶魚經人類豢養觀賞之歷史較短,也經常發現新品種進入觀賞魚市場。.

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Danio rerio

#重定向 斑馬魚.

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音猬因子

音蝟因子(英语:Sonic hedgehog,简称SHH)是5種刺蝟因子(英语:Hedgehog,简称HH,其他四种是,DHH、,IHH、Echidna Hedgehog,EHH和Tiggywinkle Hedgehog,TwHH)中的一種。 刺蝟因子是重要的信号传导途径。而音蝟因子則是刺蝟信号传导途径中研究最透彻的配体,這種因子作为重要的形态发生素(Morphogen),在调节脊椎动物器官发育中起关键作用,比如它决定四肢以及腦脊髓正中線的形成。音蝟因子在成年个体中也很重要,它控制成年体细胞的分裂。音蝟因子的失控将导致癌症。.

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螢光魚

螢光魚是一種經過基因改造而培育成功的新種觀賞魚,因為植入水母的螢光基因而能發出藍、綠、黃、紅等不同顏色的螢光。這種新品種的魚是由新加坡國立大學生物科學系的教授龔志遠所提出的,培育出螢光斑馬魚,1999年新加坡國立大學以此申請專利。 臺灣邰港科技公司研發成功螢光青鱂魚。這項技術是由台灣大學分子與細胞生物學研究所蔡懷禎教授2003年培育成功。.

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鍾邦柱

鍾邦柱,現任中研院分子生物所特聘研究員,第五屆台灣女科學家「傑出獎」得主。專長是類固醇功能與調控, 斑馬魚發育, 小鼠動物模式與基因調控。.

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魚鬚

魚鬚是魚類嘴邊的觸覺器官。鯰魚、鯉魚、绯鲵鲣、盲鰻、鱘魚、斑馬魚和一些鯊魚都有魚鬚。它們起到味蕾的作用,可以幫助魚類在渾濁的水中尋找到食物。 不同魚類的魚鬚位置不同,有些魚位於上顎,有些位於下顎甚至下巴上。.

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鲤科

科是鲤形目下种类最多的一个科,包括370属3000多种Eschmeyer, W.N., Fong, J.D. (2015) in the Catalog of Fishes, California Academy of Sciences (retrieved 2 July 2015)。中国共有132属532种和亚种,其中包括鯉魚、鯽魚等常見魚類。此科魚的特徵是有鱼鬚、有咽齒沒脂鰭。鲤科一族在北美,非洲,欧亚有着密切的联系。最大的鲤鱼—巨暹罗鲤(Catlocarpio siamensis),可以长到3米长。在北美分支中的尖頭葉唇魚(Ptychocheilus lucius)单体记录为1.8米长,45千克。 与之相对的,有很多种类的体长不足5厘米。透體小鿕发育成熟后体长仅11毫米,而2006年發現的微鯉更僅有7.9毫米。鲤科的所有成员均为卵生,大部分不保护他们的卵。但是,有一些种类建鱼窝或护卵。鰟鮍類的鱼會将卵产于贝类体内,新生的小鱼直到有能力生存后才离开寄主。.

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色素細胞

色素細胞,有時稱為色素體,是两栖动物、鱼类、爬行动物、甲壳动物、头足纲动物中的一種含有生物色素的細胞。色素細胞是由胚胎中的神经嵴發展而來,對於產生皮膚色彩和眼睛色彩扮演重要角色。色素細胞依據白光下所呈现的颜色,可以分为黃色素細胞、紅色素細胞、彩虹色素細胞、白色素細胞、黑色素細胞與藍色素細胞。 有些物種的色素細胞,能夠透过色素位置的改變,以及反光结构方向的重新定位,达到快速改变色彩的目的。不同物种有不同的改变色彩方法,例如屬於頭足類的章魚,是利用肌肉來控制结构复杂的色素細胞器官;而屬於脊椎動物的變色龍,則利用細胞信號达到變色的目的。与變溫動物不同,恆溫動物中的鸟类和哺乳類只擁有一種類似色素细胞的黑素细胞,而變溫動物身上與其作用相当的「载黑素细胞」,被科学家作為研究人类疾病以及开发药物的一种工具。.

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GenBank

基因銀行(GenBank)是一个开放获取的,对所有公开可利用的核苷酸序列与其翻译的蛋白质进行收集并注释。 此数据库是(INSDC)的一部分,由美国国家生物技术信息中心(NCBI)主管,NCBI为美国国立卫生研究院的下属机构。GenBank和它的合作者从全球各个实验室接收了超过百万种生物的数据。 成立三十年来,GenBank数据库成为了最重要的也是最有影响力的生物全领域数据库,其数据正被全球数以百万计的研究人员获取与引用。GenBank中的数据量正以每18个月翻一番的速度持续指數增長,在2013年2月的版本194中,數據庫包含有1.62億個序列,含有1500億個核苷酸堿基。.

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P2X受体

P2X受体(P2X receptors,或称为P2X嘌呤受体 P2X purinoreceptor)是一个阳离子渗透型配体门控离子通道家族,能同细胞外的ATP结合,属于一个更大的嘌呤受体家族。P2X受体存在于一系列动物中,包括人、鼠类、兔、鸡、斑马鱼、牛蛙、吸虫甚至是变形虫。 4 receptor (deltaP2X4-B) channel as viewed from the side (left), extracellular (top right), and intracellular (bottom right) perspectives().

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模式生物

模式生物(model organism)是指受到廣泛研究,對其生物現象有深入了解的物種。根據從這些物種所得的科學研究結果,可以歸納出一些涵蓋許多生物的模型,並應用在各領域的研究。 利用不同的模式生物來進行實驗,對於結果會有不同的差異是眾所周知的事,因此,要如何選擇適當的生物,來進行生物體內研究,也是生物學和生物醫學一個重要方向。利用模式生物來發現、確認,可以對於疾病的治療、防治達到更佳的效果,進而發展更新的藥物。 模式生物的選擇上,要考慮到生物的多胎性、生命週期長短、生物體型或胚胎大小是否利於觀察、品種特異性、能供大部分研究者使用、能運輸至國外、能精確控制疾病或病變的再現性。 動物模式可應用於癌症、糖尿病、高血壓或其他疾病研究,近年的動物模式也應用於致癌原或環境毒物對人類的影響。.

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沙利度胺

--(Thalidomide)又名反应停、酞咪脈啶酮、沙利--竇邁、賽得(Thado),是研制抗菌药物过程中发现的一种具有中枢抑制作用的药物,曾经作为抗妊娠嘔吐反应药物在欧洲和日本广泛使用,投入使用后不久,数据显示使用该药物的孕妇的流产率和海豹肢症(Phocomelia)畸形胎儿率上升,该药物退出市场,该事件被称为反应停事件。后来研究发现该药物有两种对应异构体,其中的R构形是安全的,而S构形有致畸型作用。但此前科学界没有意识到两种构形在人体内有不同的生理活性。最近,科学家经过研究发现沙利度胺对于人免疫系统有调节作用,可以治疗红斑狼疮;此外沙利度胺还可以用于癌症的治疗,目前对沙利度胺的这些治疗作用正处于临床研究阶段。.

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淡水鱼

淡水魚是最常見的淡水生物。牠們是居住於湖泊、溪流、河川等淡水環境的魚類。地球的淡水面積少,淡水魚品種卻異常豐富,佔魚類物種數的約 41.2% 。 例如全球魚類約28000種(已记载為26000多種),淡水魚就有約10700種。雖然可以見到總數比海水魚少,但淡水水域只佔總水域2.5%,故淡水魚明顯比海水魚豐富得多。平均每種海水魚可棲息的水體要比淡水魚高出7500倍。這是由於內陸河川常被分隔,致使淡水魚易於特化,所以在可棲息水體比海水魚少的情況下,仍有眾多種類。此外跟人類易於採集河、湖水魚種也有關係。.

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